Entry information : Ssrc1lsm3aCIIAA01
Entry ID 15324
Creation 2018-06-15 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-06-15 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: Ssrc1lsm3aCIIAA01
Name Ssrc1lsm3aCIIAA01
Class Asco Class II type A    [Orthogroup: CIIAA001]
Taxonomy Fungi/Metazoa; Fungi; Ascomycota; Ascomycota
Organism Stagonospora sp. SRC1lsM3a    [TaxId: 765868 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value Ssrc1lsm3aCIIAA01
start..stop
S start..stop
MbicCIIAA01 387 2e-134 15..354 11..351
MvarCIIAA01 346 2e-118 19..365 15..355
AwenCIIAA01 339 3e-115 13..353 7..349
AcarCIIAA01 330 5e-112 25..354 1..332
Literature and cross-references Ssrc1lsm3aCIIAA01
Cluster/Prediction ref. JGI gene:   284039
Protein sequence: Ssrc1lsm3aCIIAA01
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   369 (348)
PWM (Da):   %s   40306.86 (38028.7)  
PI (pH):   %s   4.62 (4.51) Peptide Signal:   %s   cut: 22 range:22-369
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MMRTLLGYTA CALAIANVSV AFPGLKNLMT ELGARQAPPE PNVPIGDLAT EGPTTPVGHQ VMDCLDDKGC QSNATYTAPG DLHSRACQED TCCIWNTISK ELEDRFLGDD GTCNQMARAS  VRLGLHDSAA WSQTSGPGGA DGSILLTNEI ERSENRPLRD IRSQALDLLR KYRGYGYEIS AADLVQFMHN VATVACPLGP RILTFVGRKD SFEPNPDGLL PDPNMSATEL IELFNNKTIT  FRDIVALIGA HTTANQFDFD PSKAGQPLDS TPGIWDVKFY EENMLPESPE GVFRLPSDAS FANDTASRVG FRTFADPDQG QEIWNEEYSV GWVRMSLLGV NNINHLTDCS GVLPKVNNVG 
PIPRRRLKK* 

Retrieve as FASTA  
Remarks estExt_Genewise1Plus.C_17_t20225 Stasp1
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGATGCGCA CTCTTCTCGG TTACACGGCT TGCGCTCTAG CCATAGCTAA TGTCTCTGTT GCTTTTCCAG GCTTAAAGAA CCTCATGACA GAACTGGGGG CACGACAAGC TCCTCCCGAG  CCGAATGTGC CAATTGGAGA TTTGGCAACC GAGGGTCCTA CAACTCCTGT TGGTCACCAG GTGATGGATT GTTTGGACGA TAAGGGCTGC CAAAGTAATG CTGTATGCTT TCTAGGATCA  TTGCTCATCA ATTCTTCTCA CGCTAACATA TATAATATAG ACTTATACTG CACCCGGTGA TCTCCACTCC AGAGCCTGTC AGGAAGATAC ATGCTGCATC TGGAACACCA TATCCAAGGA  ACTCGAAGAC CGGTTTCTTG GCGACGATGG CACCTGCAAT CAAATGGCCA GGGCTTCCGT TCGGCTCGGT CTTCATGATT CCGCTGCTTG GAGCCAGACG AGCGGGCCCG GAGGAGCCGA  TGGCTCTATC CTCCTTACCA ATGAGATAGA AAGATCCGAG AATCGACCAT TGCGCGATAT CCGGTCTCAG GCCTTGGACC TCTTGCGCAA GTACCGTGGC TACGGCTACG AGATTAGCGC  TGCAGACCTT GTACAGTTCA TGCACAATGT CGCAACCGTA GCCTGCCCGC TGGGCCCTCG GATACTGACC TTCGTCGGTC GAAAAGATAG CTTCGAGCCC AATCCCGATG GCCTACTCCC  AGATCCCAAC ATGTCCGCTA CGGAGCTTAT TGAGCTATTC AACAACAAGA CCATCACGTT CAGGGACATA GTTGCCTTGA TTGGTGCTCA CACCACCGCT AACCAATTCG ACTTCGATCC  CTCGAAGGCT GGTCAACCTC TCGATTCGAC ACCCGGAATC TGGGATGTTA AGTTCTACGA AGAAAACATG CTGCCAGAAT CTCCGGAGGG TGTCTTCCGC CTTCCGTCGG ATGCGAGTTT  TGCCAATGAT ACGGCATCAC GTGTAGGCTT TAGGACTTTT GCTGATCCGG ATCAAGGACA GGAGATTTGG AATGAGGAGT ACTCTGTGGG CTGGGTGCGG ATGTCGCTGC TTGGAGTGAA 
CAATATCAAC CATTTGACTG ACTGCTCGGG GGTTCTGCCG AAGGTAAACA ATGTAGGGCC AATACCCCGC AGACGACTGA AGAAGTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGATGCGCA CTCTTCTCGG TTACACGGCT TGCGCTCTAG CCATAGCTAA TGTCTCTGTT GCTTTTCCAG GCTTAAAGAA CCTCATGACA GAACTGGGGG CACGACAAGC TCCTCCCGAG  CCGAATGTGC CAATTGGAGA TTTGGCAACC GAGGGTCCTA CAACTCCTGT TGGTCACCAG GTGATGGATT GTTTGGACGA TAAGGGCTGC CAAAGTAATG CTACTTATAC TGCACCCGGT  GATCTCCACT CCAGAGCCTG TCAGGAAGAT ACATGCTGCA TCTGGAACAC CATATCCAAG GAACTCGAAG ACCGGTTTCT TGGCGACGAT GGCACCTGCA ATCAAATGGC CAGGGCTTCC  GTTCGGCTCG GTCTTCATGA TTCCGCTGCT TGGAGCCAGA CGAGCGGGCC CGGAGGAGCC GATGGCTCTA TCCTCCTTAC CAATGAGATA GAAAGATCCG AGAATCGACC ATTGCGCGAT  ATCCGGTCTC AGGCCTTGGA CCTCTTGCGC AAGTACCGTG GCTACGGCTA CGAGATTAGC GCTGCAGACC TTGTACAGTT CATGCACAAT GTCGCAACCG TAGCCTGCCC GCTGGGCCCT  CGGATACTGA CCTTCGTCGG TCGAAAAGAT AGCTTCGAGC CCAATCCCGA TGGCCTACTC CCAGATCCCA ACATGTCCGC TACGGAGCTT ATTGAGCTAT TCAACAACAA GACCATCACG  TTCAGGGACA TAGTTGCCTT GATTGGTGCT CACACCACCG CTAACCAATT CGACTTCGAT CCCTCGAAGG CTGGTCAACC TCTCGATTCG ACACCCGGAA TCTGGGATGT TAAGTTCTAC  GAAGAAAACA TGCTGCCAGA ATCTCCGGAG GGTGTCTTCC GCCTTCCGTC GGATGCGAGT TTTGCCAATG ATACGGCATC ACGTGTAGGC TTTAGGACTT TTGCTGATCC GGATCAAGGA  CAGGAGATTT GGAATGAGGA GTACTCTGTG GGCTGGGTGC GGATGTCGCT GCTTGGAGTG AACAATATCA ACCATTTGAC TGACTGCTCG GGGGTTCTGC CGAAGGTAAA CAATGTAGGG 
CCAATACCCC GCAGACGACT GAAGAAGTAG 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTGAAACCTC TTGGGCGACC TTTAACCTTC TTTGAAGCAG CATGATGCGC ACTCTTCTCG GTTACACGGC TTGCGCTCTA GCCATAGCTA ATGTCTCTGT TGCTTTTCCA GGCTTAAAGA  ACCTCATGAC AGAACTGGGG GCACGACAAG CTCCTCCCGA GCCGAATGTG CCAATTGGAG ATTTGGCAAC CGAGGGTCCT ACAACTCCTG TTGGTCACCA GGTGATGGAT TGTTTGGACG  ATAAGGGCTG CCAAAGTAAT GCTACTTATA CTGCACCCGG TGATCTCCAC TCCAGAGCCT GTCAGGAAGA TACATGCTGC ATCTGGAACA CCATATCCAA GGAACTCGAA GACCGGTTTC  TTGGCGACGA TGGCACCTGC AATCAAATGG CCAGGGCTTC CGTTCGGCTC GGTCTTCATG ATTCCGCTGC TTGGAGCCAG ACGAGCGGGC CCGGAGGAGC CGATGGCTCT ATCCTCCTTA  CCAATGAGAT AGAAAGATCC GAGAATCGAC CATTGCGCGA TATCCGGTCT CAGGCCTTGG ACCTCTTGCG CAAGTACCGT GGCTACGGCT ACGAGATTAG CGCTGCAGAC CTTGTACAGT  TCATGCACAA TGTCGCAACC GTAGCCTGCC CGCTGGGCCC TCGGATACTG ACCTTCGTCG GTCGAAAAGA TAGCTTCGAG CCCAATCCCG ATGGCCTACT CCCAGATCCC AACATGTCCG  CTACGGAGCT TATTGAGCTA TTCAACAACA AGACCATCAC GTTCAGGGAC ATAGTTGCCT TGATTGGTGC TCACACCACC GCTAACCAAT TCGACTTCGA TCCCTCGAAG GCTGGTCAAC  CTCTCGATTC GACACCCGGA ATCTGGGATG TTAAGTTCTA CGAAGAAAAC ATGCTGCCAG AATCTCCGGA GGGTGTCTTC CGCCTTCCGT CGGATGCGAG TTTTGCCAAT GATACGGCAT  CACGTGTAGG CTTTAGGACT TTTGCTGATC CGGATCAAGG ACAGGAGATT TGGAATGAGG AGTACTCTGT GGGCTGGGTG CGGATGTCGC TGCTTGGAGT GAACAATATC AACCATTTGA  CTGACTGCTC GGGGGTTCTG CCGAAGGTAA ACAATGTAGG GCCAATACCC CGCAGACGAC TGAAGAAGTA GTCTATGAGC TCCTTTGATG CCTTGCAAGT CCCACTTTGC AATGCGAATG  CGACGCAGTG TCAAGAGCTC AAGGGACGCG GAACCGGGAG GGAATGTAGT GGGAGTGAAG GAACACGCTT CCTAGATTCG GTGTGCAGGA ATATACCCCA AGCAATGCAT TTGTCTCGTC 
AACCATGCGC TTTTCATGAT GCTGCTGATG GCCGGAGTTT GTT 

Retrieve as FASTA