Entry information : BstrPrx10Bostr.15697s0396
Entry ID 14937
Creation 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: BstrPrx10Bostr.15697s0396
Name BstrPrx10Bostr.15697s0396
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx038]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Boechera
Organism Boechera stricta    [TaxId: 72658 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value BstrPrx10
start..stop
S start..stop
NoffPrx07-1B 619 0 1..351 1..350
CrubPrx42 616 0 17..352 16..353
AlyPrx07 616 0 18..351 18..349
CagraPrx71 615 0 17..352 16..353
Literature and cross-references BstrPrx10Bostr.15697s0396
Protein sequence: BstrPrx10Bostr.15697s0396
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   351 (329)
PWM (Da):   %s   38604.63 (36196.2) Transmb domain:   %s   i5-22o
PI (pH):   %s   5.5 (5.27) Peptide Signal:   %s   cut: 23 range:23-351
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKLAVVSVVV LLGILVAWPV SAGRKDLPGA GGYGGDDDDD DDTRSWFPLD NLLSLNYYDR ICPDFEKIVD NKVRAWTKVD ASLGPALLRL IFHDCGVTGC DASVLLDYEG TERRSPASKT  LRGFELIDDI KSEIEKSCPG LVSCADILTA ASRAATVQLG GPYWPNAYGR RDSKNSYARD VEKVPSGRRD VTALLETFQS YGLNILDLVV LSGAHTIGKA NCGTIQSRLY NYNATSGSDP 
SIDPKYADYL RRKCRWATET VDLDAITPAV FDNQYYINLQ KHMGVLTTDQ ELVKDPRTAP LVQAFAEQPA QIFRQQFAVS MAKLVNVGVL TGEDRIGEIR KVCSKSNSRP Y* 

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Remarks
DNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CATTAATTTC CAAACCCAAT ATATAAATTA CTCACACAAC ACACCTCTCA TCAAACAAAT TCATCAAAGC CAATCAAATT CAGAAAAAAA ATATAAAAAG CAACATAATG AAATTGGCCG  TGGTCTCAGT CGTCGTCCTA CTCGGAATTC TCGTGGCTTG GCCGGTATCA GCTGGCCGGA AAGACTTACC GGGAGCGGGA GGATACGGAG GTGATGATGA TGATGATGAT GACACAAGGT  CATGGTTTCC TTTGGACAAT CTATTATCGT TGAATTACTA TGATAGGATT TGTCCAGATT TTGAGAAAAT CGTTGATAAC AAAGTGAGGG CATGGACAAA GGTTGACGCT TCTCTTGGTC  CCGCCCTCCT CCGCCTTATC TTCCACGATT GTGGCGTCAC GGTATTGCCA ACTATATCTT CTTTCTTAAA TATTTCTTAA ATATTGATAT TTTCATTACT CCATGCTATA TAGCCAATGT  TTTCATTCAT ATATGTATTG TTCTAAAAAT GGGTCTAAAT TGAAGGTTCT TGGGATTACT ATTAGGGTTC GTATTTGAAA CATTTTTGGA ATTGTCAAAT TTATTATTTT GCCGAACAGA  ATGACGATAG ATTCTATTAA CTGAACTGAA ATCCAAGAAA TGATGGAATT CATTTGAGTT TAATTTCATC GTTACTATAG CTGAACAAAT GAACATAAAT AACGATTTTG CATAGTTATG  TAATTAGTAA TGTTAAATCA CGTAACCAAA ACCAAGATGT TAAATATTCG CCTAATATGT TTATATTCTT CTTTAATGAA AACTATTCAT TCGCTATCAG ATGAGAATTG TTCTTACGTC  CATGATCTAG ACCATATATA GAACATTGAT AGCCATTATA AGATATAAAT TTCTCGATAT TGAAGATGGA CTTATGCAAT TATTCTATGC ATAAACGCAC CTTAGTGTTT TGCGCATATC  TATATAGATA AGCATTTCAA AAGATAACAA CTTGACTCTT TTGTAAATGT ATTAACAACT TTCAGGGATG TGATGCGTCG GTTCTTCTAG ACTATGAAGG GACAGAGAGA AGATCTCCGG  CGAGCAAAAC CCTAAGAGGC TTCGAGCTAA TCGACGATAT CAAGTCAGAG ATCGAGAAAT CTTGCCCCGG TTTAGTCTCC TGCGCTGACA TCCTAACCGC AGCTAGCCGT GCCGCCACCG  TCCAACTCGG TGGTCCTTAC TGGCCCAACG CCTACGGTCG TCGGGACTCA AAAAACTCTT ACGCTAGAGA CGTCGAGAAA GTCCCTTCAG GCCGCCGTGA CGTCACCGCC CTTCTCGAGA  CGTTTCAGTC TTACGGTCTC AACATCCTCG ACCTAGTTGT CCTCTCCGGG GCCCACACCA TCGGAAAAGC CAACTGTGGC ACCATCCAGT CGAGGCTTTA CAACTACAAC GCAACCAGTG  GTTCTGATCC ATCGATTGAC CCCAAATACG CTGATTACTT GCGACGCAAG TGTCGCTGGG CCACTGAGAC CGTTGATCTC GACGCCATAA CTCCGGCAGT TTTTGATAAT CAGTACTACA  TTAATCTTCA GAAGCATATG GGAGTCTTGA CGACTGATCA AGAGCTTGTT AAGGACCCGA GGACCGCTCC GCTTGTGCAG GCTTTCGCAG AGCAGCCGGC TCAGATATTC AGACAGCAGT  TTGCTGTGTC GATGGCTAAG CTGGTCAATG TTGGTGTTCT CACTGGTGAA GATCGTATCG GAGAGATTAG GAAGGTTTGC AGCAAATCTA ATTCCAGACC TTACTAATTA TAAATATTAT  CCCTCAATGA GTTTCAAAAA GAATATTTTG TTTCTTGAAA GTAATTTCTT GTTTGGTTTT AATTTTGAGC TCTTTTCAAT TGTAATTTGT TGTCTGAACA ACAAAAATGT GAATCTTGAT 
TTATACTGAG AATTATTTTC GT 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAATTGG CCGTGGTCTC AGTCGTCGTC CTACTCGGAA TTCTCGTGGC TTGGCCGGTA TCAGCTGGCC GGAAAGACTT ACCGGGAGCG GGAGGATACG GAGGTGATGA TGATGATGAT  GATGACACAA GGTCATGGTT TCCTTTGGAC AATCTATTAT CGTTGAATTA CTATGATAGG ATTTGTCCAG ATTTTGAGAA AATCGTTGAT AACAAAGTGA GGGCATGGAC AAAGGTTGAC  GCTTCTCTTG GTCCCGCCCT CCTCCGCCTT ATCTTCCACG ATTGTGGCGT CACGGGATGT GATGCGTCGG TTCTTCTAGA CTATGAAGGG ACAGAGAGAA GATCTCCGGC GAGCAAAACC  CTAAGAGGCT TCGAGCTAAT CGACGATATC AAGTCAGAGA TCGAGAAATC TTGCCCCGGT TTAGTCTCCT GCGCTGACAT CCTAACCGCA GCTAGCCGTG CCGCCACCGT CCAACTCGGT  GGTCCTTACT GGCCCAACGC CTACGGTCGT CGGGACTCAA AAAACTCTTA CGCTAGAGAC GTCGAGAAAG TCCCTTCAGG CCGCCGTGAC GTCACCGCCC TTCTCGAGAC GTTTCAGTCT  TACGGTCTCA ACATCCTCGA CCTAGTTGTC CTCTCCGGGG CCCACACCAT CGGAAAAGCC AACTGTGGCA CCATCCAGTC GAGGCTTTAC AACTACAACG CAACCAGTGG TTCTGATCCA  TCGATTGACC CCAAATACGC TGATTACTTG CGACGCAAGT GTCGCTGGGC CACTGAGACC GTTGATCTCG ACGCCATAAC TCCGGCAGTT TTTGATAATC AGTACTACAT TAATCTTCAG  AAGCATATGG GAGTCTTGAC GACTGATCAA GAGCTTGTTA AGGACCCGAG GACCGCTCCG CTTGTGCAGG CTTTCGCAGA GCAGCCGGCT CAGATATTCA GACAGCAGTT TGCTGTGTCG 
ATGGCTAAGC TGGTCAATGT TGGTGTTCTC ACTGGTGAAG ATCGTATCGG AGAGATTAGG AAGGTTTGCA GCAAATCTAA TTCCAGACCT TACTAA 

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cDNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CATTAATTTC CAAACCCAAT ATATAAATTA CTCACACAAC ACACCTCTCA TCAAACAAAT TCATCAAAGC CAATCAAATT CAGAAAAAAA ATATAAAAAG CAACATAATG AAATTGGCCG  TGGTCTCAGT CGTCGTCCTA CTCGGAATTC TCGTGGCTTG GCCGGTATCA GCTGGCCGGA AAGACTTACC GGGAGCGGGA GGATACGGAG GTGATGATGA TGATGATGAT GACACAAGGT  CATGGTTTCC TTTGGACAAT CTATTATCGT TGAATTACTA TGATAGGATT TGTCCAGATT TTGAGAAAAT CGTTGATAAC AAAGTGAGGG CATGGACAAA GGTTGACGCT TCTCTTGGTC  CCGCCCTCCT CCGCCTTATC TTCCACGATT GTGGCGTCAC GGGATGTGAT GCGTCGGTTC TTCTAGACTA TGAAGGGACA GAGAGAAGAT CTCCGGCGAG CAAAACCCTA AGAGGCTTCG  AGCTAATCGA CGATATCAAG TCAGAGATCG AGAAATCTTG CCCCGGTTTA GTCTCCTGCG CTGACATCCT AACCGCAGCT AGCCGTGCCG CCACCGTCCA ACTCGGTGGT CCTTACTGGC  CCAACGCCTA CGGTCGTCGG GACTCAAAAA ACTCTTACGC TAGAGACGTC GAGAAAGTCC CTTCAGGCCG CCGTGACGTC ACCGCCCTTC TCGAGACGTT TCAGTCTTAC GGTCTCAACA  TCCTCGACCT AGTTGTCCTC TCCGGGGCCC ACACCATCGG AAAAGCCAAC TGTGGCACCA TCCAGTCGAG GCTTTACAAC TACAACGCAA CCAGTGGTTC TGATCCATCG ATTGACCCCA  AATACGCTGA TTACTTGCGA CGCAAGTGTC GCTGGGCCAC TGAGACCGTT GATCTCGACG CCATAACTCC GGCAGTTTTT GATAATCAGT ACTACATTAA TCTTCAGAAG CATATGGGAG  TCTTGACGAC TGATCAAGAG CTTGTTAAGG ACCCGAGGAC CGCTCCGCTT GTGCAGGCTT TCGCAGAGCA GCCGGCTCAG ATATTCAGAC AGCAGTTTGC TGTGTCGATG GCTAAGCTGG  TCAATGTTGG TGTTCTCACT GGTGAAGATC GTATCGGAGA GATTAGGAAG GTTTGCAGCA AATCTAATTC CAGACCTTAC TAATTATAAA TATTATCCCT CAATGAGTTT CAAAAAGAAT 
ATTTTGTTTC TTGAAAGTAA TTTCTTGTTT GGTTTTAATT TTGAGCTCTT TTCAATTGTA ATTTGTTGTC TGAACAACAA AAATGTGAAT CTTGATTTAT ACTGAGAATT ATTTTCGT 

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