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Entry information : CrubPrx120Carubv10001380m.g
Entry ID 15034
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CrubPrx120Carubv10001380m.g
Name CrubPrx120Carubv10001380m.g
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx004]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubPrx120
start..stop		 S start..stop
CagraPrx62 630 0 10..337 9..336
AhalPrx13 626 0 1..337 1..337
AruPrx53-1 623 0 1..336 1..336
AruPrx53-2 621 0 1..336 1..336
Literature and cross-references CrubPrx120Carubv10001380m.g
Protein sequence: CrubPrx120Carubv10001380m.g
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   336 (305)
PWM (Da):   %s   35172.39 (31837.7) Transmb domain:   %s   i13-35o
PI (pH):   %s   4.64 (4.74) Peptide Signal:   %s   cut: 32 range:32-336
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MDVTRSSSTC DGFFIISLLV IVSLLFGTSS AQLNATFYSA TCPNASAIVR STIQQALQSD ARIGASLIRL HFHDCFVNGC DGSLLLDDTG SIQSEKNAAP NANSTRGFNV VDNIKTALEN  ACPGIVSCSD VLALASEASV SLAGGPSWTV LLGRRDSLTA NLAGANSAIP SPVESLSNIT SKFSAVGLNT NDLVALSGAH TFGRARCGVF NNRLFNFSGT GNPDPTLNST LLSSLQQLCP 
QNGSASTITN LDLSTPDAFD NNYFNNLQSN NGLLQSDQEL FSTTVSSTIA IVTSFASNQT LFFQVFAQSM INMGNISPLT GSNGEIRLDC KKVNGS* 

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Remarks
DNA ►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGATGTAA CAAGATCTTC CTCTACTTGT GATGGTTTCT TCATCATCAG CCTTCTTGTT ATCGTTTCTT TATTGTTTGG GACTTCATCT GCGCAGTTAA ACGCAACGTT TTACTCGGCT  ACGTGCCCTA ACGCCTCTGC CATCGTTCGC AGCACTATTC AGCAAGCTCT TCAATCCGAC GCGAGAATCG GAGCAAGCCT AATCCGCCTT CATTTTCACG ACTGCTTTGT TAATGTATAA  GAGAAGCTCT TTAAATAAGC TTCTTTGATT TCTAATTATT TTGTCAAAAA GCCTTATAAG TTTTGTTATT CTAAACCATT GCTTTGCTTC TTTACTTTTG AAAAGGGTTG CGACGGGTCG  CTCTTGCTTG ACGATACTGG AAGCATCCAG AGCGAGAAGA ACGCTGCTCC CAACGCAAAC TCAACTAGAG GATTCAATGT TGTCGATAAT ATCAAGACTG CCCTCGAGAA TGCTTGTCCC  GGCATTGTCT CTTGCTCTGA CGTTTTAGCC CTTGCCTCTG AGGCTTCCGT TTCTTTGGTA CGTAATATTA CTTTCTTCAT AAACACATCA AACAATACAT AATTTGTATA AATTGTCTAC  TTCTGACAAG CCGGGCTGGA CCACATATTA AAAAGCCCGT TTAACTTTCC TAATATATAT TTCATCTATG TTCACGTTCA TCTATATAAA AAAATTATAT ACTACATGTT TGATCATCTT  CAGGCAGGAG GGCCTTCATG GAGTGTATTA TTAGGAAGAA GAGATGGTCT CAATGCAAAC CTGTCTGGGG CCAATTCGTC ACTTCCTTCT CCCTTTGAAG GCCTTAACAA CATAACATCT  AAATTTGTAG CTGTCGGGCT AAATACAACC GATGTAGTAG CCTTGTCAGG TAATTTATCT GACACGTAGG TTTAATTATA CTTGCTGCTC AATTCAAACA AAACCCTAAT TAATGGCACC  ATCTCTCTTA TGTTTCAATG TGCGTAAATA GGGGCGCATA CGTTTGGGCG TGGTCAATGC GTAACGTTCA ACAATAGGCT ATTCAACTTC AACGGGACAG GGAACCCCGA TCCGACTTTG  AACTCAACAC TTCTCAGCAC TCTTCAACAG CTATGTCCTC AAAACGGCAG CGGATCAGGG ATCACCAATC TCGATCTGAC CACACCTGAT GCATTCGATA GTAGTTACTT CACGAACCTT  CAGAGTAACA ATGGGCTTCT TCAGTCAGAC CAGGAACTGT TCTCCAATAC TGGTTCAACC ACCGTAGCAA TGGTTAATTC CTTTGCAAGT AACCAGACTC TGTTTTTCGA GGCGTTTATT  CAGTCTATGA TCAAGATGGG GAACATTAGT CCATTGACAG GGGCTAATGG AGAGATTAGA CAAGATTGTA AAGTGGTTAA TGCACAGTCA TCAGCCACTG AAGCAGAGCA CATTCAGTTA  CAATCTGATG GAGGATCGCT GAGTGTAGCA GTCGCAGATA TGTGAACAAT GATGGTTTCA GTCTCACCAC CGTCTGTATC ATATGTATTT GAATTATTAT ATATGTACTC CTAAGCTTAA  CGATTTTTGT AAAAATAAAT AAGTTTTGCT GGGGAAGAAA TAAAATCTGA GTGGTAGGGT TTTGTTTTAC ACTTGTGATG GTGCTTTCAA TATTTTAAGA ACTTTACTAT GTGTGGTCCA  AAAAAAAAAA AAAAAACTTT ATTATGCCCA AAATCATGCA TGGGATGTGT ATCAGTAACA ATATTAATAC ATGCGTTATC ACGTCGAAAA TATTGTTTTA CTTTCTTGAA GCGAAGTAGT  TGAGATTTGA CTTCAGATTT GGAAGCAACC ACTATAAAGT GACTTGAAAC ATATATTTAG TTTTGTTATA ACTTATAACT TACTGTATAA TCAAGTGATT AATACTATAT GGATTTTGTG  TCCTTAATAA TATATATTTT GAAAAACGAT TTATTCTAAG CCCTTTCTAA GTTTTATAAT CCATGTCTTT AGAGATACCC CGGAGCAGTC GCGCGCATTT TTGAATGTTA TTCAACAAGT  GTTAATGTCA AAGGAACGTA ACATCTCCAA AATTCTCGTA CCTACGTAAG ACTTTTGCAG ATTGTTTATC AAAATCAGTG ATTATGATTT ATGAATCTCT TTTTTCTTCT TCTTCTTCTG  AAAATACAGC TGTAAAGCTC CAACAACTAT ATATTGAAGG CGGCATTTCT TTCAAAGATT GTGACTTATA AACTACTCGT ATAATTTTGT AGACTAGCTT TGTAAAAAGT TTATCTAAAT  TTTTTAAGAA TTGAGATCGC CTTCCACATT CTTTTGGTTC TGTCCACGTT TATATGAATT CTCTTGATTA AACATGGGAA TGTAAATGCA TTAAAGATGC TTGATGCTTA AATTTAATTT  TGAGATTGAA GTATGGCTTT ATCATATTTT AGTGTATGAT TCAATTATTT TTCTAGTAAA ACCACCGATT TCGTCAGCAA AGCAAAAAAC TTATACCTTG ATTTTACCAA CCGCGTGGGA  AGATTAGAAT AAGTCAATAA TGTGCATGTG ACGGAGATAG TATAACCTAA AGACGAATTA CTTTTTCACT AAACAAATGT ACAAGCACCA GCTTTGTTTT CCCATATTTT GGACTATGTA  GACAAACACA CACGTTAATC TATAACTATT TGGCCTCATT CAAAATCTTT CACTTTCATG ATCAGTCCAG AAATACGCGT TTAATCTACT TTATTTTCCT CTATATATAC AATTATTTCG  AAATGATCAA AGCGTAGTCA TAAGTTCCGC ATCAATCAGT GGAAACTAAC TAATCAAAAC TTTATATCAT CATTTTTCAA AAACTGATAT AATGGCTGTA GCAAATCGTC CTGCTTGTGA  TGGTCTGTTT ATCATCAGCC TTATTGTAAT CGTTTCTTTA ATGGTCGGAA CATCATCTGC ACAACTAAAC GCAACGTTTT ACTCTGGGAC TTGCCCTAAC GCCTCTGCCA TCGTACGCAG  CACTATTCAG CAAGCTCTTC AATCCGATAC AAGAATCGGA GCCAGCCTCA TCCGCCTTCA TTTTCACGAC TGTTTTGTTA ATGTATACTA TTCTTTCTCA ATGCAACTCT TTAAGATAAA  AGCCTTATTC GATATTTTTG GCCTAAACCA CTACTTTGCT TCATTATTTT TTAAAAGGGT TGTGATGCGT CGATCTTGCT TGATGACACT GGAAGCATCC AGAGCGAGAA GAGCGCGGGT  CCGAATGCAA ACTCGGCTAG AGGATTCAAC GTTGTCGATA ATATCAAGAC TGCCCTTGAA AACGCTTGCC CTGGTGTTGT CTCTTGCTCT GACGTTTTAG CTCTTGCCTC TGAGGCTTCC  GTGTCTTTGG TAATATAACA CTTTCTTAGT GGACATTACG AAACATAACT AAATATTATT GTCGTAAAGT TTGATTGTTT ATATATGTAT TTGATCATCT TCAGGCAGGA GGACCATCAT  GGACTGTATT ATTAGGAAGA AGAGATAGTC TCACCGCAAA CCTGGCCGGG GCAAATTCAG CCATTCCTTC TCCAGTCGAA AGCCTTAGCA ACATCACGTC TAAATTCTCA GCTGTGGGGC  TAAACACAAA CGATCTAGTA GCCTTATCTG GTAATTTCAT CTAAATGTTA AGTTACTTGC GGTTAAAGTT AATGTAAAAC CCTAACGGCA TCTCTTGTGG ATCGATCCAC GTATAGGTGC  GCATACGTTC GGGCGTGCTC GATGTGGAGT TTTCAACAAC AGACTATTCA ATTTCAGCGG GACAGGAAAC CCGGACCCGA CTCTAAACTC AACGCTGCTC AGCAGCCTGC AACAGCTATG  TCCTCAAAAC GGCAGCGCGT CAACGATCAC CAATCTCGAT CTGAGCACAC CTGATGCGTT CGATAACAAT TACTTCAACA ACCTTCAGAG CAACAATGGG CTTCTTCAGT CAGACCAAGA  GCTGTTCTCT ACCACCGTTT CATCCACCAT CGCGATCGTT ACGTCCTTTG CAAGTAACCA GACTCTGTTT TTTCAGGTCT TTGCGCAGTC AATGATCAAC ATGGGGAACA TTAGTCCCTT 
GACAGGGAGT AATGGAGAGA TTAGGTTAGA CTGTAAGAAG GTTAATGGAA GTTGATTTTC CTTAAAA 

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CDS►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGATGTAA CAAGATCTTC CTCTACTTGT GATGGTTTCT TCATCATCAG CCTTCTTGTT ATCGTTTCTT TATTGTTTGG GACTTCATCT GCGCAGTTAA ACGCAACGTT TTACTCGGCT  ACGTGCCCTA ACGCCTCTGC CATCGTTCGC AGCACTATTC AGCAAGCTCT TCAATCCGAC GCGAGAATCG GAGCAAGCCT AATCCGCCTT CATTTTCACG ACTGCTTTGT TAATGGTTGC  GACGGGTCGC TCTTGCTTGA CGATACTGGA AGCATCCAGA GCGAGAAGAA CGCTGCTCCC AACGCAAACT CAACTAGAGG ATTCAATGTT GTCGATAATA TCAAGACTGC CCTCGAGAAT  GCTTGTCCCG GCATTGTCTC TTGCTCTGAC GTTTTAGCCC TTGCCTCTGA GGCTTCCGTT TCTTTGGCAG GAGGACCATC ATGGACTGTA TTATTAGGAA GAAGAGATAG TCTCACCGCA  AACCTGGCCG GGGCAAATTC AGCCATTCCT TCTCCAGTCG AAAGCCTTAG CAACATCACG TCTAAATTCT CAGCTGTGGG GCTAAACACA AACGATCTAG TAGCCTTATC TGGTGCGCAT  ACGTTCGGGC GTGCTCGATG TGGAGTTTTC AACAACAGAC TATTCAATTT CAGCGGGACA GGAAACCCGG ACCCGACTCT AAACTCAACG CTGCTCAGCA GCCTGCAACA GCTATGTCCT  CAAAACGGCA GCGCGTCAAC GATCACCAAT CTCGATCTGA GCACACCTGA TGCGTTCGAT AACAATTACT TCAACAACCT TCAGAGCAAC AATGGGCTTC TTCAGTCAGA CCAAGAGCTG  TTCTCTACCA CCGTTTCATC CACCATCGCG ATCGTTACGT CCTTTGCAAG TAACCAGACT CTGTTTTTTC AGGTCTTTGC GCAGTCAATG ATCAACATGG GGAACATTAG TCCCTTGACA 
GGGAGTAATG GAGAGATTAG GTTAGACTGT AAGAAGGTTA ATGGAAGTTG A 

Retrieve as FASTA  
cDNA►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGATGTAA CAAGATCTTC CTCTACTTGT GATGGTTTCT TCATCATCAG CCTTCTTGTT ATCGTTTCTT TATTGTTTGG GACTTCATCT GCGCAGTTAA ACGCAACGTT TTACTCGGCT  ACGTGCCCTA ACGCCTCTGC CATCGTTCGC AGCACTATTC AGCAAGCTCT TCAATCCGAC GCGAGAATCG GAGCAAGCCT AATCCGCCTT CATTTTCACG ACTGCTTTGT TAATGGTTGC  GACGGGTCGC TCTTGCTTGA CGATACTGGA AGCATCCAGA GCGAGAAGAA CGCTGCTCCC AACGCAAACT CAACTAGAGG ATTCAATGTT GTCGATAATA TCAAGACTGC CCTCGAGAAT  GCTTGTCCCG GCATTGTCTC TTGCTCTGAC GTTTTAGCCC TTGCCTCTGA GGCTTCCGTT TCTTTGGCAG GAGGACCATC ATGGACTGTA TTATTAGGAA GAAGAGATAG TCTCACCGCA  AACCTGGCCG GGGCAAATTC AGCCATTCCT TCTCCAGTCG AAAGCCTTAG CAACATCACG TCTAAATTCT CAGCTGTGGG GCTAAACACA AACGATCTAG TAGCCTTATC TGGTGCGCAT  ACGTTCGGGC GTGCTCGATG TGGAGTTTTC AACAACAGAC TATTCAATTT CAGCGGGACA GGAAACCCGG ACCCGACTCT AAACTCAACG CTGCTCAGCA GCCTGCAACA GCTATGTCCT  CAAAACGGCA GCGCGTCAAC GATCACCAAT CTCGATCTGA GCACACCTGA TGCGTTCGAT AACAATTACT TCAACAACCT TCAGAGCAAC AATGGGCTTC TTCAGTCAGA CCAAGAGCTG  TTCTCTACCA CCGTTTCATC CACCATCGCG ATCGTTACGT CCTTTGCAAG TAACCAGACT CTGTTTTTTC AGGTCTTTGC GCAGTCAATG ATCAACATGG GGAACATTAG TCCCTTGACA 
GGGAGTAATG GAGAGATTAG GTTAGACTGT AAGAAGGTTA ATGGAAGTTG ATTTTCCTTA AAA 

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