Entry information : NtPrx06-1A(Nitab4.5_0001149g0070 / TOBCPI38KA)
Entry ID 15
Creation 2006-06-15 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2006-06-15 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2022-07-27 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NtPrx06-1A(Nitab4.5_0001149g0070 / TOBCPI38KA)
Name NtPrx06-1A(Nitab4.5_0001149g0070 / TOBCPI38KA)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx011]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Nicotiana
Organism Nicotiana tabacum    [TaxId: 4097 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NtPrx06-1A
start..stop
S start..stop
NtPrx06-1B 637 0 1..329 1..331
StPrx76 550 0 1..329 1..328
StPrx53 550 0 1..329 1..329
LePrx64 547 0 7..329 5..328
Literature and cross-references NtPrx06-1A(Nitab4.5_0001149g0070 / TOBCPI38KA)
Literature Matsumoto,S., Narita,H., Ikura,K. and Sasaki,R.Nucleotide sequence of cationic peroxidases (Accession No.D42065,D42064) abundantly secreted by cultured tobacco cells Plant Physiol. 110, 713-714 (1996)
Protein ref. UniProtKB:   Q40486
EST ref. GenBank:   FS403271.1 [5' end]  BP533869.1 [3' end]
Cluster/Prediction ref. UniGene:   Nta.7230
Protein sequence: NtPrx06-1A(Nitab4.5_0001149g0070 / TOBCPI38KA)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   329 (305)
PWM (Da):   %s   35914.32 (33366.9) Transmb domain:   %s   i7-29o
PI (pH):   %s   8.64 (8.56) Peptide Signal:   %s   cut: 25 range:25-329
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MRTAQLLLLS FLVFLSIVVC GVSGAGNNVP RKNFYKNTRC PNAEQFVRDI TWSKAKNDAT LSAKLLRLHY HDCFVRGCDA SILLDKVGTD QSEKEARPNL SLGGFDVIDD IKRQVEEKCP  EIVSCADILA LAARDAVSFP FKKSLWDVAT GRKDGNVSFG SEVNGNLPSP FSDFATLQQL FAKKGLNVND LVALSGAHTI GVAHCGAFSR RLFNFTGKGD MDPSLNPTYV ESLKQLCPNP 
ANPATTVEMD PQSSTSFDSN YFNILTQNKG LFQSDAVLLT DKKSAKVVKQ LQKTNTFFSE FAKSMQKMGA IEVLTGNAGE IRKSCRVRN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and 4 ESTs (FS373252.1, FS429416.1). Uncorrect prediction from SGN. Splicing error intron 3.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGAACTG CTCAATTACT GCTACTAAGT TTTCTTGTTT TTCTTTCTAT TGTTGTTTGT GGAGTTTCGG GTGCAGGAAA TAATGTGCCA CGCAAGAATT TCTACAAGAA CACTCGTTGT  CCAAATGCTG AACAATTTGT TAGAGATATC ACTTGGAGCA AAGCTAAGAA TGACGCTACT TTGAGTGCTA AATTGCTTCG ACTCCACTAC CATGATTGTT TCGTTAGGGT ACGTCTACGT  ATTAGAATTA CTATATACCA TGCACACGTT AATCTCATAG GATTTTTGTT ATATTCACTG ACTGCATGAA GATCTTTTTC AGTATCACTG TAATTTAATG GTACTATGGT GTAGCATATT  ATTTATCATA TTTCTTCAAA CATTATTCAT TGGCATTATT TGCTATGCAA TTTTGCAGGG ATGTGATGCA TCGATATTGC TGGATAAAGT TGGAACAGAT CAATCTGAGA AGGAGGCCAG  GCCAAACCTC TCGTTGGGTG GTTTCGATGT AATTGATGAT ATCAAGCGAC AAGTTGAGGA AAAATGTCCT GAGATTGTTT CTTGTGCTGA CATTTTAGCA TTAGCTGCTC GTGATGCTGT  TTCTTTTCCT GTAAGTATTC TCATATATAA TTGAACCTAT TTAACTACAT AATTTGAGTT ATATATGCTA ACAGTATAAA GAATTCAGTA TTCATTTACA TAATGAATCA TTTTCTTAAT  TATTTCTTTC TCTCTAACTT CTGCAGTTTA AGAAATCGCT ATGGGATGTG GCGACCGGAA GAAAAGATGG GAATGTTTCC TTTGGGAGTG AAGTGAACGG AAACTTACCT TCACCATTCT  CAGATTTTGC CACCCTTCAG CAACTCTTTG CAAAGAAAGG ACTAAATGTC AATGATCTTG TTGCATTATC AGGTAAAATA TTAATCATAC AAAGCGAACT GTACGCAAAG GCGAAGCCAG  GATTTGAATT TATGGATTTT AAATTCTAGG ATAACGGCAT CATGTGTTAA TAATTGGATC TTAAATTTAA TTTTTGTACA TATTTAGAGG ATTTCTTAAT GCAAATATAG AATTTTGACT  AATTTTATCG GATGAACTTG TATGTAACCT TTTATCTTCA CCCTTGATTG TATAATGAAT TCGTTCATAC ATTATCAAGT CATCTGAAAG ATAACTACAA GTAATCGTCC ATAAAAAGCG  TGGCTATTAA CCTGAAAAAC AAAGTAGGTT ACTGTTTAGC AGAAAATATA TCTTTTGATC AAATTTTAAT TTTAGAAGAA AAATGGGTTA CTGATAACCC ACTTTTGCTT CACTTTCTCA  ATGATATCAA AGGAAATAAT AAGAATAACT AAGGAAATAA ATTGATTGCA AAGTCAAGGT AGAGAATTTC GAAAAAGCAG AAAAGTAAAG TGTTTATTTC AATATTGTCT CAGATCTGTC  CTTACAAATA GAAATCTATG TCCTTATATA GGAATATACA ATAGTAACGA TTTTTTCTCA TAATTTGGGT TAATTATGGT CATTAATGAC ATTGATTTCC CATTATTTTG GATTCTTACA  ACTGACGCAT TTATTGCTAT AAATGTCTTA TATCCGTTCC AATTCTCCTT CCTTATTTCC TTCTGGTTCA TGTATCTTTC CTTCTTTTTA CTATTTATTC ATTCCTTGCC AGCTATTAGT  TCCGGTAACG TCTCGTGGGT ATTTCTTCCC GTGCCTTTTC TTTTTCTATC AAATAAGATT GCCACGTGTC GCTATATTAC TGTTCCACGC GTTATGCCAT GTCAACAATC TAATATTCCA  CGTGTAGCAC CTTTTCACCA CCAATACAGT TACCTTCTGC AATAAGCTAA TACCAAATAA ATGATATTAG TAACTATATA CATACTGTCA GTATATATAA CCTAAATCCT TGAGTATATC  CTTCATCCAT GCATGCAGGT GCTCACACAA TTGGTGTTGC TCATTGTGGA GCTTTCTCTA GAAGACTCTT CAATTTCACA GGCAAAGGTG ACATGGATCC ATCTTTAAAT CCTACTTATG  TTGAATCTTT GAAACAATTG TGCCCTAATC CAGCAAACCC AGCCACTACT GTGGAAATGG ACCCTCAGAG CTCAACTTCA TTTGACAGCA ATTATTTCAA CATCCTTACT CAGAACAAAG  GGTTGTTCCA ATCTGATGCA GTCCTCCTCA CAGACAAAAA ATCAGCTAAA GTTGTGAAAC AGCTGCAAAA AACTAATACC TTTTTTTCTG AGTTTGCTAA ATCCATGCAG AAAATGGGAG 
CCATTGAAGT TCTTACTGGA AATGCTGGAG AAATCAGGAA GAGTTGCCGC GTCAGAAACT AA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CTTAATTCTA ATTAGGTTTA AGTCCTTTGA CATTATTGTC TTGTTTTCAT TTCCTAGCAA GGAATAAAAA GAAAATGAGA ACTGCTCAAT TACTGCTACT AAGTTTTCTT GTTTTTCTTT  CTATTGTTGT TTGTGGAGTT TCGGGTGCAG GAAATAATGT GCCACGCAAG AATTTCTACA AGAACACTCG TTGTCCAAAT GCTGAACAAT TTGTTAGAGA TATCACTTGG AGCAAAGCTA  AGAATGACGC TACTTTGAGT GCTAAATTGC TTCGACTCCA CTACCATGAT TGTTTCGTTA GGGGATGTGA TGCATCGATA TTGCTGGATA AAGTTGGAAC AGATCAATCT GAGAAGGAGG  CCAGGCCAAA CCTCTCGTTG GGTGGTTTCG ATGTAATTGA TGATATCAAG CGACAAGTTG AGGAAAAATG TCCTGAGATT GTTTCTTGTG CTGACATTTT AGCATTAGCT GCTCGTGATG  CTGTTTCTTT TCCTTTTAAG AAATCGCTAT GGGATGTGGC GACCGGAAGA AAAGATGGGA ATGTTTCCTT TGGGAGTGAA GTGAACGGAA ACTTACCTTC ACCATTCTCA GATTTTGCCA  CCCTTCAGCA ACTCTTTGCA AAGAAAGGAC TAAATGTCAA TGATCTTGTT GCATTATCAG GTGCTCACAC AATTGGTGTT GCTCATTGTG GAGCTTTCTC TAGAAGACTC TTCAATTTCA  CAGGCAAAGG TGACATGGAT CCATCTTTAA ATCCTACTTA TGTTGAATCT TTGAAACAAT TGTGCCCTAA TCCAGCAAAC CCAGCCACTA CTGTGGAAAT GGACCCTCAG AGCTCAACTT  CATTTGACAG CAATTATTTC AACATCCTTA CTCAGAACAA AGGGTTGTTC CAATCTGATG CAGTCCTCCT CACAGACAAA AAATCAGCTA AAGTTGTGAA ACAGCTGCAA AAAACTAATA  CCTTTTTTTC TGAGTTTGCT AAATCCATGC AGAAAATGGG AGCCATTGAA GTTCTTACTG GAAATGCTGG AGAAATCAGG AAGAGTTGCC GCGTCAGAAA CTAATTCTGA AAACCTATGA  TTAATTTTAT GTCATATATG TAATCTCAAA AGTGTACAAC ATCTGGTATT TAATTTGTGT CTATTTGTTT CTTTTCCTTT TTGAAAGTGA TGTGTTATTT GGGTTGGAAT ACGTGCTTCA 
ATAAATTTGA AATAATGTAT CTGAGCGGCC GCGA 

Retrieve as FASTA