Entry information : CrubPrx44Carubv10024496m.g
Entry ID 15046
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CrubPrx44Carubv10024496m.g
Name CrubPrx44Carubv10024496m.g
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx029]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubPrx44
start..stop
S start..stop
CagraPrx40 692 0 1..333 3..335
BstrPrx74 665 0 1..333 3..335
AhalPrx12 659 0 1..333 3..335
AlyPrx26 650 0 1..333 3..335
Literature and cross-references CrubPrx44Carubv10024496m.g
Protein sequence: CrubPrx44Carubv10024496m.g
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   333 (310)
PWM (Da):   %s   37397.64 (34786.3)  
PI (pH):   %s   8.19 (8.37) Peptide Signal:   %s   cut: 24 range:24-333
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MYQILLTVVM VGAVSFFPET AEAAVMEPSM QKLTWHYYKV YNTCENAENF IRHQVEIFYR NDKSIAPKLL RLLYSDCFVS GCDASVLLEG PNSERMAPQN RGLGGFVIID KIKLVLEQRC  PGVVSCADIL NLATRDAVHL AGAPSYPVFT GRRDGLTSDK QTVDLPSPSI SWDQAMAYFN SRGLSVLDMA TLLGSHSMGR THCSHVVDRL YNYNKTGKPS PTMNKYFLSE MAKQCPPRTK 
KGQTDPLVYL NPDSGSNHSF TNSFYSRILS NKSVLEVDQQ LLYNDDTKQI SEEFAASFED LRKSFALSMS KMGAINVLTK TEGEIRRDCR RRN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTATCAGA TCTTACTCAC CGTTGTGATG GTTGGAGCCG TCAGTTTCTT TCCGGAGACG GCAGAAGCGG CCGTGATGGA ACCTTCGATG CAGAAGCTAA CTTGGCATTA CTACAAAGTT  TACAACACTT GCGAGAACGC CGAGAATTTT ATAAGGCACC AAGTTGAGAT ATTTTACAGG AACGATAAGA GCATTGCTCC TAAGCTCCTT CGTCTCCTCT ACTCCGACTG CTTCGTCTCC  GTACGTTTCT TCTTATCCTT ATCTTACCCA TTTGAATACA TGTCATATGA AACCTAAGGA TATATTATCA TGTATGCTAG GGATGCGATG CATCTGTTCT TCTAGAAGGT CCGAACTCAG  AGAGAATGGC GCCACAAAAC AGAGGACTTG GAGGATTCGT GATCATAGAC AAAATCAAAC TAGTCTTGGA ACAAAGATGT CCCGGTGTTG TCTCTTGCGC CGACATTCTT AATCTTGCAA  CTCGGGATGC CGTTCATTTG GTAACTAATC TCTCTAGTCT CTACCTATAG CTATAGACAT GGATCACCTT AGATACTGAC CAGCTGAGAG ATACGGTTTC GTACAGGCTG GTGCACCATC  TTATCCAGTA TTCACCGGCA GGAGAGATGG CTTGACGTCG GATAAGCAAA CAGTGGACTT ACCATCACCA TCCATCTCAT GGGACCAAGC CATGGCTTAT TTCAATTCTA GAGGCTTGAG  TGTCCTTGAC ATGGCTACAC TTCTAGGTCA GTCACCTTTT CGTCCTACCT TGTATATCTT TAAACCGGTT TATATTTAAG GATTTATATA TATAGGCCTG TCCATCCTGC GTTCCGGATC  GGTTTGTGAA GTTCTTGGTT CATGAATAAT AGAAATCAAA AAGAGACAAA AAAAAAAAAA AAAAAACACT CGTTTCCTTT AGATATAGGT TTGGTCTCTG CTCATACTTT GAAGGTCGTT  TTAATCTGGT CTGAATCGCT TAAACTGAAC TACTACCTAA TCAGGATCAC ATTCAATGGG GAGAACACAT TGCAGCCATG TCGTTGACCG TCTCTACAAT TACAACAAAA CCGGTAAACC  AAGCCCGACT ATGAACAAGT ATTTCCTGTC TGAAATGGCA AAGCAATGTC CACCAAGAAC GAAGAAAGGC CAAACCGATC CGCTTGTGTA CCTAAACCCG GACTCGGGCT CAAACCACAG  TTTCACAAAC TCATTCTACT CAAGAATTCT ATCAAACAAA TCTGTACTTG AAGTGGATCA ACAACTGCTT TACAATGATG ACACCAAGCA AATTTCTGAG GAATTTGCAG CAAGTTTTGA 
GGATCTTCGG AAATCCTTTG CTCTTTCGAT GAGCAAGATG GGAGCGATAA ATGTGTTAAC TAAAACCGAA GGTGAGATAC GAAGAGACTG CAGGCGTAGA AACTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTATCAGA TCTTACTCAC CGTTGTGATG GTTGGAGCCG TCAGTTTCTT TCCGGAGACG GCAGAAGCGG CCGTGATGGA ACCTTCGATG CAGAAGCTAA CTTGGCATTA CTACAAAGTT  TACAACACTT GCGAGAACGC CGAGAATTTT ATAAGGCACC AAGTTGAGAT ATTTTACAGG AACGATAAGA GCATTGCTCC TAAGCTCCTT CGTCTCCTCT ACTCCGACTG CTTCGTCTCC  GGATGCGATG CATCTGTTCT TCTAGAAGGT CCGAACTCAG AGAGAATGGC GCCACAAAAC AGAGGACTTG GAGGATTCGT GATCATAGAC AAAATCAAAC TAGTCTTGGA ACAAAGATGT  CCCGGTGTTG TCTCTTGCGC CGACATTCTT AATCTTGCAA CTCGGGATGC CGTTCATTTG GCTGGTGCAC CATCTTATCC AGTATTCACC GGCAGGAGAG ATGGCTTGAC GTCGGATAAG  CAAACAGTGG ACTTACCATC ACCATCCATC TCATGGGACC AAGCCATGGC TTATTTCAAT TCTAGAGGCT TGAGTGTCCT TGACATGGCT ACACTTCTAG GATCACATTC AATGGGGAGA  ACACATTGCA GCCATGTCGT TGACCGTCTC TACAATTACA ACAAAACCGG TAAACCAAGC CCGACTATGA ACAAGTATTT CCTGTCTGAA ATGGCAAAGC AATGTCCACC AAGAACGAAG  AAAGGCCAAA CCGATCCGCT TGTGTACCTA AACCCGGACT CGGGCTCAAA CCACAGTTTC ACAAACTCAT TCTACTCAAG AATTCTATCA AACAAATCTG TACTTGAAGT GGATCAACAA  CTGCTTTACA ATGATGACAC CAAGCAAATT TCTGAGGAAT TTGCAGCAAG TTTTGAGGAT CTTCGGAAAT CCTTTGCTCT TTCGATGAGC AAGATGGGAG CGATAAATGT GTTAACTAAA 
ACCGAAGGTG AGATACGAAG AGACTGCAGG CGTAGAAACT AA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTATCAGA TCTTACTCAC CGTTGTGATG GTTGGAGCCG TCAGTTTCTT TCCGGAGACG GCAGAAGCGG CCGTGATGGA ACCTTCGATG CAGAAGCTAA CTTGGCATTA CTACAAAGTT  TACAACACTT GCGAGAACGC CGAGAATTTT ATAAGGCACC AAGTTGAGAT ATTTTACAGG AACGATAAGA GCATTGCTCC TAAGCTCCTT CGTCTCCTCT ACTCCGACTG CTTCGTCTCC  GGATGCGATG CATCTGTTCT TCTAGAAGGT CCGAACTCAG AGAGAATGGC GCCACAAAAC AGAGGACTTG GAGGATTCGT GATCATAGAC AAAATCAAAC TAGTCTTGGA ACAAAGATGT  CCCGGTGTTG TCTCTTGCGC CGACATTCTT AATCTTGCAA CTCGGGATGC CGTTCATTTG GCTGGTGCAC CATCTTATCC AGTATTCACC GGCAGGAGAG ATGGCTTGAC GTCGGATAAG  CAAACAGTGG ACTTACCATC ACCATCCATC TCATGGGACC AAGCCATGGC TTATTTCAAT TCTAGAGGCT TGAGTGTCCT TGACATGGCT ACACTTCTAG GATCACATTC AATGGGGAGA  ACACATTGCA GCCATGTCGT TGACCGTCTC TACAATTACA ACAAAACCGG TAAACCAAGC CCGACTATGA ACAAGTATTT CCTGTCTGAA ATGGCAAAGC AATGTCCACC AAGAACGAAG  AAAGGCCAAA CCGATCCGCT TGTGTACCTA AACCCGGACT CGGGCTCAAA CCACAGTTTC ACAAACTCAT TCTACTCAAG AATTCTATCA AACAAATCTG TACTTGAAGT GGATCAACAA  CTGCTTTACA ATGATGACAC CAAGCAAATT TCTGAGGAAT TTGCAGCAAG TTTTGAGGAT CTTCGGAAAT CCTTTGCTCT TTCGATGAGC AAGATGGGAG CGATAAATGT GTTAACTAAA 
ACCGAAGGTG AGATACGAAG AGACTGCAGG CGTAGAAACT AA 

Retrieve as FASTA