Entry information : CagraPrx56Cagra.7999s0005
Entry ID 14902
Creation 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CagraPrx56Cagra.7999s0005
Name CagraPrx56Cagra.7999s0005
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx016]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella grandiflora    [TaxId: 264402 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CagraPrx56
start..stop
S start..stop
CrubPrx43 658 0 1..317 1..317
BstrPrx12 648 0 1..317 1..317
AlyPrx64 636 0 1..317 1..317
AhalPrx17 635 0 1..317 1..317
Literature and cross-references CagraPrx56Cagra.7999s0005
Protein sequence: CagraPrx56Cagra.7999s0005
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   317 (295)
PWM (Da):   %s   34616.54 (31990.1)  
PI (pH):   %s   8.74 (8.91) Peptide Signal:   %s   cut: 23 range:23-317
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MNAHFFNVLL IVILVVSFDV QALSPHYYDH SCPQADHIVT NAVKKAMSND KTVPAALLRM HFHDCFVRGC DGSVLLDSKG KNKAEKDGPP NISLHAFYVI DNAKKVLEEQ CPGIVSCADI  LSLAARDAVA LSGGPTWAVP KGRKDGRISK AIETRQLPAP TFNISQLRQN FGQRGLSMHD LVVLSGGHTL GFAHCSSFQN RLHNFNTQKE VDPTLNPSFA ASLEGVCPAH NTVKNAGSTL 
DGTVSSFDNI YYRMLMQGKS LFSSDEALLA VPSTKKLVAK YASSNEEFER AFVKSMIKMS SISGNGNEVR LNCRRVR* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AAAATCTTGT CCATGTTTCA TCACATAAGC CACCCAACAA ATTCTCTAAA TACATTCCTT TTCACTCAAG AAAGATTTTG ATAATTCCGA ATTCGAAAAT TCCAAAATGA ATGCACATTT  TTTCAATGTC CTTCTCATTG TCATCTTAGT GGTTTCTTTT GACGTCCAAG CACTTAGTCC TCACTACTAC GACCATTCAT GTCCACAAGC TGACCACATT GTCACCAATG CAGTCAAGAA  GGCCATGTCA AACGACAAAA CAGTCCCAGC CGCGCTCTTA AGGATGCATT TCCACGACTG CTTCGTCAGA GTACTAACTA CTTTACACAC AACATTCTCT TGCCATCTTT CAATGTCATA  TGTGTTTATA CTCTTAATAA CTTGAATATA TATGTTTGAT CTTTAAAGGG ATGTGATGGG TCAGTTCTAT TAGACTCAAA GGGTAAGAAC AAAGCAGAGA AAGATGGACC TCCTAACATC  TCACTCCATG CGTTTTATGT GATTGACAAT GCAAAAAAGG TATTAGAAGA GCAATGCCCT GGTATTGTCT CTTGCGCCGA CATTCTTTCA CTCGCTGCAA GAGATGCGGT CGCTCTCGTG  AGTGATCTCT CTATCTCATA TTCCAAATAC TACCTCTTCT TTGATGATTT GATGATTGAT CCACTCAAAA CATTCATTTT GGGTGTTGTT ATAGTCAGGA GGGCCGACAT GGGCTGTGCC  TAAAGGGAGA AAAGATGGAA GAATATCAAA GGCAATAGAA ACAAGACAAC TACCAGCTCC TACTTTCAAC ATCTCTCAAC TACGTCAAAA CTTTGGCCAA AGAGGCCTCT CTATGCATGA  TCTTGTTGTT CTCTCTGGTA TTCTACATTT CTCCCCTTAA CCTAAAATAT ATATACAAAG CTATATTGAA AAATCTTGTT AGTATCCTTA GAGATGTGAC ATAAATATAT GAAACAAAAA  TTTCTTAAAC TAAGTGGATA TGTACACAAT CTAGAAACTA GGTGGATTTT TACAGTTTCG ATGATCTTAC TTATTTATGT GAAGTAATAT AAATTGTGAA TGTTGAATGA AATGACAGGG  GGACATACAC TAGGATTTGC CCACTGCTCA TCGTTCCAGA ATAGGCTCCA CAACTTCAAC ACCCAAAAGG AGGTTGACCC AACACTAAAC CCGTCGTTTG CAGCCAGCTT GGAGGGAGTG  TGCCCAGCCC ATAACACGGT GAAGAACGCT GGATCGACCT TGGATGGAAC CGTGTCATCA TTCGACAATA TCTACTACAG GATGCTTATG CAAGGCAAGT CACTGTTCTC ATCTGACGAA  GCGCTTCTCG CAGTGCCCTC TACTAAGAAA CTTGTGGCCA AGTACGCAAG TTCCAACGAA GAGTTCGAGA GGGCTTTTGT AAAATCCATG ATCAAGATGA GTAGTATCAG TGGGAATGGT  AATGAGGTCA GACTTAACTG CAGAAGGGTT CGCTAGAATC TCAATCTACG CTTCCATCAG CAAGTTACTA CATTCATGTC TCTCTTTCTC TTGTCACATT GATTACTTGT AATGAGCCTT 
TCTAAAGATT AAGGCAGAGG TTCTTGTATC CTAATTATCT ATCATTCTCT CGTGTGTGCT TGTATAGGCA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAATGCAC ATTTTTTCAA TGTCCTTCTC ATTGTCATCT TAGTGGTTTC TTTTGACGTC CAAGCACTTA GTCCTCACTA CTACGACCAT TCATGTCCAC AAGCTGACCA CATTGTCACC  AATGCAGTCA AGAAGGCCAT GTCAAACGAC AAAACAGTCC CAGCCGCGCT CTTAAGGATG CATTTCCACG ACTGCTTCGT CAGAGGATGT GATGGGTCAG TTCTATTAGA CTCAAAGGGT  AAGAACAAAG CAGAGAAAGA TGGACCTCCT AACATCTCAC TCCATGCGTT TTATGTGATT GACAATGCAA AAAAGGTATT AGAAGAGCAA TGCCCTGGTA TTGTCTCTTG CGCCGACATT  CTTTCACTCG CTGCAAGAGA TGCGGTCGCT CTCTCAGGAG GGCCGACATG GGCTGTGCCT AAAGGGAGAA AAGATGGAAG AATATCAAAG GCAATAGAAA CAAGACAACT ACCAGCTCCT  ACTTTCAACA TCTCTCAACT ACGTCAAAAC TTTGGCCAAA GAGGCCTCTC TATGCATGAT CTTGTTGTTC TCTCTGGGGG ACATACACTA GGATTTGCCC ACTGCTCATC GTTCCAGAAT  AGGCTCCACA ACTTCAACAC CCAAAAGGAG GTTGACCCAA CACTAAACCC GTCGTTTGCA GCCAGCTTGG AGGGAGTGTG CCCAGCCCAT AACACGGTGA AGAACGCTGG ATCGACCTTG  GATGGAACCG TGTCATCATT CGACAATATC TACTACAGGA TGCTTATGCA AGGCAAGTCA CTGTTCTCAT CTGACGAAGC GCTTCTCGCA GTGCCCTCTA CTAAGAAACT TGTGGCCAAG 
TACGCAAGTT CCAACGAAGA GTTCGAGAGG GCTTTTGTAA AATCCATGAT CAAGATGAGT AGTATCAGTG GGAATGGTAA TGAGGTCAGA CTTAACTGCA GAAGGGTTCG CTAG 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AAAATCTTGT CCATGTTTCA TCACATAAGC CACCCAACAA ATTCTCTAAA TACATTCCTT TTCACTCAAG AAAGATTTTG ATAATTCCGA ATTCGAAAAT TCCAAAATGA ATGCACATTT  TTTCAATGTC CTTCTCATTG TCATCTTAGT GGTTTCTTTT GACGTCCAAG CACTTAGTCC TCACTACTAC GACCATTCAT GTCCACAAGC TGACCACATT GTCACCAATG CAGTCAAGAA  GGCCATGTCA AACGACAAAA CAGTCCCAGC CGCGCTCTTA AGGATGCATT TCCACGACTG CTTCGTCAGA GGATGTGATG GGTCAGTTCT ATTAGACTCA AAGGGTAAGA ACAAAGCAGA  GAAAGATGGA CCTCCTAACA TCTCACTCCA TGCGTTTTAT GTGATTGACA ATGCAAAAAA GGTATTAGAA GAGCAATGCC CTGGTATTGT CTCTTGCGCC GACATTCTTT CACTCGCTGC  AAGAGATGCG GTCGCTCTCT CAGGAGGGCC GACATGGGCT GTGCCTAAAG GGAGAAAAGA TGGAAGAATA TCAAAGGCAA TAGAAACAAG ACAACTACCA GCTCCTACTT TCAACATCTC  TCAACTACGT CAAAACTTTG GCCAAAGAGG CCTCTCTATG CATGATCTTG TTGTTCTCTC TGGGGGACAT ACACTAGGAT TTGCCCACTG CTCATCGTTC CAGAATAGGC TCCACAACTT  CAACACCCAA AAGGAGGTTG ACCCAACACT AAACCCGTCG TTTGCAGCCA GCTTGGAGGG AGTGTGCCCA GCCCATAACA CGGTGAAGAA CGCTGGATCG ACCTTGGATG GAACCGTGTC  ATCATTCGAC AATATCTACT ACAGGATGCT TATGCAAGGC AAGTCACTGT TCTCATCTGA CGAAGCGCTT CTCGCAGTGC CCTCTACTAA GAAACTTGTG GCCAAGTACG CAAGTTCCAA  CGAAGAGTTC GAGAGGGCTT TTGTAAAATC CATGATCAAG ATGAGTAGTA TCAGTGGGAA TGGTAATGAG GTCAGACTTA ACTGCAGAAG GGTTCGCTAG AATCTCAATC TACGCTTCCA  TCAGCAAGTT ACTACATTCA TGTCTCTCTT TCTCTTGTCA CATTGATTAC TTGTAATGAG CCTTTCTAAA GATTAAGGCA GAGGTTCTTG TATCCTAATT ATCTATCATT CTCTCGTGTG 
TGCTTGTATA GGCA 

Retrieve as FASTA