Entry information : BstrPrx23Bostr.10273s0484
Entry ID 14950
Creation 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: BstrPrx23Bostr.10273s0484
Name BstrPrx23Bostr.10273s0484
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx025]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Boechera
Organism Boechera stricta    [TaxId: 72658 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value BstrPrx23
start..stop
S start..stop
AlyPrx11 653 0 1..335 1..335
AtPrx11 652 0 1..335 2..336
TsPrx11 643 0 1..335 1..335
BrPrx11-1Ab_other 636 0 1..335 1..335
Literature and cross-references BstrPrx23Bostr.10273s0484
Protein sequence: BstrPrx23Bostr.10273s0484
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   335 (316)
PWM (Da):   %s   37166.57 (34832.3)  
PI (pH):   %s   4.96 (4.77) Peptide Signal:   %s   cut: 20 range:20-335
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKLLLVFLMV HTIFIPCFSL DIVGKDHPLT LDYYKSTCPT VFDVIKKEME CIVKEDPRNA AILIRLHFHD CFVQGCDGSV LLDETATLQG EKEASPNINS LKGYEIVDRI KNIIESECPG  VVSCADLLTI GARDATILVG GPYWDVPVGR KDSKTASYEL ATTNLPTPEE GVISIIAKFY SQGLSVEDMV ALVGAHTIGM AQCRNFRSRI YGNFQVTSAL NPISETYLSS LRKICPSNSG 
EGDNNVTAMD NVTPNLFDNS IYHTLLRGEG LLNSDQEMYT SMFGLQTRRV VSKYAEDPVA FFEQFSKSMV KMGNILNSES FVDGEVRRNC RFVNT* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CAAACACTTT AACATTTTTC CCAAAAATTG GATCAAAAGG GTTTCTGAAA AAGAACTATG AAACTCCTCC TTGTGTTCTT AATGGTTCAC ACCATCTTTA TCCCCTGCTT TTCCCTTGAT  ATAGTGGGAA AGGATCATCC TTTAACCCTA GATTATTACA AGTCTACTTG TCCGACCGTA TTTGACGTCA TCAAGAAAGA AATGGAATGC ATAGTGAAGG AAGATCCTAG AAATGCAGCC  ATACTTATTC GTTTACACTT CCACGACTGC TTTGTTCAAG TAAGTATTCA TCCACACGTT TCTTGAAATA CAAAAAACAT TCCCGCAGGA GAAAATTCAT AAGGGATATG TCAAACATTA  CTGACTTACT GTTATCAAAT ACTTCCTTTA ACGACATATA TATCATGCTA GATTTTGGAT GAAACAGATT TTAGCTGAAA GGGGGTTGCC TTATGATATG GATGGTTAAT TACTTTAAGG  GTTAACACGG TATTGCAGGG GTGCGATGGA TCAGTGTTGC TAGACGAAAC AGCGACACTA CAGGGAGAGA AGGAAGCTTC TCCCAACATA AACTCATTGA AAGGATACGA AATTGTAGAC  AGAATCAAGA ACATAATCGA ATCCGAATGT CCTGGAGTCG TTTCCTGCGC TGATCTTCTC ACAATCGGTG CTAGAGATGC TACAATCCTG GTAAATAAAC AAAACCGAAA CATAAACTCT  CTCAAAAATA TACCGTATAT CATATAGTAT CCAATGAATT AGGTAATGAA ACAACATTTT AAATTTTTGT TTGAAGGTGG GTGGGCCTTA CTGGGACGTT CCTGTGGGAA GAAAAGATTC  AAAAACAGCA AGCTACGAGC TTGCCACAAC AAACCTTCCA ACTCCAGAAG AGGGTGTGAT CAGCATCATC GCTAAGTTCT ATTCTCAGGG TCTCTCTGTT GAAGACATGG TCGCTCTTGT  AGGTAAGGAT CAATCCTATC TTGACCAAAC TAAACTGGAC AATTGATTTT TGGTATTGTG GTAAACCGGA TTACTAAATC CCTAACTTGA CCAATAATCT ATCTAGGAGC TCACACGATT  GGAATGGCAC AATGTCGGAA CTTTCGATCC CGGATCTATG GAAATTTTCA AGTGACGTCA GCCCTAAATC CTATTTCAGA GACGTACTTG TCAAGTCTCC GAAAGATATG TCCTTCGAAC  AGCGGAGAAG GTGATAACAA TGTGACGGCA ATGGACAATG TGACACCGAA TCTCTTCGAT AACTCGATCT ACCACACGCT GCTAAGAGGA GAAGGGTTAT TGAACTCAGA CCAGGAGATG  TACACGAGCA TGTTCGGGCT ACAAACGCGG CGGGTAGTGA GCAAGTATGC GGAGGATCCA GTGGCTTTCT TCGAGCAATT CTCGAAGTCG ATGGTGAAGA TGGGGAACAT TTTGAACTCT  GAAAGCTTTG TTGATGGAGA AGTGAGAAGA AATTGCAGAT TCGTTAATAC ATGAAACATC AACAACCAAA CAAAACAGTG GAGAAATAAA CTATTTCCGA TCATTTATTT ATTTAAGAAA  AAAAAATGAA ACCGATCTTA TTCTTCTCCT TATTTCTATT TCAAAAAAAT TATAGGGTTC TTGAATGTTT AAAAGAGCTT CCTCTGATAC AGTATCTTCT AAGGATTTTC AAATGATTTG 
CGTCTTAGTT G 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAACTCC TCCTTGTGTT CTTAATGGTT CACACCATCT TTATCCCCTG CTTTTCCCTT GATATAGTGG GAAAGGATCA TCCTTTAACC CTAGATTATT ACAAGTCTAC TTGTCCGACC  GTATTTGACG TCATCAAGAA AGAAATGGAA TGCATAGTGA AGGAAGATCC TAGAAATGCA GCCATACTTA TTCGTTTACA CTTCCACGAC TGCTTTGTTC AAGGGTGCGA TGGATCAGTG  TTGCTAGACG AAACAGCGAC ACTACAGGGA GAGAAGGAAG CTTCTCCCAA CATAAACTCA TTGAAAGGAT ACGAAATTGT AGACAGAATC AAGAACATAA TCGAATCCGA ATGTCCTGGA  GTCGTTTCCT GCGCTGATCT TCTCACAATC GGTGCTAGAG ATGCTACAAT CCTGGTGGGT GGGCCTTACT GGGACGTTCC TGTGGGAAGA AAAGATTCAA AAACAGCAAG CTACGAGCTT  GCCACAACAA ACCTTCCAAC TCCAGAAGAG GGTGTGATCA GCATCATCGC TAAGTTCTAT TCTCAGGGTC TCTCTGTTGA AGACATGGTC GCTCTTGTAG GAGCTCACAC GATTGGAATG  GCACAATGTC GGAACTTTCG ATCCCGGATC TATGGAAATT TTCAAGTGAC GTCAGCCCTA AATCCTATTT CAGAGACGTA CTTGTCAAGT CTCCGAAAGA TATGTCCTTC GAACAGCGGA  GAAGGTGATA ACAATGTGAC GGCAATGGAC AATGTGACAC CGAATCTCTT CGATAACTCG ATCTACCACA CGCTGCTAAG AGGAGAAGGG TTATTGAACT CAGACCAGGA GATGTACACG  AGCATGTTCG GGCTACAAAC GCGGCGGGTA GTGAGCAAGT ATGCGGAGGA TCCAGTGGCT TTCTTCGAGC AATTCTCGAA GTCGATGGTG AAGATGGGGA ACATTTTGAA CTCTGAAAGC 
TTTGTTGATG GAGAAGTGAG AAGAAATTGC AGATTCGTTA ATACATGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CAAACACTTT AACATTTTTC CCAAAAATTG GATCAAAAGG GTTTCTGAAA AAGAACTATG AAACTCCTCC TTGTGTTCTT AATGGTTCAC ACCATCTTTA TCCCCTGCTT TTCCCTTGAT  ATAGTGGGAA AGGATCATCC TTTAACCCTA GATTATTACA AGTCTACTTG TCCGACCGTA TTTGACGTCA TCAAGAAAGA AATGGAATGC ATAGTGAAGG AAGATCCTAG AAATGCAGCC  ATACTTATTC GTTTACACTT CCACGACTGC TTTGTTCAAG GGTGCGATGG ATCAGTGTTG CTAGACGAAA CAGCGACACT ACAGGGAGAG AAGGAAGCTT CTCCCAACAT AAACTCATTG  AAAGGATACG AAATTGTAGA CAGAATCAAG AACATAATCG AATCCGAATG TCCTGGAGTC GTTTCCTGCG CTGATCTTCT CACAATCGGT GCTAGAGATG CTACAATCCT GGTGGGTGGG  CCTTACTGGG ACGTTCCTGT GGGAAGAAAA GATTCAAAAA CAGCAAGCTA CGAGCTTGCC ACAACAAACC TTCCAACTCC AGAAGAGGGT GTGATCAGCA TCATCGCTAA GTTCTATTCT  CAGGGTCTCT CTGTTGAAGA CATGGTCGCT CTTGTAGGAG CTCACACGAT TGGAATGGCA CAATGTCGGA ACTTTCGATC CCGGATCTAT GGAAATTTTC AAGTGACGTC AGCCCTAAAT  CCTATTTCAG AGACGTACTT GTCAAGTCTC CGAAAGATAT GTCCTTCGAA CAGCGGAGAA GGTGATAACA ATGTGACGGC AATGGACAAT GTGACACCGA ATCTCTTCGA TAACTCGATC  TACCACACGC TGCTAAGAGG AGAAGGGTTA TTGAACTCAG ACCAGGAGAT GTACACGAGC ATGTTCGGGC TACAAACGCG GCGGGTAGTG AGCAAGTATG CGGAGGATCC AGTGGCTTTC  TTCGAGCAAT TCTCGAAGTC GATGGTGAAG ATGGGGAACA TTTTGAACTC TGAAAGCTTT GTTGATGGAG AAGTGAGAAG AAATTGCAGA TTCGTTAATA CATGAAACAT CAACAACCAA  ACAAAACAGT GGAGAAATAA ACTATTTCCG ATCATTTATT TATTTAAGAA AAAAAAATGA AACCGATCTT ATTCTTCTCC TTATTTCTAT TTCAAAAAAA TTATAGGGTT CTTGAATGTT 
TAAAAGAGCT TCCTCTGATA CAGTATCTTC TAAGGATTTT CAAATGATTT GCGTCTTAGT TG 

Retrieve as FASTA