Entry information : CagraPrx08 (Cagra.26570s0001)
Entry ID 14854
Creation 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Sequence status partial
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CagraPrx08 (Cagra.26570s0001)
Name (synonym) CagraPrx08 (Cagra.26570s0001)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx018]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella grandiflora    [TaxId: 264402 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CagraPrx08
start..stop
S start..stop
CrubPrx48 630 0 1..305 1..305
AtPrx33 568 0 1..305 1..305
AlyPrx33 568 0 1..305 1..300
AruPrx01-3 561 0 5..305 3..303
Literature and cross-references CagraPrx08 (Cagra.26570s0001)
Protein sequence: CagraPrx08 (Cagra.26570s0001)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   305 (274)
PWM (Da):   %s   33411.67 (30127.1) Transmb domain:   %s   i13-35o
PI (pH):   %s   5.35 (5.09) Peptide Signal:   %s   cut: 32 range:32-305
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKFSSSSTTS YTWTTLITLG CLMLCASLSV AQLTPTFYDN SCPNVTNIVR DTIVDELRSD PRIAGSILRL HFHDCFVNGC DASILLDNTT SFQTEKDAFG NANSARGFPV IDRMKAAIES  ACPRTVSCAD MLTIAAQQSV TLAGGPSWKV PLGRRDSLQA FLELANKNLP APTLTLPELK ENFKNVGLDR PSDLVALSGG HTFGKNQCRF IMDRLYNFSN TGLPDPTLNT TYLQTLRGQC 
PQDGNQSVLV DFDLRTPLVF DNKYYVNLKE QKGLIQTDQE LFSSPNATDT IPLVRSYADG TQTFF 

Retrieve as FASTA  
Remarks Partial sequence from genomic. 3'end is missing due to scaffold border.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGTTCT CTTCATCTTC TACTACTTCC TACACTTGGA CAACCTTAAT CACATTGGGA TGTCTTATGC TTTGTGCCTC TTTGTCCGTT GCTCAACTTA CCCCTACCTT TTACGACAAT  TCTTGTCCTA ATGTCACCAA CATTGTTAGA GATACTATTG TAGACGAGCT AAGATCGGAC CCTCGTATCG CCGGGAGCAT TCTTCGTCTT CACTTCCACG ACTGCTTTGT TAACGTAAGA  TACCATTATC ATTATTTACA TATATGTTTT AGTCTTTTGA ATTACTGTAG TTCATCTCTA TATCTTTTAA TGAGTCAAGA GTGTGATAAC AGAAATGCAT TCAAAATCAC ATTTTATCTA  TTTTTCGCAA AATCACATTG TTACATTTGG TATACATATG GATGTGATAC ATTGACTGAT AATTTCTTAA ATGTCGTTTT GAATTCTTAA AAGGGTTGTG ATGCATCGAT CTTGTTAGAC  AACACAACAT CATTTCAAAC AGAGAAAGAT GCGTTTGGAA ACGCAAATTC GGCTCGGGGA TTTCCCGTGA TTGATAGAAT GAAAGCCGCA ATAGAGAGTG CTTGCCCGAG AACTGTTTCA  TGCGCAGACA TGCTTACCAT TGCAGCTCAA CAATCTGTTA CTTTGGTACG CTTCATTGTT CCATCTTCTT TCCTTGGTTA CAAACATTTT TTTTCCTTCA AATTTTAATA TTTCAAGTAG  TCACTTTACA TATCAAACAT ATATGAGTTA AATTTGGGAT ATAGTTGTTT GAGAATGTCA CAATGATCAT ATTTAGTACT AACCACACGT TTTGAATATT TCTCGAATAA TTTTGAACAC  TTTAATTTTG AAAAGTGCTC AAAATTATTC GAGAAATATT CAAAACGTGT GGTCCGGTCA AGAATATTTG TCAAGCTTAA TATCAAACTA GGATATACTT TTATTTGGTT AATTTTTTTT  CCGAAGAAGC AGTGGAAATT CTAAAAATTT CCTTTTGAGT ATTTAACGAA TTATATATAG TACATGTTTC TGAGTGATAA AACTTTCTTA TAAAGTAATT ATAATTTTGA GAGTATAATG  GTAAGTGTAC TATATAGGCA GGAGGTCCTT CTTGGAAGGT TCCTTTGGGA AGAAGAGACA GCTTACAAGC ATTTTTGGAA CTCGCTAATA AAAATCTTCC AGCTCCAACC TTAACACTTC  CAGAACTTAA GGAAAACTTT AAAAATGTTG GCCTTGATCG TCCTTCTGAT CTTGTTGCTC TCTCAGGTAC GTCATTAACA CAACTAAATT AAACCCTATT GACATAGTTG TATTATTTTA  TCTAATAATG GTCTTTATTT TGTTTAGGGG GTCACACATT TGGTAAAAAT CAATGTCGAT TTATTATGGA CAGATTATAC AACTTCAGCA ACACCGGGTT ACCTGACCCT ACCCTCAACA  CTACTTACCT ACAAACTCTT CGTGGACAAT GCCCCCAAGA TGGTAACCAA AGCGTCTTGG TGGATTTCGA TTTGCGTACG CCTTTGGTCT TCGACAACAA ATACTACGTG AATCTGAAAG 
AACAAAAAGG TCTTATCCAA ACCGATCAAG AGTTGTTCTC TAGTCCTAAT GCCACAGACA CGATCCCCTT GGTGAGATCT TATGCTGATG GCACACAAAC ATTCTTT 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGTTCT CTTCATCTTC TACTACTTCC TACACTTGGA CAACCTTAAT CACATTGGGA TGTCTTATGC TTTGTGCCTC TTTGTCCGTT GCTCAACTTA CCCCTACCTT TTACGACAAT  TCTTGTCCTA ATGTCACCAA CATTGTTAGA GATACTATTG TAGACGAGCT AAGATCGGAC CCTCGTATCG CCGGGAGCAT TCTTCGTCTT CACTTCCACG ACTGCTTTGT TAACGGTTGT  GATGCATCGA TCTTGTTAGA CAACACAACA TCATTTCAAA CAGAGAAAGA TGCGTTTGGA AACGCAAATT CGGCTCGGGG ATTTCCCGTG ATTGATAGAA TGAAAGCCGC AATAGAGAGT  GCTTGCCCGA GAACTGTTTC ATGCGCAGAC ATGCTTACCA TTGCAGCTCA ACAATCTGTT ACTTTGGCAG GAGGTCCTTC TTGGAAGGTT CCTTTGGGAA GAAGAGACAG CTTACAAGCA  TTTTTGGAAC TCGCTAATAA AAATCTTCCA GCTCCAACCT TAACACTTCC AGAACTTAAG GAAAACTTTA AAAATGTTGG CCTTGATCGT CCTTCTGATC TTGTTGCTCT CTCAGGGGGT  CACACATTTG GTAAAAATCA ATGTCGATTT ATTATGGACA GATTATACAA CTTCAGCAAC ACCGGGTTAC CTGACCCTAC CCTCAACACT ACTTACCTAC AAACTCTTCG TGGACAATGC  CCCCAAGATG GTAACCAAAG CGTCTTGGTG GATTTCGATT TGCGTACGCC TTTGGTCTTC GACAACAAAT ACTACGTGAA TCTGAAAGAA CAAAAAGGTC TTATCCAAAC CGATCAAGAG 
TTGTTCTCTA GTCCTAATGC CACAGACACG ATCCCCTTGG TGAGATCTTA TGCTGATGGC ACACAAACAT TCTTT 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGTTCT CTTCATCTTC TACTACTTCC TACACTTGGA CAACCTTAAT CACATTGGGA TGTCTTATGC TTTGTGCCTC TTTGTCCGTT GCTCAACTTA CCCCTACCTT TTACGACAAT  TCTTGTCCTA ATGTCACCAA CATTGTTAGA GATACTATTG TAGACGAGCT AAGATCGGAC CCTCGTATCG CCGGGAGCAT TCTTCGTCTT CACTTCCACG ACTGCTTTGT TAACGGTTGT  GATGCATCGA TCTTGTTAGA CAACACAACA TCATTTCAAA CAGAGAAAGA TGCGTTTGGA AACGCAAATT CGGCTCGGGG ATTTCCCGTG ATTGATAGAA TGAAAGCCGC AATAGAGAGT  GCTTGCCCGA GAACTGTTTC ATGCGCAGAC ATGCTTACCA TTGCAGCTCA ACAATCTGTT ACTTTGGCAG GAGGTCCTTC TTGGAAGGTT CCTTTGGGAA GAAGAGACAG CTTACAAGCA  TTTTTGGAAC TCGCTAATAA AAATCTTCCA GCTCCAACCT TAACACTTCC AGAACTTAAG GAAAACTTTA AAAATGTTGG CCTTGATCGT CCTTCTGATC TTGTTGCTCT CTCAGGGGGT  CACACATTTG GTAAAAATCA ATGTCGATTT ATTATGGACA GATTATACAA CTTCAGCAAC ACCGGGTTAC CTGACCCTAC CCTCAACACT ACTTACCTAC AAACTCTTCG TGGACAATGC  CCCCAAGATG GTAACCAAAG CGTCTTGGTG GATTTCGATT TGCGTACGCC TTTGGTCTTC GACAACAAAT ACTACGTGAA TCTGAAAGAA CAAAAAGGTC TTATCCAAAC CGATCAAGAG 
TTGTTCTCTA GTCCTAATGC CACAGACACG ATCCCCTTGG TGAGATCTTA TGCTGATGGC ACACAAACAT TCTTT 

Retrieve as FASTA