Entry information : CagraPrx14Cagra.1268s0012
Entry ID 14860
Creation 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CagraPrx14Cagra.1268s0012
Name CagraPrx14Cagra.1268s0012
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx083]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella grandiflora    [TaxId: 264402 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CagraPrx14
start..stop
S start..stop
CrubPrx98 658 0 1..330 1..330
AlyPrx58 598 0 1..330 1..329
AhalPrx63 588 0 17..330 1..314
AtPrx58 588 0 1..330 1..329
Literature and cross-references CagraPrx14Cagra.1268s0012
Protein sequence: CagraPrx14Cagra.1268s0012
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   330 (308)
PWM (Da):   %s   35683.24 (33061.8) Transmb domain:   %s   i7-26o
PI (pH):   %s   6.77 (6.77) Peptide Signal:   %s   cut: 23 range:23-330
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MDLSKTLLFI LFSIWILFGV LGNAQLSSDF YSTTCPNATV IARGLIEQAS RGDVRLTAKV MRLHFHDCFV NGCDGSVLLD AAPADGVEGE KEAFQNAGSL GGFEVIDDIK TALENVCPGV  VSCADILAIA AEISVALAGG PSWDVLLGRR DGRTAISADA VATLPLGSDS LHILTSKFSV HNLDTTDLVA LSGAHTFGRV QCRVINNRLH NFSGKKGQSD PTIETKFLQT LLRKCPKGGD 
LTVRVNLDPT SPDSFDNDYF KNLQNNRGVI KSDQILFSST GAPTVSLVNR FAESQSDFYR NFARSMIKMG NIKILTGSEG EIRRECRRVN * 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGACCTAA GCAAAACTCT TCTCTTCATT TTATTCTCGA TTTGGATATT GTTTGGGGTT TTGGGTAATG CTCAGCTTAG CTCTGATTTT TACTCCACGA CCTGTCCTAA CGCAACAGTC  ATCGCTCGGG GTTTGATAGA GCAAGCTAGC CGTGGCGATG TCAGACTCAC TGCTAAAGTC ATGCGTCTTC ACTTTCACGA CTGTTTCGTG AACGTAAGAA CTGTTTCTAC TCATTACAAT  ATATATGTGT GTGCGCTATG CTTTTTTTGG TTTAACAAAA TGAAACCGAT CGTTTGATCC AAACGCGATC TCATAATATT CATGCATATA TGTTATCTAA AAACCAGCTA TAGCACATGT  GAAGTTTATG AATGAAGGCT AACTCATGAC ATGACTTTAC ATATTTGATT AGGCCGCATT TATTTTTATT TTATTTTTAG GTTTAATGGG TTATTAATTG TTCATACTCG TTGTTTCACC  AAAGAAAATA CTTACTCTCG TTGTAACGGA AAATTAAGTT TAGAGTTTTG CATTGGTGGA ATCATTTTTC AAGGTCAAAT TTAAAGTTTC TTGATGTTTT TGATTATATA TGTTTGATAT  AATTTGTCAT CATTAATCTT GGTTTTCATA TTAAGAAAGT ACCGGTCTTT CTTAACCCAA ACTAAAATAT CACTTCTCTT GTTCTTTTTC TCTAATCATA AACTAAGAAA AGTATATATA  TATAGACATA TAATTTGTCA AGAAAACATG ATAATTAGGT CTATTTTGTT AGTGGAATTA GGTGAACATT TGCATACAAT ATTGAAGTAG TAGAGTGTGA AACACAGGGG TGCGATGGTT  CGGTACTATT GGACGCTGCT CCTGCGGATG GAGTAGAGGG TGAGAAGGAG GCTTTCCAAA ACGCTGGTTC TCTTGGCGGA TTTGAAGTGA TTGACGATAT CAAAACAGCC CTCGAGAATG  TTTGCCCTGG AGTGGTCTCT TGTGCCGATA TCCTCGCTAT CGCAGCTGAG ATCTCTGTCG CACTGGTATA TATGTAGTAT AATAACATCA TTTTTCAAAT AATTTTACGT GCTTTTAGAT  TCCCTTTTTA AACCTATGAA AACATAACCT AGTGTATACC AAAAGCTATA TATAATGTTT TCAGAAAATA TTTATATCAT ATTTTAGGCG GGAGGGCCGT CATGGGACGT ATTGCTAGGA  AGGAGAGATG GCCGGACGGC TATCAGTGCG GACGCGGTGG CTACACTTCC ACTAGGATCT GATTCCCTCC ATATTCTTAC TTCCAAATTC TCCGTACATA ATCTTGACAC TACAGATCTC  GTCGCTTTAT CTGGTAATGT ACTTCCGAGT TTTACTATAT ATGTATTTTT TCATATTGGA CACCTCAGAA ATGTGATTGT AATTATAGAG TATAAAGATC AAATACTTGA GTAGTATACT  TTGTTACGAT ATATCTTAAT TAAGGATCAT AATAATGTAC ATGCAGGTGC TCATACCTTC GGGAGGGTTC AGTGTAGAGT GATAAACAAT CGTCTGCACA ATTTTAGTGG TAAGAAGGGA  CAGTCTGATC CGACTATAGA AACGAAGTTC TTGCAAACGT TGCTACGAAA ATGTCCCAAA GGTGGAGATC TCACTGTGAG GGTGAATCTT GATCCTACAA GCCCGGACTC ATTTGATAAC  GACTATTTCA AGAACCTTCA AAACAACCGT GGTGTGATAA AATCAGATCA AATCTTGTTC TCCTCAACGG GAGCGCCAAC TGTATCTTTG GTGAATCGTT TTGCTGAGAG CCAAAGTGAT 
TTCTATAGAA ATTTTGCGAG ATCTATGATC AAGATGGGAA ATATAAAGAT TCTCACAGGA AGTGAGGGAG AGATCCGTAG AGAGTGCAGA AGGGTCAATT AA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGACCTAA GCAAAACTCT TCTCTTCATT TTATTCTCGA TTTGGATATT GTTTGGGGTT TTGGGTAATG CTCAGCTTAG CTCTGATTTT TACTCCACGA CCTGTCCTAA CGCAACAGTC  ATCGCTCGGG GTTTGATAGA GCAAGCTAGC CGTGGCGATG TCAGACTCAC TGCTAAAGTC ATGCGTCTTC ACTTTCACGA CTGTTTCGTG AACGGGTGCG ATGGTTCGGT ACTATTGGAC  GCTGCTCCTG CGGATGGAGT AGAGGGTGAG AAGGAGGCTT TCCAAAACGC TGGTTCTCTT GGCGGATTTG AAGTGATTGA CGATATCAAA ACAGCCCTCG AGAATGTTTG CCCTGGAGTG  GTCTCTTGTG CCGATATCCT CGCTATCGCA GCTGAGATCT CTGTCGCACT GGCGGGAGGG CCGTCATGGG ACGTATTGCT AGGAAGGAGA GATGGCCGGA CGGCTATCAG TGCGGACGCG  GTGGCTACAC TTCCACTAGG ATCTGATTCC CTCCATATTC TTACTTCCAA ATTCTCCGTA CATAATCTTG ACACTACAGA TCTCGTCGCT TTATCTGGTG CTCATACCTT CGGGAGGGTT  CAGTGTAGAG TGATAAACAA TCGTCTGCAC AATTTTAGTG GTAAGAAGGG ACAGTCTGAT CCGACTATAG AAACGAAGTT CTTGCAAACG TTGCTACGAA AATGTCCCAA AGGTGGAGAT  CTCACTGTGA GGGTGAATCT TGATCCTACA AGCCCGGACT CATTTGATAA CGACTATTTC AAGAACCTTC AAAACAACCG TGGTGTGATA AAATCAGATC AAATCTTGTT CTCCTCAACG  GGAGCGCCAA CTGTATCTTT GGTGAATCGT TTTGCTGAGA GCCAAAGTGA TTTCTATAGA AATTTTGCGA GATCTATGAT CAAGATGGGA AATATAAAGA TTCTCACAGG AAGTGAGGGA 
GAGATCCGTA GAGAGTGCAG AAGGGTCAAT TAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGACCTAA GCAAAACTCT TCTCTTCATT TTATTCTCGA TTTGGATATT GTTTGGGGTT TTGGGTAATG CTCAGCTTAG CTCTGATTTT TACTCCACGA CCTGTCCTAA CGCAACAGTC  ATCGCTCGGG GTTTGATAGA GCAAGCTAGC CGTGGCGATG TCAGACTCAC TGCTAAAGTC ATGCGTCTTC ACTTTCACGA CTGTTTCGTG AACGGGTGCG ATGGTTCGGT ACTATTGGAC  GCTGCTCCTG CGGATGGAGT AGAGGGTGAG AAGGAGGCTT TCCAAAACGC TGGTTCTCTT GGCGGATTTG AAGTGATTGA CGATATCAAA ACAGCCCTCG AGAATGTTTG CCCTGGAGTG  GTCTCTTGTG CCGATATCCT CGCTATCGCA GCTGAGATCT CTGTCGCACT GGCGGGAGGG CCGTCATGGG ACGTATTGCT AGGAAGGAGA GATGGCCGGA CGGCTATCAG TGCGGACGCG  GTGGCTACAC TTCCACTAGG ATCTGATTCC CTCCATATTC TTACTTCCAA ATTCTCCGTA CATAATCTTG ACACTACAGA TCTCGTCGCT TTATCTGGTG CTCATACCTT CGGGAGGGTT  CAGTGTAGAG TGATAAACAA TCGTCTGCAC AATTTTAGTG GTAAGAAGGG ACAGTCTGAT CCGACTATAG AAACGAAGTT CTTGCAAACG TTGCTACGAA AATGTCCCAA AGGTGGAGAT  CTCACTGTGA GGGTGAATCT TGATCCTACA AGCCCGGACT CATTTGATAA CGACTATTTC AAGAACCTTC AAAACAACCG TGGTGTGATA AAATCAGATC AAATCTTGTT CTCCTCAACG  GGAGCGCCAA CTGTATCTTT GGTGAATCGT TTTGCTGAGA GCCAAAGTGA TTTCTATAGA AATTTTGCGA GATCTATGAT CAAGATGGGA AATATAAAGA TTCTCACAGG AAGTGAGGGA 
GAGATCCGTA GAGAGTGCAG AAGGGTCAAT TAA 

Retrieve as FASTA