Entry information : CrubPrx93Carubv10021650m.g
Entry ID 15090
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CrubPrx93Carubv10021650m.g
Name CrubPrx93Carubv10021650m.g
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx015]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubPrx93
start..stop
S start..stop
CagraPrx60 679 0 1..337 1..337
BstrPrx54 645 0 1..337 1..336
AlyPrx13 635 0 1..337 1..336
AhalPrx56 632 0 1..337 1..336
Literature and cross-references CrubPrx93Carubv10021650m.g
Protein sequence: CrubPrx93Carubv10021650m.g
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   337
PWM (Da):   %s   36740.49 Transmb domain:   %s   i13-32o
PI (pH):   %s   4.73
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MCRRLQEDKS IRLFGPKMIT SVALSIVLLY FHDQLGYSEA QLQFGFYSET CPSAESVVRE VVQQAVTNDP GKAAVLLRLQ FHDCFVEGCD GSILIKHDGS DDERFAAGNA GVAGFDVIDE  AKSELERLCP GVVSCADIVA LAARDAIVEA KGPFYEVPTG RRDGRVANVG HVTNLPDVQD SISSLKSKFR EKGLSDQDLV LLSAGAHTIG TTACFFVIAR LDAQDPTINP EFFQILRSKC 
PQGGDVNVRI PLDWDSQFVF DDQILRNIKN GRGVILSDSV LYQDNNMKTI IDSYLETNQS SEANFAADFA KAMVKMGAIG VKIGGEGEIR RLCNATN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTGTCGTA GACTACAAGA AGATAAATCG ATTCGTTTGT TTGGTCCGAA AATGATAACT AGTGTTGCAT TATCTATAGT TTTGTTATAT TTCCATGATC AGTTAGGTTA TTCGGAGGCA  CAACTTCAGT TTGGATTCTA CTCAGAAACA TGTCCATCAG CCGAATCAGT CGTCCGTGAA GTTGTTCAAC AGGCGGTGAC AAACGACCCC GGAAAGGCTG CTGTCTTACT CCGTCTCCAG  TTCCACGATT GCTTCGTTGA GGTCCATTGC AAAAAACAAA AAAAACTTGT TAATTATTAA TCAGTTTTTA TACAATTTTT CATACTAGTC ATGACATATA TATATTAACT GGTTTGGTTA  TATGTTGTAG GGTTGTGATG GGTCAATACT GATCAAGCAT GATGGGAGCG ATGACGAAAG GTTTGCTGCA GGTAACGCGG GTGTGGCTGG TTTCGATGTT ATAGACGAAG CTAAATCAGA  GCTTGAACGT CTCTGCCCGG GCGTTGTGTC TTGCGCTGAC ATCGTTGCTC TTGCTGCTAG AGACGCTATT GTTGAGGTAA CACTTTAATA CTTCTTCATA GAAAAATTGA ATACACCATA  AATATTTGTT ACGTTATATT CGTGCTATAT TCATATTATA TTGGGATATA AAAGATGCTT TGATATTAAA TAATATTAAC TTATTAGGCA AAAGGACCGT TTTATGAGGT TCCAACCGGT  CGGAGAGACG GTCGGGTTGC AAATGTTGGT CATGTTACGA ACTTGCCAGA TGTTCAAGAT TCCATAAGCT CCTTGAAATC AAAATTTAGA GAAAAAGGGC TTTCAGATCA AGATCTTGTA  CTTCTTAGTG CTGGTATATA TATATCATAA TCTCATGCAT TGACAACTCG ATAAAATAAA CACTTCCTTG CTTACTCGAA TCTTACTTTT TGTTTAAGGT GCACATACTA TCGGTACAAC  AGCATGCTTC TTTGTCATAG CACGTCTAGA TGCGCAAGAT CCTACGATAA ATCCAGAATT CTTTCAAATC TTGAGATCAA AATGTCCCCA AGGCGGCGAT GTTAATGTCA GGATTCCCTT  GGATTGGGAT AGTCAGTTTG TGTTTGATGA CCAAATCTTG CGGAACATCA AAAATGGTAG AGGTGTCATT TTGTCGGACT CTGTCTTGTA CCAAGACAAT AACATGAAGA CAATCATAGA  TTCGTACCTA GAAACAAATC AAAGTTCAGA AGCTAATTTT GCTGCGGATT TCGCTAAAGC CATGGTAAAG ATGGGTGCTA TTGGTGTGAA AATCGGTGGT GAAGGAGAGA TTAGACGTTT 
ATGCAATGCT ACAAACTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTGTCGTA GACTACAAGA AGATAAATCG ATTCGTTTGT TTGGTCCGAA AATGATAACT AGTGTTGCAT TATCTATAGT TTTGTTATAT TTCCATGATC AGTTAGGTTA TTCGGAGGCA  CAACTTCAGT TTGGATTCTA CTCAGAAACA TGTCCATCAG CCGAATCAGT CGTCCGTGAA GTTGTTCAAC AGGCGGTGAC AAACGACCCC GGAAAGGCTG CTGTCTTACT CCGTCTCCAG  TTCCACGATT GCTTCGTTGA GGGTTGTGAT GGGTCAATAC TGATCAAGCA TGATGGGAGC GATGACGAAA GGTTTGCTGC AGGTAACGCG GGTGTGGCTG GTTTCGATGT TATAGACGAA  GCTAAATCAG AGCTTGAACG TCTCTGCCCG GGCGTTGTGT CTTGCGCTGA CATCGTTGCT CTTGCTGCTA GAGACGCTAT TGTTGAGGCA AAAGGACCGT TTTATGAGGT TCCAACCGGT  CGGAGAGACG GTCGGGTTGC AAATGTTGGT CATGTTACGA ACTTGCCAGA TGTTCAAGAT TCCATAAGCT CCTTGAAATC AAAATTTAGA GAAAAAGGGC TTTCAGATCA AGATCTTGTA  CTTCTTAGTG CTGGTGCACA TACTATCGGT ACAACAGCAT GCTTCTTTGT CATAGCACGT CTAGATGCGC AAGATCCTAC GATAAATCCA GAATTCTTTC AAATCTTGAG ATCAAAATGT  CCCCAAGGCG GCGATGTTAA TGTCAGGATT CCCTTGGATT GGGATAGTCA GTTTGTGTTT GATGACCAAA TCTTGCGGAA CATCAAAAAT GGTAGAGGTG TCATTTTGTC GGACTCTGTC  TTGTACCAAG ACAATAACAT GAAGACAATC ATAGATTCGT ACCTAGAAAC AAATCAAAGT TCAGAAGCTA ATTTTGCTGC GGATTTCGCT AAAGCCATGG TAAAGATGGG TGCTATTGGT 
GTGAAAATCG GTGGTGAAGG AGAGATTAGA CGTTTATGCA ATGCTACAAA CTAG 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTGTCGTA GACTACAAGA AGATAAATCG ATTCGTTTGT TTGGTCCGAA AATGATAACT AGTGTTGCAT TATCTATAGT TTTGTTATAT TTCCATGATC AGTTAGGTTA TTCGGAGGCA  CAACTTCAGT TTGGATTCTA CTCAGAAACA TGTCCATCAG CCGAATCAGT CGTCCGTGAA GTTGTTCAAC AGGCGGTGAC AAACGACCCC GGAAAGGCTG CTGTCTTACT CCGTCTCCAG  TTCCACGATT GCTTCGTTGA GGGTTGTGAT GGGTCAATAC TGATCAAGCA TGATGGGAGC GATGACGAAA GGTTTGCTGC AGGTAACGCG GGTGTGGCTG GTTTCGATGT TATAGACGAA  GCTAAATCAG AGCTTGAACG TCTCTGCCCG GGCGTTGTGT CTTGCGCTGA CATCGTTGCT CTTGCTGCTA GAGACGCTAT TGTTGAGGCA AAAGGACCGT TTTATGAGGT TCCAACCGGT  CGGAGAGACG GTCGGGTTGC AAATGTTGGT CATGTTACGA ACTTGCCAGA TGTTCAAGAT TCCATAAGCT CCTTGAAATC AAAATTTAGA GAAAAAGGGC TTTCAGATCA AGATCTTGTA  CTTCTTAGTG CTGGTGCACA TACTATCGGT ACAACAGCAT GCTTCTTTGT CATAGCACGT CTAGATGCGC AAGATCCTAC GATAAATCCA GAATTCTTTC AAATCTTGAG ATCAAAATGT  CCCCAAGGCG GCGATGTTAA TGTCAGGATT CCCTTGGATT GGGATAGTCA GTTTGTGTTT GATGACCAAA TCTTGCGGAA CATCAAAAAT GGTAGAGGTG TCATTTTGTC GGACTCTGTC  TTGTACCAAG ACAATAACAT GAAGACAATC ATAGATTCGT ACCTAGAAAC AAATCAAAGT TCAGAAGCTA ATTTTGCTGC GGATTTCGCT AAAGCCATGG TAAAGATGGG TGCTATTGGT 
GTGAAAATCG GTGGTGAAGG AGAGATTAGA CGTTTATGCA ATGCTACAAA CTAG 

Retrieve as FASTA