Entry information : CagraPrx36 (Cagra.0027s0009)
Entry ID 14882
Creation 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Sequence status partial
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CagraPrx36 (Cagra.0027s0009)
Name (synonym) CagraPrx36 (Cagra.0027s0009)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx004]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella grandiflora    [TaxId: 264402 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CagraPrx36
start..stop
S start..stop
CrubPrx71 382 9e-136 10..205 113..338
CrubPrx61 378 5e-134 10..205 112..337
AtPrx15 376 2e-133 10..205 113..338
AhalPrx05 373 4e-132 10..205 114..339
Literature and cross-references CagraPrx36 (Cagra.0027s0009)
Protein sequence: CagraPrx36 (Cagra.0027s0009)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   205
PWM (Da):   %s   22300.91  
PI (pH):   %s   4.55
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MSRVKTISAI VDEIKAALES ECPNTVSCAD ALTLAARDSS VLTGGPSWTV PLGRRDSTSA SLSGSNNNIP APNNTFNTIV SRFNNQGLDL TDVVALSEQS YAANLRQRCP KSGGDQNLSE 
LDINSAGRFD NSYFKNLIEN MGLLNSDEVL FSSNEQSREL VKKYAEDQEE FFEQFAESMV KMGNISPLTG SSGEIRKNCR KINNS* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Partial sequence from genomic. 5'end is missing due to N in the sequence.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCAAGAG TCAAAACTAT TAGTGCAAGT AGGACTCGCA CACGCGTTGA AGTGTTCGTA GTTTTTTTTC TTTATATGAT TTGCTTTTTA CCTGCATATC CATGTTCTAT ATGATAGAAG  ACAAAACCTC TTTTGCATAT TTTATTCTTT ATAAGTCAAC AAACAAATGA AATTTTTGAG TTTTCGCATT TTTTTCAATA GAGCAGTTAG AAACTGTTCC TACTCTATCC CTTTTTAGTT  ATTTTTTTAT CACACAAAAG ATGACTTGTG AAATCTTCAC AAACATAACC ACGACCAAGT AACTATACAA TGCATGTTTT TTAATAGTTA AGTGTCAAGA ATTTTTTAAA AACGCGTTTA  AGATTTGCTG CGTGCCTTGT GAGTTGTGGC CGAATCACCA TTTGTAAATA ATTATATTAA TATAGTTCAT TCAACCACGA CCAAGTAAAT AATCAGTAAT AATCACCATA TTTGCTAGAC  TATTACTTAA CCACGACCAA GTAAAACTAT ACAAGACATT GTATTTGGCT AAATAGCTAG GTTTAAATGT TAAGTGTCAA GAATTAAAAA GCGCCTTAAA GATTTGCCGA GTGCTAATTG  TGACCCAATC ACCATAATTA TATCTATACT AGTTCATATG TTAACCTATT AATTAATCAT CACTTTTAAC TTTTGGTTTT ATTTTGGTTC TATTTTGGTT CTATCAACAT TAAATGTAGT  GTTCACTTTA TAAAAACCTT AATAACAAAA ACAAATTAAA CTATTAAAAT AACCAAAATG GAGGTGAAAT AGTCAAACAA CTCATGCAAG TTTGGGACAT TTGGATACCA AACCCAAGAT  TTTGTATAGT CTCTTTGAAT TCAAACCATT TATTTCAATA TACATATTGT CATTTAAATT TTTTATTTAT CTGAATGAAT TGACTCCAAT CAAGGTACCA ACTCTACTGC GTTTGCTTTT  TCCTCTCATG ACGCCAGAAT CCACGAACTC TCTCGTCTAT ATATACTTTC GATnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnGAAGT  TGTTGACGAG ATCAAAGCTG CATTGGAGAG TGAATGCCCT AACACTGTTT CTTGTGCTGA CGCCTTAACT CTAGCTGCTA GAGACTCCTC TGTTCTTGTA AGTCATTTTC TTTTTAAGCC  TCTGTCTCTA TTGCTTATTC AAAATTTTCA AGATCTGATT TGGTATGGTT TGGTTTGTGT TTAGACTGGT GGACCAAGCT GGACGGTTCC TTTGGGAAGA AGAGATTCCA CAAGTGCAAG  TTTGAGTGGA TCAAACAACA ACATCCCTGC ACCTAACAAC ACTTTCAACA CAATTGTATC GAGATTTAAC AATCAAGGTC TTGACCTCAC TGACGTTGTT GCTCTCTCCG GTAAGCTTAC  TTCACACACA AGCCATAATA Tnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnGTTTC AGACAAAGAC TTTACAACCA ATCTGGAAAC GGAAGTCCCG ACACAACCTT AGAGCAATCC TACGCTGCAA ACTTGCGCCA AAGGTGCCCT AAGTCCGGTG  GGGATCAGAA CCTGTCGGAG CTTGACATCA ACAGTGCCGG GAGGTTTGAT AACAGCTACT TCAAGAACTT GATCGAGAAC ATGGGACTGT TAAATTCCGA CGAAGTCTTG TTCTCTAGCA  ATGAACAATC GAGAGAGCTT GTGAAGAAGT ATGCAGAGGA TCAAGAAGAG TTCTTTGAGC AGTTCGCAGA ATCGATGGTT AAGATGGGAA ACATCTCTCC CTTGACAGGT TCGAGTGGTG 
AGATCAGGAA GAATTGCAGG AAGATTAATA ACTCTTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCAAGAG TCAAAACTAT TAGTGCAATT GTTGACGAGA TCAAAGCTGC ATTGGAGAGT GAATGCCCTA ACACTGTTTC TTGTGCTGAC GCCTTAACTC TAGCTGCTAG AGACTCCTCT  GTTCTTACTG GTGGACCAAG CTGGACGGTT CCTTTGGGAA GAAGAGATTC CACAAGTGCA AGTTTGAGTG GATCAAACAA CAACATCCCT GCACCTAACA ACACTTTCAA CACAATTGTA  TCGAGATTTA ACAATCAAGG TCTTGACCTC ACTGACGTTG TTGCTCTCTC CGAGCAATCC TACGCTGCAA ACTTGCGCCA AAGGTGCCCT AAGTCCGGTG GGGATCAGAA CCTGTCGGAG  CTTGACATCA ACAGTGCCGG GAGGTTTGAT AACAGCTACT TCAAGAACTT GATCGAGAAC ATGGGACTGT TAAATTCCGA CGAAGTCTTG TTCTCTAGCA ATGAACAATC GAGAGAGCTT  GTGAAGAAGT ATGCAGAGGA TCAAGAAGAG TTCTTTGAGC AGTTCGCAGA ATCGATGGTT AAGATGGGAA ACATCTCTCC CTTGACAGGT TCGAGTGGTG AGATCAGGAA GAATTGCAGG 
AAGATTAATA ACTCTTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCAAGAG TCAAAACTAT TAGTGCAATT GTTGACGAGA TCAAAGCTGC ATTGGAGAGT GAATGCCCTA ACACTGTTTC TTGTGCTGAC GCCTTAACTC TAGCTGCTAG AGACTCCTCT  GTTCTTACTG GTGGACCAAG CTGGACGGTT CCTTTGGGAA GAAGAGATTC CACAAGTGCA AGTTTGAGTG GATCAAACAA CAACATCCCT GCACCTAACA ACACTTTCAA CACAATTGTA  TCGAGATTTA ACAATCAAGG TCTTGACCTC ACTGACGTTG TTGCTCTCTC CGAGCAATCC TACGCTGCAA ACTTGCGCCA AAGGTGCCCT AAGTCCGGTG GGGATCAGAA CCTGTCGGAG  CTTGACATCA ACAGTGCCGG GAGGTTTGAT AACAGCTACT TCAAGAACTT GATCGAGAAC ATGGGACTGT TAAATTCCGA CGAAGTCTTG TTCTCTAGCA ATGAACAATC GAGAGAGCTT  GTGAAGAAGT ATGCAGAGGA TCAAGAAGAG TTCTTTGAGC AGTTCGCAGA ATCGATGGTT AAGATGGGAA ACATCTCTCC CTTGACAGGT TCGAGTGGTG AGATCAGGAA GAATTGCAGG 
AAGATTAATA ACTCTTGA 

Retrieve as FASTA