Entry information : RrubMnP08
Entry ID 15285
Creation 2018-05-31 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-05-31 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: RrubMnP08
Name RrubMnP08
Class Manganese peroxidase     [Orthogroup: MnP002]*
Taxonomy Fungi/Metazoa; Fungi; Basidiomycota; Basidiomycota
Organism Ramaria rubella    [TaxId: 113071 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value RrubMnP08
start..stop
S start..stop
RrubMnP10 457 1e-161 11..355 10..356
SsteMnP02 444 3e-156 7..354 8..356
SsteMnP19 442 3e-155 5..355 6..357
RrubMnP11 441 5e-155 14..364 14..366
Literature and cross-references RrubMnP08
Protein sequence: RrubMnP08
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   399 (380)
PWM (Da):   %s   42661.68 (40595.6)  
PI (pH):   %s   6.66 (6.50) Peptide Signal:   %s   cut: 20 range:20-399
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MLKLFPSLVC LAVATTCSGV NIKHVNCPDG VHVASDAACC PFFALRDDLQ KNLFNNECGV DAREALRLSF LDAIAHSLSL KRLGKPHGGG ADGSMLTFPC VEPYYAANSG ISDIVDALLP  FLASHPVSAG DLIQFAAAVG ISNCVGAPRL HFKAGRPQAM SPAPEGLTPE PQDSVTEILA RFADSGGFSP DEVVALLAAH SIAISDHVDS TIKDAPFDST PYAFDTQIHL EMLLREREYL  GSTNSTRDVA SPLPFASGDL SGVLRLRSDY AIARDARTAC QWQGFINKQT EMTRAFKVAM AKLAVVGQDT TDFVDCSEAV PVPVSTSVKH TTYPLSKTER DVEQFCKAPF PKLSASGSGS 
GSMLLQLISN KLIKAKERIL KSRVGSIVLS TLQAQLRFM* 

Retrieve as FASTA  
Remarks fgenesh2_kg.214_#_10_#_Locus11571v1rpkm9.81 Ramac1
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCTCAAGT TGTTCCCATC ACTTGTATGT CTCGCTGTCG CCACTACCTG CAGTGGGGTC AACATTAAAC ACGTAAACTG TCCTGACGGT GTGCACGTCG CTTCTGACGC TGCTTGTTGC  CCTTTCTTTG CCCTCCGTGA TGATCTTCAA AAAAATCTGT AGGTAAAATC TTTCGTGAGT CCGAGTTCTC ATGATTTATA TATAATCCGA GGGATCAGGT TCAACAATGA ATGTGGCGTG  GATGCACGCG AGGCTCTTCG CCTTAGTTTT CGTAAGTTAT GCTTCGATCC AAATTACACT GTCAACTGTT TTATTTCCTT CTTAGTCGAC GCCATTGCGC ACTCATTGTC TCTGAAGCGA  CTGGGAAAGC CTCATGGTGG GGGAGCTGAC GGTTCTATGC TCACATTTCC CTGCGTTGAA CCCTACTACG CTGCAAATAG TGGCATCTCC GATATCGTTG ATGCCCTTCT TCCTTTCTTA  GCCTCTCATC CTGTGAGCGC CGGAGATCTC ATCCAATTCG CCGCTGCTGT AGGGATATCG AATTGTGTAG GAGCTCCCAG GTTGCATTTC AAGGCCGGGC GACCTCAGGC TATGTCCCCC  GCTCCCGAGG GTCTGACCCC AGAGCCCCAA GACTCGGTCA CTGAGATACT CGCTCGCTTT GCTGACAGTG GGGGATTCTC CCCCGACGAG GTTGTCGCAT TGCTCGCCGC GCACTCCATT  GCTATTTCGG ACCATGTCGA CTCTACGATC AAGGATGCTC CCTTTGACTC GACGCCCTAT GCATTCGACA CACAGATTCA CTTGGAAATG CTATTACGGG AGAGGGAGTA TCTAGGATCG  ACGAACAGCA CACGTAACCG CTATCGGTCT CATTTAATTT CTTCTAACCA ACCTGTGTTT TATAGGGGAT GTCGCGTCTC CTCTTCCTTT CGCTTCAGGT GATCTATCTG GGGTGTTGCG  TCTCCGTTCA GATTACGCTA TTGCTCGTGA CGCACGCACT GCGTGTCAAT GGCAAGGGTT TATCAACAAG CAGACCGAGA TGACCAGAGC CTTCAAAGTC GCGATGGCAA AACTTGCAGT  AGTGGGTCAG GATACAACCG ACTTCGTCGA TTGCTCCGAG GCAGTGCCAG TGCCTGTTTC TACTTCTGTG AAGCACACAA CGTACGCCCA ACTGGCATGC CTTCTCCGTG CAAGTGATAA  TAGCACTCGA CTTATAGGTA CCCCCTCTCT AAGACAGAAA GAGACGTAGA ACAATTCTGT AAGGCTCCTT TCCCCAAGCT CAGTGCCAGT GGAAGTGGTT CGGGTTCGAT GCTTCTGTAA  GCCAGACTTC TATTCGCACT CCTCTTGAGC TATCCTGACC TTTGCTCCAA CGTAGACAAT TAATTTCCAA CAAGCTGATC AAGGCAAAGG AGAGAATACT CAAAAGCCGT GTAGGAAGCA 
TAGTATTATC GACGTTGCAG GCCCAACTGC GCTTTATGTA A 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCTCAAGT TGTTCCCATC ACTTGTATGT CTCGCTGTCG CCACTACCTG CAGTGGGGTC AACATTAAAC ACGTAAACTG TCCTGACGGT GTGCACGTCG CTTCTGACGC TGCTTGTTGC  CCTTTCTTTG CCCTCCGTGA TGATCTTCAA AAAAATCTGT TTAACAATGA ATGTGGCGTG GATGCACGCG AGGCTCTTCG CCTTAGTTTT CTCGACGCCA TTGCGCACTC ATTGTCTCTG  AAGCGACTGG GAAAGCCTCA TGGTGGGGGA GCTGACGGTT CTATGCTCAC ATTTCCCTGC GTTGAACCCT ACTACGCTGC AAATAGTGGC ATCTCCGATA TCGTTGATGC CCTTCTTCCT  TTCTTAGCCT CTCATCCTGT GAGCGCCGGA GATCTCATCC AATTCGCCGC TGCTGTAGGG ATATCGAATT GTGTAGGAGC TCCCAGGTTG CATTTCAAGG CCGGGCGACC TCAGGCTATG  TCCCCCGCTC CCGAGGGTCT GACCCCAGAG CCCCAAGACT CGGTCACTGA GATACTCGCT CGCTTTGCTG ACAGTGGGGG ATTCTCCCCC GACGAGGTTG TCGCATTGCT CGCCGCGCAC  TCCATTGCTA TTTCGGACCA TGTCGACTCT ACGATCAAGG ATGCTCCCTT TGACTCGACG CCCTATGCAT TCGACACACA GATTCACTTG GAAATGCTAT TACGGGAGAG GGAGTATCTA  GGATCGACGA ACAGCACACG GGATGTCGCG TCTCCTCTTC CTTTCGCTTC AGGTGATCTA TCTGGGGTGT TGCGTCTCCG TTCAGATTAC GCTATTGCTC GTGACGCACG CACTGCGTGT  CAATGGCAAG GGTTTATCAA CAAGCAGACC GAGATGACCA GAGCCTTCAA AGTCGCGATG GCAAAACTTG CAGTAGTGGG TCAGGATACA ACCGACTTCG TCGATTGCTC CGAGGCAGTG  CCAGTGCCTG TTTCTACTTC TGTGAAGCAC ACAACGTACC CCCTCTCTAA GACAGAAAGA GACGTAGAAC AATTCTGTAA GGCTCCTTTC CCCAAGCTCA GTGCCAGTGG AAGTGGTTCG  GGTTCGATGC TTCTACAATT AATTTCCAAC AAGCTGATCA AGGCAAAGGA GAGAATACTC AAAAGCCGTG TAGGAAGCAT AGTATTATCG ACGTTGCAGG CCCAACTGCG CTTTATGTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GGAAGGTTGA GTTTGACGAT ACAATAACTT TCTAGGGATG TACTATAGAA CAGGTGGTGT CGAGTCGGAT CGACAGATTA CCCCACTGCT AGCACGTCTC CCTCATGCTC AAGTTGTTCC  CATCACTTGT ATGTCTCGCT GTCGCCACTA CCTGCAGTGG GGTCAACATT AAACACGTAA ACTGTCCTGA CGGTGTGCAC GTCGCTTCTG ACGCTGCTTG TTGCCCTTTC TTTGCCCTCC  GTGATGATCT TCAAAAAAAT CTGTTTAACA ATGAATGTGG CGTGGATGCA CGCGAGGCTC TTCGCCTTAG TTTTCTCGAC GCCATTGCGC ACTCATTGTC TCTGAAGCGA CTGGGAAAGC  CTCATGGTGG GGGAGCTGAC GGTTCTATGC TCACATTTCC CTGCGTTGAA CCCTACTACG CTGCAAATAG TGGCATCTCC GATATCGTTG ATGCCCTTCT TCCTTTCTTA GCCTCTCATC  CTGTGAGCGC CGGAGATCTC ATCCAATTCG CCGCTGCTGT AGGGATATCG AATTGTGTAG GAGCTCCCAG GTTGCATTTC AAGGCCGGGC GACCTCAGGC TATGTCCCCC GCTCCCGAGG  GTCTGACCCC AGAGCCCCAA GACTCGGTCA CTGAGATACT CGCTCGCTTT GCTGACAGTG GGGGATTCTC CCCCGACGAG GTTGTCGCAT TGCTCGCCGC GCACTCCATT GCTATTTCGG  ACCATGTCGA CTCTACGATC AAGGATGCTC CCTTTGACTC GACGCCCTAT GCATTCGACA CACAGATTCA CTTGGAAATG CTATTACGGG AGAGGGAGTA TCTAGGATCG ACGAACAGCA  CACGGGATGT CGCGTCTCCT CTTCCTTTCG CTTCAGGTGA TCTATCTGGG GTGTTGCGTC TCCGTTCAGA TTACGCTATT GCTCGTGACG CACGCACTGC GTGTCAATGG CAAGGGTTTA  TCAACAAGCA GACCGAGATG ACCAGAGCCT TCAAAGTCGC GATGGCAAAA CTTGCAGTAG TGGGTCAGGA TACAACCGAC TTCGTCGATT GCTCCGAGGC AGTGCCAGTG CCTGTTTCTA  CTTCTGTGAA GCACACAACG TACCCCCTCT CTAAGACAGA AAGAGACGTA GAACAATTCT GTAAGGCTCC TTTCCCCAAG CTCAGTGCCA GTGGAAGTGG TTCGGGTTCG ATGCTTCTAC  AATTAATTTC CAACAAGCTG ATCAAGGCAA AGGAGAGAAT ACTCAAAAGC CGTGTAGGAA GCATAGTATT ATCGACGTTG CAGGCCCAAC TGCGCTTTAT GTAAGATGCC GTGATTGCTT  TCAAAGTCGC CTGGGAAGCT TTTCAACTTG TATGGCTTTG CAAGCTAATC AGTGCTATGC ATGTACAACT CGGCGGATGC TGTGGCAGTT TGCCAGTGAT GCACAGATAA ACTTGAAGAG 
ACGTGGGCTA ATGTTGTCTT TCGACGACTA ACTGAACAAA ACTACATAAA AAAGCACTTT AGGAATTTCA ACGATTT 

Retrieve as FASTA