Entry information : CrubAPx07 (Carubv10001333m.g)
Entry ID 15036
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CrubAPx07 (Carubv10001333m.g)
Name (synonym) CrubAPx07 (Carubv10001333m.g)
Class Ascorbate peroxidase     [Orthogroup: APx2004]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubAPx07
start..stop
S start..stop
CagraAPx07 700 0 1..345 1..348
AtAPx07 657 0 1..344 1..349
BstrAPx07 655 0 1..345 1..349
NoffAPx07-1B 647 0 1..344 1..347
Literature and cross-references CrubAPx07 (Carubv10001333m.g)
Protein sequence: CrubAPx07 (Carubv10001333m.g)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   344 (666)
PWM (Da):   %s   37369.26 (71640.7)  
PI (pH):   %s   8.57 (5.21) Peptide Signal:   %s   cut: 22 range:22-687
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGGVSFLSTV PSFTTNLTTL SSSSHRPVLI RCCKMEPQVS GESLPLHRRD VLKLAGTAVG MELIGNGFIN HVGDAKAADL NQRRQRSEFL SKIKLMLSSA FKAKPELVPS ILKLALNDAM  TYDKATKSGG ANGSIRFSSE LSRAENEGLS DGLGLIEEMK KEIDSISKGG PISYADLIQL AGQSAVKSTF LASAIRKCGG NEEKGNLLYT AYGSAGQWGL FDRNFGRTDA TEADPEGRVP 
QWGKATVQEM KDKFIAVGLG PRQLAVMSAF LGPDQLATEQ LLATDPQVAP WVQKYQRSRE TVSQTDYEVD LITAFTKLSC LGQQINFEAY TYPVERINLS KLKL* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATCAAATGGA CCTATATAAT TGGTGGATTT GGATAACAGA GAATCCACAA AAGTGTCTCC TTCACAAAAC CAAAACACAC ACACTCTCCA TTTTCTTCAG ACATCTCTCT TCTCTCTTCT  CTGTCTCATC ACAAACCAAA CCAAAATGGG AGGAGTCTCC TTCCTCTCCA CTGTTCCTTC CTTCACAACA AACCTCACCA CACTCTCTTC ATCTTCACAT CGCCCTGTGA GTTTCAAACC  CATTTTCACA TTCTCTTTAT ACTCCCAACC CATTTCTTAT ACTAACAATC TTGAAATTAT GATGATGATC ATCATCAAAT TCAGGTTCTC ATACGATGTT GCAAGATGGA ACCACAAGTC  TCCGGAGAAA GTTTACCTCT TCACCGTCGT GATGTTCTCA AACTCGCCGG CACTGCTGTC GGAATGGTAC CCTTCAATTC AATTACAGAA CCATCTTCTT AAAGTTCATG TCTTTATGTC  ACATTTGATG AGTTCTTGGT AGTGATGATC TCTATTGTTA GGAATTAATA GGCAATGGTT TCATTAATCA TGTGGGTGAT GCTAAAGCTG CTGACTTGAA TCAACGTAGA CAGCGATCTG  AGTTTCTATG TGAGTTCTGT AACAAGAACG TTACTAAAGA AGTACCCAAG AGGTTGATAT TGGTACTAAA GGTTTCATTT TTATTATGCA GCAAAGATCA AGCTTATGCT TTCGAGTGCC  TTTAAGGCTA AACCTGAACT TGTACCTTCT ATACTTAAAC TAGCACTCAA TGATGCAATG ACTTATGATA AGGTCAGGCT TCACAAAAGT CTCTTATCTA TCTCTCTGGT GATTGCATAG  CTCTTTTACC CTTATTGATG TTGGCTTTTC TTTTGTTTAG GCTACAAAAT CTGGGGGAGC TAATGGATCA ATACGGTTCA GGTACTTTAC TTACATGATG TAAAGAACAT TAGCATAGGA  GTCTTTAGAT GATGTCTTTA TGGAATCTTA GACTTGGTGT TAAATTTTTG TGTAGCTCTG AGTTGAGTAG AGCTGAGAAT GAGGGGCTTT CTGATGGGTT GGGTTTGATA GAGGAAATGA  AGAAGGAGAT TGATTCTATA TCGAAGGGTG GACCTATTTC ATATGCTGAC CTTATTCAAT TGGCAGGTGG TGATGTTTAT ATACCAAGAC TTGTTCATGG ACAGGATTAG GATTGTGTAA  CTGAAGTCTT TCTTGGGTTA ATGTCTTTTT GTAGGACAAT CAGCGGTTAA GTCTACGTTT TTAGCATCGG CGATACGCAA ATGTGGTGGA AATGAAGAAA AAGGGAACTT ACTCTACACA  GCATATGGTT CAGCTGGTCA GGTACACAAT GCTGTGTCAT GTTGATGTTC TTATGCGTTT TGAGCGGTTC AAATGGAGAC TGAACTGTTG TGAATCTGTT TAGTGGGGCT TGTTTGATAG  AAATTTCGGA AGGACTGATG CAACAGAGGC AGATCCAGAA GGCAGAGTCC CACAGTGGGG AAAAGCAACT GTGCAAGAGA TGAAAGATAA GTTCATTGCC GTTGGATTGG GTCCTCGTCA  GGTACAAGAT TTTGGGTTTA AAATTATGGC TATCGGATCA AATCCGTCAT AGTTACTAAC CTGTATTTGA TTCAATGTTT GGGGATTTCT AGCTAGCTGT AATGTCTGCA TTCTTGGGTC  CTGATCAACT CGCAACAGAG CAACTCTTGG CCACTGACCC GCAAGTTGCT CCATGGGTTC AGAAGTACCA ACGAAGCCGT GAAACCGTAT CACAGACAGA TTACGAGGTT AGTTTTCTCT  CATTCTCCTT ATCATATATT CCTCTACTTC AAACTCAAGC TCATGTTTTG ATTTATAAAC ATGTTTGCAG GTTGATCTGA TAACAGCATT CACAAAGCTA AGTTGCTTAG GACAACAAAT  CAACTTCGAA GCATACACAT ATCCCGTCGA ACGAATCAAT CTGAGCAAAC TCAAGCTATA AGCTATGTAC ACTATATGTA TAACCTGAGA GTAAACTTGA ACTTATTCAG CAATTGATTG  CTGAAATAAA CCAAAGATTT TTCTCGACAT TGAAACAAGA AAAGATAAAT CCATTACAAA CAGAGAAACA GAACATGAAA GTCAATTCAC GATAAAATGG AAACAGATTA AAGAAAAATA  ATAGGAATCG AGTTTTCGCA TCCACGTTTA AGAAAAGCAA ACAAGGACAA GAATTAGACT GCCTCAGAGA GCTTCGGGAT AAAAGGAAAT CAGAAACCAA CACAGAAACT CCTCCTCCAA  GAGAAAAACA TATTAATGGA GAAGTTTTAG ATACTGAAAC AACAACAACA AACTCGCCGC ATGACTTAGG ATTGTTGCTG ATCTTCGGCA GGCTTTGGTG CTGCTGGTGC TGCTTCTTTG  ATGTCGTCAG CAGCATCGTC CTGAATAAAA AGCATTTGAG AATATCATCA TAATCAGAAT CGGATTAGAA GACAGAAGAA ATGAGAAATG CATCAAATGG AAACTAAACA ATTTGATTTG  CATAACTAGT CTTTCAGAAT GACTTATTTT GCTCATAGTA ATCAAGCAAC AAAACAGGAT TAAACACATG ACATGACAAT CATGAAATTG AGAATCAAAC CAGACGGGAC AAGAAAAACA  CGAATGCATC ACCAAGCAAA CTAAACCATT GATTTCCAAA TCTAGTCTCT TAATGGCTTA ATAAGACTCA TGGTTTCAGA TATCAAGCAA CAAAACAGGC TTCCACAGCT TATATACAGC  ATTAGACCAG AAGAATGCAT CAAAATGTAA ACTAAATCGT TTGCTTCCTC AATGGCTTAA TAAGGCTAAT TGCTTCCGTT GTTAAGCAAC AAAACAGTCT CAAACAGGAT TAAACACATT  TGAATATCAC CAAAATCCAA AACAGAATGC ATGTAAATGT AAACTAGATC CTTTCATTTT CAAATTTAGT CTTCCTCAAT GGGTTAACAA AGCTCATGTC ATGGTTTCAG AAACAAAGCA  ACAACACAGT CTTAAACACA ATTAAACACA TTTGAAAATC ACTAAAATCA GAATCAAACC AGGAGAATGC ATCAAAATAT AAACCAAACC GTTTGATAAA CAAGCAACAT TATGCTCAAC  GTTTTCACAA ATCAAGCAAC AAAACCAAGC TTATAAGGCC AAAGTATAAT ACCTGCATGT CAGAAGTCCA GAGAGTGAGG TTATCACGAA GAAGCTGCAT AATCAAAGTA CTGTCCTTGT  ATGACTCTTC ACCAAGAGTA TCCAATTCAG CAATAGCTTC ATCAAACGCC TAATAAACCC ATAAACAAAA CTCATCAAAC ACACATAAAC AAACAAACAC AATCATATAA AGCACACTTC  TGATTGACCC CAAACCTGCT TAGCGAGATT ACAAGCACGG TCAGGAGAAT TGAGAATCTC ATAGTAAAAC ACAGAGAAGT TCAACGCAAG ACCAAGACGA ATCGGGTGAG TAGGAGCCAA  TTCAGAGTTA GCAATGTCCT ACACAAACCA AAACCAAAAG CAAATCTCAC AAACCTAAAT CATCCAAAAT CAAAAACCAG ATCGGAGAAA GAGATCAAAA CCTGAGCAGC TTTGTAAGCA  GTAAGAGTAT GTTCAGCAGC ATCTTTCCTC TCTTGACCAG ATTTAAACTC AGCCAAGTAT CTATGGTAAT CACCTTTCAT CTTAAGGTAA AACACCTTCG AATCTCCAGA AGCAGCAGCG  GGAACGAGAA TCGTATCGAG AAGCTTGAGG ATACCATCAC AGATATCAGA AAGCTCGGTT TCGATTTTGC TTCTGTAATC ACGGATCAAG GAAACATGGT CATCGTTGCC GCGAGACTCT  TCCTTCTGTT CAATCGATGA AATGATTCTC CAAGAAGCAC GACGAGCTCC GATCACGTTT TTGTAAGCGA CGGAGAGGAG GTTACGTTCT TCGACGGTGA GTTCTTCTTT GTCAACAGCT  TTCGCGACTT TTTCCATGAA TTCAACCATT TCTTCGTATC GCTCGGCTTG TTCCGCGAGT TTCGCCATGT ATACGAATTC TTCCCTTGCT GATGAACCTG TTGGTGCCGC CATTGTTGTT  TAGATCGGAG TTTGATGATG AACAAAGGAA GAAGAAGAAG ATGATTCTCA GATCTGCGAG CGAGAGAGAG AGAGAGAGAC TTTTTTTTTT TTCCTTCGGC TTTGAGATTT TATTTTTGTT 
TTTATTTGGA AATTTGTGTT TTTTTTTTTT TTTTTTTTAA TGTTTAATTG AAATGAGTGG GGAGCGACGA TTACGGTAAG GAGGAGGAAG GAGAGCCGTT GGATTGAAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGAGGAG TCTCCTTCCT CTCCACTGTT CCTTCCTTCA CAACAAACCT CACCACACTC TCTTCATCTT CACATCGCCC TGTTCTCATA CGATGTTGCA AGATGGAACC ACAAGTCTCC  GGAGAAAGTT TACCTCTTCA CCGTCGTGAT GTTCTCAAAC TCGCCGGCAC TGCTGTCGGA ATGGAATTAA TAGGCAATGG TTTCATTAAT CATGTGGGTG ATGCTAAAGC TGCTGACTTG  AATCAACGTA GACAGCGATC TGAGTTTCTA TCAAAGATCA AGCTTATGCT TTCGAGTGCC TTTAAGGCTA AACCTGAACT TGTACCTTCT ATACTTAAAC TAGCACTCAA TGATGCAATG  ACTTATGATA AGGCTACAAA ATCTGGGGGA GCTAATGGAT CAATACGGTT CAGCTCTGAG TTGAGTAGAG CTGAGAATGA GGGGCTTTCT GATGGGTTGG GTTTGATAGA GGAAATGAAG  AAGGAGATTG ATTCTATATC GAAGGGTGGA CCTATTTCAT ATGCTGACCT TATTCAATTG GCAGGACAAT CAGCGGTTAA GTCTACGTTT TTAGCATCGG CGATACGCAA ATGTGGTGGA  AATGAAGAAA AAGGGAACTT ACTCTACACA GCATATGGTT CAGCTGGTCA GTGGGGCTTG TTTGATAGAA ATTTCGGAAG GACTGATGCA ACAGAGGCAG ATCCAGAAGG CAGAGTCCCA  CAGTGGGGAA AAGCAACTGT GCAAGAGATG AAAGATAAGT TCATTGCCGT TGGATTGGGT CCTCGTCAGC TAGCTGTAAT GTCTGCATTC TTGGGTCCTG ATCAACTCGC AACAGAGCAA  CTCTTGGCCA CTGACCCGCA AGTTGCTCCA TGGGTTCAGA AGTACCAACG AAGCCGTGAA ACCGTATCAC AGACAGATTA CGAGGTTGAT CTGATAACAG CATTCACAAA GCTAAGTTGC 
TTAGGACAAC AAATCAACTT CGAAGCATAC ACATATCCCG TCGAACGAAT CAATCTGAGC AAACTCAAGC TATAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATCAAATGGA CCTATATAAT TGGTGGATTT GGATAACAGA GAATCCACAA AAGTGTCTCC TTCACAAAAC CAAAACACAC ACACTCTCCA TTTTCTTCAG ACATCTCTCT TCTCTCTTCT  CTGTCTCATC ACAAACCAAA CCAAAATGGG AGGAGTCTCC TTCCTCTCCA CTGTTCCTTC CTTCACAACA AACCTCACCA CACTCTCTTC ATCTTCACAT CGCCCTGTTC TCATACGATG  TTGCAAGATG GAACCACAAG TCTCCGGAGA AAGTTTACCT CTTCACCGTC GTGATGTTCT CAAACTCGCC GGCACTGCTG TCGGAATGGA ATTAATAGGC AATGGTTTCA TTAATCATGT  GGGTGATGCT AAAGCTGCTG ACTTGAATCA ACGTAGACAG CGATCTGAGT TTCTATCAAA GATCAAGCTT ATGCTTTCGA GTGCCTTTAA GGCTAAACCT GAACTTGTAC CTTCTATACT  TAAACTAGCA CTCAATGATG CAATGACTTA TGATAAGGCT ACAAAATCTG GGGGAGCTAA TGGATCAATA CGGTTCAGCT CTGAGTTGAG TAGAGCTGAG AATGAGGGGC TTTCTGATGG  GTTGGGTTTG ATAGAGGAAA TGAAGAAGGA GATTGATTCT ATATCGAAGG GTGGACCTAT TTCATATGCT GACCTTATTC AATTGGCAGG ACAATCAGCG GTTAAGTCTA CGTTTTTAGC  ATCGGCGATA CGCAAATGTG GTGGAAATGA AGAAAAAGGG AACTTACTCT ACACAGCATA TGGTTCAGCT GGTCAGTGGG GCTTGTTTGA TAGAAATTTC GGAAGGACTG ATGCAACAGA  GGCAGATCCA GAAGGCAGAG TCCCACAGTG GGGAAAAGCA ACTGTGCAAG AGATGAAAGA TAAGTTCATT GCCGTTGGAT TGGGTCCTCG TCAGCTAGCT GTAATGTCTG CATTCTTGGG  TCCTGATCAA CTCGCAACAG AGCAACTCTT GGCCACTGAC CCGCAAGTTG CTCCATGGGT TCAGAAGTAC CAACGAAGCC GTGAAACCGT ATCACAGACA GATTACGAGG TTGATCTGAT  AACAGCATTC ACAAAGCTAA GTTGCTTAGG ACAACAAATC AACTTCGAAG CATACACATA TCCCGTCGAA CGAATCAATC TGAGCAAACT CAAGCTATAA GCTATGTACA CTATATGTAT  AACCTGAGAG TAAACTTGAA CTTATTCAGC AATTGATTGC TGAAATAAAC CAAAGATTTT TCTCGACATT GAAACAAGAA AAGATAAATC CATTACAAAC AGAGAAACAG AACATGAAAG  TCAATTCACG ATAAAATGGA AACAGATTAA AGAAAAATAA TAGGAATCGA GTTTTCGCAT CCACGTTTAA GAAAAGCAAA CAAGGACAAG AATTAGACTG CCTCAGAGAG CTTCGGGATA  AAAGGAAATC AGAAACCAAC ACAGAAACTC CTCCTCCAAG AGAAAAACAT ATTAATGGAG AAGTTTTAGA TACTGAAACA ACAACAACAA ACTCGCCGCA TGACTTAGGA TTGTTGCTGA  TCTTCGGCAG GCTTTGGTGC TGCTGGTGCT GCTTCTTTGA TGTCGTCAGC AGCATCGTCC TGAATAAAAA GCATTTGAGA ATATCATCAT AATCAGAATC GGATTAGAAG ACAGAAGAAA  TGAGAAATGC ATCAAATGGA AACTAAACAA TTTGATTTGC ATAACTAGTC TTTCAGAATG ACTTATTTTG CTCATAGTAA TCAAGCAACA AAACAGGATT AAACACATGA CATGACAATC  ATGAAATTGA GAATCAAACC AGACGGGACA AGAAAAACAC GAATGCATCA CCAAGCAAAC TAAACCATTG ATTTCCAAAT CTAGTCTCTT AATGGCTTAA TAAGACTCAT GGTTTCAGAT  ATCAAGCAAC AAAACAGGCT TCCACAGCTT ATATACAGCA TTAGACCAGA AGAATGCATC AAAATGTAAA CTAAATCGTT TGCTTCCTCA ATGGCTTAAT AAGGCTAATT GCTTCCGTTG  TTAAGCAACA AAACAGTCTC AAACAGGATT AAACACATTT GAATATCACC AAAATCCAAA ACAGAATGCA TGTAAATGTA AACTAGATCC TTTCATTTTC AAATTTAGTC TTCCTCAATG  GGTTAACAAA GCTCATGTCA TGGTTTCAGA AACAAAGCAA CAACACAGTC TTAAACACAA TTAAACACAT TTGAAAATCA CTAAAATCAG AATCAAACCA GGAGAATGCA TCAAAATATA  AACCAAACCG TTTGATAAAC AAGCAACATT ATGCTCAACG TTTTCACAAA TCAAGCAACA AAACCAAGCT TATAAGGCCA AAGTATAATA CCTGCATGTC AGAAGTCCAG AGAGTGAGGT  TATCACGAAG AAGCTGCATA ATCAAAGTAC TGTCCTTGTA TGACTCTTCA CCAAGAGTAT CCAATTCAGC AATAGCTTCA TCAAACGCCT AATAAACCCA TAAACAAAAC TCATCAAACA  CACATAAACA AACAAACACA ATCATATAAA GCACACTTCT GATTGACCCC AAACCTGCTT AGCGAGATTA CAAGCACGGT CAGGAGAATT GAGAATCTCA TAGTAAAACA CAGAGAAGTT  CAACGCAAGA CCAAGACGAA TCGGGTGAGT AGGAGCCAAT TCAGAGTTAG CAATGTCCTA CACAAACCAA AACCAAAAGC AAATCTCACA AACCTAAATC ATCCAAAATC AAAAACCAGA  TCGGAGAAAG AGATCAAAAC CTGAGCAGCT TTGTAAGCAG TAAGAGTATG TTCAGCAGCA TCTTTCCTCT CTTGACCAGA TTTAAACTCA GCCAAGTATC TATGGTAATC ACCTTTCATC  TTAAGGTAAA ACACCTTCGA ATCTCCAGAA GCAGCAGCGG GAACGAGAAT CGTATCGAGA AGCTTGAGGA TACCATCACA GATATCAGAA AGCTCGGTTT CGATTTTGCT TCTGTAATCA  CGGATCAAGG AAACATGGTC ATCGTTGCCG CGAGACTCTT CCTTCTGTTC AATCGATGAA ATGATTCTCC AAGAAGCACG ACGAGCTCCG ATCACGTTTT TGTAAGCGAC GGAGAGGAGG  TTACGTTCTT CGACGGTGAG TTCTTCTTTG TCAACAGCTT TCGCGACTTT TTCCATGAAT TCAACCATTT CTTCGTATCG CTCGGCTTGT TCCGCGAGTT TCGCCATGTA TACGAATTCT  TCCCTTGCTG ATGAACCTGT TGGTGCCGCC ATTGTTGTTT AGATCGGAGT TTGATGATGA ACAAAGGAAG AAGAAGAAGA TGATTCTCAG ATCTGCGAGC GAGAGAGAGA GAGAGAGACT  TTTTTTTTTT TCCTTCGGCT TTGAGATTTT ATTTTTGTTT TTATTTGGAA ATTTGTGTTT TTTTTTTTTT TTTTTTTAAT GTTTAATTGA AATGAGTGGG GAGCGACGAT TACGGTAAGG 
AGGAGGAAGG AGAGCCGTTG GATTGAAA 

Retrieve as FASTA