Entry information : CagraPrx75 (Cagra.8204s0001)
Entry ID 14921
Creation 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Sequence status partial
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CagraPrx75 (Cagra.8204s0001)
Name (synonym) CagraPrx75 (Cagra.8204s0001)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx035]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella grandiflora    [TaxId: 264402 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CagraPrx75
start..stop
S start..stop
CrubPrx52 529 0 1..256 91..346
TsPrx09 499 1e-180 1..256 97..352
BrPrx09-1Aa_other 495 2e-179 1..256 92..347
BstrPrx25 489 1e-176 1..256 111..366
Literature and cross-references CagraPrx75 (Cagra.8204s0001)
Protein sequence: CagraPrx75 (Cagra.8204s0001)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   256
PWM (Da):   %s   27771.03  
PI (pH):   %s   6.51
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GCDASILLDD SATIQSEKNA GPNKNSIRGF QVIDEIKAKL EQACPQVVSC ADILALAARG STVLSGGPSW ELPLGRRDSR TASLNGANTN IPAPNSTIQN LLTMFQRKGL NEEDLVSLSG  GHTIGVARCT TFKQRLYNQN GNNQPDETLE RSYYYGLRSI CPPTGGDNNI SPLDLASPAR FDNTYFKLLL WGKGLLTSDE VLITGNVDKT VALVKAYAED ESLFFRQFAK SMVNMGNIQP 
LTGFNGEIRK SCHVIN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Partial sequence from genomic. 5'end is missing due to scaffold border.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GGATGTGATG CATCAATCTT GTTGGATGAT AGTGCTACCA TACAAAGTGA AAAGAACGCA GGACCAAACA AGAACTCCAT TAGAGGGTTT CAAGTCATAG ATGAGATCAA AGCCAAACTG  GAACAAGCTT GTCCTCAAGT TGTCTCATGT GCAGACATTC TTGCTCTTGC TGCTCGTGGT TCAACTGTTC TGGTAAAATA GAGACACCTT CAAGAGATTT GGCTCATGAC TTACAAGTTA  TATAATCTAA TATTGCTAAA GTTGTGGTTC AATACAGAGC GGTGGACCAT CATGGGAGCT TCCACTAGGG AGAAGAGACT CGAGAACAGC GAGCCTCAAC GGCGCAAACA CGAACATCCC  TGCACCTAAC TCAACTATTC AGAACCTCTT AACCATGTTC CAACGCAAAG GTTTAAACGA AGAAGACCTT GTTTCCCTAT CAGGTAAGCT TAATAACATG TATTATTCTT GTTATACAAG  TTATCATGGA AACCTAACCG AGCCGAACTG AATAAACCTA ATTTTTTGTA GGAGGACATA CGATTGGAGT AGCGAGATGC ACAACATTCA AACAAAGACT ATACAACCAA AACGGTAATA  ACCAACCAGA CGAGACACTA GAAAGATCAT ACTACTATGG ACTAAGATCA ATTTGTCCAC CAACGGGAGG GGACAACAAC ATATCACCAC TAGACTTAGC CTCTCCTGCT AGATTCGACA  ACACATACTT CAAACTCCTT CTTTGGGGCA AAGGCTTATT GACATCAGAT GAAGTGCTTA TCACTGGTAA TGTAGACAAG ACTGTTGCAT TGGTTAAAGC TTATGCTGAA GATGAGAGCC 
TTTTCTTCCG ACAGTTTGCA AAGTCTATGG TTAATATGGG GAATATACAG CCTCTTACTG GTTTTAATGG TGAGATTAGA AAGAGTTGTC ATGTGATTAA CTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GGATGTGATG CATCAATCTT GTTGGATGAT AGTGCTACCA TACAAAGTGA AAAGAACGCA GGACCAAACA AGAACTCCAT TAGAGGGTTT CAAGTCATAG ATGAGATCAA AGCCAAACTG  GAACAAGCTT GTCCTCAAGT TGTCTCATGT GCAGACATTC TTGCTCTTGC TGCTCGTGGT TCAACTGTTC TGAGCGGTGG ACCATCATGG GAGCTTCCAC TAGGGAGAAG AGACTCGAGA  ACAGCGAGCC TCAACGGCGC AAACACGAAC ATCCCTGCAC CTAACTCAAC TATTCAGAAC CTCTTAACCA TGTTCCAACG CAAAGGTTTA AACGAAGAAG ACCTTGTTTC CCTATCAGGA  GGACATACGA TTGGAGTAGC GAGATGCACA ACATTCAAAC AAAGACTATA CAACCAAAAC GGTAATAACC AACCAGACGA GACACTAGAA AGATCATACT ACTATGGACT AAGATCAATT  TGTCCACCAA CGGGAGGGGA CAACAACATA TCACCACTAG ACTTAGCCTC TCCTGCTAGA TTCGACAACA CATACTTCAA ACTCCTTCTT TGGGGCAAAG GCTTATTGAC ATCAGATGAA  GTGCTTATCA CTGGTAATGT AGACAAGACT GTTGCATTGG TTAAAGCTTA TGCTGAAGAT GAGAGCCTTT TCTTCCGACA GTTTGCAAAG TCTATGGTTA ATATGGGGAA TATACAGCCT 
CTTACTGGTT TTAATGGTGA GATTAGAAAG AGTTGTCATG TGATTAACTA A 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GGATGTGATG CATCAATCTT GTTGGATGAT AGTGCTACCA TACAAAGTGA AAAGAACGCA GGACCAAACA AGAACTCCAT TAGAGGGTTT CAAGTCATAG ATGAGATCAA AGCCAAACTG  GAACAAGCTT GTCCTCAAGT TGTCTCATGT GCAGACATTC TTGCTCTTGC TGCTCGTGGT TCAACTGTTC TGAGCGGTGG ACCATCATGG GAGCTTCCAC TAGGGAGAAG AGACTCGAGA  ACAGCGAGCC TCAACGGCGC AAACACGAAC ATCCCTGCAC CTAACTCAAC TATTCAGAAC CTCTTAACCA TGTTCCAACG CAAAGGTTTA AACGAAGAAG ACCTTGTTTC CCTATCAGGA  GGACATACGA TTGGAGTAGC GAGATGCACA ACATTCAAAC AAAGACTATA CAACCAAAAC GGTAATAACC AACCAGACGA GACACTAGAA AGATCATACT ACTATGGACT AAGATCAATT  TGTCCACCAA CGGGAGGGGA CAACAACATA TCACCACTAG ACTTAGCCTC TCCTGCTAGA TTCGACAACA CATACTTCAA ACTCCTTCTT TGGGGCAAAG GCTTATTGAC ATCAGATGAA  GTGCTTATCA CTGGTAATGT AGACAAGACT GTTGCATTGG TTAAAGCTTA TGCTGAAGAT GAGAGCCTTT TCTTCCGACA GTTTGCAAAG TCTATGGTTA ATATGGGGAA TATACAGCCT 
CTTACTGGTT TTAATGGTGA GATTAGAAAG AGTTGTCATG TGATTAACTA A 

Retrieve as FASTA