Entry information : CrubPrx112Carubv10020513m.g
Entry ID 15026
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CrubPrx112Carubv10020513m.g
Name CrubPrx112Carubv10020513m.g
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx024]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubPrx112
start..stop
S start..stop
CagraPrx01 693 0 32..365 1..334
AtPrx11 609 0 32..365 2..336
BstrPrx23 607 0 32..365 1..335
AlyPrx11 603 0 32..365 1..335
Literature and cross-references CrubPrx112Carubv10020513m.g
Protein sequence: CrubPrx112Carubv10020513m.g
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   365
PWM (Da):   %s   40442.49 Transmb domain:   %s   i34-56o
PI (pH):   %s   7.42
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
PTIFSNSSSL PQTHFSHLKN WIKKVSSERR TMKLLLVFIM VHTIFIPCFS FDIPTLLPAF PLTLDYYKST CPTVFDVIKK EMECIVKEDP RNAAILIRLH FHDCFVQGCD GSVLLDETET  LKGEKKASPN INSLKGYEII DRLKNIIESE CPGVVSCADL LTISARDATI LVGGPYWDVL VGRNDSKSAS YAHATTNLPT PDESLLSIVA KFYSQGLSVE DMVALIGAHT VGMAQCRNFR  SRIYGDFQVT SALNPLSVTY VASLRKICPA NSGEGDSNVA AMDNVTPNLF DNSFYHTLLR GEGLLNSDQA MYTSVFGIQT RKIVSKYAEN PVAFFEQFSK SMVKMGNILN PSGGEVRRNC 
RFVNT* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TCCCAACCAT TTTCTCTAAC TCCTCATCTC TCCCACAAAC ACATTTTTCT CATCTCAAAA ATTGGATCAA AAAGGTTTCA TCAGAAAGAA GAACTATGAA ACTCCTCCTT GTGTTCATAA  TGGTTCACAC CATCTTTATC CCCTGTTTTT CCTTTGACAT ACCAACTTTA TTACCTGCTT TTCCTTTAAC CCTAGATTAT TACAAGTCTA CTTGTCCGAC AGTCTTTGAC GTCATCAAGA  AAGAAATGGA ATGCATAGTG AAGGAAGATC CTAGAAATGC AGCCATACTT ATTCGTTTAC ACTTCCACGA CTGCTTTGTC CAAGTAAGTA CTCATTCACA CACCTTTCTT GAAATACAAG  AAATCGTTCA ACAGAGGAAA TTACGAACAT TTTACATGAT ATTTACCTGA GAGGGGTTCC TTAATTTATG CTACGAATGG TTAATTAGTT TTCAAAGTTT CAAAATGTTA TTACAGGGAT  GCGATGGATC AGTGTTGCTA GACGAAACAG AAACACTCAA GGGAGAGAAG AAAGCTTCTC CCAACATAAA CTCATTGAAA GGATACGAAA TTATAGACAG ACTCAAGAAC ATAATCGAAT  CCGAATGTCC TGGAGTCGTT TCCTGCGCTG ATCTTCTCAC AATCAGTGCT AGAGATGCTA CAATCCTGGT AAATAAACAA GACTTAGAAA CATACTCTCT CATATAAATT ATGAAATAAA  GAAACATCTA AAATTGTGGT TTGAAGGTGG GTGGACCTTA CTGGGATGTT CTTGTGGGAA GAAACGATTC AAAATCAGCA AGTTACGCGC ATGCCACAAC AAACCTTCCA ACTCCAGATG  AGAGTTTACT CAGCATCGTC GCTAAGTTTT ATTCTCAGGG TCTCTCTGTT GAAGACATGG TCGCTCTTAT AGGTATTGTG GCAATCTAAT TAAACCGGAC AATTAATTTT TTGGTAACTG  TGCTAAACCG GATTGCGAAA ACCCTAACTT AACGAACAAT CTATGTAGGA GCTCACACGG TCGGAATGGC ACAATGTCGG AACTTTAGAT CCCGGATCTA TGGAGATTTT CAAGTGACGT  CAGCCCTAAA TCCACTATCG GTGACGTACG TGGCAAGTCT CCGAAAGATA TGTCCCGCGA ACAGCGGAGA AGGTGATAGC AATGTGGCGG CAATGGACAA CGTGACGCCG AATCTCTTCG  ATAACTCGTT CTACCACACG CTGCTAAGAG GAGAAGGGTT GTTGAACTCG GACCAGGCTA TGTACACGAG CGTGTTCGGG ATACAAACTC GGAAGATAGT GAGCAAGTAC GCGGAGAATC  CTGTGGCGTT CTTCGAGCAA TTCTCTAAGT CGATGGTGAA GATGGGGAAC ATTTTGAACC CTTCTGGAGG AGAAGTTAGA AGAAATTGCC GATTCGTGAA TACATGAAAA CTTCAACAAC 
AAGGAATAAG CTATTTCCGA TATTTTTACT TATTTAAGAA AGCGAAAAAA G 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CCAACCATTT TCTCTAACTC CTCATCTCTC CCACAAACAC ATTTTTCTCA TCTCAAAAAT TGGATCAAAA AGGTTTCATC AGAAAGAAGA ACTATGAAAC TCCTCCTTGT GTTCATAATG  GTTCACACCA TCTTTATCCC CTGTTTTTCC TTTGACATAC CAACTTTATT ACCTGCTTTT CCTTTAACCC TAGATTATTA CAAGTCTACT TGTCCGACAG TCTTTGACGT CATCAAGAAA  GAAATGGAAT GCATAGTGAA GGAAGATCCT AGAAATGCAG CCATACTTAT TCGTTTACAC TTCCACGACT GCTTTGTCCA AGGATGCGAT GGATCAGTGT TGCTAGACGA AACAGAAACA  CTCAAGGGAG AGAAGAAAGC TTCTCCCAAC ATAAACTCAT TGAAAGGATA CGAAATTATA GACAGACTCA AGAACATAAT CGAATCCGAA TGTCCTGGAG TCGTTTCCTG CGCTGATCTT  CTCACAATCA GTGCTAGAGA TGCTACAATC CTGGTGGGTG GACCTTACTG GGATGTTCTT GTGGGAAGAA ACGATTCAAA ATCAGCAAGT TACGCGCATG CCACAACAAA CCTTCCAACT  CCAGATGAGA GTTTACTCAG CATCGTCGCT AAGTTTTATT CTCAGGGTCT CTCTGTTGAA GACATGGTCG CTCTTATAGG AGCTCACACG GTCGGAATGG CACAATGTCG GAACTTTAGA  TCCCGGATCT ATGGAGATTT TCAAGTGACG TCAGCCCTAA ATCCACTATC GGTGACGTAC GTGGCAAGTC TCCGAAAGAT ATGTCCCGCG AACAGCGGAG AAGGTGATAG CAATGTGGCG  GCAATGGACA ACGTGACGCC GAATCTCTTC GATAACTCGT TCTACCACAC GCTGCTAAGA GGAGAAGGGT TGTTGAACTC GGACCAGGCT ATGTACACGA GCGTGTTCGG GATACAAACT  CGGAAGATAG TGAGCAAGTA CGCGGAGAAT CCTGTGGCGT TCTTCGAGCA ATTCTCTAAG TCGATGGTGA AGATGGGGAA CATTTTGAAC CCTTCTGGAG GAGAAGTTAG AAGAAATTGC 
CGATTCGTGA ATACATGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TCCCAACCAT TTTCTCTAAC TCCTCATCTC TCCCACAAAC ACATTTTTCT CATCTCAAAA ATTGGATCAA AAAGGTTTCA TCAGAAAGAA GAACTATGAA ACTCCTCCTT GTGTTCATAA  TGGTTCACAC CATCTTTATC CCCTGTTTTT CCTTTGACAT ACCAACTTTA TTACCTGCTT TTCCTTTAAC CCTAGATTAT TACAAGTCTA CTTGTCCGAC AGTCTTTGAC GTCATCAAGA  AAGAAATGGA ATGCATAGTG AAGGAAGATC CTAGAAATGC AGCCATACTT ATTCGTTTAC ACTTCCACGA CTGCTTTGTC CAAGGATGCG ATGGATCAGT GTTGCTAGAC GAAACAGAAA  CACTCAAGGG AGAGAAGAAA GCTTCTCCCA ACATAAACTC ATTGAAAGGA TACGAAATTA TAGACAGACT CAAGAACATA ATCGAATCCG AATGTCCTGG AGTCGTTTCC TGCGCTGATC  TTCTCACAAT CAGTGCTAGA GATGCTACAA TCCTGGTGGG TGGACCTTAC TGGGATGTTC TTGTGGGAAG AAACGATTCA AAATCAGCAA GTTACGCGCA TGCCACAACA AACCTTCCAA  CTCCAGATGA GAGTTTACTC AGCATCGTCG CTAAGTTTTA TTCTCAGGGT CTCTCTGTTG AAGACATGGT CGCTCTTATA GGAGCTCACA CGGTCGGAAT GGCACAATGT CGGAACTTTA  GATCCCGGAT CTATGGAGAT TTTCAAGTGA CGTCAGCCCT AAATCCACTA TCGGTGACGT ACGTGGCAAG TCTCCGAAAG ATATGTCCCG CGAACAGCGG AGAAGGTGAT AGCAATGTGG  CGGCAATGGA CAACGTGACG CCGAATCTCT TCGATAACTC GTTCTACCAC ACGCTGCTAA GAGGAGAAGG GTTGTTGAAC TCGGACCAGG CTATGTACAC GAGCGTGTTC GGGATACAAA  CTCGGAAGAT AGTGAGCAAG TACGCGGAGA ATCCTGTGGC GTTCTTCGAG CAATTCTCTA AGTCGATGGT GAAGATGGGG AACATTTTGA ACCCTTCTGG AGGAGAAGTT AGAAGAAATT 
GCCGATTCGT GAATACATGA AAACTTCAAC AACAAGGAAT AAGCTATTTC CGATATTTTT ACTTATTTAA GAAAGCGAAA AAAG 

Retrieve as FASTA