Entry information : CrubPrx64Carubv10014103m.g
Entry ID 15064
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CrubPrx64Carubv10014103m.g
Name CrubPrx64Carubv10014103m.g
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx028]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubPrx64
start..stop
S start..stop
CagraPrx54 689 0 1..343 1..342
BstrPrx17 634 0 1..342 1..339
AhalPrx23 632 0 1..342 1..339
AtPrx29 626 0 1..342 1..339
Literature and cross-references CrubPrx64Carubv10014103m.g
Protein sequence: CrubPrx64Carubv10014103m.g
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   343 (315)
PWM (Da):   %s   37315.39 (34240.9)  
PI (pH):   %s   4.65 (4.56) Peptide Signal:   %s   cut: 29 range:29-343
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKPKSKVVES AAASCFLVMS LLCTYTNGDQ METNNYEETL SYSYYEKTCP KVEEIVKSSL SSMFVLDPTA PAALLRLMFH DCQVQGCDAS ILLEPSGDQQ QFTELDSVKN FGIRKRDLIG  SIKTSLETEC PKQVSCSDVI ILAAREAVAL TGGPRIAVPL GRKDSLSIYS KHMADSELPP STADVDITLS LFAGKGMTVE ESVAIMGSHT IGVTHCNNVL SRFDNANATS QNLDPRFETF 
LRVACPEFSP TSQAAKVTFV PNDQTAVIFD SAYYDDAIAG RGNLRIDSEI GADPRTRPFA EAFAADQDRF FNAFSSAFVK LSSYKVLTGN EGVVRSVCDK VDD* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTTCTCTTTA GCTTCCGATT TAAATTACCT TCAAAAAACA AAAAAAAGTG ATGAAACCAA AGAGCAAAGT TGTAGAATCT GCAGCTGCGT CATGTTTTCT CGTCATGAGC TTGTTATGTA  CCTACACTAA TGGTGACCAG ATGGAGACTA ATAATTATGA AGAGACGTTA TCTTATAGTT ACTACGAGAA AACTTGTCCC AAAGTCGAAG AGATCGTGAA ATCTTCACTT TCATCAATGT  TTGTACTTGA TCCTACTGCT CCTGCTGCCT TGCTAAGGCT TATGTTTCAC GACTGCCAAG TTCAGGTTCT CTGATCTATC TCTAGCTTAA TCAATCTCTC TTTCTTGCTC TGAGAAAATT  CTCAATATAT GGGGTAAACT CAATTTGGGG TTTTGCTTTT AAAAAGACGG AAAAAACTCA ATAGGATTTG GTTGAAAATT GTATGCCAAT GATGTTAAGT ATTCGAATTT ATACATTTTA  CGTGAATAAA CATATCAGCA TGTCATGATT AGGATCACTA TTAGTGATGT ATGATCATTA ATTCTGTCTT TAAAAATGCG AAAATTGGAC GTTCGTACAT GATATATATC TTGTTTTTTA  TGGTTTTCTG CCATTGTATT TGAGCTTTCG TTTTATTTTT CTTATAAATT TGTTTGTATA TTATACGAGC CAGAGTTTGA GATGTTTCAT ACATGACTGA AATATGTTTT CTCTAACTAT  ATAATGTATA ATGCATGTGA TTGATAAATT TGGAAGAGAA TAGAACACGG ATATATTACT AAGACCACTT TAATTAGTTA AACATGTCAC GGTCCATTAA TGTGGACTAA TTATATGTAG  GAAAAATGTA TATTTTCCCA TATCAGTGCG CGTCATGTCA CGTACAACAC AATATTTTAA GAGATTCAAA AAAAAAACGA TTAGATCATT GTTCTTGGCA TTTATTTCAT CTCGTCCATC  ACCATTAACT GTCTGGAACA AATACATGTG GCATATGTAC ACAACAGGGC TGTGACGCAT CGATCCTACT CGAGCCAAGC GGTGACCAAC AACAGTTCAC GGAGCTTGAT TCAGTCAAGA  ACTTCGGAAT CAGAAAGAGA GACCTGATTG GCTCTATCAA AACCTCACTG GAGACGGAGT GTCCGAAGCA AGTCTCATGC TCTGACGTTA TCATCCTCGC CGCCAGAGAA GCCGTGGCTC  TCACGGGAGG CCCTCGCATC GCCGTGCCCT TAGGAAGAAA AGACTCTCTC TCCATTTACA GCAAACACAT GGCAGACTCT GAGCTCCCTC CCTCCACTGC TGACGTGGAC ATTACCTTAA  GCCTATTTGC CGGCAAAGGC ATGACCGTCG AAGAGTCCGT TGCCATCATG GGTATATTAT ATTTTTTTAA TTTAATTCGT AAACTTATGT GCATATACGT ATATAATTTA TAAGACTTGT  TCTTGTCTGG TATAGGTTCA CATACTATAG GAGTGACACA CTGCAATAAC GTACTATCGC GTTTCGACAA CGCAAACGCG ACAAGCCAGA ACTTGGATCC ACGTTTCGAA ACGTTTTTGC  GAGTTGCTTG TCCAGAGTTT TCTCCAACGT CCCAAGCCGC GAAAGTCACG TTTGTTCCCA ACGATCAAAC TGCGGTGATC TTTGATTCAG CCTACTACGA TGATGCCATC GCTGGACGTG  GCAATCTGAG GATTGATTCG GAGATTGGAG CTGACCCACG CACACGTCCG TTCGCCGAAG CGTTTGCGGC TGATCAAGAC CGTTTCTTCA ACGCCTTCTC TTCCGCGTTT GTAAAATTGT  CGTCGTACAA AGTGTTAACC GGGAACGAAG GAGTAGTTAG AAGCGTGTGT GACAAAGTAG ATGATTGATG TATATGATTT TCATCAAATG TTACATGACA AAAATATTAT AATCCGTAAA 
CAAGTTATAA GATAGTATGA AGCATAGTAT AAAGCCTTGT TTATACGTTT TGC 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAACCAA AGAGCAAAGT TGTAGAATCT GCAGCTGCGT CATGTTTTCT CGTCATGAGC TTGTTATGTA CCTACACTAA TGGTGACCAG ATGGAGACTA ATAATTATGA AGAGACGTTA  TCTTATAGTT ACTACGAGAA AACTTGTCCC AAAGTCGAAG AGATCGTGAA ATCTTCACTT TCATCAATGT TTGTACTTGA TCCTACTGCT CCTGCTGCCT TGCTAAGGCT TATGTTTCAC  GACTGCCAAG TTCAGGGCTG TGACGCATCG ATCCTACTCG AGCCAAGCGG TGACCAACAA CAGTTCACGG AGCTTGATTC AGTCAAGAAC TTCGGAATCA GAAAGAGAGA CCTGATTGGC  TCTATCAAAA CCTCACTGGA GACGGAGTGT CCGAAGCAAG TCTCATGCTC TGACGTTATC ATCCTCGCCG CCAGAGAAGC CGTGGCTCTC ACGGGAGGCC CTCGCATCGC CGTGCCCTTA  GGAAGAAAAG ACTCTCTCTC CATTTACAGC AAACACATGG CAGACTCTGA GCTCCCTCCC TCCACTGCTG ACGTGGACAT TACCTTAAGC CTATTTGCCG GCAAAGGCAT GACCGTCGAA  GAGTCCGTTG CCATCATGGG TTCACATACT ATAGGAGTGA CACACTGCAA TAACGTACTA TCGCGTTTCG ACAACGCAAA CGCGACAAGC CAGAACTTGG ATCCACGTTT CGAAACGTTT  TTGCGAGTTG CTTGTCCAGA GTTTTCTCCA ACGTCCCAAG CCGCGAAAGT CACGTTTGTT CCCAACGATC AAACTGCGGT GATCTTTGAT TCAGCCTACT ACGATGATGC CATCGCTGGA  CGTGGCAATC TGAGGATTGA TTCGGAGATT GGAGCTGACC CACGCACACG TCCGTTCGCC GAAGCGTTTG CGGCTGATCA AGACCGTTTC TTCAACGCCT TCTCTTCCGC GTTTGTAAAA 
TTGTCGTCGT ACAAAGTGTT AACCGGGAAC GAAGGAGTAG TTAGAAGCGT GTGTGACAAA GTAGATGATT GA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTTCTCTTTA GCTTCCGATT TAAATTACCT TCAAAAAACA AAAAAAAGTG ATGAAACCAA AGAGCAAAGT TGTAGAATCT GCAGCTGCGT CATGTTTTCT CGTCATGAGC TTGTTATGTA  CCTACACTAA TGGTGACCAG ATGGAGACTA ATAATTATGA AGAGACGTTA TCTTATAGTT ACTACGAGAA AACTTGTCCC AAAGTCGAAG AGATCGTGAA ATCTTCACTT TCATCAATGT  TTGTACTTGA TCCTACTGCT CCTGCTGCCT TGCTAAGGCT TATGTTTCAC GACTGCCAAG TTCAGGGCTG TGACGCATCG ATCCTACTCG AGCCAAGCGG TGACCAACAA CAGTTCACGG  AGCTTGATTC AGTCAAGAAC TTCGGAATCA GAAAGAGAGA CCTGATTGGC TCTATCAAAA CCTCACTGGA GACGGAGTGT CCGAAGCAAG TCTCATGCTC TGACGTTATC ATCCTCGCCG  CCAGAGAAGC CGTGGCTCTC ACGGGAGGCC CTCGCATCGC CGTGCCCTTA GGAAGAAAAG ACTCTCTCTC CATTTACAGC AAACACATGG CAGACTCTGA GCTCCCTCCC TCCACTGCTG  ACGTGGACAT TACCTTAAGC CTATTTGCCG GCAAAGGCAT GACCGTCGAA GAGTCCGTTG CCATCATGGG TTCACATACT ATAGGAGTGA CACACTGCAA TAACGTACTA TCGCGTTTCG  ACAACGCAAA CGCGACAAGC CAGAACTTGG ATCCACGTTT CGAAACGTTT TTGCGAGTTG CTTGTCCAGA GTTTTCTCCA ACGTCCCAAG CCGCGAAAGT CACGTTTGTT CCCAACGATC  AAACTGCGGT GATCTTTGAT TCAGCCTACT ACGATGATGC CATCGCTGGA CGTGGCAATC TGAGGATTGA TTCGGAGATT GGAGCTGACC CACGCACACG TCCGTTCGCC GAAGCGTTTG  CGGCTGATCA AGACCGTTTC TTCAACGCCT TCTCTTCCGC GTTTGTAAAA TTGTCGTCGT ACAAAGTGTT AACCGGGAAC GAAGGAGTAG TTAGAAGCGT GTGTGACAAA GTAGATGATT 
GATGTATATG ATTTTCATCA AATGTTACAT GACAAAAATA TTATAATCCG TAAACAAGTT ATAAGATAGT ATGAAGCATA GTATAAAGCC TTGTTTATAC GTTTTGC 

Retrieve as FASTA