Entry information : BstrPrx20 (Bostr.18473s0043)
Entry ID 14947
Creation 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-07 (Christophe Dunand)
Sequence status theoretical translation / pseudogene
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2018-03-07 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: BstrPrx20 (Bostr.18473s0043)
Name (synonym) BstrPrx20 (Bostr.18473s0043)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx018]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Boechera
Organism Boechera stricta    [TaxId: 72658 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value BstrPrx20
start..stop
S start..stop
AlyPrx33 629 0 1..343 1..349
AhalPrx39 620 0 13..343 14..355
BstrPrx51 619 0 1..343 1..354
CrubPrx107 618 0 13..343 12..353
Literature and cross-references BstrPrx20 (Bostr.18473s0043)
Protein sequence: BstrPrx20 (Bostr.18473s0043)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   342 (311)
PWM (Da):   %s   37797.13 (34286.4)  
PI (pH):   %s   7.93 (7.70) Peptide Signal:   %s   cut: 32 range:32-342
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKFSSSSTTS YTWTILITLG CLMLRATLSD AQLTPTFYDN SCPNVTNIVR DTIVNELRSD PRIAASILRL HFHDCFVNGC DASILLDNTT SILTEKDAFG NANSARGFPV IDRMKAAVER  ACPRTVSCAD IAGGSSWRVP LGRRDSLQAF LDLANANLPG PNFTLPELKA SFKKVGLDRP SDLVALSGGH TFGKNQCRFI MDRLYNFKDT GLPDPTLNTT YLQTLRGQCA RNGI*SVLVD 
FDLRTPLVFD NKYYVNLKEQ KGLIRSDQEL FSSPNATYTI PLVRSFADGT QKFFDAFVEA MNRMGNITPL TGTQGQIRLN CRVVNSNSLL HDVVEIVDFV SSM* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Pseudogene from genomic. Frame shift and stop codon.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGTTCT CTTCATCTTC TACTACTTCG TACACTTGGA CAATCTTAAT CACATTGGGA TGTCTTATGC TTCGTGCGAC TTTGTCTGAT GCTCAACTTA CCCCTACCTT TTACGACAAT  TCATGTCCTA ACGTCACCAA CATCGTAAGA GATACCATTG TCAACGAGCT AAGATCGGAC CCTCGTATCG CCGCGAGCAT CCTTCGTCTT CACTTCCACG ACTGCTTTGT TAATGTAAGA  TATCACTTTT CATATATCTA TAGCGTTTTG AGTTACTGTA CTTCATCTCT TCATCTTTTA AATTTATGTT GATTAAGGAG TGTAAATTTA TTTCTAAAAA AAGTGATAAC AAATTATATT  TGTTATCAGC ATATGCAATT TTTCTGTTGT TGATCAATAA ATTTAACATT TCAACAACAA AAAACTGTTT TAGTTAATAC TCTTATTTGC TTTAAATTTA ATGTCATTTT AGCAGAATTT  GTATTTTCAA TGTAGATTTA AATGAAAAAA CTAATTTAAT ATCAAGTCAA ATTAATAAAC CATAATACAA AGAATCAATT TGTTTTATTA GTTGCATGAT GGAACTTTAC CATGTTTGTT  AATTTGTTTG AAAAATATAA AACAGACACT TATCATGAAA ATGAGATATA TTTATTAAAT GAGAATTTTG ATACAATTAT TAGATGATAA ACATAATTCT AGCCCTTTAG AATTTTAGAT  AGTTGGATAG TTCTCATTTA CAAAAAAATT CATGGATTAA TTTTACAAAA TTATAAGTTA ACTTGCCTTC AGAAAATATG TATAGCATTG CTATAACATA AATATATACA AAACACATTT  ATCTTTTTTT TTTCACAAAT ATAAAGCAAT ACTATTCAGT TAATATAAGA TTTTTTTAAC TGTCTATTGA AATTTTTACA CGATCATAAA TACCAAAATG CGATTTAAAA AAAAGATTTG  TTTTTAACAT TACGTCAATT GTTCAACTAA TGTGCTACTA TTTTCATGAT TATTTATTTC TATTAATTTA TTTTATTATT TAATTTTGAT TAATATATAT TTTAATGTGA TTATATATGA  ATATTTCAAT AATATAAAAA TATTTTTATT GAAAAATGTT TTATTTTCTA ATGAGTTAAA ATGGATTAGA GGAGTTTCTC TCTCCTAACT TTGTTTACAT TATATAGATA TATAATCTCC  ACTCATTACT TGCTTCAGAG GAACACATGC ATGGTTTTAG TGGGTGAAAA AGAGTTCAAT GTTAAATTGT TACCTTTGGT AAAGATTTTA TAACTATGGA TGTAATACAT TGACTAATAA  TTTGTTAAAT AATATTTTGG ACTTTTAAAA GGGTTGTGAT GCATCGATCT TGTTAGACAA CACGACATCA ATTCTAACAG AGAAAGATGC GTTTGGAAAC GCAAATTCAG CTCGGGGATT  TCCCGTAATT GATAGAATGA AAGCTGCGGT GGAGAGGGCA TGCCCAAGGA CCGTTTCATG CGCAGATATA CCACTGCAGC TCAACAATCT GTTACTCTGG TATGCTCCAT TGTTCCATCT  TCTTTTATTC ATTAAAAAGA TTTTTTTTTT TTAGTTTTAA TATGTCAAGT AGCCCCTTTA CATATCAAAC ATGAGAGTCT AAGTTTGAAA AGAAAATTTG GGATATTTTT AGTTGTTTGA  GATGTCACAA TCATTATTTA GTATCAACTT TTCAACTATA TGACAGCATT CAAAATTAAT TGAGAAATAC TCAAAACGCG TGGTCCCGTT AAGAAAATTT GATAATTTCA ATATTTTTCA  AAAGGTCTCA TCATTAAGAT TTACTTGGTT AAGCAAGGCA ACCTTTTTAG TTAACCAAAA AGAAAATTTC AGTTTCTTCG AAGAAACAGT GGAGATTAAA AAAACTTCCT TTTGAGTATA  GAATCAATGA ATTTATAGTA CATGTTTCCG AATGATAAAA AAATTTCTGA GTAAGTAATT ATTATTTTGA ATATAATGGT AATTATACTA TAGGCAGGAG GTTCTTCTTG GAGGGTTCCT  TTGGGGAGAA GAGACAGCTT ACAAGCATTT CTGGATCTCG CTAATGCAAA TCTTCCAGGT CCAAACTTCA CACTTCCAGA ACTTAAGGCC AGCTTTAAAA AGGTTGGCCT AGATCGTCCT  TCTGATCTTG TTGCTCTCTC CGGTAATTAA CAAAATGAAA TTAAACACCA TTATTGATAT ATTTGTAATT AGCGAGTTAA TTGTTGATCT AATTATGGTC TTTCTGCTGT TAGGGGGTCA  CACATTTGGT AAAAATCAGT GTCGATTTAT TATGGACAGA TTATACAACT TCAAAGACAC CGGTTTACCT GACCCTACCC TCAACACTAC TTACCTACAA ACTCTTCGTG GACAATGTGC  CCGTAATGGT ATTTAAAGCG TCTTGGTGGA TTTCGATCTG CGTACGCCTT TGGTTTTCGA CAACAAATAC TACGTGAATC TGAAAGAGCA AAAAGGTCTT ATCCGGAGCG ATCAAGAGTT  GTTCTCTAGC CCCAATGCCA CATACACGAT CCCATTGGTG AGATCATTTG CTGATGGCAC ACAAAAATTC TTTGATGCGT TTGTGGAGGC AATGAATAGG ATGGGAAACA TTACACCTCT 
TACAGGAACT CAAGGACAAA TCAGGCTGAA TTGTAGAGTG GTGAACTCCA ACTCTCTACT CCATGATGTG GTAGAGATCG TTGACTTTGT TAGCTCTATG TGA 

Retrieve as FASTA