Entry information : CrubPrx57Carubv10005246m.g
Entry ID 15057
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CrubPrx57Carubv10005246m.g
Name CrubPrx57Carubv10005246m.g
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx011]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubPrx57
start..stop
S start..stop
CrubPrx73 566 0 23..323 24..330
AhalPrx33 564 0 3..323 1..327
BstrPrx06 561 0 1..323 1..329
AtPrx50 560 0 1..323 1..329
Literature and cross-references CrubPrx57Carubv10005246m.g
Protein sequence: CrubPrx57Carubv10005246m.g
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   323 (298)
PWM (Da):   %s   35422 (32570.4)  
PI (pH):   %s   8.38 (8.20) Peptide Signal:   %s   cut: 26 range:26-323
Sequence
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Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MALVYKTNLS LLLLSLFLTF NLASAQLRRN FYAGSCPNVE QIVRNAVQKK AQQSIITIPA TLRLYFHDCF VNGCDASVMI ASTDSNKAER DHEDNISLAG DGFDTVNKAK EALDAVPNCR  NKVSCADILT MATRDVVNIA GGPKYDVELG RLDGLSSTAA SVEGNLPHPT AGVNQLTSLF AKNGLSLNDM IALSGFAHCT KVFNRIYSFN KTTKVDPTIN KEFVTELKRS CPQDIDPNVV 
INIDPTPRQF DNVYYKNLQQ GKGLFTSDQV LFTDRRSKPT VDLWASNAQL FNQAFVNSMI KLGRVGVKTG SDGNIRRDCG AFN* 

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Remarks
DNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GAGGAGACTT GAAGCCCTAT ATAACGATGA ACTCTCTCCA TTGAGTGAAG ATAATTTAAA AATATGGCTT TGGTGTACAA AACGAATCTC TCGTTACTTC TTCTCTCTCT TTTTCTAACC  TTCAACCTCG CCTCCGCTCA ACTCCGCCGC AACTTCTACG CGGGAAGTTG CCCTAACGTC GAACAAATTG TCAGAAACGC CGTTCAGAAA AAAGCTCAGC AAAGTATCAT CACCATTCCC  GCCACTCTAC GCCTATATTT CCATGATTGC TTCGTCAATG TAAAACATAT ACTTTTCTTG ATAATTTTCT TCTCCTGCGT AAATTTATCT CATTATTTTA TATAATTTAT GGATTTATAG  GGATGTGATG CATCAGTGAT GATAGCGTCG ACTGATAGTA ATAAGGCAGA GAGGGATCAT GAGGACAATA TATCGTTAGC CGGAGATGGA TTTGACACCG TCAATAAAGC TAAAGAAGCT  CTCGATGCCG TCCCAAATTG TCGTAACAAA GTTTCTTGCG CCGATATACT CACGATGGCC ACTCGTGACG TTGTCAATAT TGTTAGTTAC TCAGACTTAC ATTTTATTAT ATAATATAAT  GTTTTCTTAA ACTAAAACAT TCTTGTAAGT TACTAATTTA AATTCAAAAA TATAGGCGGG TGGACCAAAA TACGACGTGG AATTGGGAAG GCTAGATGGT CTATCGTCGA CGGCCGCTAG  TGTCGAAGGG AATTTGCCGC ATCCGACGGC CGGTGTCAAC CAACTCACTT CGCTTTTTGC CAAAAATGGC CTTAGCCTTA ACGACATGAT CGCTCTCTCT GGCAAGTGTT GAACTACTTC  TCGATCAAGA ATATATTGTA CATTTTTGTT TTTTTTAACA TTACTATCTT TTGGACAAAA CTTAGTTAGC AGTGACTTAA AATTGATATT ATCTCGGTTT AGCTTGAACT ATATACCCGA  TTTTGATTAG GATTTATATG TGTTATGTTT AATTTCTGTT ATTACACGAT GTGACATCTT AGATACCCAC TCATCTATTC ACTAATACAT TTTCAGGTTC TTGGTTACTT TGGTTTAGGA  TTCGCGCATT GCACCAAAGT GTTCAATCGG ATATACAGTT TCAACAAGAC AACTAAAGTG GATCCCACAA TCAACAAAGA GTTCGTGACA GAGCTAAAAA GGTCGTGTCC TCAAGACATA  GATCCAAATG TAGTTATAAA CATAGATCCA ACACCAAGAC AGTTCGACAA CGTTTACTAC AAGAACTTGC AGCAAGGAAA AGGATTGTTC ACGTCTGATC AAGTCTTATT CACGGATCGT  CGGTCAAAGC CAACCGTTGA CTTATGGGCT AGTAATGCAC AGCTGTTTAA CCAAGCTTTT GTTAACTCCA TGATCAAGCT TGGTCGTGTT GGTGTCAAAA CCGGCAGTGA TGGTAATATC  CGTCGTGATT GTGGCGCTTT CAATTGATCT GAAAATATAT ATATATATGT TTTATAATAT ATTTATTTCC TCCATTCAGT TGTATATCCT TCATAAAATA AATTGTCACA AAACGGTCTT 
TTGTAAAATT GTATGGTTGG TGAAAAAAGA TACGAG 

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CDS
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTTGG TGTACAAAAC GAATCTCTCG TTACTTCTTC TCTCTCTTTT TCTAACCTTC AACCTCGCCT CCGCTCAACT CCGCCGCAAC TTCTACGCGG GAAGTTGCCC TAACGTCGAA  CAAATTGTCA GAAACGCCGT TCAGAAAAAA GCTCAGCAAA GTATCATCAC CATTCCCGCC ACTCTACGCC TATATTTCCA TGATTGCTTC GTCAATGGAT GTGATGCATC AGTGATGATA  GCGTCGACTG ATAGTAATAA GGCAGAGAGG GATCATGAGG ACAATATATC GTTAGCCGGA GATGGATTTG ACACCGTCAA TAAAGCTAAA GAAGCTCTCG ATGCCGTCCC AAATTGTCGT  AACAAAGTTT CTTGCGCCGA TATACTCACG ATGGCCACTC GTGACGTTGT CAATATTGCG GGTGGACCAA AATACGACGT GGAATTGGGA AGGCTAGATG GTCTATCGTC GACGGCCGCT  AGTGTCGAAG GGAATTTGCC GCATCCGACG GCCGGTGTCA ACCAACTCAC TTCGCTTTTT GCCAAAAATG GCCTTAGCCT TAACGACATG ATCGCTCTCT CTGGATTCGC GCATTGCACC  AAAGTGTTCA ATCGGATATA CAGTTTCAAC AAGACAACTA AAGTGGATCC CACAATCAAC AAAGAGTTCG TGACAGAGCT AAAAAGGTCG TGTCCTCAAG ACATAGATCC AAATGTAGTT  ATAAACATAG ATCCAACACC AAGACAGTTC GACAACGTTT ACTACAAGAA CTTGCAGCAA GGAAAAGGAT TGTTCACGTC TGATCAAGTC TTATTCACGG ATCGTCGGTC AAAGCCAACC  GTTGACTTAT GGGCTAGTAA TGCACAGCTG TTTAACCAAG CTTTTGTTAA CTCCATGATC AAGCTTGGTC GTGTTGGTGT CAAAACCGGC AGTGATGGTA ATATCCGTCG TGATTGTGGC 
GCTTTCAATT GA 

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cDNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GAGGAGACTT GAAGCCCTAT ATAACGATGA ACTCTCTCCA TTGAGTGAAG ATAATTTAAA AATATGGCTT TGGTGTACAA AACGAATCTC TCGTTACTTC TTCTCTCTCT TTTTCTAACC  TTCAACCTCG CCTCCGCTCA ACTCCGCCGC AACTTCTACG CGGGAAGTTG CCCTAACGTC GAACAAATTG TCAGAAACGC CGTTCAGAAA AAAGCTCAGC AAAGTATCAT CACCATTCCC  GCCACTCTAC GCCTATATTT CCATGATTGC TTCGTCAATG GATGTGATGC ATCAGTGATG ATAGCGTCGA CTGATAGTAA TAAGGCAGAG AGGGATCATG AGGACAATAT ATCGTTAGCC  GGAGATGGAT TTGACACCGT CAATAAAGCT AAAGAAGCTC TCGATGCCGT CCCAAATTGT CGTAACAAAG TTTCTTGCGC CGATATACTC ACGATGGCCA CTCGTGACGT TGTCAATATT  GCGGGTGGAC CAAAATACGA CGTGGAATTG GGAAGGCTAG ATGGTCTATC GTCGACGGCC GCTAGTGTCG AAGGGAATTT GCCGCATCCG ACGGCCGGTG TCAACCAACT CACTTCGCTT  TTTGCCAAAA ATGGCCTTAG CCTTAACGAC ATGATCGCTC TCTCTGGATT CGCGCATTGC ACCAAAGTGT TCAATCGGAT ATACAGTTTC AACAAGACAA CTAAAGTGGA TCCCACAATC  AACAAAGAGT TCGTGACAGA GCTAAAAAGG TCGTGTCCTC AAGACATAGA TCCAAATGTA GTTATAAACA TAGATCCAAC ACCAAGACAG TTCGACAACG TTTACTACAA GAACTTGCAG  CAAGGAAAAG GATTGTTCAC GTCTGATCAA GTCTTATTCA CGGATCGTCG GTCAAAGCCA ACCGTTGACT TATGGGCTAG TAATGCACAG CTGTTTAACC AAGCTTTTGT TAACTCCATG  ATCAAGCTTG GTCGTGTTGG TGTCAAAACC GGCAGTGATG GTAATATCCG TCGTGATTGT GGCGCTTTCA ATTGATCTGA AAATATATAT ATATATGTTT TATAATATAT TTATTTCCTC 
CATTCAGTTG TATATCCTTC ATAAAATAAA TTGTCACAAA ACGGTCTTTT GTAAAATTGT ATGGTTGGTG AAAAAAGATA CGAG 

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