Entry information : BstrPrx16 (Bostr.23794s0232)
Entry ID 14943
Creation 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Sequence status theoretical translation / pseudogene
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2018-03-07 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: BstrPrx16 (Bostr.23794s0232)
Name (synonym) BstrPrx16 (Bostr.23794s0232)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx039]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Boechera
Organism Boechera stricta    [TaxId: 72658 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value BstrPrx16
start..stop
S start..stop
AhalPrx38 273 1e-92 6..147 55..196
AhalPrx38 113 2e-30 140..206 284..349
AlyPrx22 272 3e-92 6..147 55..196
AlyPrx22 110 4e-29 140..206 284..349
AhalPrx26 267 3e-92 6..151 55..200
BstrPrx34 272 4e-92 6..147 55..196
BstrPrx34 111 1e-29 140..206 284..349
Literature and cross-references BstrPrx16 (Bostr.23794s0232)
Protein sequence: BstrPrx16 (Bostr.23794s0232)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   206
PWM (Da):   %s   22498.55  
PI (pH):   %s   8.51
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
IPSSMMRTDP RIAASLLRLH FHDCFVRGCD ASILLDNSTS FRTEKDAAPN ANSARGFNVI DRMKVALERA CPRTVSCADI LTIASQISVL LSGGPFWSVP LGRRDSVEAF FDLANTSLPS 
PFFTLTQLKA AFADVGLDRA SDLVALSVNL YSSNMSVFFR AFVDAMIRVG NLRPLTGTKG EIRQHCRVVN SRIRVVENDD GVVSSL* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Pseudogene sequence from genomic. 5'end is missing, part of last exon is missing due to N in the sequence (very large intron).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATACCATCAT CGATGATGCG GACTGATCCT CGTATTGCCG CGAGCCTCCT TCGTCTTCAC TTCCATGACT GCTTTGTTCG GGTAACGACT TACTTAACTT ATCTTTTATT AAAGAAATCC  ACGGCGTCTA CTTTTACATA CCATTTACAT AAACATAGAA TAGAGGCTAA AAGTCATTTT TGAATTAATA AATCATGTCG TCATGTTATG TAATATATAT ATGGCTTTTG TAGGGTTGTG  ATGCATCAAT CTTGCTTGAC AATTCCACAT CATTCCGGAC CGAGAAAGAC GCTGCTCCAA ACGCAAATTC GGCTCGAGGG TTCAATGTCA TAGATAGAAT GAAAGTAGCC CTTGAGAGAG  CTTGCCCAAG AACAGTGTCT TGTGCAGATA TTCTCACCAT CGCCTCTCAA ATATCAGTGC TTTTGGTATG TACATATGTA TACCTACATG ACTTATATCG GGTGAAGTTA ATCCAAAAAT  ACTATGAATT TGACGTCAAT GCTTTATATG TTATAGTCTG GAGGTCCATT TTGGTCGGTT CCGTTGGGGA GGAGAGACAG CGTAGAAGCT TTCTTCGATT TGGCTAATAC ATCTCTTCCC  TCTCCATTTT TCACTCTTAC TCAACTTAAA GCAGCTTTTG CTGACGTTGG TCTAGACCGC GCCTCGGATC TAGTCGCTCT TTCTGGTAAA ATTTTCATAT TGTGTTAATA TCATATCCTC  TTAAGATATG TGTTTGTGAT AGCTAGATAC AATTCTTTTT ATATATTGAT AGCTAGCTAG ACGCATTCAC TACAAGAAAA CAATGCTATA ACCGACGGCT CCCCTACCTT CGGACGTTTC  CGTCGGAATT CCGATGAAAA AACTTCCGCT TTTCGGTTCT CGGAAATCCG TCGGAAATTA TCGACGGAAT TCCGACGAAA AACGAAAAAG CGATGACATT CCGACAGTAT TAGTCCGTCG  GAAAAGCGGA CTAAATTGCG ATGGATAACC GATAGATTTC CGATAACAGT TACGACGATT TTCCGACGGA TAGGAATCTC GTAGGTAATC CGTAGGAAAA TGACTTTTTG GTTTATTTAA  TTAAAAAACT TATATTATTT TATATAAAAT GGAAATAGAA ATTAAATACA AATTTGGAAC TGAAATTACT AAAAATATAT TAGGGGAAAA ATATTATATA TAAAAAAAAT AGATAAAATC  AAAACGACAA AAAAAAAAGG AAAAATCAAA ACGACAAAAG AAAATTTTTA CAAAGAGTCA AATTAAATAA ATTTGAACTA ATTATCATCC GATGTACTAT CTGAATATTC TGATGGTGAT  GAATCAGATT GTGAATCAAA TTCTTCATGT TCCTCCTCGG AATAATCAAA AATATTGTTA TCACCTTCCT CGGTAAAATC GACAACAAGA TCAACTTGTT GCGGTTCTGC GATCGGACCT  AGAAAACCTG CAGTGACGCC TTGTTGCATA ACCTCGTTAT CTGCAATACC ATCCACCATA CCTCTTGGTG TAATCAATGA AACAGTGATC CAAGGATCAT GCTTGTTCGT GACACGAGGA  TATGGAATAT AACAAACTTG GTTTACTTGT GATGCAAGGA TAAAAGGATC GTACTTTTGC AGCCGTTTTC CGGAATGTAT AGATATAACC CCAAATTCAT CTTGGCGAAC ACCAGCTCCT  AGGAACGGAT CATACCAATC GCAAAAAAAA AACAACGCAT CGCAAGTCGA GGAAACCAGG GTAATGGACT TCGAGAATTT CCCTTAGAAT ACAATAGTAG ACAATGTCAC CCGATTCTGA  AGAAATACCA TAATCACATG TTGGCCGGAT CCTTCCTTCG CGTAAAATCT TAAAAGCATA TCCACGTGTA CAATACATAG GATAGAAGTG GGCAACGACC AATGGACCGT TAATCAATTC  TTCTAACCAA GTTGGAAAAG ATTGACCTCT GCTTGCACCT GTGGTTACCT GCAATAATTA TTTTAAAAAC TATATTTATA AATTAAAAAA TGATATTTGT TGTAATAGTA AAAAGAACGT  AAGAGAATGA AATAAACTTA CATAAAATGC GAGCCATCGA GCGAACTCGC TCTCTTTGAG CGCATTAAGT GATTCCTCCG TGTAAGTTGA GTAATGAAAA CGTTGTAAGC TATATAAATC  CTGTAAATAA AAATATGAAT ACATTATTTT AATTATGAAT ATTATTAGGA AAATTTAGAT TTTTAAAAAT GAAATACCTT TCATATTCAA GAAGATCATC TCAATTTGTG AGAATATACA  TATGCAAATG ATTTTGCTCC TCTTTAGTTA ATCTCCGTTT TTTGCTTTTT CCACTTAGTC GTCCAACCTA TACATATGTA AATAGATTTA AGTTGTAATT AAAATTTTTA TTGAATGTAT  AAATTTTCTT ACTTAAAATT GAAATGCACC TTACCTGTCG GAAGATACTT GGAACGTAGA TTGGATAACT TGCTTTTTCA CCTCCGTCAT TGTGCCTCGC GGGTCTACGA CTCTTTGTTT  GCACTTGTTT TGGAAAATAA TATTCGGAGA AATGTGCCGC TTCTTCATTA ATGGATTGAG CGACAATAGA CCCCTCTACT TTACTCAAAT TTTTAGCTTT TTTCTTCAGA TGATACATAT  ACCTCTCGAA CGGGTACATC CACCGATATT GAGCAGGGCC ACCTAATGCT GCTTCGGGAG GAAGATGAAT TGGAAGATGC TCCATAACAT CAAAAAATGA AGGGGGAAAA ATCTTCTCCA  AATTACATAG GATAATTGGT ATATGCGTCT CCAAATTACA AATACCGTCA ACCGTCAGAG ATCTAGTACA TAAATCCCGG AAAAAAGCAG CGATACCTGA GAAAAAACAT AAACCAATTA  AAACAATACT TGATGTAGTC CTAACCTGTA ATATATATGC TAAAAAAATT ACCTGCAATT GACTTGTGGA CGTTTTGTGG AAGAAGATAA GCAAATGCAA ACAGAAGAAT GCGCTGCATT  ATGACATGAC AATCGTGACT TTTTAGACCA GAAAACTTCT CTTCACCATA ATTAATGCAG TTTCGTAAGT TCGACGCGTA ACCATCCGGG AATTTAACAT TGCTGGCAAT CCATTCGAAA  AACTCTTGTT TTGCATCCGA AGGTAAACGA AATTGGGGTA TAGGACATTT GTTGTTATTC CCCACAACAT GAAGAGTTTT TCGAGAACAT ATATCTGGCA AATCCAATAT AGACTTCAGA  TTATCTTTCG TTTTCCCTTG GACATTGAGA ACAGTGTTAA TCAAGTTTTC AAAAAAATTC TTCTCAATGT GCATGACATC TAGGTTATGC CTCAATAGAT GGTATTTCCA GTATGGCAGA  TTCCAAAAGA TACTCTTCTT ATGCCAGTTA TGGTATACGC CAACTCCATC TACCGGAGTA TGTCCATTTC CGCCACAACG AACAGTTTTC TCCGCCCCAA AATCTCGTAA TTGTGTTAAA  ATGATATCAC CATCTAACTC AGGAGGTGGA CCATCAAAAT TTTTTTTGTT TTTGGTAAAC AATGTCGTGC TTCGGCGATA GGGATGATCG TCTCTCAAAA AACATCTATG ACAATCAAAC  CAAGATGTTT TACGCTCATT TCTCAATTGG AACGCATCTG TATTGTCTTG ACAATATGGA CACGATAATC TCTCATGTGT CGTCCATCCA GATAACATAC CATATGCTGG AAAATCACTT  ATGGTCCACA TAAGCACTGC CCGCATCAAA AAATTTGCCT GCAATGAAAC GTCGAATGCC TGAACTCCAT GTTCCCATAA CATCTGCAAC TCATAAATCA ATGGCTGTAA GAAAACATCA  AGTGATCTCT TTGGATGCTC AGGTCCAGGA ACGAGAATTT AGAGGAAAAG AAACTCTTTC TTCATGCATA AAGATGGTGG CAAATTGTAT GGTGTCACGA TTACTGGCCA CAATGAATAT  TGTCTTCCAT GCTTTCCGAA AAGATTAAAA CCATCAGTGC ATAAACCAAG GTACACATTC CTGCTCTCAG CTGCAAAATC AGGATAAACA TTCTGAAAGT GTCGCCATGC TTCAGTGTCG  GACGGATGTG ATATATCTCC ATCCCGTAGA TGATCTGAAT GCCATCTCAT AGACTGTGCT GTCCGCTCTG GTTGATATAA TCATTTCAAC CTCTCCGCTA GTGGCAAATA CCACATCCGT  TTGTATGGAA TACTGACTCT TCCTCCTGTA TCTTGATACC GAGGATTGCG AGAAAACCGA CATACTAACC GATCTGAAAC CTCTTTCCAG TAGATCATAC AATTGTTGCT GCACACATCT  ATCACCTGAT ACGGTAAGCC AAGCTCAGCC ACCAACTTCT GAATCTCATA GTATGTTGAT GGATAATTAC TATCTGCAGG CAAATGTCTT TTCATATAAT CAGCAAATGC ATCAACACAA  GTCTCTGACA AATTGTAATC CGTCTTGATT GTCATCAATT CTGTTGCAGT CGATAATGGT GATATTCCCT CTGGACAACC TCTAAACAAC GGATGCTTTG CCGCATCTAA CATATCGAAG  AATCTTTGTG CTTCTAAATT AGGTTCnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnACGTAA AATTTGCACT TGTACTAGCA AAATCTACCA TAGAATCATT TTCTTCATGC GAATACCAAA  TCTTGTAACC CGCCATAAAT CATCTACGAT GTAAATGCGA ACTTACTTCT AAAATATCGA AAAATCTACG ATTCTTACAT TTAAGACAAG GACAATAGAT TTTACCCGTT TGCAAAGCAA  GTTCCTGATT TGTTGCAAAA TTCATGAACT GTCGTACACC TTCGACAAAG TCTTCTGTAA GTTGCTCTGT CTCGGGATCG CGCATTGGTC TGTCCATCCA GGATAGAAAA TAATTATATG  GACTTGACGA TGACATATTT GTAATAGACA ATTTAAAGAT AATATGACAA GAATATAGGT AGAGAGAAAT TGTATGAGAA AGTGTAATAT TCAAGTGAAG AATGGTGGGT TAAATAGACG  CCCTAACCGA CGGAAAACCG ATGGCAACGG TCACTGACCA TATTACCGAG GGAAAACCGA CGGTTTTTAT ATTGCCGTCG GTTTTCCATC GGTATTACCG ATGGGAAACC GATGGCAATA  TATATAACGG CTAATTTTTG AACGGTCATA TTTTGACATT ACCGAGGGAA AACCGTCGGT TTTTATATAT ATATTTTTTT TTTATATACA TATGAATTTT AATTATTTAA ATATACATAC  ATTTACAATA ATTTAGAATA CTTATTGAAT CTCAATCCTT TAAAATCATA TTGATTTACA TATTTATTAA AGCATAATTA CATAAAATTT TATTTATTTG ATATCATAGT TAATCTAACT  TCTTACATAA TAATAGTAAA TAAAGAAATT AGTATTAAGA TTTTATAAAT TAGAATGAAT ATTTCATAAG TATGATGTTA TATGATTTTA TTCGCATGTA AGTATAGAAT TTATTATGGA  TTTAAGGTTT AGTTTAGGGT TTAGGGTAAT ATCCTAAACC CTAAAACCAA AACTAAAACA TAAATTCGGA ATAAATGCGA ATAAATCATA TAAACTCATA CTTAAGAAAT AATAATTCTT  ATTTATTAAT TAAATATGAT TTGAACTAAA ATAGATTTAA TAAATATGAT TATATATGTG TTTAACTGTA ATTTCTGTCG GTATCCCATC GATAATACCT ATGGATTACC GACGGAATTT  AGATTTTCGT CGGTATTAGC GATGGAATAC CGATAGTAAT TTAATAACCA TCGGTATAAC AGATGGTGAA CCGACCGTAT TAACTTTTTA AATCAAAAAT CATAATTTTT AAATCTAATT  TAATACAAAT CATTTGTGAT TACTAAATTA GAATGAATAT TTCATAAGTA CGATGTTATA TGATTTTATT CGCATGTAAG TATAGAATTT CTCATGGATT TAGGGTTTAG TTTAGGGTTT  AGGGTATTAC CCTAAACCTT AAATCCAAAA CTAAAACATA AACTCGGAAT AAATGTGAAT AAATCATATA AACTCATACT TAAGAAATAA TAATTCTTAT TTATTAATTA AATATGATTT  GAACTACAAT AGATTTAATA AATATGATTT TATATGTGTT TAACTGTAAT TTTCGTCGGT ATCCCATCGA TAATACCGAT GGAATTTAGA TTTAAATATA TATTTAATAG CCAATAGAAT  CGCATGCAAG AATTCAGAAT ACCGTCGGTT TTCCGTCGGA AACCGACCCG AATTTATTGT TCCGCCAAAA CTTCGGAACG CGGGAATTAA AAAATTATAA ACCGACGGAA AACCGACGGT  CACTGAAAAT AAAACCCGAT CGAGAACCTT CTCTCTTCTA CTCCATTTCT TCTTCTTCTC CGAATCGTCC CCTTCTCCGG CGATTTCTTC CCTTCCCGGC GAGATCTTCC TCCTTCCTCA  GGCGATTGCT TCCTCCTTCC TCCGCCGTTC TCCTCCTCGA TCGAGAACCC TCGATCTCAT CACCCTCCGT CGCTTCTCCT TCCATCTCTT CTCACCTCCG CCGCTTCTCC TCCGGCGTTC  ACCTTCGCCG CTTCTCCTCC GGTGAACCTC CTCGCCGGCG ACATGTAAGT TAATTTTGAT TTTGTGAATT ATTGGATTTT GGGTTTATGA TTTTGGAATA GGGATTTTGT TATATAGAAT  TTAGATTTTG GAATTAGGAT ATAGAAATTA GAGATATTGT GATTTGGAAA TTATGATTTT GAAATTAGGA TTAGAAATTG TTATATTGAA TTTGGGATTT TGTAATTTAG TAATTATGAA  TTAGCAAAAC AAAAACTAAT TTACTAATTT TGTAAACATA TGTGAATTTG TGAATAATTT AGTAAAAATT ACGTAATTAT CAATTAGAAA TTAGGATTTA GAAATTACGA TTTCTATTTT  TGGATTTTGT GATTTAGTTT GAAAATAAGA ATTATGAATT AGAATTTTTG ATTTTCGATT TTGGAATTAG GATTTTTGAT TTTCAATTTT GGAATTAGGA TTTAGAAATT ATGCTTTTGT  GATTAAGGTT TGAAATTAGT TTTATAAATT GACGATAAAA TTGTGATAAA ATTTAGGTTA TCAATTAGTA TTATGAATTT AGGATTTCAA TTAACTTATA ATTTATGAGC AATATTTTTT  ATGTCAGATT CCAATTATGA TTTTTCTTAC TAATCATTTA CTTGTTTTAG GAGTTACGAG GATTTCCTCC GTTCCTCTCA TGGAGCTCCG AGTGCTCCTT CGAACCAGAG GAGTAGTTCC  GCCACTCCAT CTATTGTTCC ACCTTCGGAG AATTCCGAAG CCCGCACCAG AATCACATTT GAGGAGGTTC TTGCTCTTCC GAGCCGAGAG CGTTTACTGG TGCTTCACCC ACATATAATT  CCTGGAACAA CTTGGTATGT AATTTTAATA TTTTTTAATG TTCTCACATA TTTTTTAATT GTGTTTTTTA TTTTTATTGA AGGTTTCACC GTAAAAATGG GATAACCAAA TCGATTATGA  CTGTGCTCCA TCGCCAACTC CTGAGATGTA TCCCACCTAT GGAGAAATGC CAAAAGAGCG GCGAGAGCTA TGGTTCCGTA CTTTCGCGGT ATGATATTTT ATTACTTCAT TATGGTTTTT  TATTAACATT TAATATTGAT GTAACTAATT CGTTATTTTT TTTTTCTTTT TTAGCAAGAT TTCAATTGGC ACCCTGATCA TATGCGCGAG GTTCGTAAGG CGTTCGATGC GCAAGCTAGT  GCGCAATTCA GCGAACATGT CTACAGATGG AAGCAGAGGT GGAAGAAGGG TAAACAAAAG CACAGGGATC TCGACGAAAG AGTTTGGGAG GCGTACATTC GTTACTGGAG TACGGAAGAG  GCCAACGCCA TCTCTGCAAG AAACAGGGTG AACCGCATGA GCGACCGAGA TGGGCTCGGA ATCGCAACAC ATAATGCGGG ATCAATGACG TTCGAGAGTC GTGCTGACGA GCTGGTATTA  ATACAATCTT TTATTAATAA TTAATTTCCT TATATTTTTA TTATTTAGTA ACACTTTTAT TGTTTTACCA GGCTGCCAAG TCCGGTGGTG TGTGATCAGA TCTATATGAG CTTTTGATCG  ACACGCACAC CAATAAAAAA ACCGGCCAGG TTCAAGACAA GTTGGCGTGC AAAGTGATGA CCAACGTCGA GAAGAAGAAG CAGGCGAAGC TTACTGAGCT ATCTCAAGAA GGAGGATCTG  CTTCGGATTC TAATTCTTTG CCGCGGGAAG TCATGAACCA ACTAGTGATC GAGGTAAATA AATTTATATA ACTTGTACTA TTTTAAAGAA ATTTCAGTAT TTTAATATTT GTTTCTAATT  TATCAGGAAG CTCTTAGAAG CCGAGGACGT GTTTTGGATT AGGCCGCCTT CCCGAAGCTG ACACTGCATC GTCGTCCTTT ACACAACAAA CAAATCCTGT GGTCACAGAA GAGCTTGAGA  GACTGAGGAC TGAATTGGCG GAAAAGAATG CAGAAATTAG CAAGTTGACT GCCTCTCAGG AGTACTTCAC GACGTTTATG AGTCAGCATT TTTCTGATTT CCGTCCTCCA CAGCTCGATT  AGTACTTTTA TGTTTTCATA ATTTCGTATT CAAACAATGT TTTTTATGTT TTTATAATTT AGTATTCGAA CAATGTTTAA CTTTTAATTT AATGTATAAT TGAAATTTCC CATTTTTATA  TTTATCATTT TTATTAAATA TTTTAATTAA AATATTGAAA TTATAAAAAT GAAATTTTAT TTATATTTTA TTTTTATTAA ATCCGTCGGT TAACCATCGG AATTCCTTCC CGTCGGTTAA  CCATCGGTTT TGTTGCCGTC GGTTAACCAT CGGAATATTT TTCATCGGTT TTCCGTCGAT ACCTTTTTCC ATCGGTTGTC CCACGGTTTT GTCATCGGAC AACTTCCCTC GGAATACCGT  CGGAAGGGTT TAACCGACGG AAATTTCGTC GGTTATTTGT CGGAAATTTT CTCTCGGAAA TCCGTCGCTT TTTGCTACAG AAAACCGACA GCAAATGATT TCCGACGACT TGGAACCGAC  GGTTTTGCAG TGGTCGGTAA ACCGCCGGAA AACATGGTTT CCGACAGCGT ATCGACGGTT TTTTCCGTCG GTATATACCC TGCTTTCTTG TAGTGATTAC TCGACTAAGT CTGGAATTTA  CATAGTTATT TTTAAGTTAT AAATTnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnA CGATCCCACT AGTAAACCTA TACAGCAGCA ACATGTCCGT  GTTCTTTCGT GCATTCGTTG ACGCAATGAT AAGGGTGGGT AATCTTAGAC CTTTGACTGG AACTAAAGGC GAGATAAGAC AGCATTGTAG GGTTGTGAAT TCACGAATTA GGGTTGTGGA 
GAACGACGAT GGTGTTGTGA GTTCTCTTTG A 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATACCATCAT CGATGATGCG GACTGATCCT CGTATTGCCG CGAGCCTCCT TCGTCTTCAC TTCCATGACT GCTTTGTTCG GGGTTGTGAT GCATCAATCT TGCTTGACAA TTCCACATCA  TTCCGGACCG AGAAAGACGC TGCTCCAAAC GCAAATTCGG CTCGAGGGTT CAATGTCATA GATAGAATGA AAGTAGCCCT TGAGAGAGCT TGCCCAAGAA CAGTGTCTTG TGCAGATATT  CTCACCATCG CCTCTCAAAT ATCAGTGCTT TTGTCTGGAG GTCCATTTTG GTCGGTTCCG TTGGGGAGGA GAGACAGCGT AGAAGCTTTC TTCGATTTGG CTAATACATC TCTTCCCTCT  CCATTTTTCA CTCTTACTCA ACTTAAAGCA GCTTTTGCTG ACGTTGGTCT AGACCGCGCC TCGGATCTAG TCGCTCTTTC TGTAAACCTA TACAGCAGCA ACATGTCCGT GTTCTTTCGT  GCATTCGTTG ACGCAATGAT AAGGGTGGGT AATCTTAGAC CTTTGACTGG AACTAAAGGC GAGATAAGAC AGCATTGTAG GGTTGTGAAT TCACGAATTA GGGTTGTGGA GAACGACGAT 
GGTGTTGTGA GTTCTCTTTG A 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATACCATCAT CGATGATGCG GACTGATCCT CGTATTGCCG CGAGCCTCCT TCGTCTTCAC TTCCATGACT GCTTTGTTCG GGGTTGTGAT GCATCAATCT TGCTTGACAA TTCCACATCA  TTCCGGACCG AGAAAGACGC TGCTCCAAAC GCAAATTCGG CTCGAGGGTT CAATGTCATA GATAGAATGA AAGTAGCCCT TGAGAGAGCT TGCCCAAGAA CAGTGTCTTG TGCAGATATT  CTCACCATCG CCTCTCAAAT ATCAGTGCTT TTGTCTGGAG GTCCATTTTG GTCGGTTCCG TTGGGGAGGA GAGACAGCGT AGAAGCTTTC TTCGATTTGG CTAATACATC TCTTCCCTCT  CCATTTTTCA CTCTTACTCA ACTTAAAGCA GCTTTTGCTG ACGTTGGTCT AGACCGCGCC TCGGATCTAG TCGCTCTTTC TGTAAACCTA TACAGCAGCA ACATGTCCGT GTTCTTTCGT  GCATTCGTTG ACGCAATGAT AAGGGTGGGT AATCTTAGAC CTTTGACTGG AACTAAAGGC GAGATAAGAC AGCATTGTAG GGTTGTGAAT TCACGAATTA GGGTTGTGGA GAACGACGAT 
GGTGTTGTGA GTTCTCTTTG A 

Retrieve as FASTA