Entry information : CrubPrx39Carubv10025052m.g
Entry ID 15041
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CrubPrx39Carubv10025052m.g
Name CrubPrx39Carubv10025052m.g
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx038]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubPrx39
start..stop
S start..stop
AtPrx23 637 0 1..350 1..349
AhalPrx38 633 0 1..350 1..349
AtPrx22 631 0 1..350 1..349
AruPrx23 629 0 1..350 1..349
Literature and cross-references CrubPrx39Carubv10025052m.g
Protein sequence: CrubPrx39Carubv10025052m.g
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   350 (321)
PWM (Da):   %s   38289.37 (35288.9)  
PI (pH):   %s   7.6 (7.68) Peptide Signal:   %s   cut: 30 range:30-350
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGFSLSLSCS AMGALILGCL LFQASNSNAQ LRPDFYSRTC PPVFDIIGNA IVERLQTDPR IAASLLRLHF HDCFVRGCDA SILLDNSTSF RTEKDAAPNA NSIRGLDVVD IMKTALERAC  PRTVSCADIL TIASQISVLL SGGPWWPVPL GRRDSVEAFF DLANTALPSP FFNLTQLKAA FADVGLNRPS DLVALSGGHT FGKAQCQFVT PRLYNFNGTN RPDPTLNPTY LAELRRLCPQ 
NGNGTVLVNF DPVTPTAFDS QYYTNLRNGK GLIQSDQELF STPGADTIPL VNQYSSSTFL FFRAFVDAMI RMGNLRPLTG TQGEIRKNCR VVNSRRIRDV ENDDGVVSSI * 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGGTTTT CACTTTCATT ATCTTGCAGT GCTATGGGAG CCCTAATATT GGGTTGCCTT CTGTTTCAAG CATCAAACTC TAATGCTCAG TTGAGGCCTG ACTTCTACTC CAGGACTTGC  CCACCTGTTT TCGATATCAT TGGAAATGCC ATCGTCGAGA GACTGCAGAC TGATCCTCGT ATTGCCGCGA GCCTCCTTCG TCTTCACTTC CATGACTGCT TTGTTCGGGT AAAGACTCAC  TTGTCTTTTA CTAATTAAAG AAATCCATAG CGTCATCTAC TTTTACATCT ATACGTATAG AAAATACCCT ACAAGGCAAT TTTGAATTAA TAAATAATGT CTTCATGTTA TATGTAATAT  TTATATATGG CTTTTGTAGG GTTGTGATGC ATCAATCTTG CTTGACAATT CCACATCATT CCGGACCGAG AAAGATGCTG CTCCGAACGC AAATTCGATT CGAGGTCTCG ATGTCGTAGA  TATAATGAAA ACAGCCCTTG AGAGAGCTTG CCCAAGAACG GTGTCTTGTG CGGATATTCT CACCATAGCC TCTCAAATAT CAGTGCTTTT GGTATTTAAC TAGACTTACC TACATGGCTA  TCTCAGGATG AAACTAATCG AAACATGTTA TATGAACAAG ACATCAATGT TTTTGACGTC AATGCTTTTT ATGTTATATA GTCGGGAGGT CCATGGTGGC CGGTTCCGTT GGGGAGAAGA  GACAGCGTGG AAGCTTTCTT CGATTTGGCT AATACAGCTC TTCCCTCTCC ATTTTTCAAT CTTACTCAAC TCAAAGCAGC TTTTGCTGAC GTTGGTCTAA ACCGCCCCTC GGATCTTGTC  GCTCTTTCTG GTAATTTTTT TCATGCGTGT TGTTTCTCAT CTATAAAAGA TAAGTGTGTT TTAATTCAAA ATTTTATTAA AAATGATAAA AACTTTCTCA ATTATTTATA TTTAGTCTAT  ACTTTCTTAG AAATGATTTG GTTGGCTTTG TTAAAAGAAA CTCTATCTAC TTTGAATTAT AAAATGACTT GGTAAAACGA AAAGAAACAT GACTCATCTA ATAAAAACAT ACAATATGTA  TCAAATCCTT AATGTTTTGT CAAAATGGTA GGTGGTCACA CATTTGGAAA AGCACAATGC CAATTCGTGA CACCTCGTCT CTACAACTTC AACGGAACCA ACAGACCAGA CCCAACTCTA  AACCCAACTT ACCTCGCCGA ACTCCGTCGG TTATGCCCAC AAAACGGAAA CGGCACAGTT CTGGTCAACT TCGATCCCGT GACTCCAACC GCTTTCGATA GTCAATACTA CACCAATCTT  CGTAACGGGA AAGGTCTGAT TCAGAGTGAC CAAGAGCTCT TCTCGACTCC AGGAGCCGAC ACTATTCCAC TAGTAAACCA ATACAGCAGC AGCACGTTCT TGTTCTTCCG AGCATTCGTT  GATGCAATGA TCAGGATGGG TAATCTTAGA CCATTGACTG GAACTCAAGG GGAGATAAGA AAGAACTGTA GGGTTGTGAA TTCACGAAGA ATTAGGGACG TGGAGAACGA CGATGGTGTT 
GTGAGTTCTA TCTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGGTTTT CACTTTCATT ATCTTGCAGT GCTATGGGAG CCCTAATATT GGGTTGCCTT CTGTTTCAAG CATCAAACTC TAATGCTCAG TTGAGGCCTG ACTTCTACTC CAGGACTTGC  CCACCTGTTT TCGATATCAT TGGAAATGCC ATCGTCGAGA GACTGCAGAC TGATCCTCGT ATTGCCGCGA GCCTCCTTCG TCTTCACTTC CATGACTGCT TTGTTCGGGG TTGTGATGCA  TCAATCTTGC TTGACAATTC CACATCATTC CGGACCGAGA AAGATGCTGC TCCGAACGCA AATTCGATTC GAGGTCTCGA TGTCGTAGAT ATAATGAAAA CAGCCCTTGA GAGAGCTTGC  CCAAGAACGG TGTCTTGTGC GGATATTCTC ACCATAGCCT CTCAAATATC AGTGCTTTTG TCGGGAGGTC CATGGTGGCC GGTTCCGTTG GGGAGAAGAG ACAGCGTGGA AGCTTTCTTC  GATTTGGCTA ATACAGCTCT TCCCTCTCCA TTTTTCAATC TTACTCAACT CAAAGCAGCT TTTGCTGACG TTGGTCTAAA CCGCCCCTCG GATCTTGTCG CTCTTTCTGG TGGTCACACA  TTTGGAAAAG CACAATGCCA ATTCGTGACA CCTCGTCTCT ACAACTTCAA CGGAACCAAC AGACCAGACC CAACTCTAAA CCCAACTTAC CTCGCCGAAC TCCGTCGGTT ATGCCCACAA  AACGGAAACG GCACAGTTCT GGTCAACTTC GATCCCGTGA CTCCAACCGC TTTCGATAGT CAATACTACA CCAATCTTCG TAACGGGAAA GGTCTGATTC AGAGTGACCA AGAGCTCTTC  TCGACTCCAG GAGCCGACAC TATTCCACTA GTAAACCAAT ACAGCAGCAG CACGTTCTTG TTCTTCCGAG CATTCGTTGA TGCAATGATC AGGATGGGTA ATCTTAGACC ATTGACTGGA 
ACTCAAGGGG AGATAAGAAA GAACTGTAGG GTTGTGAATT CACGAAGAAT TAGGGACGTG GAGAACGACG ATGGTGTTGT GAGTTCTATC TGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGGTTTT CACTTTCATT ATCTTGCAGT GCTATGGGAG CCCTAATATT GGGTTGCCTT CTGTTTCAAG CATCAAACTC TAATGCTCAG TTGAGGCCTG ACTTCTACTC CAGGACTTGC  CCACCTGTTT TCGATATCAT TGGAAATGCC ATCGTCGAGA GACTGCAGAC TGATCCTCGT ATTGCCGCGA GCCTCCTTCG TCTTCACTTC CATGACTGCT TTGTTCGGGG TTGTGATGCA  TCAATCTTGC TTGACAATTC CACATCATTC CGGACCGAGA AAGATGCTGC TCCGAACGCA AATTCGATTC GAGGTCTCGA TGTCGTAGAT ATAATGAAAA CAGCCCTTGA GAGAGCTTGC  CCAAGAACGG TGTCTTGTGC GGATATTCTC ACCATAGCCT CTCAAATATC AGTGCTTTTG TCGGGAGGTC CATGGTGGCC GGTTCCGTTG GGGAGAAGAG ACAGCGTGGA AGCTTTCTTC  GATTTGGCTA ATACAGCTCT TCCCTCTCCA TTTTTCAATC TTACTCAACT CAAAGCAGCT TTTGCTGACG TTGGTCTAAA CCGCCCCTCG GATCTTGTCG CTCTTTCTGG TGGTCACACA  TTTGGAAAAG CACAATGCCA ATTCGTGACA CCTCGTCTCT ACAACTTCAA CGGAACCAAC AGACCAGACC CAACTCTAAA CCCAACTTAC CTCGCCGAAC TCCGTCGGTT ATGCCCACAA  AACGGAAACG GCACAGTTCT GGTCAACTTC GATCCCGTGA CTCCAACCGC TTTCGATAGT CAATACTACA CCAATCTTCG TAACGGGAAA GGTCTGATTC AGAGTGACCA AGAGCTCTTC  TCGACTCCAG GAGCCGACAC TATTCCACTA GTAAACCAAT ACAGCAGCAG CACGTTCTTG TTCTTCCGAG CATTCGTTGA TGCAATGATC AGGATGGGTA ATCTTAGACC ATTGACTGGA 
ACTCAAGGGG AGATAAGAAA GAACTGTAGG GTTGTGAATT CACGAAGAAT TAGGGACGTG GAGAACGACG ATGGTGTTGT GAGTTCTATC TGA 

Retrieve as FASTA