Entry information : CrubPrx69Carubv10009564m.g
Entry ID 15069
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CrubPrx69Carubv10009564m.g
Name CrubPrx69Carubv10009564m.g
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx021]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubPrx69
start..stop
S start..stop
CagraPrx12 730 0 1..356 1..356
BstrPrx66 669 0 1..356 1..350
AhalPrx15 664 0 1..356 1..350
AlyPrx10 663 0 1..356 1..350
Literature and cross-references CrubPrx69Carubv10009564m.g
Protein sequence: CrubPrx69Carubv10009564m.g
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   356
PWM (Da):   %s   38928.28 Transmb domain:   %s   i7-29o
PI (pH):   %s   6.5
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MDYTKISYWS ISYLAILTLF FKDFVFSFPS GYNNGYNNHG NYNKGHGYGL TSDLNYRFYD RSCPRLQMIV KSGVWRAFKD DSRIAASLLR LHFHDCFVNG CDGSILLNDS EDFKGEKNAR  PNRNSVRGFE VIEDIKSDIE SSCPLTVSCA DIVALAAREA VVLTGGPFWS VPLGRRDSLT ASEQAANTNL PSPFEPLENI TAKFVNLGLD LKDVVVLSGA HTIGFAQCFV FKHRLFNFKG 
SGQPDPNLAA SSALLSTLKD TCPNVDSSNS KLAALDAASS VKFDNAYYVN LMNNIGLLDS DQTLMTDPTA AAMVKSYSEN PYLFSRDFAV SMVKMGNVGV LTGSDGVIRA KCGFPG* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGACTACA CAAAGATTTC GTATTGGTCT ATATCTTACC TAGCAATCTT AACTCTTTTC TTCAAAGACT TTGTCTTCTC GTTTCCTTCG GGGTATAACA ATGGTTATAA CAACCATGGT  AATTATAACA AAGGTCACGG ATACGGACTA ACTAGCGATC TCAACTATCG ATTCTACGAT CGGTCTTGTC CTCGTCTTCA GATGATTGTT AAGTCCGGAG TTTGGAGAGC TTTTAAAGAT  GATTCTAGAA TCGCTGCGTC TCTTCTCCGA CTCCATTTCC ATGATTGTTT TGTCAATGTA AGTAGTTTTG TATCTTTACG TGACATTTCT TTTTCTTTGT TTAATGTTTT ACGCATGCAT  ATATAGTAGT GGATTATATA TCACTATTCA CACATATATA CTCTTTATAT ATATATAACT CGTGTATGTA TTATAAAAAC TAATCAAGCC ATTTTAGTGA AAACTATACT ACTCAGCTAC  TAAAATTTTA CAAAATTTTT ACATCAAACA CAAAAAGAGC TCTTTAGGCA TACATACATA CACATCAGCA TTTTTTTTTT TTTTGTAATC TGTTTTAGTA TAGGAAAGAT ACATATTAGA  GTAGAAGCCA CTAGTTAGAC TAAGGCTTTG TATATGTACA TAAATGTATC AAACATATTT ATCTCTATAT ATGTATATAA CTAGGAAAAA GGATGTAATT AAATTGTATG TTGTAGGGAT  GTGATGGATC TATACTTCTG AATGATTCCG AGGACTTCAA AGGAGAGAAG AACGCTCGTC CAAACCGAAA CTCAGTCCGT GGCTTCGAAG TCATTGAAGA CATTAAATCT GACATCGAAA  GTTCTTGTCC CTTAACTGTT TCATGCGCAG ACATAGTTGC CCTTGCGGCC AGAGAAGCCG TCGTCCTCGT GCGTGTGATC TTGAAACCCC TAGCTAATCA TTAATCTGAA TTGTAACAAT  ATATTGTAAT GAAATAACCA AAACATTATC TATTGGTTCA TTACTTATGA TTTGGTTATA TGCCATGCAG ACCGGAGGGC CGTTTTGGTC GGTGCCTTTG GGGCGAAGGG ACTCTTTAAC  GGCGAGTGAG CAAGCGGCAA ATACAAATCT GCCATCTCCG TTTGAGCCAT TGGAGAATAT AACGGCCAAG TTTGTAAACC TTGGACTCGA TCTCAAGGAT GTTGTTGTCC TCTCAGGTTT  GGTTAATTCT TTGATTTTGG TTTTAATTAA ATTACCCAAA ATATTACTTA TTCTAAAGCA AAAAATAAAA GTTAGAATAT ATTTTACATG ATTAATTTGA ACTTTTTGAT CCAAAAAGAG  AAAAAAAAAG ATTAATTTGA ACTTATGTTA TCTATGACTA TTCGTGTATG TAGGAGCACA TACTATAGGA TTTGCTCAAT GTTTCGTGTT CAAGCACAGG CTCTTCAACT TCAAGGGCTC  GGGCCAGCCT GATCCAAACC TAGCCGCTTC CTCGGCTCTT CTCTCTACAC TAAAGGACAC GTGTCCTAAC GTGGACTCTT CCAACTCTAA GCTCGCGGCT CTTGACGCAG CTAGCTCGGT  CAAGTTTGAC AATGCTTACT ACGTGAACTT GATGAATAAC ATAGGACTGT TGGATTCCGA CCAAACCCTA ATGACGGATC CTACAGCCGC CGCCATGGTG AAATCGTACA GCGAGAATCC  GTACTTGTTC TCGAGGGACT TTGCAGTTTC AATGGTTAAA ATGGGGAATG TCGGTGTTCT GACCGGAAGT GATGGAGTGA TTAGAGCAAA ATGTGGATTT CCAGGTTAAG TTATATAGCC  TTGTTTGAAC GTACGTAAAA CACTTAATAT CATCAATCTA TAACATATCT AGAAATATTC TAGCATTTAA ATATAAATCA TATAGACCAA AGTCCATGAA TAAAATATAT ATGTTTATAT 
ATAATGGTGT AAAATCAGCC TTATGTATCT ACATATCGAT CACAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGACTACA CAAAGATTTC GTATTGGTCT ATATCTTACC TAGCAATCTT AACTCTTTTC TTCAAAGACT TTGTCTTCTC GTTTCCTTCG GGGTATAACA ATGGTTATAA CAACCATGGT  AATTATAACA AAGGTCACGG ATACGGACTA ACTAGCGATC TCAACTATCG ATTCTACGAT CGGTCTTGTC CTCGTCTTCA GATGATTGTT AAGTCCGGAG TTTGGAGAGC TTTTAAAGAT  GATTCTAGAA TCGCTGCGTC TCTTCTCCGA CTCCATTTCC ATGATTGTTT TGTCAATGGA TGTGATGGAT CTATACTTCT GAATGATTCC GAGGACTTCA AAGGAGAGAA GAACGCTCGT  CCAAACCGAA ACTCAGTCCG TGGCTTCGAA GTCATTGAAG ACATTAAATC TGACATCGAA AGTTCTTGTC CCTTAACTGT TTCATGCGCA GACATAGTTG CCCTTGCGGC CAGAGAAGCC  GTCGTCCTCA CCGGAGGGCC GTTTTGGTCG GTGCCTTTGG GGCGAAGGGA CTCTTTAACG GCGAGTGAGC AAGCGGCAAA TACAAATCTG CCATCTCCGT TTGAGCCATT GGAGAATATA  ACGGCCAAGT TTGTAAACCT TGGACTCGAT CTCAAGGATG TTGTTGTCCT CTCAGGAGCA CATACTATAG GATTTGCTCA ATGTTTCGTG TTCAAGCACA GGCTCTTCAA CTTCAAGGGC  TCGGGCCAGC CTGATCCAAA CCTAGCCGCT TCCTCGGCTC TTCTCTCTAC ACTAAAGGAC ACGTGTCCTA ACGTGGACTC TTCCAACTCT AAGCTCGCGG CTCTTGACGC AGCTAGCTCG  GTCAAGTTTG ACAATGCTTA CTACGTGAAC TTGATGAATA ACATAGGACT GTTGGATTCC GACCAAACCC TAATGACGGA TCCTACAGCC GCCGCCATGG TGAAATCGTA CAGCGAGAAT 
CCGTACTTGT TCTCGAGGGA CTTTGCAGTT TCAATGGTTA AAATGGGGAA TGTCGGTGTT CTGACCGGAA GTGATGGAGT GATTAGAGCA AAATGTGGAT TTCCAGGTTA A 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGACTACA CAAAGATTTC GTATTGGTCT ATATCTTACC TAGCAATCTT AACTCTTTTC TTCAAAGACT TTGTCTTCTC GTTTCCTTCG GGGTATAACA ATGGTTATAA CAACCATGGT  AATTATAACA AAGGTCACGG ATACGGACTA ACTAGCGATC TCAACTATCG ATTCTACGAT CGGTCTTGTC CTCGTCTTCA GATGATTGTT AAGTCCGGAG TTTGGAGAGC TTTTAAAGAT  GATTCTAGAA TCGCTGCGTC TCTTCTCCGA CTCCATTTCC ATGATTGTTT TGTCAATGGA TGTGATGGAT CTATACTTCT GAATGATTCC GAGGACTTCA AAGGAGAGAA GAACGCTCGT  CCAAACCGAA ACTCAGTCCG TGGCTTCGAA GTCATTGAAG ACATTAAATC TGACATCGAA AGTTCTTGTC CCTTAACTGT TTCATGCGCA GACATAGTTG CCCTTGCGGC CAGAGAAGCC  GTCGTCCTCA CCGGAGGGCC GTTTTGGTCG GTGCCTTTGG GGCGAAGGGA CTCTTTAACG GCGAGTGAGC AAGCGGCAAA TACAAATCTG CCATCTCCGT TTGAGCCATT GGAGAATATA  ACGGCCAAGT TTGTAAACCT TGGACTCGAT CTCAAGGATG TTGTTGTCCT CTCAGGAGCA CATACTATAG GATTTGCTCA ATGTTTCGTG TTCAAGCACA GGCTCTTCAA CTTCAAGGGC  TCGGGCCAGC CTGATCCAAA CCTAGCCGCT TCCTCGGCTC TTCTCTCTAC ACTAAAGGAC ACGTGTCCTA ACGTGGACTC TTCCAACTCT AAGCTCGCGG CTCTTGACGC AGCTAGCTCG  GTCAAGTTTG ACAATGCTTA CTACGTGAAC TTGATGAATA ACATAGGACT GTTGGATTCC GACCAAACCC TAATGACGGA TCCTACAGCC GCCGCCATGG TGAAATCGTA CAGCGAGAAT  CCGTACTTGT TCTCGAGGGA CTTTGCAGTT TCAATGGTTA AAATGGGGAA TGTCGGTGTT CTGACCGGAA GTGATGGAGT GATTAGAGCA AAATGTGGAT TTCCAGGTTA AGTTATATAG  CCTTGTTTGA ACGTACGTAA AACACTTAAT ATCATCAATC TATAACATAT CTAGAAATAT TCTAGCATTT AAATATAAAT CATATAGACC AAAGTCCATG AATAAAATAT ATATGTTTAT 
ATATAATGGT GTAAAATCAG CCTTATGTAT CTACATATCG ATCACAG 

Retrieve as FASTA