Entry information : BstrPrx48Bostr.19046s0086
Entry ID 14975
Creation 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: BstrPrx48Bostr.19046s0086
Name BstrPrx48Bostr.19046s0086
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx142]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Boechera
Organism Boechera stricta    [TaxId: 72658 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value BstrPrx48
start..stop
S start..stop
CrubPrx37 561 0 1..323 1..323
BrPrx28-1Aa_other 526 0 1..322 1..323
AlyPrx28 519 0 1..322 1..321
AtPrx28 518 0 1..322 1..321
Literature and cross-references BstrPrx48Bostr.19046s0086
Protein sequence: BstrPrx48Bostr.19046s0086
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   322 (301)
PWM (Da):   %s   33986.12 (31573.7)  
PI (pH):   %s   5.34 (5.08) Peptide Signal:   %s   cut: 22 range:22-322
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKIANFSVPL LILFIFPVAL AQLRVGFYSQ SCPNAETIVQ NLVRQRFGGD PSITAALTRM HFHDCFVQGC DASLLIDPTT TQPSPEKTAG PNGSVRGFEL IDEIKTALEA QCPSTVSCSD  IVTLAARDSV ALAGGPSYFV STGRRDGFVS NLADAEGNLP GPGISVAGML GLFASKGMDV ADAVALLGAH TVGVASCGNF AFRVTNFQGT GQPDPSMDPS LVVRLRDTCA APGGFAALDQ 
SMPVTPFSFD NLFFSQIRAR KGILEIDQRL ATDPATSDVV SQYAANNELF KGRFAIAMVK MGAVDVLTGL AGEIRRNCRA FN* 

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Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AACATACCAC TATTACATTG CAACATTTTC CACCTAAACA AAATGAAGAT TGCAAACTTT TCTGTTCCAC TCTTGATTTT ATTTATTTTC CCCGTGGCAT TAGCACAGCT AAGAGTCGGG  TTTTACAGTC AATCGTGCCC TAATGCAGAG ACCATCGTAC AAAACCTGGT CCGCCAGCGG TTTGGTGGTG ACCCTTCAAT CACGGCCGCC TTGACTCGGA TGCATTTTCA CGACTGTTTT  GTCCAGGTAT GATTCTCATC AAACATCCAT CTTCAATTTT GATATCGTTA GGTTTACTAA AAGAGATGCA ATCAAAGAGA AATAATTATT CAGTCGAGTT GTATGTGTTG GCTATAAATA  TTTTCTTAAA ATAAAGTTGA ATAAGTCATT TTTTTAATTA TAAATTTACC GTTAATACAA AAACATGATT GTATATATTT TCTGAAAATT AACATAGATT TAAAAATTAA CTTGATTATT  ATATATGTAA TTTTCTTAAG AACAATTTCT CGTTGAAATC TCTAATAGGG CTGCGACGCT TCTCTCCTCA TAGACCCAAC GACGACTCAA CCATCACCGG AAAAAACCGC CGGCCCAAAC  GGCAGCGTCA GAGGGTTTGA GCTGATCGAC GAGATTAAGA CGGCACTCGA AGCTCAATGT CCCTCCACGG TCTCGTGCTC CGACATAGTC ACGCTCGCGG CACGTGACTC TGTGGCCTTA  GCCGGAGGAC CGAGCTACTT TGTCTCCACC GGACGTCGTG ATGGCTTTGT ATCGAACCTA GCAGACGCAG AGGGTAACCT CCCTGGACCA GGCATCTCTG TCGCAGGTAT GCTAGGTCTT  TTCGCCAGCA AAGGGATGGA CGTTGCTGAT GCGGTTGCTC TTTTGGGTGC GCACACGGTT GGTGTCGCTT CTTGTGGTAA TTTTGCGTTC CGGGTCACAA ACTTTCAAGG GACTGGACAG  CCCGACCCGT CTATGGACCC CAGTTTGGTT GTCAGGTAAT TATATTGGAA TTAAGTTATT AACTTTAGAT GGCTATATAG TAATGAAGTT TCTTACAAAA GAAGATCTTT AGTGATGTTT  CATTCGATAA TAATCCTAGG AAAAATATTT GCGTCTAGTG TGTAGAGTGT CAGATATTGT TGTCATTTAA ATCAAAGCAT AACGATGATT AACAATGATT AAATCATAGT AGGAAAAAAT  TAATTTACAA GGATTTGAAA CTACGAATTT GTTGGTAAGA AAACATAATA TATTTTGAAT ATTTCTCATA TAGGCTAAGG GACACATGTG CGGCTCCAGG CGGCTTCGCG GCACTGGACC  AGTCGATGCC AGTAACGCCG TTTTCATTCG ACAACTTGTT CTTTAGTCAG ATCAGAGCGA GGAAAGGAAT TTTGGAAATT GACCAGCGGC TCGCAACCGA CCCGGCCACT TCTGATGTTG  TGTCTCAGTA CGCCGCCAAC AACGAACTAT TCAAAGGCCG GTTCGCAATC GCGATGGTGA AGATGGGAGC CGTTGACGTG CTAACTGGTT TAGCCGGTGA GATCAGGAGG AATTGTAGAG  CATTCAACTA AAGCTTTATA ACTTCTTTCT AAATCTGATT CTTGATTGTT TTTTTTTTCC GCTGATGAAT TGTGAATGGT GATTGTTTGC TTATAATTAT ATGTATGTAT ATCTTTAAAA  TAAGGTTTGT TGAATCGATT TGATAACAAC AGTATGTTAA GTTGGTACCA GATTTGAGTG AATTGTGATG TATTTGAGTT TATCTGAGTC CAAACTAATT TCAGAGTTGT ATCTTTGTCA 
TGCTGATCAA GCACTTGGAT ATATATGTAT TTTTTTCC 

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CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGATTG CAAACTTTTC TGTTCCACTC TTGATTTTAT TTATTTTCCC CGTGGCATTA GCACAGCTAA GAGTCGGGTT TTACAGTCAA TCGTGCCCTA ATGCAGAGAC CATCGTACAA  AACCTGGTCC GCCAGCGGTT TGGTGGTGAC CCTTCAATCA CGGCCGCCTT GACTCGGATG CATTTTCACG ACTGTTTTGT CCAGGGCTGC GACGCTTCTC TCCTCATAGA CCCAACGACG  ACTCAACCAT CACCGGAAAA AACCGCCGGC CCAAACGGCA GCGTCAGAGG GTTTGAGCTG ATCGACGAGA TTAAGACGGC ACTCGAAGCT CAATGTCCCT CCACGGTCTC GTGCTCCGAC  ATAGTCACGC TCGCGGCACG TGACTCTGTG GCCTTAGCCG GAGGACCGAG CTACTTTGTC TCCACCGGAC GTCGTGATGG CTTTGTATCG AACCTAGCAG ACGCAGAGGG TAACCTCCCT  GGACCAGGCA TCTCTGTCGC AGGTATGCTA GGTCTTTTCG CCAGCAAAGG GATGGACGTT GCTGATGCGG TTGCTCTTTT GGGTGCGCAC ACGGTTGGTG TCGCTTCTTG TGGTAATTTT  GCGTTCCGGG TCACAAACTT TCAAGGGACT GGACAGCCCG ACCCGTCTAT GGACCCCAGT TTGGTTGTCA GGCTAAGGGA CACATGTGCG GCTCCAGGCG GCTTCGCGGC ACTGGACCAG  TCGATGCCAG TAACGCCGTT TTCATTCGAC AACTTGTTCT TTAGTCAGAT CAGAGCGAGG AAAGGAATTT TGGAAATTGA CCAGCGGCTC GCAACCGACC CGGCCACTTC TGATGTTGTG  TCTCAGTACG CCGCCAACAA CGAACTATTC AAAGGCCGGT TCGCAATCGC GATGGTGAAG ATGGGAGCCG TTGACGTGCT AACTGGTTTA GCCGGTGAGA TCAGGAGGAA TTGTAGAGCA 
TTCAACTAA 

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cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AACATACCAC TATTACATTG CAACATTTTC CACCTAAACA AAATGAAGAT TGCAAACTTT TCTGTTCCAC TCTTGATTTT ATTTATTTTC CCCGTGGCAT TAGCACAGCT AAGAGTCGGG  TTTTACAGTC AATCGTGCCC TAATGCAGAG ACCATCGTAC AAAACCTGGT CCGCCAGCGG TTTGGTGGTG ACCCTTCAAT CACGGCCGCC TTGACTCGGA TGCATTTTCA CGACTGTTTT  GTCCAGGGCT GCGACGCTTC TCTCCTCATA GACCCAACGA CGACTCAACC ATCACCGGAA AAAACCGCCG GCCCAAACGG CAGCGTCAGA GGGTTTGAGC TGATCGACGA GATTAAGACG  GCACTCGAAG CTCAATGTCC CTCCACGGTC TCGTGCTCCG ACATAGTCAC GCTCGCGGCA CGTGACTCTG TGGCCTTAGC CGGAGGACCG AGCTACTTTG TCTCCACCGG ACGTCGTGAT  GGCTTTGTAT CGAACCTAGC AGACGCAGAG GGTAACCTCC CTGGACCAGG CATCTCTGTC GCAGGTATGC TAGGTCTTTT CGCCAGCAAA GGGATGGACG TTGCTGATGC GGTTGCTCTT  TTGGGTGCGC ACACGGTTGG TGTCGCTTCT TGTGGTAATT TTGCGTTCCG GGTCACAAAC TTTCAAGGGA CTGGACAGCC CGACCCGTCT ATGGACCCCA GTTTGGTTGT CAGGCTAAGG  GACACATGTG CGGCTCCAGG CGGCTTCGCG GCACTGGACC AGTCGATGCC AGTAACGCCG TTTTCATTCG ACAACTTGTT CTTTAGTCAG ATCAGAGCGA GGAAAGGAAT TTTGGAAATT  GACCAGCGGC TCGCAACCGA CCCGGCCACT TCTGATGTTG TGTCTCAGTA CGCCGCCAAC AACGAACTAT TCAAAGGCCG GTTCGCAATC GCGATGGTGA AGATGGGAGC CGTTGACGTG  CTAACTGGTT TAGCCGGTGA GATCAGGAGG AATTGTAGAG CATTCAACTA AAGCTTTATA ACTTCTTTCT AAATCTGATT CTTGATTGTT TTTTTTTTCC GCTGATGAAT TGTGAATGGT  GATTGTTTGC TTATAATTAT ATGTATGTAT ATCTTTAAAA TAAGGTTTGT TGAATCGATT TGATAACAAC AGTATGTTAA GTTGGTACCA GATTTGAGTG AATTGTGATG TATTTGAGTT 
TATCTGAGTC CAAACTAATT TCAGAGTTGT ATCTTTGTCA TGCTGATCAA GCACTTGGAT ATATATGTAT TTTTTTCC 

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