Entry information : CrubPrx109Carubv10001453m.g
Entry ID 15023
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CrubPrx109Carubv10001453m.g
Name CrubPrx109Carubv10001453m.g
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx048]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubPrx109
start..stop
S start..stop
BstrPrx35 600 0 1..324 1..329
AlyPrx56-1 591 0 1..324 1..329
AhalPrx41 588 0 1..324 1..327
AtPrx56 587 0 1..324 1..329
Literature and cross-references CrubPrx109Carubv10001453m.g
Protein sequence: CrubPrx109Carubv10001453m.g
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   324 (293)
PWM (Da):   %s   35836.54 (32461.8)  
PI (pH):   %s   9.77 (9.86) Peptide Signal:   %s   cut: 32 range:32-324
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAALRMTISC VILLQVLSCL LSSFAPTNVQ GLKVGFYDKA CPKAELIVKK FVFEAMKKDP TLGAPLLRLF FHDCFVRGCE GSVLLELKNK KDEKNAMPNL SLRGFEIIDN AKAALEKECP  GIVSCSDVLA IVARDAMVAL NGPSWEVETG RRDGLVTNMY EALSNLPSPL SNISSLITRF HSKGLDKKDL VVLSGKGHCP QIRNRLYNFT GKGDSDPNLD TKYAAKLRNK CKPTDNTMAL 
EMDPGSFKTF DVSYFKRVSQ RRGLFQSDAA LLDNQETKSY LLKQMNSDGS TFFKDFGVSM VKMGRIGVLT GKVGQVRKKC RMVN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTGCTT TGAGGATGAC TATCTCTTGT GTCATCCTCC TTCAAGTACT ATCGTGCTTG CTCTCTTCAT TTGCTCCAAC CAATGTGCAA GGATTGAAAG TTGGGTTCTA CGACAAGGCA  TGCCCGAAAG CTGAGCTCAT TGTCAAGAAG TTTGTCTTCG AGGCAATGAA GAAGGACCCG ACACTTGGAG CTCCTTTGCT AAGATTGTTT TTCCATGATT GCTTCGTTCG GGTAATATCC  TCAATATCCA TTTCGTCTTT TTGGGGAACT TTATCGATCT AATGACTGAA TCATGCATGG TAATTTAGGG ATGCGAAGGG TCAGTCTTGC TAGAGCTAAA GAACAAAAAA GATGAGAAAA  ACGCAATGCC CAACCTCAGC CTTCGAGGGT TTGAGATCAT AGACAATGCC AAGGCAGCTC TAGAAAAGGA GTGTCCGGGC ATTGTTTCTT GCTCTGATGT GTTGGCTATT GTCGCTAGGG  ATGCAATGGT TGCGGTAAGT ATAGAGTTTT ACTATCAGTT TATAGTGGAT CTAATATTTG GTCGAGCTCA CGGTATCTTT ATTACACCCT TCCTTTTTTT TTTTTGCGCT TAGTAAAAAT  TTCACATGGC GATTATAGAC TCCATAAATT ATGTTGGACG CATATAATCC ATAAATCTGT TGTATATGTA ATTTGTTAGA TTTTAAAGAT TGTATACTTT TATGATATAC CAATCAATAT  ATATTCAGCT CAATGGACCG TCGTGGGAGG TTGAAACAGG AAGAAGAGAC GGTCTGGTTA CAAACATGTA TGAGGCCCTA TCAAACCTAC CATCACCACT TAGTAATATC AGTAGCCTTA  TCACTCGATT CCATTCCAAA GGCCTGGACA AGAAAGACCT CGTTGTGCTT TCAGGTTTGT TATAGAATTA GAAATTAAAT TCACAAATCA TACCTGAACC ATGCATCAAA ATAAAATAAA  AAAAGTACAG TGTTTTTTGG AACAAACAAG AAACCAGATA AAAACTCATT AACAAAGAAC AAAATTTATA AATTGGTTTT GTCCGACATT TGATAGAATT GACTTGAAAA AAATTAGAAA  GGCAGTCTTC AGTCAAATTT TTTGAGATTG AAAAAGACCA TAGTTTGTAT CATATTCACT TTCTTGATAT TTCACTAGCT TTTATATGAG AAGAATTTAT TCTTTTATTC TCATTTTTCT  CCTTTTTCCA AGCATTTGTT TTTGTTTTTT TTTGCTATTT TAGACTTTTA AAATAGCAAC TAGCAAGAAT ACTCTGGTCT ACTACATAAT TTGTAGATTA ATCTTAGTTT TGGCTTGGGA  TATCCAGTTA TAAAATAAAT AAAAGTATAA CCATTCTCAA ATCAACTTAT TTGTATATAC TTACATTATA ATAGGTGGAC ACACACTAGG GAAAGGACAT TGTCCTCAAA TCAGAAACCG  GCTCTACAAC TTCACCGGGA AAGGAGATAG TGACCCAAAC TTAGACACGA AATACGCAGC CAAACTCAGA AATAAATGCA AGCCAACTGA CAACACGATG GCATTAGAGA TGGATCCAGG  AAGCTTTAAA ACGTTCGATG TGAGCTACTT TAAGCGTGTG TCTCAAAGAA GAGGGTTGTT TCAATCAGAT GCAGCTCTTT TAGACAATCA AGAGACCAAG TCTTATCTTC TCAAGCAAAT  GAATAGTGAT GGCTCTACTT TCTTTAAAGA CTTTGGTGTC TCTATGGTAA AGATGGGTCG GATTGGGGTT TTAACGGGAA AGGTTGGGCA AGTTCGCAAA AAATGCAGAA TGGTTAATTA  ATTAAGTGTT AGGTATATGT CTGTGAGATT GTGTTGTGTT ACGTTTGTTT CCTAAAGAAT AAAGTGTGTA CCTATCAAAA AAGTATACTG TGTGTAATCA TGTGTATTGT AACAATTAAG 
TGTTTAAACT GTAAAATCAG ATTATGTCAA GTTTTTCTTT CTAATTGATT TTATATACAG TATATA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTGCTT TGAGGATGAC TATCTCTTGT GTCATCCTCC TTCAAGTACT ATCGTGCTTG CTCTCTTCAT TTGCTCCAAC CAATGTGCAA GGATTGAAAG TTGGGTTCTA CGACAAGGCA  TGCCCGAAAG CTGAGCTCAT TGTCAAGAAG TTTGTCTTCG AGGCAATGAA GAAGGACCCG ACACTTGGAG CTCCTTTGCT AAGATTGTTT TTCCATGATT GCTTCGTTCG GGGATGCGAA  GGGTCAGTCT TGCTAGAGCT AAAGAACAAA AAAGATGAGA AAAACGCAAT GCCCAACCTC AGCCTTCGAG GGTTTGAGAT CATAGACAAT GCCAAGGCAG CTCTAGAAAA GGAGTGTCCG  GGCATTGTTT CTTGCTCTGA TGTGTTGGCT ATTGTCGCTA GGGATGCAAT GGTTGCGCTC AATGGACCGT CGTGGGAGGT TGAAACAGGA AGAAGAGACG GTCTGGTTAC AAACATGTAT  GAGGCCCTAT CAAACCTACC ATCACCACTT AGTAATATCA GTAGCCTTAT CACTCGATTC CATTCCAAAG GCCTGGACAA GAAAGACCTC GTTGTGCTTT CAGGGAAAGG ACATTGTCCT  CAAATCAGAA ACCGGCTCTA CAACTTCACC GGGAAAGGAG ATAGTGACCC AAACTTAGAC ACGAAATACG CAGCCAAACT CAGAAATAAA TGCAAGCCAA CTGACAACAC GATGGCATTA  GAGATGGATC CAGGAAGCTT TAAAACGTTC GATGTGAGCT ACTTTAAGCG TGTGTCTCAA AGAAGAGGGT TGTTTCAATC AGATGCAGCT CTTTTAGACA ATCAAGAGAC CAAGTCTTAT  CTTCTCAAGC AAATGAATAG TGATGGCTCT ACTTTCTTTA AAGACTTTGG TGTCTCTATG GTAAAGATGG GTCGGATTGG GGTTTTAACG GGAAAGGTTG GGCAAGTTCG CAAAAAATGC 
AGAATGGTTA ATTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTGCTT TGAGGATGAC TATCTCTTGT GTCATCCTCC TTCAAGTACT ATCGTGCTTG CTCTCTTCAT TTGCTCCAAC CAATGTGCAA GGATTGAAAG TTGGGTTCTA CGACAAGGCA  TGCCCGAAAG CTGAGCTCAT TGTCAAGAAG TTTGTCTTCG AGGCAATGAA GAAGGACCCG ACACTTGGAG CTCCTTTGCT AAGATTGTTT TTCCATGATT GCTTCGTTCG GGGATGCGAA  GGGTCAGTCT TGCTAGAGCT AAAGAACAAA AAAGATGAGA AAAACGCAAT GCCCAACCTC AGCCTTCGAG GGTTTGAGAT CATAGACAAT GCCAAGGCAG CTCTAGAAAA GGAGTGTCCG  GGCATTGTTT CTTGCTCTGA TGTGTTGGCT ATTGTCGCTA GGGATGCAAT GGTTGCGCTC AATGGACCGT CGTGGGAGGT TGAAACAGGA AGAAGAGACG GTCTGGTTAC AAACATGTAT  GAGGCCCTAT CAAACCTACC ATCACCACTT AGTAATATCA GTAGCCTTAT CACTCGATTC CATTCCAAAG GCCTGGACAA GAAAGACCTC GTTGTGCTTT CAGGGAAAGG ACATTGTCCT  CAAATCAGAA ACCGGCTCTA CAACTTCACC GGGAAAGGAG ATAGTGACCC AAACTTAGAC ACGAAATACG CAGCCAAACT CAGAAATAAA TGCAAGCCAA CTGACAACAC GATGGCATTA  GAGATGGATC CAGGAAGCTT TAAAACGTTC GATGTGAGCT ACTTTAAGCG TGTGTCTCAA AGAAGAGGGT TGTTTCAATC AGATGCAGCT CTTTTAGACA ATCAAGAGAC CAAGTCTTAT  CTTCTCAAGC AAATGAATAG TGATGGCTCT ACTTTCTTTA AAGACTTTGG TGTCTCTATG GTAAAGATGG GTCGGATTGG GGTTTTAACG GGAAAGGTTG GGCAAGTTCG CAAAAAATGC  AGAATGGTTA ATTAATTAAG TGTTAGGTAT ATGTCTGTGA GATTGTGTTG TGTTACGTTT GTTTCCTAAA GAATAAAGTG TGTACCTATC AAAAAAGTAT ACTGTGTGTA ATCATGTGTA 
TTGTAACAAT TAAGTGTTTA AACTGTAAAA TCAGATTATG TCAAGTTTTT CTTTCTAATT GATTTTATAT ACAGTATATA 

Retrieve as FASTA