Entry information : BstrPrx55Bostr.23794s0564
Entry ID 14982
Creation 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: BstrPrx55Bostr.23794s0564
Name BstrPrx55Bostr.23794s0564
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx042]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Boechera
Organism Boechera stricta    [TaxId: 72658 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value BstrPrx55
start..stop
S start..stop
AhalPrx14 650 0 1..336 1..336
CrubPrx116 649 0 1..336 1..337
CagraPrx24 646 0 1..336 1..337
AlyPrx20 645 0 1..336 1..336
Literature and cross-references BstrPrx55Bostr.23794s0564
Protein sequence: BstrPrx55Bostr.23794s0564
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   336 (312)
PWM (Da):   %s   37820.49 (35020.9) Transmb domain:   %s   i9-31o
PI (pH):   %s   6.26 (5.70) Peptide Signal:   %s   cut: 25 range:25-336
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MEIKQKKLWL YLIVLSAITT SALGEFGGPL LKGFYKESCP LAEEIVKHNV EVAVLKDPRM AASLLRLQFH DCFVLGCDAS VLLDKHGGMV SEKQATPNVN SLRGFEVIDY IKYLLEEACP  LTVSCSDIIA MAARDSVFLR GGPWWEVLLG RRDSLKASFA GANQFIPAPN SSLDSLIINF KQQGLDIKDL IALSGAHTIG KARCVSFKQR IVQPNIEQTF YVDEFKRQSS FRRVLRSQCK 
DSSRDNELSP LDIKTAAYFD NHYYINLLEG KGLLISDNVL VTEDHQGEIF RKVWEYAVDQ DLFFLNFVES MLKMGNINVL TGSEGEIREN CRFVNV* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AGGCAAGTTA GGTCCCTATT GGTCAATTTG GTTGTATCTA CCGTTGACAA AACTGTAACA TCCTTTGTGG TAAAAATTGG GCATGAAAAC ACACATAACG ACATATGATA ACATACAAGG  AACATTGATT CATGAAGCAC ACACATATAG TCATATGCAC ACACACACAG ATAGAGATGA ACAGAAACAC ATGACATAAC TTTCCAATGG AGATCAAGCA GAAGAAGCTA TGGCTTTATT  TAATTGTGCT TTCTGCAATT ACAACATCGG CTTTGGGGGA ATTTGGAGGA CCATTACTGA AGGGTTTCTA CAAAGAGAGT TGCCCATTGG CAGAGGAAAT CGTGAAGCAT AACGTCGAGG  TTGCTGTTCT CAAAGATCCT CGTATGGCGG CTTCTCTTCT TCGTCTTCAG TTCCACGATT GCTTCGTCTT GGTTAGAAAA TCGTCCCTCT CTACTCTTTT TATTTCCTCA TTTGTGAGTT  TTTTTATTCC GTTCTCTGAA ATCATAACTT TTTCAAGTAG TTTTGAGGCT CTGATTCTAT AGCATAATTG AATGGTATTT GAATTTGCGT GTATGAGAGT GAGATTGTCT TAGTGCGTCG  ATCTGATTTT CAATTGCGGG ATTTACCGTG GGTTTAGGGT TGTGATGCGT CTGTGCTCTT GGACAAACAT GGAGGTATGG TGAGTGAGAA ACAAGCAACT CCTAATGTGA ACTCTTTGCG  TGGATTCGAA GTAATTGACT ACATTAAGTA CCTCCTCGAA GAAGCTTGTC CTCTAACCGT CTCCTGTTCC GATATCATCG CCATGGCCGC TCGTGACTCA GTCTTCCTGG TAATTTCCCC  CTTACTCCTT AGGGTACTTT CTGATTAAAT CGAAACCTAT GGAGTTAATT TCCTTAAAAA ACACAAATAT TGTTTGGTAT CATCAGAGAG GTGGACCATG GTGGGAAGTT TTGCTAGGGA  GAAGAGACTC ATTAAAGGCA AGCTTCGCCG GCGCAAACCA ATTTATTCCG GCACCAAACT CCTCCCTCGA CAGCCTCATC ATTAATTTCA AGCAACAAGG CCTCGATATT AAAGATCTCA  TCGCTCTTTC GGGTGCTCAT ACGATAGGTA AAGCGAGATG CGTGAGCTTC AAGCAACGAA TTGTTCAACC AAACATAGAA CAAACATTCT ACGTCGATGA GTTCAAGAGA CAAAGCTCAT  TCAGGCGAGT CCTACGGTCA CAATGCAAAG ATTCCAGCCG CGACAACGAA CTGTCACCAT TGGATATAAA GACAGCAGCC TACTTTGATA ACCATTATTA CATCAATCTG TTAGAGGGGA  AAGGGTTGTT GATTTCGGAT AACGTTCTGG TCACAGAAGA TCATCAAGGA GAGATCTTTC GCAAGGTTTG GGAATATGCA GTTGATCAAG ATCTCTTTTT CCTGAATTTT GTAGAATCTA 
TGTTGAAAAT GGGTAATATT AATGTTCTTA CTGGTAGTGA AGGTGAAATT AGGGAGAATT GTAGATTTGT CAATGTTTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGATCA AGCAGAAGAA GCTATGGCTT TATTTAATTG TGCTTTCTGC AATTACAACA TCGGCTTTGG GGGAATTTGG AGGACCATTA CTGAAGGGTT TCTACAAAGA GAGTTGCCCA  TTGGCAGAGG AAATCGTGAA GCATAACGTC GAGGTTGCTG TTCTCAAAGA TCCTCGTATG GCGGCTTCTC TTCTTCGTCT TCAGTTCCAC GATTGCTTCG TCTTGGGTTG TGATGCGTCT  GTGCTCTTGG ACAAACATGG AGGTATGGTG AGTGAGAAAC AAGCAACTCC TAATGTGAAC TCTTTGCGTG GATTCGAAGT AATTGACTAC ATTAAGTACC TCCTCGAAGA AGCTTGTCCT  CTAACCGTCT CCTGTTCCGA TATCATCGCC ATGGCCGCTC GTGACTCAGT CTTCCTGAGA GGTGGACCAT GGTGGGAAGT TTTGCTAGGG AGAAGAGACT CATTAAAGGC AAGCTTCGCC  GGCGCAAACC AATTTATTCC GGCACCAAAC TCCTCCCTCG ACAGCCTCAT CATTAATTTC AAGCAACAAG GCCTCGATAT TAAAGATCTC ATCGCTCTTT CGGGTGCTCA TACGATAGGT  AAAGCGAGAT GCGTGAGCTT CAAGCAACGA ATTGTTCAAC CAAACATAGA ACAAACATTC TACGTCGATG AGTTCAAGAG ACAAAGCTCA TTCAGGCGAG TCCTACGGTC ACAATGCAAA  GATTCCAGCC GCGACAACGA ACTGTCACCA TTGGATATAA AGACAGCAGC CTACTTTGAT AACCATTATT ACATCAATCT GTTAGAGGGG AAAGGGTTGT TGATTTCGGA TAACGTTCTG  GTCACAGAAG ATCATCAAGG AGAGATCTTT CGCAAGGTTT GGGAATATGC AGTTGATCAA GATCTCTTTT TCCTGAATTT TGTAGAATCT ATGTTGAAAA TGGGTAATAT TAATGTTCTT 
ACTGGTAGTG AAGGTGAAAT TAGGGAGAAT TGTAGATTTG TCAATGTTTG A 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AGGCAAGTTA GGTCCCTATT GGTCAATTTG GTTGTATCTA CCGTTGACAA AACTGTAACA TCCTTTGTGG TAAAAATTGG GCATGAAAAC ACACATAACG ACATATGATA ACATACAAGG  AACATTGATT CATGAAGCAC ACACATATAG TCATATGCAC ACACACACAG ATAGAGATGA ACAGAAACAC ATGACATAAC TTTCCAATGG AGATCAAGCA GAAGAAGCTA TGGCTTTATT  TAATTGTGCT TTCTGCAATT ACAACATCGG CTTTGGGGGA ATTTGGAGGA CCATTACTGA AGGGTTTCTA CAAAGAGAGT TGCCCATTGG CAGAGGAAAT CGTGAAGCAT AACGTCGAGG  TTGCTGTTCT CAAAGATCCT CGTATGGCGG CTTCTCTTCT TCGTCTTCAG TTCCACGATT GCTTCGTCTT GGGTTGTGAT GCGTCTGTGC TCTTGGACAA ACATGGAGGT ATGGTGAGTG  AGAAACAAGC AACTCCTAAT GTGAACTCTT TGCGTGGATT CGAAGTAATT GACTACATTA AGTACCTCCT CGAAGAAGCT TGTCCTCTAA CCGTCTCCTG TTCCGATATC ATCGCCATGG  CCGCTCGTGA CTCAGTCTTC CTGAGAGGTG GACCATGGTG GGAAGTTTTG CTAGGGAGAA GAGACTCATT AAAGGCAAGC TTCGCCGGCG CAAACCAATT TATTCCGGCA CCAAACTCCT  CCCTCGACAG CCTCATCATT AATTTCAAGC AACAAGGCCT CGATATTAAA GATCTCATCG CTCTTTCGGG TGCTCATACG ATAGGTAAAG CGAGATGCGT GAGCTTCAAG CAACGAATTG  TTCAACCAAA CATAGAACAA ACATTCTACG TCGATGAGTT CAAGAGACAA AGCTCATTCA GGCGAGTCCT ACGGTCACAA TGCAAAGATT CCAGCCGCGA CAACGAACTG TCACCATTGG  ATATAAAGAC AGCAGCCTAC TTTGATAACC ATTATTACAT CAATCTGTTA GAGGGGAAAG GGTTGTTGAT TTCGGATAAC GTTCTGGTCA CAGAAGATCA TCAAGGAGAG ATCTTTCGCA  AGGTTTGGGA ATATGCAGTT GATCAAGATC TCTTTTTCCT GAATTTTGTA GAATCTATGT TGAAAATGGG TAATATTAAT GTTCTTACTG GTAGTGAAGG TGAAATTAGG GAGAATTGTA 
GATTTGTCAA TGTTTGA 

Retrieve as FASTA