Entry information : BstrPrx[P]56 (Bostr.26527s0212)
Entry ID 14983
Creation 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Sequence status theoretical translation / pseudogene
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2018-03-07 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: BstrPrx[P]56 (Bostr.26527s0212)
Name (synonym) BstrPrx[P]56 (Bostr.26527s0212)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx056]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Boechera
Organism Boechera stricta    [TaxId: 72658 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value BstrPrx[P]56
start..stop
S start..stop
AlyPrx58 521 0 1..275 1..275
AtPrx58 513 0 1..275 1..275
TsPrx58-1 505 0 1..275 1..276
AhalPrx63 499 0 16..275 1..260
Literature and cross-references BstrPrx[P]56 (Bostr.26527s0212)
Protein sequence: BstrPrx[P]56 (Bostr.26527s0212)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   283 (261)
PWM (Da):   %s   30553.35 (27891.9)  
PI (pH):   %s   4.81 (4.61) Peptide Signal:   %s   cut: 23 range:23-283
Sequence
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Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGLNKIIPFI LLSIWMFGVL NNTQLCSDFY STTCPNATVI ARGLIEQASR SDVRLTAKVM RLHFHDCFVN GCDGSVLLDA APADGVEGEK EAFQNAGSLD GFEVIDDIKT ALENVCPGVV  SCADILAIAA EISVALAGGP SWDVLLGRRD GRTAIRADAV AALPLGPDSL EILTSKFSVH NLDTTDLVAL SGAHTFGRVQ CGVINNRLHN FNGNNGQSNR SIEPKFLTTL RRQCPQGGDV 
TTRVNLDPTS PDSFDNAYFK NLQNNRGVIE SDQILPDNYF PKF* 

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Remarks Pseudogene from genomic. Part of the last exon is missing.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CTCTAGGCTT CTTCTCTCTA TCTCTCACCT TTACAAACAA AGGGAGACCA AAAATGGGTC TAAACAAAAT TATTCCCTTT ATTTTACTCT CAATTTGGAT GTTTGGGGTT TTGAATAATA  CTCAGCTTTG CTCTGATTTT TACTCCACGA CCTGTCCTAA CGCCACAGTC ATCGCTCGGG GTTTGATCGA GCAAGCTAGC CGTAGCGATG TCAGACTCAC TGCTAAAGTC ATGCGTCTTC  ACTTTCACGA CTGTTTCGTG AACGTAAGAT CTATTTCTAT ATTAAAGTTT TGTTATACAT GCATATGTAT AATAATGAAA CCGATTGTTT AGTGCACATG TGTTCTCATG ATTCATGTTA  AATATCTAAA CTAGCACATG TGAAAATTTA TGAAGGGAGC TAACTCAGAC ATGACTTTAC ATACTCGTTG ACTTTACAAA TTTATGAAAA TTTTATTAGG CCGCATTTAT TTTATTTTTA  TGTTTAATGG GCTATTAATT GTTCATACTC GTCGTTTGAC CAAAAAAAGT ACATACTCGT TGTAAAGGGT GATGAACTTC AAACCGAGGA AAATTAAGTT TAGAGTTTTG CATTAGTGGA  GTCATCAAGG TCAAATTTGA ACTTTCTTGA TGTTTTGATT ATATATGTTT GACTATTGCT TGTCACTAAG CTTGGTTGTC ATATTCAGAT AAGTAACGGT CTTTCTAAAC CCAAACTAAA  ATATATATAC CTTTGTTGTT CTTCTTCTCT AATAATAAAC TAAGAAAAGT ATAGACATAT ATATACGTTG TCAAAAATAC ATAGTTAGGT TTATTTTGTT AGTGGAATTA GGTTTCTTTA  AAATAAATTA AACATGCATA AAATATTGAA GTCATAGTGT GTGAACACAG GGGTGCGATG GTTCGGTACT ATTGGATGCT GCTCCTGCGG ATGGAGTAGA GGGAGAAAAG GAGGCTTTCC  AAAACGCGGG TTCTCTTGAC GGATTTGAAG TGATTGATGA TATCAAAACC GCCCTCGAGA ATGTTTGTCC TGGAGTTGTT TCTTGTGCCG ATATCCTCGC CATCGCAGCT GAAATCTCTG  TCGCACTGGT AATAATATAA TTCTCAAAGT TTATGTGCTT TTAGATTCCC TTTTTAAACC GATGAAAACA TAAACATAAC CATAATGGAT GTTGTTGACA AAAAAAAAAA AATTTCATGA  AAAGATTATA ATATACCAAA GAAATACTAA TGTTTCTTTT TAAATATTTA TATCATATTT TAGGCGGGGG GGCCGTCATG GGACGTATTG CTAGGAAGGA GAGATGGCCG GACGGCTATC  CGTGCGGACG CGGTGGCTGC ACTTCCACTA GGACCTGATT CTCTCGAGAT TCTTACTTCC AAATTCTCCG TACATAATCT TGACACTACC GATCTCGTCG CTTTATCTGG TAATGTACTT  TCGAGTCTTA ATATATATAT TTTTTATTTT GTCATCTTGG TCATCTCAAA AATATGAGTA TAATTTATAG AGTATAAAGA TCAAATACTT GAGTAGTACT TTGTTACAAT ATATCTTAAG  GAATAACTAT GAATCATAAT AATGTACATG CAGGTGCTCA TACCTTCGGG AGGGTTCAGT GTGGAGTGAT AAACAATCGT CTGCACAATT TTAATGGTAA CAATGGACAG TCAAATCGGA  GTATTGAACC CAAGTTTTTG ACAACGTTGC GACGACAATG CCCGCAAGGC GGAGATGTCA CCACGAGGGT GAATCTTGAT CCTACGAGCC CCGACTCATT TGATAACGCC TATTTTAAGA  ACCTTCAAAA CAACCGCGGT GTGATAGAAT CAGATCAAAT CTTGCCAGAC AACTATTTTC CGAAGTTTTA ACAATCCCAA ATATAGATGA AAGAAAGCTC TCTGAGCTAG TTTCTAAGAT  ATCAAAAATC ATCGTGATCA GACCCATGTG TTAATAATAG TTACAGTTGT CCGCATTTCA AACTGCACGA GATACCGCAA GATGGTCGGT CCTTGTTGGA TACTTAGAAT TGCCTTTGTT 
TGCTTCCTTG GAGATAAAAA ATCTGGCC 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGTCTAA ACAAAATTAT TCCCTTTATT TTACTCTCAA TTTGGATGTT TGGGGTTTTG AATAATACTC AGCTTTGCTC TGATTTTTAC TCCACGACCT GTCCTAACGC CACAGTCATC  GCTCGGGGTT TGATCGAGCA AGCTAGCCGT AGCGATGTCA GACTCACTGC TAAAGTCATG CGTCTTCACT TTCACGACTG TTTCGTGAAC GGGTGCGATG GTTCGGTACT ATTGGATGCT  GCTCCTGCGG ATGGAGTAGA GGGAGAAAAG GAGGCTTTCC AAAACGCGGG TTCTCTTGAC GGATTTGAAG TGATTGATGA TATCAAAACC GCCCTCGAGA ATGTTTGTCC TGGAGTTGTT  TCTTGTGCCG ATATCCTCGC CATCGCAGCT GAAATCTCTG TCGCACTGGC GGGGGGGCCG TCATGGGACG TATTGCTAGG AAGGAGAGAT GGCCGGACGG CTATCCGTGC GGACGCGGTG  GCTGCACTTC CACTAGGACC TGATTCTCTC GAGATTCTTA CTTCCAAATT CTCCGTACAT AATCTTGACA CTACCGATCT CGTCGCTTTA TCTGGTGCTC ATACCTTCGG GAGGGTTCAG  TGTGGAGTGA TAAACAATCG TCTGCACAAT TTTAATGGTA ACAATGGACA GTCAAATCGG AGTATTGAAC CCAAGTTTTT GACAACGTTG CGACGACAAT GCCCGCAAGG CGGAGATGTC  ACCACGAGGG TGAATCTTGA TCCTACGAGC CCCGACTCAT TTGATAACGC CTATTTTAAG AACCTTCAAA ACAACCGCGG TGTGATAGAA TCAGATCAAA TCTTGCCAGA CAACTATTTT 
CCGAAGTTTT AA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CTCTAGGCTT CTTCTCTCTA TCTCTCACCT TTACAAACAA AGGGAGACCA AAAATGGGTC TAAACAAAAT TATTCCCTTT ATTTTACTCT CAATTTGGAT GTTTGGGGTT TTGAATAATA  CTCAGCTTTG CTCTGATTTT TACTCCACGA CCTGTCCTAA CGCCACAGTC ATCGCTCGGG GTTTGATCGA GCAAGCTAGC CGTAGCGATG TCAGACTCAC TGCTAAAGTC ATGCGTCTTC  ACTTTCACGA CTGTTTCGTG AACGGGTGCG ATGGTTCGGT ACTATTGGAT GCTGCTCCTG CGGATGGAGT AGAGGGAGAA AAGGAGGCTT TCCAAAACGC GGGTTCTCTT GACGGATTTG  AAGTGATTGA TGATATCAAA ACCGCCCTCG AGAATGTTTG TCCTGGAGTT GTTTCTTGTG CCGATATCCT CGCCATCGCA GCTGAAATCT CTGTCGCACT GGCGGGGGGG CCGTCATGGG  ACGTATTGCT AGGAAGGAGA GATGGCCGGA CGGCTATCCG TGCGGACGCG GTGGCTGCAC TTCCACTAGG ACCTGATTCT CTCGAGATTC TTACTTCCAA ATTCTCCGTA CATAATCTTG  ACACTACCGA TCTCGTCGCT TTATCTGGTG CTCATACCTT CGGGAGGGTT CAGTGTGGAG TGATAAACAA TCGTCTGCAC AATTTTAATG GTAACAATGG ACAGTCAAAT CGGAGTATTG  AACCCAAGTT TTTGACAACG TTGCGACGAC AATGCCCGCA AGGCGGAGAT GTCACCACGA GGGTGAATCT TGATCCTACG AGCCCCGACT CATTTGATAA CGCCTATTTT AAGAACCTTC  AAAACAACCG CGGTGTGATA GAATCAGATC AAATCTTGCC AGACAACTAT TTTCCGAAGT TTTAACAATC CCAAATATAG ATGAAAGAAA GCTCTCTGAG CTAGTTTCTA AGATATCAAA  AATCATCGTG ATCAGACCCA TGTGTTAATA ATAGTTACAG TTGTCCGCAT TTCAAACTGC ACGAGATACC GCAAGATGGT CGGTCCTTGT TGGATACTTA GAATTGCCTT TGTTTGCTTC 
CTTGGAGATA AAAAATCTGG CC 

Retrieve as FASTA