Entry information : AhalPrx13Araha.2250s0001
Entry ID 14794
Creation 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: AhalPrx13Araha.2250s0001
Name AhalPrx13Araha.2250s0001
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx004]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Arabidopsis
Organism Arabidopsis halleri    [TaxId: 81970 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AhalPrx13
start..stop
S start..stop
AlyPrx53 629 0 1..336 1..335
CrubPrx120 626 0 1..337 1..337
AruPrx53-1 623 0 1..336 1..336
AtPrx53 623 0 1..336 1..335
Literature and cross-references AhalPrx13Araha.2250s0001
Protein sequence: AhalPrx13Araha.2250s0001
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   336 (305)
PWM (Da):   %s   35065.19 (31800.6) Transmb domain:   %s   i13-35o
PI (pH):   %s   4.76 (4.74) Peptide Signal:   %s   cut: 32 range:32-336
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAVTRSSSTC DGFFIISLIV IVSSLFGTSS AQLNATFYSG TCPNASAIVR STIQQALQSD ARIGASLIRL HFHDCFVNGC DASILLDDSG SIQSEKNAGP NANSARGFNV VDNIKTALEN  ACPGVVSCSD VLAFAAEASV SLAGGPSWTV LLGRRDGLTA NLAGANSSIP SPVESLSNIT SKFSAVGLNT NDLVALSGAH TFGRARCGVF NNRLFNFSGT GNPDPTLNST LLSTLQQLCP 
QNGSVSTLTN LDRSTPDAFD NNYFTNLQSN NGLLQSDQEL FSATGSSTIA IVTSFASNQT LFFQAFAQSM INMGNISPWT GSNGEIRLDC KNVNGS* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AAACGATAAG CTAATTATCC CAAAACTCTC CAATTTGCAA CAACTAATCA ATGGCTGTAA CAAGATCTTC TTCTACTTGT GATGGTTTCT TCATCATCAG CCTTATTGTT ATCGTTTCTT  CATTGTTTGG GACATCATCT GCGCAGTTAA ACGCAACGTT TTACTCCGGC ACGTGCCCTA ACGCCTCTGC CATCGTTCGC AGCACTATTC AGCAAGCTCT TCAATCCGAT GCAAGAATCG  GAGCCAGCCT AATCCGCCTT CATTTTCACG ACTGCTTTGT TAATGTATAA GAAGCTCTTT AAATAAGCTT CTTGATTTCT CTTTTATCAT AAAGCCTTCT AAATTTTGTT ACACTAAACC  GCTACTTTGC TTCTTTACnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnAC TTGACATTAT TTGTATTTCC TTTCTTGAAT TTCCTTTCTT CTTTTTCCGT TCTTATTTTT CTTTTCTAGG ATCTTCTAGA  AAGAGATTAC TTGCTCCTCA AGTAAGTTGG AATTATCCAA CAGCATATGT TCATATTTTG AAAAATGAGA AGCATAATCT ATTCTATGAT TTTATAATCT ACATCTCAAA TTTACCGGAA  CTACTTGAGC ATCTTTGAAT GTTTATTCTA TGCGTTAATG TCAAAGGAAC ATCTCAGACT TTTGCAGATT CTTCATAAAA ATCAGTGAAG TAATAACAAC TCATTATAAA AGACTTGATT  ATGAGTCCTT TTTGGTTTTT CTGAAAATAT ATAGCTGTAA AGCTCCAACA ACTATTGAAG GCAGCAGTTC TTTCAAATAT TATTTATCAT TCACAGAACT GTCTTATAAA CCAAAGTCTA  AAATTGTAGA CTAACTTTTA GAAAGCTTAT AAAATATTGA GATCTCCTTT CACAATCTCG TAGGTTTCGC CATATATGTT TATATGAAAT TCCCTTGATT AAACATGGGA ATCTAAATGC  ATTATAGATG TTGGCTGTAT AATAAATTTA ATTTTGAGAT TGAAATATGG TCTTATTTTA GTGTATTAAT CTTTTTATGA AAGAAAGAAA AAAAAAAACC TTGATTTTCT TGACCACCGA  TTTCGTCTCA AGAACGCAAA ATCTTATAAA ACTATTTGTA ACTTCATTTA CCAACCGCGT GGGAGGATTA CAATAATGCA ATTGATGGAG ATGGTGTAAC CTAAAGACAA ATTACTTTTA  ACTAAACAAA ATGTAGAAGT AGAAGCACCA GCTTTCTTTT CCCATCTTTT GGACTATGTA GACAAACACA CACGTTAATC TATAGTTATT GGCTTAATTC AAAATCTTTC ATTTTCATGA  TCAGTCAAGA AATACGCGTT TAATCAACTT TTCCTCTCTA TATATAAAAT TATTTCAAAA TGATCAAGCA TAGTCATAAG TTCCGCACCA ATCAGTGGAA ATAACTAATC AAAACTCTAT  ATCATCGTTT TCCAAAACCT AATTAATGGC TGTAACAAAT CTTCCTACTT GTGATGGTTT GTTCATCATC AGTCTTATTG TTATCGTTTC TTCAATGTTT AGGACATCAT CTGCGCAACT  AAACGCAACA TTTTACTCTG GGACTTGCCC TAACGCCTCT GCCATCGTAC GTCGCACTAT TCAGCAAGCT ATTCAATCTG ATGCAAGAAT TGGAGCCAGC CTAATCCGCC TTCATTTTCA  CGATTGCTTT GTTAATGTAT AGTTGTATAC TAATCTTTTT CGATGCAACT CTTTTAACAT AAAGCCCTAT TATTCTGTTT CGCCCTAAAC CGCTACTTTG CTTCTTTTTT ATTCTAAAGG  GCTGCGATGC ATCGATCTTG CTTGACGACA GTGGAAGCAT CCAGAGCGAG AAGAACGCTG GTCCGAATGC AAACTCAGCT AGAGGGTTCA ACGTTGTCGA TAATATCAAG ACTGCCCTTG  AAAACGCTTG CCCTGGTGTT GTCTCATGCT CTGATGTTTT AGCCTTTGCC GCTGAGGCTT CCGTGTCTTT GGTAATTACA CGTTCTTTGT GAACATATGA AACAAAACAT AGTTAAAATT  TCCTGTGGTA TAATTCTGTT TTAGTAATAG TTAACATATA CGTCTGATTA TCTTCAGGCA GGAGGGCCAT CATGGACCGT ATTATTAGGA AGAAGAGATG GTCTCACTGC AAACCTAGCC  GGGGCAAATT CGTCCATTCC TTCTCCCGTC GAAAGCCTTA GCAACATCAC GTCAAAATTT TCGGCTGTTG GGCTAAATAC AAACGATCTA GTAGCCTTAT CTGGTGAGTT TATCTACATG  TTTAGTTACT TGCGGTTCAA GTTGAAACAA AACCCTAACG CCATCTCTTG TGGTTCGACG CAGGTGCGCA TACGTTCGGG CGTGCTCGAT GTGGAGTCTT CAACAACAGG CTATTTAACT  TCAGCGGGAC AGGAAATCCC GACCCGACTC TAAACTCAAC GCTTCTCAGC ACTCTTCAAC AGCTATGTCC TCAAAACGGC AGCGTATCAA CGCTCACCAA TCTCGATCGG AGCACACCAG  ATGCGTTCGA TAACAATTAC TTCACCAACC TTCAGAGCAA CAATGGGCTT CTTCAGTCAG ACCAAGAGCT ATTCTCTGCC ACCGGTTCAT CCACCATCGC GATTGTTACT TCATTTGCAA  GTAACCAAAC TCTGTTTTTT CAGGCCTTTG CTCAGTCCAT GATCAACATG GGGAATATTA GTCCCTGGAC TGGGAGTAAT GGAGAGATTA GATTAGACTG TAAGAATGTT AATGGAAGTT  GATTTCCTTA AAGCTCCTTT TCTTTGAAAA AAACATATTG GCAAGCTTTG GTTGAATAAT TTTTGTTATC ATTATCACAT CAAATATGTA TTGCATTTAA ATCTTTCTTA AGCAATTTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTGTAA CAAATCTTCC TACTTGTGAT GGTTTGTTCA TCATCAGTCT TATTGTTATC GTTTCTTCAA TGTTTAGGAC ATCATCTGCG CAACTAAACG CAACATTTTA CTCTGGGACT  TGCCCTAACG CCTCTGCCAT CGTACGTCGC ACTATTCAGC AAGCTATTCA ATCTGATGCA AGAATTGGAG CCAGCCTAAT CCGCCTTCAT TTTCACGATT GCTTTGTTAA TGGCTGCGAT  GCATCGATCT TGCTTGACGA CAGTGGAAGC ATCCAGAGCG AGAAGAACGC TGGTCCGAAT GCAAACTCAG CTAGAGGGTT CAACGTTGTC GATAATATCA AGACTGCCCT TGAAAACGCT  TGCCCTGGTG TTGTCTCATG CTCTGATGTT TTAGCCTTTG CCGCTGAGGC TTCCGTGTCT TTGGCAGGAG GGCCATCATG GACCGTATTA TTAGGAAGAA GAGATGGTCT CACTGCAAAC  CTAGCCGGGG CAAATTCGTC CATTCCTTCT CCCGTCGAAA GCCTTAGCAA CATCACGTCA AAATTTTCGG CTGTTGGGCT AAATACAAAC GATCTAGTAG CCTTATCTGG TGCGCATACG  TTCGGGCGTG CTCGATGTGG AGTCTTCAAC AACAGGCTAT TTAACTTCAG CGGGACAGGA AATCCCGACC CGACTCTAAA CTCAACGCTT CTCAGCACTC TTCAACAGCT ATGTCCTCAA  AACGGCAGCG TATCAACGCT CACCAATCTC GATCGGAGCA CACCAGATGC GTTCGATAAC AATTACTTCA CCAACCTTCA GAGCAACAAT GGGCTTCTTC AGTCAGACCA AGAGCTATTC  TCTGCCACCG GTTCATCCAC CATCGCGATT GTTACTTCAT TTGCAAGTAA CCAAACTCTG TTTTTTCAGG CCTTTGCTCA GTCCATGATC AACATGGGGA ATATTAGTCC CTGGACTGGG 
AGTAATGGAG AGATTAGATT AGACTGTAAG AATGTTAATG GAAGTTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CAATCAGTGG AAATAACTAA TCAAAACTCT ATATCATCGT TTTCCAAAAC CTAATTAATG GCTGTAACAA ATCTTCCTAC TTGTGATGGT TTGTTCATCA TCAGTCTTAT TGTTATCGTT  TCTTCAATGT TTAGGACATC ATCTGCGCAA CTAAACGCAA CATTTTACTC TGGGACTTGC CCTAACGCCT CTGCCATCGT ACGTCGCACT ATTCAGCAAG CTATTCAATC TGATGCAAGA  ATTGGAGCCA GCCTAATCCG CCTTCATTTT CACGATTGCT TTGTTAATGG CTGCGATGCA TCGATCTTGC TTGACGACAG TGGAAGCATC CAGAGCGAGA AGAACGCTGG TCCGAATGCA  AACTCAGCTA GAGGGTTCAA CGTTGTCGAT AATATCAAGA CTGCCCTTGA AAACGCTTGC CCTGGTGTTG TCTCATGCTC TGATGTTTTA GCCTTTGCCG CTGAGGCTTC CGTGTCTTTG  GCAGGAGGGC CATCATGGAC CGTATTATTA GGAAGAAGAG ATGGTCTCAC TGCAAACCTA GCCGGGGCAA ATTCGTCCAT TCCTTCTCCC GTCGAAAGCC TTAGCAACAT CACGTCAAAA  TTTTCGGCTG TTGGGCTAAA TACAAACGAT CTAGTAGCCT TATCTGGTGC GCATACGTTC GGGCGTGCTC GATGTGGAGT CTTCAACAAC AGGCTATTTA ACTTCAGCGG GACAGGAAAT  CCCGACCCGA CTCTAAACTC AACGCTTCTC AGCACTCTTC AACAGCTATG TCCTCAAAAC GGCAGCGTAT CAACGCTCAC CAATCTCGAT CGGAGCACAC CAGATGCGTT CGATAACAAT  TACTTCACCA ACCTTCAGAG CAACAATGGG CTTCTTCAGT CAGACCAAGA GCTATTCTCT GCCACCGGTT CATCCACCAT CGCGATTGTT ACTTCATTTG CAAGTAACCA AACTCTGTTT  TTTCAGGCCT TTGCTCAGTC CATGATCAAC ATGGGGAATA TTAGTCCCTG GACTGGGAGT AATGGAGAGA TTAGATTAGA CTGTAAGAAT GTTAATGGAA GTTGATTTCC TTAAAGCTCC 
TTTTCTTTGA AAAAAACATA TTGGCAAGCT TTGGTTGAAT AATTTTTGTT ATCATTATCA CATCAAATAT GTATTGCATT TAAATCTTTC TTAAGCAATT TAA 

Retrieve as FASTA