Entry information : CrubPrx72Carubv10003822m.g
Entry ID 15072
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CrubPrx72Carubv10003822m.g
Name CrubPrx72Carubv10003822m.g
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx022]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubPrx72
start..stop
S start..stop
CagraPrx49 667 0 1..329 1..329
BstrPrx86 604 0 1..329 1..328
AruPrx06 597 0 1..328 1..327
TsPrx59 593 0 1..329 1..331
Literature and cross-references CrubPrx72Carubv10003822m.g
Protein sequence: CrubPrx72Carubv10003822m.g
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   329 (300)
PWM (Da):   %s   35288.92 (32038.2)  
PI (pH):   %s   8.04 (7.20) Peptide Signal:   %s   cut: 30 range:30-329
Sequence
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Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKTQTSKVMG GHVLLTVFTL FMLCSGVRAQ LNPDIYAKSC PSLVQIVRNQ VSIAMNAEKR IAASLIRLHF HDCFVNGCDA SILLDGTDSE KLAIPNVNSV RGFEVIDTIK AAVEKACPGV  VSCADILTLA ARDSVCLSGG PRWRVALGRK DGLVANQNSA NNLPSPFEPL DSIIAKFVAV GLNTTDVVAL SGAHTFGQAK CDLFSNRLFN FTGAGTPDVT LETSLLSNLR SVCPVGGNGN 
ITAPFDPNSV DAFDNNYFKN LLQGKGLLSS DQILFSSDLA VNTTKSLVEA YSRSQYLFFR DFTCSMIRMG NIANGASGEV RRNCRVINN* 

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Remarks
DNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAAACAC AAACGTCCAA GGTGATGGGA GGACATGTCT TGCTTACTGT TTTCACTCTA TTTATGCTTT GTTCAGGGGT TAGGGCACAG CTAAATCCTG ACATATATGC TAAATCATGC  CCCTCTCTTG TACAAATTGT CCGTAACCAA GTTAGTATCG CCATGAATGC CGAAAAAAGG ATTGCTGCTT CTCTCATTCG TCTTCATTTC CACGACTGTT TTGTTAATGT AAGTACTGTT  GTCTTTTTTT ACGTGTATGT TTTTCTATTG AAAAAATATT TACATATGTT AAATATTGTT ACATTAAGAG AAATGCCCCA AACACCTGGA ATCAGTTTCC TAAAGCGTAC GTAGCATGAA  AATTTCAGGG GTGTGATGCG TCTATATTGT TGGATGGAAC CGATAGTGAG AAACTCGCGA TCCCAAACGT GAACTCTGTG AGAGGATTTG AAGTAATTGA TACTATCAAA GCCGCTGTGG  AAAAGGCATG TCCTGGTGTT GTTTCTTGTG CTGATATCCT TACTTTGGCC GCTCGTGACT CGGTTTGCTT GGTAAGCCTT TCTGTTCCCA CTTAACAACC ATCTTAATAT TATTAGTTGT  TCCTTAATTA TAACACGAGA GTTACAGCTC TTACGGGACA ACTATTTATA TAATATGACC AAGGTGGCGA TTATAATTTA GTAACAAAAA CAAATGGTTA GGTTAAGTTT AATTAATGAT  TGTCTTTTTG CGGTTGAAAT ATTTAAACAA TAATATATGT AAATAAATTT TCTTTCTTTT TTTGTCGATA ACTTAATCAC GGGTTATGAA TTTTGATGTG CAGAGTGGAG GGCCAAGGTG  GAGAGTGGCA TTAGGAAGAA AAGATGGATT GGTAGCAAAT CAGAACAGTG CAAACAATCT CCCATCTCCT TTTGAACCTT TAGACTCTAT CATTGCCAAG TTTGTAGCCG TAGGCCTTAA  CACCACCGAC GTCGTAGCCT TATCAGGTTG TTAACTCATC TCCCTAATTA TACATAAACC TTAATTAGTT AGTTAATAGC TCTTTTTCTC TTCTGAGTTA CTGATGCATG CCTTTTTTTA  TAAAATATAT ATATAAAGGA GCTCACACCT TTGGACAAGC AAAGTGTGAT CTCTTCAGCA ACCGTCTGTT CAACTTCACA GGCGCGGGAA CCCCGGACGT AACACTTGAG ACATCACTGT  TGTCTAATCT AAGATCAGTT TGTCCCGTGG GAGGTAATGG AAACATAACA GCTCCTTTTG ACCCGAACTC TGTGGACGCC TTCGACAACA ACTATTTCAA GAACCTACTC CAAGGGAAAG  GTCTTTTAAG CTCTGATCAG ATTCTGTTCT CGAGTGACTT GGCCGTGAAC ACCACAAAGA GTCTAGTGGA GGCTTATAGT CGGAGCCAGT ACTTGTTTTT CAGGGACTTC ACTTGTTCGA 
TGATCAGAAT GGGGAATATT GCGAATGGAG CTAGTGGGGA GGTTAGAAGA AACTGCAGGG TTATCAATAA TTAA 

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CDS
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAAACAC AAACGTCCAA GGTGATGGGA GGACATGTCT TGCTTACTGT TTTCACTCTA TTTATGCTTT GTTCAGGGGT TAGGGCACAG CTAAATCCTG ACATATATGC TAAATCATGC  CCCTCTCTTG TACAAATTGT CCGTAACCAA GTTAGTATCG CCATGAATGC CGAAAAAAGG ATTGCTGCTT CTCTCATTCG TCTTCATTTC CACGACTGTT TTGTTAATGG GTGTGATGCG  TCTATATTGT TGGATGGAAC CGATAGTGAG AAACTCGCGA TCCCAAACGT GAACTCTGTG AGAGGATTTG AAGTAATTGA TACTATCAAA GCCGCTGTGG AAAAGGCATG TCCTGGTGTT  GTTTCTTGTG CTGATATCCT TACTTTGGCC GCTCGTGACT CGGTTTGCTT GAGTGGAGGG CCAAGGTGGA GAGTGGCATT AGGAAGAAAA GATGGATTGG TAGCAAATCA GAACAGTGCA  AACAATCTCC CATCTCCTTT TGAACCTTTA GACTCTATCA TTGCCAAGTT TGTAGCCGTA GGCCTTAACA CCACCGACGT CGTAGCCTTA TCAGGAGCTC ACACCTTTGG ACAAGCAAAG  TGTGATCTCT TCAGCAACCG TCTGTTCAAC TTCACAGGCG CGGGAACCCC GGACGTAACA CTTGAGACAT CACTGTTGTC TAATCTAAGA TCAGTTTGTC CCGTGGGAGG TAATGGAAAC  ATAACAGCTC CTTTTGACCC GAACTCTGTG GACGCCTTCG ACAACAACTA TTTCAAGAAC CTACTCCAAG GGAAAGGTCT TTTAAGCTCT GATCAGATTC TGTTCTCGAG TGACTTGGCC  GTGAACACCA CAAAGAGTCT AGTGGAGGCT TATAGTCGGA GCCAGTACTT GTTTTTCAGG GACTTCACTT GTTCGATGAT CAGAATGGGG AATATTGCGA ATGGAGCTAG TGGGGAGGTT 
AGAAGAAACT GCAGGGTTAT CAATAATTAA 

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cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAAACAC AAACGTCCAA GGTGATGGGA GGACATGTCT TGCTTACTGT TTTCACTCTA TTTATGCTTT GTTCAGGGGT TAGGGCACAG CTAAATCCTG ACATATATGC TAAATCATGC  CCCTCTCTTG TACAAATTGT CCGTAACCAA GTTAGTATCG CCATGAATGC CGAAAAAAGG ATTGCTGCTT CTCTCATTCG TCTTCATTTC CACGACTGTT TTGTTAATGG GTGTGATGCG  TCTATATTGT TGGATGGAAC CGATAGTGAG AAACTCGCGA TCCCAAACGT GAACTCTGTG AGAGGATTTG AAGTAATTGA TACTATCAAA GCCGCTGTGG AAAAGGCATG TCCTGGTGTT  GTTTCTTGTG CTGATATCCT TACTTTGGCC GCTCGTGACT CGGTTTGCTT GAGTGGAGGG CCAAGGTGGA GAGTGGCATT AGGAAGAAAA GATGGATTGG TAGCAAATCA GAACAGTGCA  AACAATCTCC CATCTCCTTT TGAACCTTTA GACTCTATCA TTGCCAAGTT TGTAGCCGTA GGCCTTAACA CCACCGACGT CGTAGCCTTA TCAGGAGCTC ACACCTTTGG ACAAGCAAAG  TGTGATCTCT TCAGCAACCG TCTGTTCAAC TTCACAGGCG CGGGAACCCC GGACGTAACA CTTGAGACAT CACTGTTGTC TAATCTAAGA TCAGTTTGTC CCGTGGGAGG TAATGGAAAC  ATAACAGCTC CTTTTGACCC GAACTCTGTG GACGCCTTCG ACAACAACTA TTTCAAGAAC CTACTCCAAG GGAAAGGTCT TTTAAGCTCT GATCAGATTC TGTTCTCGAG TGACTTGGCC  GTGAACACCA CAAAGAGTCT AGTGGAGGCT TATAGTCGGA GCCAGTACTT GTTTTTCAGG GACTTCACTT GTTCGATGAT CAGAATGGGG AATATTGCGA ATGGAGCTAG TGGGGAGGTT 
AGAAGAAACT GCAGGGTTAT CAATAATTAA 

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