Entry information : CagraPrx44Cagra.0914s0023
Entry ID 14890
Creation 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CagraPrx44Cagra.0914s0023
Name CagraPrx44Cagra.0914s0023
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx007]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella grandiflora    [TaxId: 264402 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CagraPrx44
start..stop
S start..stop
CrubPrx110 675 0 1..330 1..330
AtPrx25 651 0 1..330 14..341
BstrPrx81 645 0 1..330 1..326
AlyPrx25 632 0 1..330 1..326
Literature and cross-references CagraPrx44Cagra.0914s0023
Protein sequence: CagraPrx44Cagra.0914s0023
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   330 (307)
PWM (Da):   %s   36122.39 (33436.9) Transmb domain:   %s   i5-22o
PI (pH):   %s   7.93 (7.72) Peptide Signal:   %s   cut: 24 range:24-330
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGVYLGKYCY VMIILVLVML VLGKEVRSQS LKNGYYSTSC PKAESIVRST VQSHFDSDPT ISPGLLRLHF HDCFVQGCDG SVLIKGKSAE QAALANLGLR GMEVIDDAKS RLESVCPGVV  SCADILALAA RDSVDLSDGP SWRVPTGRKD GRISLATEAS NLPSPFDSVA VQKQKFQDKG LDTHDLVTLL GAHTIGQTDC LFFRYRLYNF TVTGNSDPTI SPSFLTQLKT LCPPNGDGSK 
RVALDIGSPS KFDESFYKNL RDGNAILESD QRLWSDAETN ALVKKYASRL RGLLGFRFDY EFGKAMIKMS SIDVKTDVDG EVRKVCSKVN * 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GGTTGTGATG GGTCGGTTTT AATCAAAGGG AAATCTGCGG AGCAAGCTGC TCTAGCGAAC CTCGGTCTAA GAGGGATGGA AGTGATCGAT GATGCAAAAT CCAGGCTCGA GTCCGTGTGT  CCAGGAGTTG TGTCATGCGC AGACATACTT GCACTTGCAG CTCGTGACTC TGTTGACTTG GTACGCAAGT TTACTAATTA ATTCCTTTGG TAGTTTTTCC AATTACTATA TATCACCTGA  GTATGCCGTA TATATGGGAA ACAAGAGTGA TGGGCCAAGC TGGCGAGTAC CAACGGGGCG TAAGGACGGG AGAATCTCGT TGGCGACGGA AGCATCGAAT CTACCTTCGC CATTTGACTC  TGTTGCTGTT CAAAAGCAAA AGTTTCAAGA TAAAGGATTG GATACTCATG ATCTCGTTAC TCTACTCGGT ATATTTATCA ATCTATATTT TTCTTTTTAC AAAATGAAAA CTTTAAAATC  ATTATTTTTA TATTTCTTGT TAAGTTTCTT TATTTTATAT TTTTTCATAT TTAAACTCTA TACATACGTT CAGAAGAAAC ATAAGTAGAG TTCCTTCAAA ATTTTGAAGG TCAGGTATGT  CTGCACTAGA CATCACATGC CAACATGAAA AAAGTTAAAA TCGTGCAAGT GACTACAAGT TGGAGTGAAC CTTATCTGTT TCGTTTTATT GATACTCTTT TGAAATTTGA GCAAAAGCTA  TACATCAGGT TGTAGTTTAT TGTTGTTGGT TCAAGGAAAG ATCGATCAAA ATGGAAACAA CAGCTTTGCC ATCGTCTTAC TGAATATAGA TTAAGAAAAT TACTAAACCG GTATATTGGT  CGTGTATATT ATCTTAAGTA GGCTTATAAG CTTTTGTTCA ATAATTATTT GAAGTTAAAG AAAAATTAAG TTTGAAAAGG TTAACACGTC GATACAAAAC TTTTTCCTGT CAACTAATTT  TTTCGAAAAG AGTAAATTTA TAACCTCATA TTTTGTTATA GCCTCATATT TTGTTATAAA ACTGAAGTTT ACAAAAATTT GAGACATCCT TTTTCTATTC TTTATTTATT TTGGATAAGA  GAACATTTGA GAAATCCTTG CTATTAGGCC ATCTTAAGTT CTTATAGAGT AATTAACTAA ACGTAGTTGC ATGTTCTTAT TGAACATGCC ATGAATTGTT TCTCTGATCC ATTATATTCA  GCTTTTTCCC CTCCAATTGT AGTTTGTATC TCTATAAAAA TGTCTAAAAT TTAATGAGGA CAGGTGCACA TACAATAGGA CAAACGGACT GTCTCTTCTT CCGTTACCGT CTATACAACT  TTACGGTGAC CGGAAACTCC GACCCAACCA TAAGCCCATC GTTTCTCACA CAGCTCAAGA CTCTTTGTCC TCCCAATGGA GACGGTTCTA AACGTGTTGC TCTTGACATC GGCAGTCCCT  CGAAATTCGA TGAAAGTTTC TACAAGAACT TACGCGACGG CAACGCTATT CTAGAGTCGG ACCAACGGCT TTGGTCCGAT GCCGAGACGA ATGCCTTGGT AAAAAAGTAT GCGAGTCGTC  TTAGAGGTTT GTTAGGGTTT AGGTTTGATT ATGAGTTTGG TAAAGCTATG ATTAAGATGA GTTCCATTGA TGTAAAGACA GATGTTGATG GTGAGGTTAG GAAAGTTTGT TCCAAGGTGA 
ACTAGTAGGT TCAATGACAA ACTTAGTAAA ATGAATAAAG ACACTCTATG TTTCAGAATT CAGAGTTTAT ATTATTGAAT ATTCCGTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGAGTGT ACTTAGGCAA GTATTGTTAT GTAATGATAA TACTAGTATT AGTCATGTTG GTGTTGGGAA AAGAAGTTAG AAGCCAATCG TTAAAAAATG GTTATTATTC AACTTCATGT  CCAAAAGCTG AGTCGATAGT AAGATCCACT GTTCAATCTC ATTTTGATTC TGATCCCACA ATTTCCCCTG GCTTGCTTAG GCTTCATTTC CATGACTGTT TTGTTCAGGG TTGTGATGGG  TCGGTTTTAA TCAAAGGGAA ATCTGCGGAG CAAGCTGCTC TAGCGAACCT CGGTCTAAGA GGGATGGAAG TGATCGATGA TGCAAAATCC AGGCTCGAGT CCGTGTGTCC AGGAGTTGTG  TCATGCGCAG ACATACTTGC ACTTGCAGCT CGTGACTCTG TTGACTTGAG TGATGGGCCA AGCTGGCGAG TACCAACGGG GCGTAAGGAC GGGAGAATCT CGTTGGCGAC GGAAGCATCG  AATCTACCTT CGCCATTTGA CTCTGTTGCT GTTCAAAAGC AAAAGTTTCA AGATAAAGGA TTGGATACTC ATGATCTCGT TACTCTACTC GGTGCACATA CAATAGGACA AACGGACTGT  CTCTTCTTCC GTTACCGTCT ATACAACTTT ACGGTGACCG GAAACTCCGA CCCAACCATA AGCCCATCGT TTCTCACACA GCTCAAGACT CTTTGTCCTC CCAATGGAGA CGGTTCTAAA  CGTGTTGCTC TTGACATCGG CAGTCCCTCG AAATTCGATG AAAGTTTCTA CAAGAACTTA CGCGACGGCA ACGCTATTCT AGAGTCGGAC CAACGGCTTT GGTCCGATGC CGAGACGAAT  GCCTTGGTAA AAAAGTATGC GAGTCGTCTT AGAGGTTTGT TAGGGTTTAG GTTTGATTAT GAGTTTGGTA AAGCTATGAT TAAGATGAGT TCCATTGATG TAAAGACAGA TGTTGATGGT 
GAGGTTAGGA AAGTTTGTTC CAAGGTGAAC TAG 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CAACATCACA CATAGAAAAA AAAAGAGTAA GTAAGAAAAA TGGGAGTGTA CTTAGGCAAG TATTGTTATG TAATGATAAT ACTAGTATTA GTCATGTTGG TGTTGGGAAA AGAAGTTAGA  AGCCAATCGT TAAAAAATGG TTATTATTCA ACTTCATGTC CAAAAGCTGA GTCGATAGTA AGATCCACTG TTCAATCTCA TTTTGATTCT GATCCCACAA TTTCCCCTGG CTTGCTTAGG  CTTCATTTCC ATGACTGTTT TGTTCAGGGT TGTGATGGGT CGGTTTTAAT CAAAGGGAAA TCTGCGGAGC AAGCTGCTCT AGCGAACCTC GGTCTAAGAG GGATGGAAGT GATCGATGAT  GCAAAATCCA GGCTCGAGTC CGTGTGTCCA GGAGTTGTGT CATGCGCAGA CATACTTGCA CTTGCAGCTC GTGACTCTGT TGACTTGAGT GATGGGCCAA GCTGGCGAGT ACCAACGGGG  CGTAAGGACG GGAGAATCTC GTTGGCGACG GAAGCATCGA ATCTACCTTC GCCATTTGAC TCTGTTGCTG TTCAAAAGCA AAAGTTTCAA GATAAAGGAT TGGATACTCA TGATCTCGTT  ACTCTACTCG GTGCACATAC AATAGGACAA ACGGACTGTC TCTTCTTCCG TTACCGTCTA TACAACTTTA CGGTGACCGG AAACTCCGAC CCAACCATAA GCCCATCGTT TCTCACACAG  CTCAAGACTC TTTGTCCTCC CAATGGAGAC GGTTCTAAAC GTGTTGCTCT TGACATCGGC AGTCCCTCGA AATTCGATGA AAGTTTCTAC AAGAACTTAC GCGACGGCAA CGCTATTCTA  GAGTCGGACC AACGGCTTTG GTCCGATGCC GAGACGAATG CCTTGGTAAA AAAGTATGCG AGTCGTCTTA GAGGTTTGTT AGGGTTTAGG TTTGATTATG AGTTTGGTAA AGCTATGATT  AAGATGAGTT CCATTGATGT AAAGACAGAT GTTGATGGTG AGGTTAGGAA AGTTTGTTCC AAGGTGAACT AGTAGGTTCA ATGACAAACT TAGTAAAATG AATAAAGACA CTCTATGTTT 
CAGAATTCAG AGTTTATATT ATTGAATATT CCGTAA 

Retrieve as FASTA