Entry information : CagraPrx01Cagra.1157s0008
Entry ID 14847
Creation 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CagraPrx01Cagra.1157s0008
Name CagraPrx01Cagra.1157s0008
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx024]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella grandiflora    [TaxId: 264402 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CagraPrx01
start..stop
S start..stop
CrubPrx112 693 0 1..334 32..365
AtPrx11 609 0 1..334 2..336
BstrPrx23 606 0 1..334 1..335
AlyPrx11 602 0 1..334 1..335
Literature and cross-references CagraPrx01Cagra.1157s0008
Protein sequence: CagraPrx01Cagra.1157s0008
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   334 (315)
PWM (Da):   %s   36862.63 (34528.4)  
PI (pH):   %s   6.24 (5.70) Peptide Signal:   %s   cut: 20 range:20-334
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKLLLVFIMV HTIFIPCFSF DIPTLLPAFP LTLDYYKSTC PTVFDVIKKE MECIVKEDPR NAAILIRLHF HDCFVQGCDG SVLLDETETL KGEKKASPNI NSLKGYEIID RLKNIIESEC  PGVVSCADLL TISARDATIL VGGPYWDVLV GRNDSKSASY AHATTNLPTP DESLLSIVAK FYSQGLSVED MVALIGAHTI GMAQCRNFRS RIYGDFQVTS ALNPLSVTYV ASLRKICPAN 
SGEGDSNVAA MDNVTPNLFD NSFYHTLLRG EGLLNSDQAM YTSVFGIQTR KIVSKYAENP VAFFEQFSKS MVKMGNILNP SGGEVRRNCR FVNT* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAACTCC TCCTTGTGTT CATAATGGTT CACACCATCT TTATCCCCTG TTTTTCCTTT GACATACCAA CTTTATTACC TGCTTTTCCT TTAACCCTAG ATTATTACAA GTCTACTTGT  CCGACAGTCT TTGACGTCAT CAAGAAAGAA ATGGAATGCA TAGTGAAGGA AGATCCTAGA AATGCAGCCA TACTTATTCG TTTACACTTC CACGACTGCT TTGTCCAAGT AAGTACTCAT  TCACACACCT TTCTTGAATT ACAAGAAATC GTTCAACAAA GGAAAATACG AACATTTTAC ATGATATTTA GCTGCGAGGG GTTCCTTTAT GCTACGAATG GTTAATTACT TTTCAAAGTT  TCAAAATGTT ATTGCAGGGA TGCGATGGAT CAGTGTTGCT AGACGAAACA GAAACACTCA AGGGAGAGAA GAAAGCTTCT CCCAACATAA ACTCATTGAA AGGATACGAA ATTATAGACA  GACTCAAGAA CATAATCGAA TCCGAATGTC CTGGAGTCGT TTCCTGCGCT GATCTTCTCA CAATCAGTGC TAGAGATGCT ACAATCCTGG TAAATAAACA AGACTTAGAA ACATATACTC  TCTCATATAG ATTATGAAAT AAAGAAATTA ACATCTAAGA ACTTTGTGGT TTGAAGGTGG GTGGACCTTA CTGGGATGTT CTTGTGGGAA GAAACGATTC AAAATCAGCA AGTTACGCGC  ATGCCACAAC AAACCTTCCA ACTCCAGATG AGAGTTTACT CAGCATCGTC GCTAAGTTTT ATTCTCAGGG TCTCTCTGTT GAAGACATGG TCGCTCTTAT AGGTATTGTG GTAAACTAAT  TAAACCGGAC AATTAATTTT TTTGGTAACT GTGGTAAACC GGATTGCAAA AACCCTAACT TGACGAACAA TCTATGTAGG AGCTCACACG ATCGGAATGG CACAATGTCG GAACTTTAGA  TCCCGGATCT ATGGAGATTT TCAAGTGACG TCAGCCCTAA ATCCACTCTC GGTGACGTAC GTGGCAAGTC TCCGAAAGAT ATGTCCAGCG AACAGCGGAG AAGGTGATAG CAATGTGGCG  GCAATGGACA ACGTGACGCC GAATCTCTTC GATAACTCGT TCTACCACAC GCTGCTAAGA GGAGAAGGGT TGTTGAACTC GGACCAGGCT ATGTACACGA GCGTGTTCGG GATACAAACT  CGGAAGATAG TGAGCAAGTA CGCCGAGAAT CCTGTGGCGT TCTTCGAGCA ATTCTCTAAG TCGATGGTGA AGATGGGGAA CATTTTGAAC CCTTCTGGAG GAGAAGTTAG AAGAAATTGC 
CGATTCGTGA ATACATGAAA ACTTCAACAA CAAGGAATAA GCTATTTCCG ATATTTTTAC TTATGTAAGA AAACAAAAAA A 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAACTCC TCCTTGTGTT CATAATGGTT CACACCATCT TTATCCCCTG TTTTTCCTTT GACATACCAA CTTTATTACC TGCTTTTCCT TTAACCCTAG ATTATTACAA GTCTACTTGT  CCGACAGTCT TTGACGTCAT CAAGAAAGAA ATGGAATGCA TAGTGAAGGA AGATCCTAGA AATGCAGCCA TACTTATTCG TTTACACTTC CACGACTGCT TTGTCCAAGG ATGCGATGGA  TCAGTGTTGC TAGACGAAAC AGAAACACTC AAGGGAGAGA AGAAAGCTTC TCCCAACATA AACTCATTGA AAGGATACGA AATTATAGAC AGACTCAAGA ACATAATCGA ATCCGAATGT  CCTGGAGTCG TTTCCTGCGC TGATCTTCTC ACAATCAGTG CTAGAGATGC TACAATCCTG GTGGGTGGAC CTTACTGGGA TGTTCTTGTG GGAAGAAACG ATTCAAAATC AGCAAGTTAC  GCGCATGCCA CAACAAACCT TCCAACTCCA GATGAGAGTT TACTCAGCAT CGTCGCTAAG TTTTATTCTC AGGGTCTCTC TGTTGAAGAC ATGGTCGCTC TTATAGGAGC TCACACGATC  GGAATGGCAC AATGTCGGAA CTTTAGATCC CGGATCTATG GAGATTTTCA AGTGACGTCA GCCCTAAATC CACTCTCGGT GACGTACGTG GCAAGTCTCC GAAAGATATG TCCAGCGAAC  AGCGGAGAAG GTGATAGCAA TGTGGCGGCA ATGGACAACG TGACGCCGAA TCTCTTCGAT AACTCGTTCT ACCACACGCT GCTAAGAGGA GAAGGGTTGT TGAACTCGGA CCAGGCTATG  TACACGAGCG TGTTCGGGAT ACAAACTCGG AAGATAGTGA GCAAGTACGC CGAGAATCCT GTGGCGTTCT TCGAGCAATT CTCTAAGTCG ATGGTGAAGA TGGGGAACAT TTTGAACCCT 
TCTGGAGGAG AAGTTAGAAG AAATTGCCGA TTCGTGAATA CATGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAACTCC TCCTTGTGTT CATAATGGTT CACACCATCT TTATCCCCTG TTTTTCCTTT GACATACCAA CTTTATTACC TGCTTTTCCT TTAACCCTAG ATTATTACAA GTCTACTTGT  CCGACAGTCT TTGACGTCAT CAAGAAAGAA ATGGAATGCA TAGTGAAGGA AGATCCTAGA AATGCAGCCA TACTTATTCG TTTACACTTC CACGACTGCT TTGTCCAAGG ATGCGATGGA  TCAGTGTTGC TAGACGAAAC AGAAACACTC AAGGGAGAGA AGAAAGCTTC TCCCAACATA AACTCATTGA AAGGATACGA AATTATAGAC AGACTCAAGA ACATAATCGA ATCCGAATGT  CCTGGAGTCG TTTCCTGCGC TGATCTTCTC ACAATCAGTG CTAGAGATGC TACAATCCTG GTGGGTGGAC CTTACTGGGA TGTTCTTGTG GGAAGAAACG ATTCAAAATC AGCAAGTTAC  GCGCATGCCA CAACAAACCT TCCAACTCCA GATGAGAGTT TACTCAGCAT CGTCGCTAAG TTTTATTCTC AGGGTCTCTC TGTTGAAGAC ATGGTCGCTC TTATAGGAGC TCACACGATC  GGAATGGCAC AATGTCGGAA CTTTAGATCC CGGATCTATG GAGATTTTCA AGTGACGTCA GCCCTAAATC CACTCTCGGT GACGTACGTG GCAAGTCTCC GAAAGATATG TCCAGCGAAC  AGCGGAGAAG GTGATAGCAA TGTGGCGGCA ATGGACAACG TGACGCCGAA TCTCTTCGAT AACTCGTTCT ACCACACGCT GCTAAGAGGA GAAGGGTTGT TGAACTCGGA CCAGGCTATG  TACACGAGCG TGTTCGGGAT ACAAACTCGG AAGATAGTGA GCAAGTACGC CGAGAATCCT GTGGCGTTCT TCGAGCAATT CTCTAAGTCG ATGGTGAAGA TGGGGAACAT TTTGAACCCT 
TCTGGAGGAG AAGTTAGAAG AAATTGCCGA TTCGTGAATA CATGAAAACT TCAACAACAA GGAATAAGCT ATTTCCGATA TTTTTACTTA TGTAAGAAAA CAAAAAAA 

Retrieve as FASTA