Entry information : CrubPrx58Carubv10003419m.g
Entry ID 15058
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CrubPrx58Carubv10003419m.g
Name CrubPrx58Carubv10003419m.g
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx029]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubPrx58
start..stop
S start..stop
BstrPrx68 675 0 1..340 2..341
AlyPrx61 673 0 2..340 3..341
AtPrx61 662 0 1..340 1..340
TsPrx61 650 0 2..340 3..341
Literature and cross-references CrubPrx58Carubv10003419m.g
Protein sequence: CrubPrx58Carubv10003419m.g
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   340 (315)
PWM (Da):   %s   37341.81 (34624.3) Transmb domain:   %s   i7-29o
PI (pH):   %s   7.98 (7.98) Peptide Signal:   %s   cut: 26 range:26-340
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MQFVKFFPLL AIVVISLAGT ATVEAATGMN PPVKLIWHYY KITNTCDDAE TYIRYQVEKL YKSDNTIAPK LLRLLYSDCM VNGCDASVLL QGPNSERTAP QNRGLGGFVI IDKIKQVLES  RCPGVVSCAD ILNLATRDAV HMAGAPSYPV FTGRRDGGRL YADAVDLPSP SISVDESLAY FKSKGLDVLD MTTLLGAHSM GKTHCSHIVN RLYNYKNTGK PDPSMNTTLV SQLRYLCPPR 
TQKGQTDPLV YLNPDSGSSN RFSSSYYSRV LSHNAVLGID QELLNNEDTK EITQEFAVGF EDFRKSFALA MSRMGSINVL TGTAGEIRRD CKVTNANYGA * 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCAGTTTG TGAAATTTTT CCCACTATTG GCCATCGTAG TCATAAGCTT AGCCGGAACG GCGACAGTAG AGGCTGCGAC GGGAATGAAC CCTCCGGTGA AGCTGATTTG GCATTACTAC  AAAATTACTA ACACTTGTGA TGATGCGGAG ACTTATATTA GATACCAAGT CGAAAAGCTT TATAAGAGTG ATAATACCAT TGCCCCCAAG CTACTTCGTC TCCTCTACTC CGATTGTATG  GTTAATGTAA GTAAAAGACG TCTTTGTATA TAACTGTGAC ATTAACATTA TCTTCATTTG GCTTATAAGT TATAACCTAT GGTGACAATG GTGTTGTTCT ATGTTATAGG GATGTGATGC  TTCGGTTCTT TTGCAAGGAC CAAACTCAGA GAGGACAGCT CCGCAGAATC GAGGGCTTGG AGGTTTTGTG ATCATCGATA AGATAAAACA AGTTCTTGAA TCACGTTGTC CTGGTGTTGT  TTCTTGCGCT GATATCCTCA ACCTTGCCAC TAGGGATGCT GTTCACATGG TACATATTTA CATATATACT TGCATGTTCT TATTAGTAGA GATATTGATT TGATTATTGT AAGAATTTTA  CTGATTGGTG TTTCTTATAC GAATTCTATA AAATGATGAT TAGGCCGGAG CACCATCTTA CCCTGTGTTT ACCGGGAGAA GGGACGGTGG GAGATTGTAT GCAGACGCCG TGGATCTTCC  GTCACCGTCC ATCTCAGTCG ACGAGTCATT AGCATACTTC AAGTCCAAAG GTCTTGACGT TTTGGATATG ACTACTCTTC TAGGTATCTC ATCGTCTTCT TTTTTCCTTT CCTTTAGACA  CAAACATGCA TATATCTTTG ATCAGTTCTT CAAGAATAAC GTAATCTCAA TGCTAATACT ATAAGTAAAT CCCATTGTTT TGTTTACGTT TGCGTTTATG TATTTACATT TAGTGTTCAC  TTTTTTCTAA ATGCATCCAA AACTAGCTAT ATAATCATTT AATCGTCACT TGTTATAATA ACAAACGTAG ACATCAAATG TATTGTTTGG ATTTGACATT TTAGGTTTGT TAGTTTGCTA  AACATGTTAT GACATTATGA AAATGTATAA TAGTAATTTA TAAATAAAAG TATAATTTAC AAGCAAGATT ATGCATGCGA AGGAATATAC AAGAAAGATA TAAGTTTCTC TTGTGTGAAT  TCTAATAACC TCTACTTAAT TGTGTAATGG AGCAGGAGCA CACTCGATGG GGAAGACTCA TTGCAGTCAC ATAGTGAACA GACTATATAA CTACAAGAAC ACAGGGAAAC CAGACCCGAG  CATGAACACG ACATTGGTGT CACAACTTCG ATATCTTTGT CCTCCAAGAA CACAAAAGGG CCAAACCGAT CCACTGGTTT ACCTAAACCC AGACTCAGGC TCGAGCAACA GGTTCAGCAG  CTCTTACTAT TCTCGTGTCC TGTCTCATAA CGCTGTCTTG GGAATAGACC AAGAATTGCT CAACAACGAG GACACGAAGG AGATCACGCA AGAGTTCGCT GTAGGTTTCG AAGACTTCAG 
AAAGTCTTTT GCTTTGGCAA TGTCGAGGAT GGGATCTATC AATGTCTTGA CCGGAACAGC GGGAGAGATT CGCCGAGACT GCAAAGTTAC CAACGCTAAC TACGGAGCTT AA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCAGTTTG TGAAATTTTT CCCACTATTG GCCATCGTAG TCATAAGCTT AGCCGGAACG GCGACAGTAG AGGCTGCGAC GGGAATGAAC CCTCCGGTGA AGCTGATTTG GCATTACTAC  AAAATTACTA ACACTTGTGA TGATGCGGAG ACTTATATTA GATACCAAGT CGAAAAGCTT TATAAGAGTG ATAATACCAT TGCCCCCAAG CTACTTCGTC TCCTCTACTC CGATTGTATG  GTTAATGGAT GTGATGCTTC GGTTCTTTTG CAAGGACCAA ACTCAGAGAG GACAGCTCCG CAGAATCGAG GGCTTGGAGG TTTTGTGATC ATCGATAAGA TAAAACAAGT TCTTGAATCA  CGTTGTCCTG GTGTTGTTTC TTGCGCTGAT ATCCTCAACC TTGCCACTAG GGATGCTGTT CACATGGCCG GAGCACCATC TTACCCTGTG TTTACCGGGA GAAGGGACGG TGGGAGATTG  TATGCAGACG CCGTGGATCT TCCGTCACCG TCCATCTCAG TCGACGAGTC ATTAGCATAC TTCAAGTCCA AAGGTCTTGA CGTTTTGGAT ATGACTACTC TTCTAGGAGC ACACTCGATG  GGGAAGACTC ATTGCAGTCA CATAGTGAAC AGACTATATA ACTACAAGAA CACAGGGAAA CCAGACCCGA GCATGAACAC GACATTGGTG TCACAACTTC GATATCTTTG TCCTCCAAGA  ACACAAAAGG GCCAAACCGA TCCACTGGTT TACCTAAACC CAGACTCAGG CTCGAGCAAC AGGTTCAGCA GCTCTTACTA TTCTCGTGTC CTGTCTCATA ACGCTGTCTT GGGAATAGAC  CAAGAATTGC TCAACAACGA GGACACGAAG GAGATCACGC AAGAGTTCGC TGTAGGTTTC GAAGACTTCA GAAAGTCTTT TGCTTTGGCA ATGTCGAGGA TGGGATCTAT CAATGTCTTG 
ACCGGAACAG CGGGAGAGAT TCGCCGAGAC TGCAAAGTTA CCAACGCTAA CTACGGAGCT TAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCAGTTTG TGAAATTTTT CCCACTATTG GCCATCGTAG TCATAAGCTT AGCCGGAACG GCGACAGTAG AGGCTGCGAC GGGAATGAAC CCTCCGGTGA AGCTGATTTG GCATTACTAC  AAAATTACTA ACACTTGTGA TGATGCGGAG ACTTATATTA GATACCAAGT CGAAAAGCTT TATAAGAGTG ATAATACCAT TGCCCCCAAG CTACTTCGTC TCCTCTACTC CGATTGTATG  GTTAATGGAT GTGATGCTTC GGTTCTTTTG CAAGGACCAA ACTCAGAGAG GACAGCTCCG CAGAATCGAG GGCTTGGAGG TTTTGTGATC ATCGATAAGA TAAAACAAGT TCTTGAATCA  CGTTGTCCTG GTGTTGTTTC TTGCGCTGAT ATCCTCAACC TTGCCACTAG GGATGCTGTT CACATGGCCG GAGCACCATC TTACCCTGTG TTTACCGGGA GAAGGGACGG TGGGAGATTG  TATGCAGACG CCGTGGATCT TCCGTCACCG TCCATCTCAG TCGACGAGTC ATTAGCATAC TTCAAGTCCA AAGGTCTTGA CGTTTTGGAT ATGACTACTC TTCTAGGAGC ACACTCGATG  GGGAAGACTC ATTGCAGTCA CATAGTGAAC AGACTATATA ACTACAAGAA CACAGGGAAA CCAGACCCGA GCATGAACAC GACATTGGTG TCACAACTTC GATATCTTTG TCCTCCAAGA  ACACAAAAGG GCCAAACCGA TCCACTGGTT TACCTAAACC CAGACTCAGG CTCGAGCAAC AGGTTCAGCA GCTCTTACTA TTCTCGTGTC CTGTCTCATA ACGCTGTCTT GGGAATAGAC  CAAGAATTGC TCAACAACGA GGACACGAAG GAGATCACGC AAGAGTTCGC TGTAGGTTTC GAAGACTTCA GAAAGTCTTT TGCTTTGGCA ATGTCGAGGA TGGGATCTAT CAATGTCTTG 
ACCGGAACAG CGGGAGAGAT TCGCCGAGAC TGCAAAGTTA CCAACGCTAA CTACGGAGCT TAA 

Retrieve as FASTA