Entry information : CagraPrx03(Cagra.10289s0002)
Entry ID 14849
Creation 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Sequence status partial
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-02-06 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CagraPrx03(Cagra.10289s0002)
Name CagraPrx03(Cagra.10289s0002)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx018]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella grandiflora    [TaxId: 264402 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CagraPrx03
start..stop
S start..stop
CrubPrx101 569 0 1..276 97..372
BstrPrx67 561 0 1..276 77..352
AtPrx32 552 0 1..276 77..352
AlyPrx32 550 0 1..276 77..352
Literature and cross-references CagraPrx03(Cagra.10289s0002)
Protein sequence: CagraPrx03(Cagra.10289s0002)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   276
PWM (Da):   %s   30189.15  
PI (pH):   %s   6.5
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GCDASILLDN TTSFRTEKEA APNANSARGF PVIDRMKAAI EAACPRTVSC ADMLTIAAQQ SVNLAGGPSW RVPLGRRDSL QAFFDLANAN LPAPFFTLPQ LKASFSNVGL DRPSDLVALS  GGHTFGKNQC QFIMDRLYNF SNTGLPDPTL NTTYLQTLRG QCPRNGNQTV LVDFDLRTPT VFDNKYYVNL KELKGLIQTD QELFSSPNAT DTVPLVRAYA DGTQKFFNAF VEAMNRMGNI 
TPLTGTQGQI RQNCRVVNSN SLLHDVVEIV DFVSSI* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Partial sequence from genomic. 5'end is missing due to N in the scaffold.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AACAATATAG AGAATTAGGT CACTGGGCTA AGATCTGGTT TACAAAAATG TCAATATAAA ATTTCAACGA AGTTAGATGT GATATTTTTG GTTTTTATGG TCTAGTATCT TAGTTCTTGT  CGTCAAGGAT GACTATAAAA AAGTAATTCG ACAACATTGT AGTAAGATTT GTTCACCCAT GCATTATTCA ATGAACGTGA ACTATTTATA AATTAATTTA AGAAAAGCAT GTGGACTCTC  GTACGGTCGT ACCAAATACG TTATTAATAT ATTAAAAAAT CATTAACTGA AGGATAAAAA AATGTCACAG AAATCATTCA AAAGTCTCAA GTTTATCATC AACACTGAAC ACCCCACATA  ATATTTGGAA ATATAAATAG AAATGTACGT GAAAACCTTA TCTATCATTT AATTTTTTAT TTCCTGGAAA TTTTTAGCTT TTGAATCAGA TGTATTTGTT AACCTAATAT AGAATGTAAA  CTAAAATCAA TAATAGCTAA CTTGTATGTA TAAACTATGT ATATTATAGT GGATTAGAAG AACAAATACT TTTAGTGAAT GAAAATGAAA TCTTACACTC TTTTATAGCT AGTAAATTAT  TTGTAAACTA AGTACAAACA TATAAACTGA TTATGATTTC AATGTATTGA CTAACGAGTG ATAAAACTTA TATTCGTTTG CAAAGGGATG CGATGCATCG ATTTTGTTAG ACAATACAAC  ATCCTTTCGA ACAGAGAAAG AGGCAGCTCC AAACGCAAAC TCGGCTCGAG GATTTCCAGT GATTGATAGG ATGAAAGCAG CAATTGAGGC AGCATGTCCA AGGACTGTAT CATGCGCAGA  TATGCTTACC ATCGCAGCTC AACAATCAGT AAATTTGGTA TGCATTTTCT CTCTCCCTTT TTTTCATTTA TAAGAAATAT TGTGTCCAAC ATAAGGAGTA GTTCTTGTTG GTTTGTTTCA  ATTTTTAAAA AAATATGGAG TAGCTCGATG CAAAATAAAA CTCATAACCA AGTGCTAATA TATCAATTGG TAAAGATCTC TGGCAAAAGC TTAGAGGTCG CCGGTTCGAG TATTGTTTGG  GACGAAACCA TATAATATGC TTTGGTTTCG GGTCTGAGGG GATGTATGGG TTTCGGTCCA GAACCTCTTT GATTATTCAA AAAAAAAGAA AAAAAAAAAA CTCATAAAAA AAATGGATAT  TCTTGATGAA TTTGAAACAA GAATTTAACT AGTAAACAAA ATTCCTATAG CCACTTGAAT ATTCGTGACC GTGCCTTAAT ATTCGTGGCT ATAGCATCGT AGCTTAACTA ATTCGTGGTT  TTTTTAAACA AATCACCTAT AGCAACGAAA TTTCGCGACT GTCAAGTGGT TAGCTATAGA GTATTCTTTT TACTAGTATA ATTTGGACGC ACCAAATGCT GCAACTCGCA AGTTGTACAA  TCTAGCTAGA TTTGATATTA TGGCATACTA CGCGGTACTA GAAAGACTTC AATATTCATT AGGGAAATGT TTTAAAATTC TAGTCTTATT CCAATAGTAA ACTCGATTCG TTAAGACTAG  TGTTTTTGGT TACTGGAAAT AATATAAGAA AAATTTCCAA ACAAACTGAA AAAAATAGTC ATAAAGTTGA GAACCAATTT GTTGAATTTT TGTGATGTAT AACTTGTCTT TTGTCTTTTG  AATCGTAACA CTTTTGTGTG GTAAGAATTA TTTTCGTAAA CTGATTATTA TGTTTTAAAT ATCGGTATTT TAGGCAGGAG GTCCTTCGTG GAGGGTTCCT TTAGGGAGAA GAGACAGCTT  ACAAGCATTT TTTGATCTCG CTAATGCAAA TCTTCCCGCA CCATTCTTCA CGCTTCCACA ACTCAAGGCT AGCTTTAGTA ATGTTGGACT TGACCGTCCT TCGGATCTTG TTGCACTCTC  TGGTAATTCT CATATATATT TCAATTCCAT CTAACAAGTT CATAAACTTT ATTGTTAATT TATCTCTTCT TTTGGTTAGG TGGTCACACA TTTGGTAAAA ACCAATGCCA ATTTATTATG  GATAGGCTAT ACAACTTTAG CAACACTGGT TTACCCGACC CTACTCTCAA TACAACTTAC CTCCAGACAC TTCGTGGACA ATGTCCCCGT AATGGTAACC AGACGGTCTT GGTCGATTTC  GATTTACGTA CACCGACGGT TTTTGACAAC AAATACTATG TGAATCTGAA AGAGCTAAAG GGACTTATCC AGACCGATCA AGAATTGTTT TCTAGCCCTA ATGCCACTGA CACTGTCCCA  TTGGTGAGAG CATATGCTGA TGGTACTCAA AAGTTCTTTA ATGCTTTTGT GGAAGCCATG AATAGGATGG GAAACATTAC ACCTCTCACT GGAACTCAAG GACAGATAAG ACAGAATTGT 
AGGGTGGTCA ACTCCAACTC GCTGCTTCAT GATGTGGTTG AAATCGTTGA CTTTGTCAGC TCTATATAAT ATAACAGTTG TTGTTTCAAT ATATGTGGC 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GGATGCGATG CATCGATTTT GTTAGACAAT ACAACATCCT TTCGAACAGA GAAAGAGGCA GCTCCAAACG CAAACTCGGC TCGAGGATTT CCAGTGATTG ATAGGATGAA AGCAGCAATT  GAGGCAGCAT GTCCAAGGAC TGTATCATGC GCAGATATGC TTACCATCGC AGCTCAACAA TCAGTAAATT TGGCAGGAGG TCCTTCGTGG AGGGTTCCTT TAGGGAGAAG AGACAGCTTA  CAAGCATTTT TTGATCTCGC TAATGCAAAT CTTCCCGCAC CATTCTTCAC GCTTCCACAA CTCAAGGCTA GCTTTAGTAA TGTTGGACTT GACCGTCCTT CGGATCTTGT TGCACTCTCT  GGTGGTCACA CATTTGGTAA AAACCAATGC CAATTTATTA TGGATAGGCT ATACAACTTT AGCAACACTG GTTTACCCGA CCCTACTCTC AATACAACTT ACCTCCAGAC ACTTCGTGGA  CAATGTCCCC GTAATGGTAA CCAGACGGTC TTGGTCGATT TCGATTTACG TACACCGACG GTTTTTGACA ACAAATACTA TGTGAATCTG AAAGAGCTAA AGGGACTTAT CCAGACCGAT  CAAGAATTGT TTTCTAGCCC TAATGCCACT GACACTGTCC CATTGGTGAG AGCATATGCT GATGGTACTC AAAAGTTCTT TAATGCTTTT GTGGAAGCCA TGAATAGGAT GGGAAACATT 
ACACCTCTCA CTGGAACTCA AGGACAGATA AGACAGAATT GTAGGGTGGT CAACTCCAAC TCGCTGCTTC ATGATGTGGT TGAAATCGTT GACTTTGTCA GCTCTATATA A 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GGATGCGATG CATCGATTTT GTTAGACAAT ACAACATCCT TTCGAACAGA GAAAGAGGCA GCTCCAAACG CAAACTCGGC TCGAGGATTT CCAGTGATTG ATAGGATGAA AGCAGCAATT  GAGGCAGCAT GTCCAAGGAC TGTATCATGC GCAGATATGC TTACCATCGC AGCTCAACAA TCAGTAAATT TGGCAGGAGG TCCTTCGTGG AGGGTTCCTT TAGGGAGAAG AGACAGCTTA  CAAGCATTTT TTGATCTCGC TAATGCAAAT CTTCCCGCAC CATTCTTCAC GCTTCCACAA CTCAAGGCTA GCTTTAGTAA TGTTGGACTT GACCGTCCTT CGGATCTTGT TGCACTCTCT  GGTGGTCACA CATTTGGTAA AAACCAATGC CAATTTATTA TGGATAGGCT ATACAACTTT AGCAACACTG GTTTACCCGA CCCTACTCTC AATACAACTT ACCTCCAGAC ACTTCGTGGA  CAATGTCCCC GTAATGGTAA CCAGACGGTC TTGGTCGATT TCGATTTACG TACACCGACG GTTTTTGACA ACAAATACTA TGTGAATCTG AAAGAGCTAA AGGGACTTAT CCAGACCGAT  CAAGAATTGT TTTCTAGCCC TAATGCCACT GACACTGTCC CATTGGTGAG AGCATATGCT GATGGTACTC AAAAGTTCTT TAATGCTTTT GTGGAAGCCA TGAATAGGAT GGGAAACATT  ACACCTCTCA CTGGAACTCA AGGACAGATA AGACAGAATT GTAGGGTGGT CAACTCCAAC TCGCTGCTTC ATGATGTGGT TGAAATCGTT GACTTTGTCA GCTCTATATA ATATAACAGT 
TGTTGTTTCA ATATATGTGG C 

Retrieve as FASTA