Entry information : CagraPrx49Cagra.1268s0011
Entry ID 14895
Creation 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CagraPrx49Cagra.1268s0011
Name CagraPrx49Cagra.1268s0011
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx022]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella grandiflora    [TaxId: 264402 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CagraPrx49
start..stop
S start..stop
CrubPrx72 667 0 1..329 1..329
BstrPrx86 601 0 1..329 1..328
AruPrx06 593 0 1..328 1..327
TsPrx59 590 0 1..329 1..331
Literature and cross-references CagraPrx49Cagra.1268s0011
Protein sequence: CagraPrx49Cagra.1268s0011
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   329 (300)
PWM (Da):   %s   35348.98 (32038.2)  
PI (pH):   %s   8.09 (7.20) Peptide Signal:   %s   cut: 30 range:30-329
Sequence
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Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKTQTSKVMG GHVLLTVFTL FMLYSGVRAQ LNPDIYAKSC PSLVQIVRNQ VSIAMNAEKR IAASLIRLHF HDCFVNGCDA SILLDGTDSE KLAIPNVNSV RGFEVIDTIK AAVEKACPGV  VSCADILTLA ARDSVCLSGG PRWRVALGRK DGLVANQNSA NNLPSPFEPL DSIIAKFVAV GLNTTDVVAL SGAHTFGQAK CDLFSNRLFN FTGAGTPDVT LETSLLSNLR SVCPVGGNGN 
ITAPFDPNSV DAFDNNYFKN LLQGKGLLSS DQILFSSDLA VNTTKSLVEA YSRSQYLFFR DFTCSMIRMG NIANGASGEV RRNCRVINN* 

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Remarks
DNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAAACAC AAACGTCCAA GGTGATGGGA GGACATGTCT TGCTTACTGT TTTCACTCTA TTTATGCTTT ATTCAGGGGT TAGGGCACAG CTAAACCCTG ACATATATGC TAAATCATGC  CCCTCTCTTG TACAAATTGT CCGTAACCAA GTTAGCATCG CCATGAATGC CGAAAAACGG ATTGCTGCTT CTCTCATTCG TCTTCATTTC CACGACTGTT TTGTTAATGT AAGTACTGTT  GTCTTTTTTT ACGTGTATGT TTTTCTATTA AAAAAATATT TACATATGTT AAAAATTGTT ACATTAAATG CCCCAAACAC CTGGAATCAG TTTCCTAAAG CGTACGTAGC ATGAAAATTT  CAGGGGTGTG ATGCGTCTAT ATTGTTGGAT GGAACGGATA GTGAGAAACT CGCGATCCCA AACGTGAACT CTGTGAGAGG ATTTGAAGTA ATTGATACTA TCAAAGCCGC TGTGGAAAAA  GCATGTCCTG GTGTTGTTTC TTGTGCTGAT ATCCTTACTT TGGCCGCTCG TGACTCGGTT TGCTTGGTAA GCCTTTCCTG TTCCCACTTA ACAGCCATCT TAACCTTGAT ATATTATTAG  TTGTTCCTTA ATTATAACAC GAGAGTTACA GCTCTTACGG GACAACTATT TATATAATAT GACCAAGGTG GTGATTATAT TTAGTAACAA AAACAAATGG TTAGGTTAAG TTTAATTAAT  GATTGTCTTT TTGCGGTTGA AATATTTAAA CAATAATATA TGTAAATAAA TTTTCTTTCT TTTTTTGTCG ATAACTTAAT CACGGGTTAT GAATTTTGAT GTGCAGAGCG GAGGGCCAAG  GTGGAGAGTG GCATTAGGAA GAAAAGATGG ATTGGTAGCA AATCAGAACA GTGCAAACAA TCTCCCATCT CCTTTTGAAC CTTTAGACTC TATCATTGCC AAGTTTGTAG CCGTAGGCCT  TAACACCACC GACGTCGTAG CCTTATCAGG TTGTTAACTC ATCTCCCTAA TTATACATAA ACCTTAATTA GTTAGTTAAT AGCTCTTTTT CTCTTGTGAG TTACTGATGC ATGCCTTTTT  TATTAAATAT ATATATAAAG GAGCTCACAC CTTTGGACAA GCAAAGTGTG ATCTCTTCAG CAACCGTCTG TTCAACTTCA CAGGCGCGGG AACCCCGGAC GTAACACTTG AGACATCACT  GTTGTCTAAT CTAAGATCAG TTTGTCCCGT GGGAGGTAAT GGAAACATAA CAGCTCCTTT TGACCCGAAC TCTGTGGACG CCTTCGACAA CAACTATTTC AAGAACCTAC TCCAAGGGAA  AGGTCTTTTA AGCTCTGATC AGATTCTGTT CTCGAGTGAC TTGGCCGTGA ACACCACAAA GAGTCTAGTG GAGGCTTATA GTCGGAGCCA GTACTTGTTT TTCAGGGACT TCACTTGTTC 
GATGATCAGA ATGGGGAATA TTGCGAATGG AGCTAGTGGG GAGGTTAGAA GAAACTGCAG GGTTATCAAT AATTAG 

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CDS
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAAACAC AAACGTCCAA GGTGATGGGA GGACATGTCT TGCTTACTGT TTTCACTCTA TTTATGCTTT ATTCAGGGGT TAGGGCACAG CTAAACCCTG ACATATATGC TAAATCATGC  CCCTCTCTTG TACAAATTGT CCGTAACCAA GTTAGCATCG CCATGAATGC CGAAAAACGG ATTGCTGCTT CTCTCATTCG TCTTCATTTC CACGACTGTT TTGTTAATGG GTGTGATGCG  TCTATATTGT TGGATGGAAC GGATAGTGAG AAACTCGCGA TCCCAAACGT GAACTCTGTG AGAGGATTTG AAGTAATTGA TACTATCAAA GCCGCTGTGG AAAAAGCATG TCCTGGTGTT  GTTTCTTGTG CTGATATCCT TACTTTGGCC GCTCGTGACT CGGTTTGCTT GAGCGGAGGG CCAAGGTGGA GAGTGGCATT AGGAAGAAAA GATGGATTGG TAGCAAATCA GAACAGTGCA  AACAATCTCC CATCTCCTTT TGAACCTTTA GACTCTATCA TTGCCAAGTT TGTAGCCGTA GGCCTTAACA CCACCGACGT CGTAGCCTTA TCAGGAGCTC ACACCTTTGG ACAAGCAAAG  TGTGATCTCT TCAGCAACCG TCTGTTCAAC TTCACAGGCG CGGGAACCCC GGACGTAACA CTTGAGACAT CACTGTTGTC TAATCTAAGA TCAGTTTGTC CCGTGGGAGG TAATGGAAAC  ATAACAGCTC CTTTTGACCC GAACTCTGTG GACGCCTTCG ACAACAACTA TTTCAAGAAC CTACTCCAAG GGAAAGGTCT TTTAAGCTCT GATCAGATTC TGTTCTCGAG TGACTTGGCC  GTGAACACCA CAAAGAGTCT AGTGGAGGCT TATAGTCGGA GCCAGTACTT GTTTTTCAGG GACTTCACTT GTTCGATGAT CAGAATGGGG AATATTGCGA ATGGAGCTAG TGGGGAGGTT 
AGAAGAAACT GCAGGGTTAT CAATAATTAG 

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cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAAACAC AAACGTCCAA GGTGATGGGA GGACATGTCT TGCTTACTGT TTTCACTCTA TTTATGCTTT ATTCAGGGGT TAGGGCACAG CTAAACCCTG ACATATATGC TAAATCATGC  CCCTCTCTTG TACAAATTGT CCGTAACCAA GTTAGCATCG CCATGAATGC CGAAAAACGG ATTGCTGCTT CTCTCATTCG TCTTCATTTC CACGACTGTT TTGTTAATGG GTGTGATGCG  TCTATATTGT TGGATGGAAC GGATAGTGAG AAACTCGCGA TCCCAAACGT GAACTCTGTG AGAGGATTTG AAGTAATTGA TACTATCAAA GCCGCTGTGG AAAAAGCATG TCCTGGTGTT  GTTTCTTGTG CTGATATCCT TACTTTGGCC GCTCGTGACT CGGTTTGCTT GAGCGGAGGG CCAAGGTGGA GAGTGGCATT AGGAAGAAAA GATGGATTGG TAGCAAATCA GAACAGTGCA  AACAATCTCC CATCTCCTTT TGAACCTTTA GACTCTATCA TTGCCAAGTT TGTAGCCGTA GGCCTTAACA CCACCGACGT CGTAGCCTTA TCAGGAGCTC ACACCTTTGG ACAAGCAAAG  TGTGATCTCT TCAGCAACCG TCTGTTCAAC TTCACAGGCG CGGGAACCCC GGACGTAACA CTTGAGACAT CACTGTTGTC TAATCTAAGA TCAGTTTGTC CCGTGGGAGG TAATGGAAAC  ATAACAGCTC CTTTTGACCC GAACTCTGTG GACGCCTTCG ACAACAACTA TTTCAAGAAC CTACTCCAAG GGAAAGGTCT TTTAAGCTCT GATCAGATTC TGTTCTCGAG TGACTTGGCC  GTGAACACCA CAAAGAGTCT AGTGGAGGCT TATAGTCGGA GCCAGTACTT GTTTTTCAGG GACTTCACTT GTTCGATGAT CAGAATGGGG AATATTGCGA ATGGAGCTAG TGGGGAGGTT 
AGAAGAAACT GCAGGGTTAT CAATAATTAG 

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