Entry information : BstrPrx65 (Bostr.23794s0235)
Entry ID 14992
Creation 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Sequence status partial
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2018-03-07 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: BstrPrx65 (Bostr.23794s0235)
Name (synonym) BstrPrx65 (Bostr.23794s0235)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx040]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Boechera
Organism Boechera stricta    [TaxId: 72658 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value BstrPrx65
start..stop
S start..stop
AhalPrx38 304 1e-104 1..190 1..213
AhalPrx38 108 2e-28 150..203 296..349
AlyPrx22 303 1e-104 1..190 1..213
AlyPrx22 105 2e-27 150..203 296..349
AtPrx22 296 2e-101 1..190 1..213
AtPrx22 106 8e-28 150..203 296..349
AhalPrx26 287 5e-100 1..149 1..149
Literature and cross-references BstrPrx65 (Bostr.23794s0235)
Protein sequence: BstrPrx65 (Bostr.23794s0235)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   203 (174)
PWM (Da):   %s   22134.09 (19119.7)  
PI (pH):   %s   7.15 (7.21) Peptide Signal:   %s   cut: 30 range:30-203
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGFSPSFSCS AMGALILGCL LLQTSNSNAQ LRPDFYFGTC PPVFDIIGNT IVDELQTDPR IAASLLRLHF HDCFVRGCDA SILLDNSTSF RTEKDAAPNA NSARGFNVID RMKVALERAC 
PRTVSCADIL TIASQISVLL SGGPWWPVPS NMSVFFRAFV DAMIRMGNLR PLTGTQGEIR QNCRVVNSRI RVVENDDGVV SSI* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Partial sequence from genomic. Fragment is missing due to N in the sequence.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGGTTTT CGCCTTCATT TTCTTGCAGT GCTATGGGAG CCCTAATATT GGGTTGCCTT CTGCTTCAAA CATCAAACTC TAATGCTCAG TTGAGGCCTG ACTTCTACTT CGGGACTTGT  CCACCTGTTT TCGATATCAT TGGGAATACC ATCGTCGATG AACTGCAGAC TGATCCTCGT ATTGCCGCGA GCCTCCTTCG TCTTCACTTC CATGACTGCT TTGTTCGGGT AACGACTTAC  TTAACTTATA TTTTATTAAA GAAATCCACG TCGTCTACTT TTACATACCA TTTACATAAA CATAGAGCAG AGGCTAAAAG TCATTTTTGA ATTAATAAAT CATATCGTCA TGTATATATA  TATGGCTTTT GTAGGGTTGT GATGCATCAA TCTTGCTTGA CAATTCCACA TCATTCCGGA CCGAGAAAGA TGCTGCTCCA AACGCAAATT CGGCTCGAGG GTTCAATGTC ATAGATAGAA  TGAAAGTAGC CCTTGAGAGA GCTTGCCCAA GAACAGTGTC TTGTGCAGAT ATTCTCACCA TCGCCTCTCA AATATCAGTG CTTTTGGTAT ATAAATATAT ACATGGCTTA TCTCGGATGA  AACTAATCGA AAAATATTAT GATTTTGACG GCGATGTTTT ATGTTATATA GTCGGGAGGT CCATGGTGGC CGGTACCGTT GGGGAGGAGA GACAGCGTAG AAGCTTTCTT CGATTTGGCT  AATACnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnACGATCC CACTAGTAAA CCTATACAGC AGCAACATGT CCGTGTTCTT TCGAGCATTC GTTGACGCAA TGATAAGGAT GGGTAATCTT AGACCTTTGA 
CTGGAACTCA AGGCGAGATA AGACAGAATT GTAGGGTTGT GAATTCACGA ATTAGGGTTG TGGAGAACGA CGATGGTGTT GTGAGTTCTA TTTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGGTTTT CGCCTTCATT TTCTTGCAGT GCTATGGGAG CCCTAATATT GGGTTGCCTT CTGCTTCAAA CATCAAACTC TAATGCTCAG TTGAGGCCTG ACTTCTACTT CGGGACTTGT  CCACCTGTTT TCGATATCAT TGGGAATACC ATCGTCGATG AACTGCAGAC TGATCCTCGT ATTGCCGCGA GCCTCCTTCG TCTTCACTTC CATGACTGCT TTGTTCGGGG TTGTGATGCA  TCAATCTTGC TTGACAATTC CACATCATTC CGGACCGAGA AAGATGCTGC TCCAAACGCA AATTCGGCTC GAGGGTTCAA TGTCATAGAT AGAATGAAAG TAGCCCTTGA GAGAGCTTGC  CCAAGAACAG TGTCTTGTGC AGATATTCTC ACCATCGCCT CTCAAATATC AGTGCTTTTG TCGGGAGGTC CATGGTGGCC GGTACCCAGC AACATGTCCG TGTTCTTTCG AGCATTCGTT  GACGCAATGA TAAGGATGGG TAATCTTAGA CCTTTGACTG GAACTCAAGG CGAGATAAGA CAGAATTGTA GGGTTGTGAA TTCACGAATT AGGGTTGTGG AGAACGACGA TGGTGTTGTG 
AGTTCTATTT GA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGGTTTT CGCCTTCATT TTCTTGCAGT GCTATGGGAG CCCTAATATT GGGTTGCCTT CTGCTTCAAA CATCAAACTC TAATGCTCAG TTGAGGCCTG ACTTCTACTT CGGGACTTGT  CCACCTGTTT TCGATATCAT TGGGAATACC ATCGTCGATG AACTGCAGAC TGATCCTCGT ATTGCCGCGA GCCTCCTTCG TCTTCACTTC CATGACTGCT TTGTTCGGGG TTGTGATGCA  TCAATCTTGC TTGACAATTC CACATCATTC CGGACCGAGA AAGATGCTGC TCCAAACGCA AATTCGGCTC GAGGGTTCAA TGTCATAGAT AGAATGAAAG TAGCCCTTGA GAGAGCTTGC  CCAAGAACAG TGTCTTGTGC AGATATTCTC ACCATCGCCT CTCAAATATC AGTGCTTTTG TCGGGAGGTC CATGGTGGCC GGTACCCAGC AACATGTCCG TGTTCTTTCG AGCATTCGTT  GACGCAATGA TAAGGATGGG TAATCTTAGA CCTTTGACTG GAACTCAAGG CGAGATAAGA CAGAATTGTA GGGTTGTGAA TTCACGAATT AGGGTTGTGG AGAACGACGA TGGTGTTGTG 
AGTTCTATTT GA 

Retrieve as FASTA