Entry information : PtaPrx39(PTA00020151)
Entry ID 15176
Creation 2018-04-25 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-04-25 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2021-01-08 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PtaPrx39(PTA00020151)
Name PtaPrx39(PTA00020151)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx090]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Pinus
Organism Pinus taeda (loblolly pine)    [TaxId: 3352 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PtaPrx39
start..stop
S start..stop
PabPrx179 628 0 1..337 7..343
PabPrx90 566 0 1..324 7..331
PabPrx32 565 0 1..343 7..348
PtaPrx73 557 0 1..342 7..350
Literature and cross-references PtaPrx39(PTA00020151)
EST ref. GenBank:   CO171802.1 [5' end]   CO175309.1 [3' end]
Protein sequence: PtaPrx39(PTA00020151)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   343 (329)
PWM (Da):   %s   37258.47 (35833.8)  
PI (pH):   %s   4.39 (4.39) Peptide Signal:   %s   cut: 26 range:15-343
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAMFFLGIIS SVGAHVRDLP TPVEGLSWTF YNDSCPNLES IVKTALEQVL EQDIAQAPGL LRLLFHDCFV QGCDASILLT GTSSDPSEQE ALPNLTLRPE AFEIINNIKE AVEAKCSGVV  SCADILALAA SYAVYMAGGP EFLVPLGRRD SLTFANQTVT VDNLPSPTSN VTVLMTVFTE KGFDNFTELV ALSGGHSFGI SRCASFVDRL YPTRDPTLDA AFAEQLEEAC PSNATVNTTV 
LDIRTPDLFD KKYYMDLRNG EGLLTSDQDL YSDSRTRHIV NNFAINQSSF FHHFALSMLK MVQLDVLTGS EGEIRKNCAV RNTNTSSTYV IVDPAVRSSS SSS 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (incorrect prediction, contains two Prx ORFs)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGAAAAA TGAAAGCCGA AAACGTCATG GCCATGTTTT TCCTTGGTAT CATATCATCT GTTGGTGCCC ATGTGAGGGA TCTGCCGACA CCAGTGGAGG GGCTTTCATG GACATTTTAC  AATGACAGCT GTCCCAACTT GGAATCCATA GTGAAAACCG CTCTTGAGCA GGTGCTGGAA CAAGATATCG CTCAAGCACC AGGGTTGCTC AGGCTCCTTT TCCACGACTG CTTTGTGCAG  GTAATGGTCT CTATTTATTT GTTCTCATTT TGTAAAGATA TTCATATCAC TCGTACTTTC TCATATTTAT ATTTTCTGTT ACTATTTCTG TATTTCTGAA ATTGTGGTGT GGTCATTTGG  TCCCCAGAAG TTTTGAGGTG CATTCTAAAG CAAGGCTATA TTACTGACTC TTTCTTGATT CATGACCAGA ACAAAAAGAG TATGCATTAT ATGTATTAAA AGATATATAT TTTCTGCTAC  TGAACTTTTG TCAGGGTTGC GACGCACCAA TCTTGCTGAC TGGAACTTCC AGTGACCCAA GCGAGCAGGA AGCTCTTCCA AACCTCACAC TCAGACCCGA GGCTTTCGAG ATCATCAACA  ACATCAAAGA AGCAGTAGAA GCCAAATGCA GTGGTGTAGT TTCTTGCGCT GACATCCTTG CTTTAGCCGC TTCCTACGCA GTATATATGG TGCGTATAAT TTGAACTCAA CTCCATTAGA  CCCCGGTTTT TCTCACACAC TGTTGGCACT TCCCTCACGT TTTTTGGGAT GATGTTCAGT AGAAAGAGAG ATTGAGTGGA GTACTTAACA AGGCCATGAC CCTGGGGGAT CAACCTCAAG  ATCATGACCT CTGACCGAGT GAGGTACTCT TATCCATGGC ATCTGACCGA GTGAGCTACT CTTGTAGCTA ATTGCATACA AGAAGCCAAG TCCCAAAGAA GTTTAGTGTT GTTATAGCTA  TTCGCATTCG AAAAATTTAA GTATTTCTGG TACCCAAGGA CGTTTAATGC TCTTACAGTG ACTTCATTCA AAGAATATAG GTGCTTTTAC AGCCATTACA AAGCCAAGTA CTCTTACAAC  TCGAAGTGGT ATAGAACTAT ATATCACAGC TATATCAAGT TTTATTTTAA CGACATAGTC TTTTCGAAGT GGGAAAGGTT TGCACTTAGT TTTTATTTTG TATGTGTTTT TCATACATTT  CATAGATGTA TACTCTGAGC ACATACTGGA GTTGAAGAAT TAAAAAAAGT GGAGTTAAAG TTAAAGAAAG TGGGTTAAAG TATTAACGAA ATTAGAGTAC AACTATGATT TTCAATAAAT  ATCTTTTTTT AAATTTATGT TTAAAATAAA TATCTTCAAA AATCTTTTTC TATTTTGCAT ATTATGTGTA ACGGCTATTT AACCTTGTAA ATGAAAATAG TTTTTGCCAT GCTTCTTTGT  TTCAAAATAG CGAAGAGATT TCAACTAAGC CATGGGTGGC TTTTTCCCTA CCAAAAACAG GCCGGAGGAC CGGAGTTTCT AGTACCATTG GGTCGCAGGG ACAGCTTAAC ATTTGCTAAT  CAAACAGTGA CTGTGGACAA TCTGCCAAGT CCGACTTCAA ATGTGACTGT ATTGATGACC GTCTTCACTG AAAAGGGTTT TGATAATTTC ACGGAGCTCG TGGCGCTCTC AGGTCAGTTT  TCAATGGTAA AGTTAATGTT TTAGCCCAAT AATAATTTTA GAACCATCTT TCATTCCATT TTGACTTTGA GCTGAAGTAG CTTGCGGATT CTTGAAATAT TCTGGGATTT TGATTCTATG  TCAAATAATG GATCTCACTT ATGTTCTTAA GATTTCAAAA TATTCCAGAA ATTCACCACC CATATTTTAA GCCAAAATAT TTCAGAAATC CGCAATCCAC TTAAAAATGT CGCCCCTGTT  CCCATGCATT ATCGATTTTT ATGGCTATAT GGACATTCAG GCGGGCACTC CTTTGGTATC AGTCACTGCG CATCCTTCGT GGACAGGCTT TATCCAACGC GGGATCCCAC CCTCGACGCC  GCCTTTGCAG AGCAACTTGA GGAGGCATGC CCTTCAAACG CCACCGTGAA CACGACGGTC TTAGATATAC GCACTCCAGA CCTATTTGAC AAAAAGTATT ACATGGATCT GCGGAACGGA  GAAGGACTGC TAACATCCGA TCAGGATCTC TACAGCGATT CACGCACACG ACACATCGTC AACAACTTTG CGATAAACCA GTCCTCCTTC TTTCACCATT TTGCTCTGAG TATGCTTAAG  ATGGTTCAGC TCGATGTCCT CACTGGAAGC GAAGGAGAGA TTCGTAAAAA CTGCGCAGTT CGTAATACTA ATACGTCCTC CACATACGTC ATCGTAGATC CTGCAGTGAG GTCTTCGTCC 
TCATCTTCTT AATTCTCTAT GATTATGTGA TACTTAGCGA TCGAATCCTT AATTCTCTAT GATTATGTGA TACTTAGCGA TCGAATCCTT TCCTGTAATA GAAATTCCTG TAATAGAAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCATGT TTTTCCTTGG TATCATATCA TCTGTTGGTG CCCATGTGAG GGATCTGCCG ACACCAGTGG AGGGGCTTTC ATGGACATTT TACAATGACA GCTGTCCCAA CTTGGAATCC  ATAGTGAAAA CCGCTCTTGA GCAGGTGCTG GAACAAGATA TCGCTCAAGC ACCAGGGTTG CTCAGGCTCC TTTTCCACGA CTGCTTTGTG CAGGGTTGCG ACGCACCAAT CTTGCTGACT  GGAACTTCCA GTGACCCAAG CGAGCAGGAA GCTCTTCCAA ACCTCACACT CAGACCCGAG GCTTTCGAGA TCATCAACAA CATCAAAGAA GCAGTAGAAG CCAAATGCAG TGGTGTAGTT  TCTTGCGCTG ACATCCTTGC TTTAGCCGCT TCCTACGCAG TATATATGGC CGGAGGACCG GAGTTTCTAG TACCATTGGG TCGCAGGGAC AGCTTAACAT TTGCTAATCA AACAGTGACT  GTGGACAATC TGCCAAGTCC GACTTCAAAT GTGACTGTAT TGATGACCGT CTTCACTGAA AAGGGTTTTG ATAATTTCAC GGAGCTCGTG GCGCTCTCAG GCGGGCACTC CTTTGGTATC  AGTCACTGCG CATCCTTCGT GGACAGGCTT TATCCAACGC GGGATCCCAC CCTCGACGCC GCCTTTGCAG AGCAACTTGA GGAGGCATGC CCTTCAAACG CCACCGTGAA CACGACGGTC  TTAGATATAC GCACTCCAGA CCTATTTGAC AAAAAGTATT ACATGGATCT GCGGAACGGA GAAGGACTGC TAACATCCGA TCAGGATCTC TACAGCGATT CACGCACACG ACACATCGTC  AACAACTTTG CGATAAACCA GTCCTCCTTC TTTCACCATT TTGCTCTGAG TATGCTTAAG ATGGTTCAGC TCGATGTCCT CACTGGAAGC GAAGGAGAGA TTCGTAAAAA CTGCGCAGTT 
CGTAATACTA ATACGTCCTC CACATACGTC ATCGTAGATC CTGCAGTGAG GTCTTCGTCC TCATCTTCTT AA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GAAAGCCGAA AACGTCATGG CCATGTTTTT CCTTGGTATC ATATCATCTG TTGGTGCCCA TGTGAGGGAT CTGCCGACAC CAGTGGAGGG GCTTTCATGG ACATTTTACA ATGACAGCTG  TCCCAACTTG GAATCCATAG TGAAAACCGC TCTTGAGCAG GTGCTGGAAC AAGATATCGC TCAAGCACCA GGGTTGCTCA GGCTCCTTTT CCACGACTGC TTTGTGCAGG GTTGCGACGC  ATCAATCTTG CTGACTGGAA CTTCCAGTGA CCCAAGCGAG CAGGAAGCTC TTCCAAACCT CACACTCAGA CCCGAGGCTT TCGAGATCAT CAACAACATC AAAGAAGCAG TAGAAGCCAA  ATGCAGCGGT GTAGTTTCTT GCGCTGACAT CCTTGCTTTA GCCGCTTCCT ACGCAGTATA TATGGCCGGA GGACCGGAGT TTCTAGTACC ATTGGGTCGC AGGGACAGCT TAACATTTGC  TAATCAAACA GTGACTGTGG ACAATCTGCC AAGTCCGACT TCAAATGTGA CTGTATTGAT GACCGTCTTC ACTGAAAAGG GTTTTGATAA TTTCACGGAG CTCGTGGCGC TCTCAGGCGG  GCACTCCTTT GGTATCAGTC GCTGCGCATC CTTCGTGGAC AGGCTTTATC CAACGCGGGA TCCCACCCTC GACGCCGCCT TTGCAGAGCA ACTTGAGGAG GCATGCCCTT CAAACGCCAC  CGTGAACACG ACGGTCTTAG ATATACGCAC TCCAGACCTA TTTGACAAAA AGTATTACAT GGATCTGCGG AACGGAGAAG GACTGCTAAC ATCCGATCAG GATCTCTACA GCGATTCACG  CACACGACAC ATCGTCAACA ACTTTGCGAT AAACCAGTCC TCCTTCTTTC ACCATTTTGC TCTGAGTATG CTTAAGATGG TTCAGCTCGA TGTCCTCACT GGAAGCGAAG GAGAGATTCG  TAAAAACTGC GCAGTTCGTA ATACTAATAC GTCCTCCACA TACGTCATCG TAGATCCTGC AGTGAGGTCT TCGTCCTCAT CTTCTTAATT CTCTATGATT ATGTGATACT TAGCGATCGA  ATCCTTAATT CTCTATGATT ATGTGATACT TAGCGATCGA ATCCTTTCTT GTAATAGAAA TTTAATAAAA TTATACAGAA ATAGTCTAAA TATCTATTGT AATTTGACTC AAAAAAAAAA 
AAAAAAAAC 

Retrieve as FASTA