Entry information : CagraPrx59 (Cagra.11786s0003)
Entry ID 14905
Creation 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Sequence status partial
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CagraPrx59 (Cagra.11786s0003)
Name (synonym) CagraPrx59 (Cagra.11786s0003)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx018]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella grandiflora    [TaxId: 264402 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CagraPrx59
start..stop
S start..stop
CrubPrx96 584 0 1..337 1..345
CrubPrx47 553 0 1..337 1..345
BstrPrx36 551 0 1..337 1..344
AtPrx37 527 0 1..337 1..346
Literature and cross-references CagraPrx59 (Cagra.11786s0003)
Protein sequence: CagraPrx59 (Cagra.11786s0003)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   337 (315)
PWM (Da):   %s   33635.07 (31178.7)  
PI (pH):   %s   8.35 (8.09) Peptide Signal:   %s   cut: 23 range:23-337
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MSSSLTKLGF VLILLQVSLS HAQLSPSFYD Kxxxxxxxxx xxxxxxxxxx xxxxxxxxxx xxCDASILLD NTTSFRTEKD AFGNAKSARG FDVIDEMKAA VEKACPRTVS CADLLAIAAQ  ESVVLAGGPS WMVPSGRRDS LRGFMDLAND NLPAPFFTLK QLKDSFKKVG LDLPSDLVAL SGGHTFGKNQ CQFIMDRLYN FSSTGKPDPS LDKSYLSTLR KQCPRNGNQS VLVDFDLRTP 
TLFDNKYYVN LKENKGLIQS DQELFSSPDA KDTIPLVRAY ADGQGKFFDA FVKAMIRMGN LSPLTGKQGE IRSNCRVVNS KPRIMDVVDV VDFVSSM* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Partial sequence from genomic. Part of the first exon is missing due to N in the sequence
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGTTCCT CTTTGACAAA ATTAGGATTT GTTCTTATTC TTCTTCAAGT CTCATTGTCT CATGCTCAAC TAAGTCCTTC CTTTTACGAT AAAAnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn ATTATACTTT TGGAACTTTG ATTCTTTATA CTTTATGTTT TGTATATTAA TGGACCAACC ACTTCGATCT CAAAGATATC AATATAGTAT TATTAGCAAC TACTCTACAT  AGATTGCAGT GCATTCTTAT CTCAAGTTTC AGATTCTGTC GTCAAAGATG AGTAGTAAAT AATTACAAAA CTCATATTAT AGATATTTCT ACAATACTAT TTTGAATTAT TAGATTATTA  GGTAGATTTC ATGGCCCATA AATCAATGTG TTTGGCGTAT TAGGTGTCGC ATTAATGTTC TATTCGAATT CACGTGAATA AGTGTATGTA TGCTAGTGAT AGTGTGATAC TAAATTTTAC  TATTTACTTA CGGTAGAAAG GTTAAAAGAA GATGTGATGT ATATTTACTA TTTACTATTG AACAATGTGG TTGGTTTGAC TAACTATGAA GATGTATACT TATGTTTTGG AAATAGGGAT  GTGATGCGTC TATATTGTTA GACAACACAA CATCGTTTAG GACGGAGAAG GACGCGTTTG GGAACGCTAA GTCGGCTCGA GGTTTCGATG TTATCGATGA AATGAAAGCT GCCGTGGAGA  AAGCATGTCC GAGAACAGTT TCATGTGCTG ATTTGCTCGC AATCGCGGCT CAAGAATCTG TCGTTTTGGT ATGAATCTTT TAGTACCATG TTATGCATAT TTGGTTTCTA GACCATTTTG  TTGATGTTTT ACTTTGATAC AATAGGCGGG AGGTCCTTCA TGGATGGTTC CAAGTGGAAG AAGAGATAGC TTAAGAGGTT TTATGGATCT TGCTAATGAT AACCTTCCAG CTCCATTCTT  TACCCTTAAA CAACTTAAGG ATAGCTTCAA AAAAGTCGGA CTCGATCTTC CTTCGGATCT CGTTGCTCTT TCCGGTATGT TATCAATAGA GTTTGAGACG TTTTCATATC TATATATAGT  TGTAATTACT AATAACTCTA TATGGTACTT CCCTTTGTTT AGGTGGTCAC ACCTTTGGCA AAAACCAATG TCAGTTTATA ATGGATCGGC TTTACAACTT CAGTAGCACC GGTAAACCCG  ACCCAAGCCT TGATAAATCT TACCTCAGTA CACTAAGAAA GCAATGTCCG CGTAATGGAA ACCAAAGTGT CTTGGTAGAT TTTGATCTAC GTACGCCAAC ACTCTTTGAC AACAAATACT  ACGTGAATCT CAAAGAGAAC AAAGGTCTTA TTCAGAGCGA CCAAGAGTTA TTCTCAAGCC CTGATGCTAA AGACACTATC CCATTAGTCC GGGCATACGC AGATGGTCAA GGGAAATTTT  TCGACGCGTT CGTTAAGGCA ATGATAAGGA TGGGAAACCT TTCACCATTA ACAGGGAAGC AAGGTGAAAT TAGATCGAAC TGTAGAGTGG TGAATTCGAA ACCGAGAATC ATGGATGTGG 
TTGATGTTGT TGATTTTGTC AGCTCAATGT GATGAAGTGA GTTTCTTGTA ATAATAAAGA TCTTCAAAT 

Retrieve as FASTA