Entry information : CrubPrx98Carubv10002844m.g
Entry ID 15095
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CrubPrx98Carubv10002844m.g
Name CrubPrx98Carubv10002844m.g
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx085]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubPrx98
start..stop
S start..stop
CagraPrx14 658 0 1..330 1..330
AlyPrx58 587 0 1..330 1..329
AhalPrx63 576 0 17..330 1..314
AtPrx58 576 0 1..330 1..329
Literature and cross-references CrubPrx98Carubv10002844m.g
Protein sequence: CrubPrx98Carubv10002844m.g
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   330 (308)
PWM (Da):   %s   35681.3 (33011.8) Transmb domain:   %s   i7-29o
PI (pH):   %s   7.13 (6.85) Peptide Signal:   %s   cut: 23 range:23-330
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MYLSKTLLFI LFSIWILFGV LGNAQLSSGF YSTTCPNATV IARGLIEQAS RGDVRLTAKV MRLHFHDCFV NGCDGSVLLD AAPADVVEGE KEAFQNAGSL GGFEVIDDIK TALENVCPGV  VSCADILAIA AEISVALAGG PSWDVLLGRR DGRTAISADA VATLPLGSDS LHILTSKFSV HNLDTTDLVA LSGAHTFGRV QCRVINNRLH SFIGKKGQSD PTIETKFLQT LLRKCPKGGD 
LTVRVNLDPT SPDSFDNDYF KNLQNNRGVI KSDQILFSST GAPTVSLVNH FAESQSDFYR NFARSMIKMG NVKILTGSEG EIRRECRRVN * 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTATCTAA GCAAAACTCT TCTCTTCATT TTATTCTCGA TTTGGATATT GTTTGGGGTT TTGGGTAATG CTCAGCTTAG CTCTGGTTTT TACTCCACGA CCTGTCCTAA CGCAACAGTC  ATCGCTCGGG GTTTGATAGA GCAAGCTAGC CGTGGCGATG TCAGACTCAC TGCTAAAGTC ATGCGTCTTC ACTTTCACGA CTGTTTCGTG AACGTAAGAT CTGTTTCTAC TCATTACAAT  ATATATCTGC GCTCTATGCT TTTTTGGTTT AACAATATGA AACCGATCGT TTGATCCACA CGTGATCTCA TATTCATGCA TGTTGAATAT CTAAAAACCA GCTAGCACAT GTGAAGTTTA  TGAATGAAGG CTAACTCATG ACATGACTTT ACATATTTGA TTAGGCCGCA TTTTTTTTTC TTAAGGTTTA ATGGGCTATT AATTGTTCTT ACTCGTTGTT TCACCAAAAA AAAGTACTTA  CTCTCCTTGT AACGGAAAAT TAAGTTTAGA GTTTTGCATT GGTGGAATCA TTCTTCAAGG TCAAATTTAA AGTTTCTTGA TGTTTTTGAT TATACATGTT TGATATAATT TGTCATCATT  AATCTTGGTT TTCATATTAA GAAAGTACCG GTCTTTCTTA ACCCAAACTA AAATATCACT TCTCTTGTTC TTTTTCTCTA ATCATAAACT AAGGAAAGTA TATATATATA TATATATATA  TATATATATA TATATATATA TATAGACATA TAATTTGTCA AGAAAACATG ATAATTAGGT CTGTTTTGTT AGTGGAATTA GGTGAACATT TGCATACAAT ATTGAAGTAG TAGTGTGTGA  AACACAGGGG TGCGATGGCT CGGTACTATT GGACGCTGCT CCTGCGGATG TAGTAGAGGG TGAGAAGGAG GCTTTCCAAA ACGCTGGTTC TCTTGGCGGA TTTGAAGTGA TTGACGATAT  CAAAACAGCC CTCGAGAATG TTTGCCCTGG AGTGGTCTCT TGTGCCGATA TCCTCGCTAT CGCAGCTGAG ATCTCTGTCG CACTGGTATA TATGTAGTAT AATAACATCA TTTTTGAAAT  AAATTTACGT GCTTTTAGAT TCCCTTTAAT TTTAAACCTA TGAAAACATA ACCTAGTGTA TACCAAAAAC TATATATAAT GTTTTCAGAA AATATTTATA TCATACTTTA GGCGGGAGGG  CCGTCATGGG ACGTATTGCT AGGAAGGAGA GATGGCCGGA CGGCTATCAG TGCGGACGCG GTGGCTACAC TTCCACTAGG ATCTGATTCC CTCCATATTC TTACTTCCAA ATTCTCCGTA  CATAATCTTG ACACTACAGA TCTCGTCGCT TTATCTGGTA ATGTACTTCC GAGTTTTACT ATATATGTAT TTTTCATATT GGACACCTCA GAAATGTGAT TGTAATTTTA GAGTATAAAG  ATCAAATACT TGAGTAGTAT ACTTTGTTAC GATATATCTT AATTAAGGAT CATAATAATG TACATGCAGG TGCTCATACC TTCGGGAGGG TTCAGTGTAG AGTGATAAAC AATCGTCTGC  ACAGTTTTAT TGGTAAGAAG GGACAGTCTG ATCCGACTAT AGAAACGAAG TTCTTGCAAA CGTTGCTACG AAAATGTCCC AAAGGTGGAG ATCTCACTGT GAGGGTGAAT CTTGATCCTA  CAAGCCCGGA CTCATTTGAT AACGACTATT TCAAGAACCT TCAAAACAAC CGTGGTGTGA TAAAATCAGA TCAAATCTTG TTCTCCTCAA CGGGAGCGCC AACTGTATCT TTGGTGAATC  ATTTTGCTGA GAGCCAAAGT GATTTCTATA GAAATTTTGC GAGATCTATG ATCAAGATGG GAAATGTAAA GATTCTCACA GGAAGTGAGG GAGAGATTCG TAGAGAGTGC AGAAGGGTCA 
ATTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTATCTAA GCAAAACTCT TCTCTTCATT TTATTCTCGA TTTGGATATT GTTTGGGGTT TTGGGTAATG CTCAGCTTAG CTCTGGTTTT TACTCCACGA CCTGTCCTAA CGCAACAGTC  ATCGCTCGGG GTTTGATAGA GCAAGCTAGC CGTGGCGATG TCAGACTCAC TGCTAAAGTC ATGCGTCTTC ACTTTCACGA CTGTTTCGTG AACGGGTGCG ATGGCTCGGT ACTATTGGAC  GCTGCTCCTG CGGATGTAGT AGAGGGTGAG AAGGAGGCTT TCCAAAACGC TGGTTCTCTT GGCGGATTTG AAGTGATTGA CGATATCAAA ACAGCCCTCG AGAATGTTTG CCCTGGAGTG  GTCTCTTGTG CCGATATCCT CGCTATCGCA GCTGAGATCT CTGTCGCACT GGCGGGAGGG CCGTCATGGG ACGTATTGCT AGGAAGGAGA GATGGCCGGA CGGCTATCAG TGCGGACGCG  GTGGCTACAC TTCCACTAGG ATCTGATTCC CTCCATATTC TTACTTCCAA ATTCTCCGTA CATAATCTTG ACACTACAGA TCTCGTCGCT TTATCTGGTG CTCATACCTT CGGGAGGGTT  CAGTGTAGAG TGATAAACAA TCGTCTGCAC AGTTTTATTG GTAAGAAGGG ACAGTCTGAT CCGACTATAG AAACGAAGTT CTTGCAAACG TTGCTACGAA AATGTCCCAA AGGTGGAGAT  CTCACTGTGA GGGTGAATCT TGATCCTACA AGCCCGGACT CATTTGATAA CGACTATTTC AAGAACCTTC AAAACAACCG TGGTGTGATA AAATCAGATC AAATCTTGTT CTCCTCAACG  GGAGCGCCAA CTGTATCTTT GGTGAATCAT TTTGCTGAGA GCCAAAGTGA TTTCTATAGA AATTTTGCGA GATCTATGAT CAAGATGGGA AATGTAAAGA TTCTCACAGG AAGTGAGGGA 
GAGATTCGTA GAGAGTGCAG AAGGGTCAAT TAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTATCTAA GCAAAACTCT TCTCTTCATT TTATTCTCGA TTTGGATATT GTTTGGGGTT TTGGGTAATG CTCAGCTTAG CTCTGGTTTT TACTCCACGA CCTGTCCTAA CGCAACAGTC  ATCGCTCGGG GTTTGATAGA GCAAGCTAGC CGTGGCGATG TCAGACTCAC TGCTAAAGTC ATGCGTCTTC ACTTTCACGA CTGTTTCGTG AACGGGTGCG ATGGCTCGGT ACTATTGGAC  GCTGCTCCTG CGGATGTAGT AGAGGGTGAG AAGGAGGCTT TCCAAAACGC TGGTTCTCTT GGCGGATTTG AAGTGATTGA CGATATCAAA ACAGCCCTCG AGAATGTTTG CCCTGGAGTG  GTCTCTTGTG CCGATATCCT CGCTATCGCA GCTGAGATCT CTGTCGCACT GGCGGGAGGG CCGTCATGGG ACGTATTGCT AGGAAGGAGA GATGGCCGGA CGGCTATCAG TGCGGACGCG  GTGGCTACAC TTCCACTAGG ATCTGATTCC CTCCATATTC TTACTTCCAA ATTCTCCGTA CATAATCTTG ACACTACAGA TCTCGTCGCT TTATCTGGTG CTCATACCTT CGGGAGGGTT  CAGTGTAGAG TGATAAACAA TCGTCTGCAC AGTTTTATTG GTAAGAAGGG ACAGTCTGAT CCGACTATAG AAACGAAGTT CTTGCAAACG TTGCTACGAA AATGTCCCAA AGGTGGAGAT  CTCACTGTGA GGGTGAATCT TGATCCTACA AGCCCGGACT CATTTGATAA CGACTATTTC AAGAACCTTC AAAACAACCG TGGTGTGATA AAATCAGATC AAATCTTGTT CTCCTCAACG  GGAGCGCCAA CTGTATCTTT GGTGAATCAT TTTGCTGAGA GCCAAAGTGA TTTCTATAGA AATTTTGCGA GATCTATGAT CAAGATGGGA AATGTAAAGA TTCTCACAGG AAGTGAGGGA 
GAGATTCGTA GAGAGTGCAG AAGGGTCAAT TAA 

Retrieve as FASTA