Entry information : Ssrc1lsm3aCIIAB06
Entry ID 15326
Creation 2018-06-15 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-06-15 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: Ssrc1lsm3aCIIAB06
Name Ssrc1lsm3aCIIAB06
Class Asco Class II type B    [Orthogroup: CIIAB001]
Taxonomy Fungi/Metazoa; Fungi; Ascomycota; Ascomycota
Organism Stagonospora sp. SRC1lsM3a    [TaxId: 765868 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value Ssrc1lsm3aCIIAB06
start..stop
S start..stop
PnoCIIAB04 443 7e-159 8..292 8..292
AalteCIIAB01 424 3e-151 1..276 1..277
DexiCIIAB01 412 2e-146 7..289 9..293
AbraCIIAB03 399 2e-141 1..276 1..277
Literature and cross-references Ssrc1lsm3aCIIAB06
Cluster/Prediction ref. JGI gene:   277177
Protein sequence: Ssrc1lsm3aCIIAB06
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   292 (275)
PWM (Da):   %s   30897.02 (29056.1)  
PI (pH):   %s   7.31 (7.24) Peptide Signal:   %s   cut: 18 range:18-292
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MPSYTFTLLA LVASTSAFNI WPRQTSSCPS VWSDVVKELQ TSFSGCGRDA HGAIRAPFHD CINNGCDGSL ILTDECSRAE NAGLSDICAK LKNWSTKYSV SAADMIQFAA ATAIAVCPLG  PTVKALVGRK DSSNAAPVGS VPSSRDSVDK ILAAFSAKGF SADDLVALLG THSVAVQVND DPSQAGKSLD STPSVYDTKF YKETKDGTAP YSLQSDKLMS NDTQTAKTWA AFGDDANSWA 
SKFTDAWNRF AVIGNDVGSL TDCSSLIPSG SARKRRGMSM PMGARGYARY HS* 

Retrieve as FASTA  
Remarks estExt_Genewise1Plus.C_10_t10332 Stasp1
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCCTTCCT ATACCTTCAC GCTTCTAGCT CTGGTAGCAT CCACCTCAGC CTTCAACATC TGGCCTCGGC AAACAAGCAG TTGCCCATCA GTCTGGTCAG ACGTGGTCAA AGAGCTGCAG  ACTTCCTTCT CAGGATGCGG AAGAGATGCT CATGGAGCCA TCCGAGCCCC TTTTCATGAT TGCATCAACA ATGGCTGTGA TGGATCTCTC ATCTTAACCG ATGAGTGCAG TCGCGCAGAA  AATGCCGGAC TCTCCGATAT ATGCGCCAAG CTCAAGAATT GGTCAACCAA GTACAGTGTC AGCGCCGCAG ACATGATTCA ATTCGCCGCT GCCACTGCCA TCGCTGTATG TCCCCTTGGA  CCAACAGTCA AGGCACTTGT TGGCCGGAAA GACAGCTCCA ATGCCGCACC CGTAGGCTCA GTACCAAGCA GTCGAGACTC AGTCGACAAG ATTCTTGCTG CCTTCAGTGC CAAAGGCTTT  TCCGCCGACG ACCTTGTTGC TCTTCTCGGC ACTCATTCTG TCGCCGTTCA AGTCAACGAT GACCCATCAC AAGCAGGAAA GTCGCTCGAC TCAACGCCAT CAGTGTATGA CACAAAGTTC  TACAAGGAGA CAAAAGATGG CACTGCTCCG TATAGTTTAC AAAGCGATAA GCTCATGTCC AACGATACTC AAGTATGTTC TCACTTTCAT GCATGTGACG CAGCTGCTAA TCTCAGATTA  GACTGCCAAA ACTTGGGCAG CTTTTGGAGA CGACGCAAAC TCATGGGCTT CAAAATTTAC TGATGCCTGG AATCGTTTCG CTGTTATTGG AAACGATGTT GGTAGTCTAA CGGACTGCTC 
GAGCTTGATA CCGAGTGGGT CTGCAAGAAA GAGACGGGGA ATGAGCATGC CGATGGGTGC GCGAGGTTAT GCTAGGTATC ATTCTTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCCTTCCT ATACCTTCAC GCTTCTAGCT CTGGTAGCAT CCACCTCAGC CTTCAACATC TGGCCTCGGC AAACAAGCAG TTGCCCATCA GTCTGGTCAG ACGTGGTCAA AGAGCTGCAG  ACTTCCTTCT CAGGATGCGG AAGAGATGCT CATGGAGCCA TCCGAGCCCC TTTTCATGAT TGCATCAACA ATGGCTGTGA TGGATCTCTC ATCTTAACCG ATGAGTGCAG TCGCGCAGAA  AATGCCGGAC TCTCCGATAT ATGCGCCAAG CTCAAGAATT GGTCAACCAA GTACAGTGTC AGCGCCGCAG ACATGATTCA ATTCGCCGCT GCCACTGCCA TCGCTGTATG TCCCCTTGGA  CCAACAGTCA AGGCACTTGT TGGCCGGAAA GACAGCTCCA ATGCCGCACC CGTAGGCTCA GTACCAAGCA GTCGAGACTC AGTCGACAAG ATTCTTGCTG CCTTCAGTGC CAAAGGCTTT  TCCGCCGACG ACCTTGTTGC TCTTCTCGGC ACTCATTCTG TCGCCGTTCA AGTCAACGAT GACCCATCAC AAGCAGGAAA GTCGCTCGAC TCAACGCCAT CAGTGTATGA CACAAAGTTC  TACAAGGAGA CAAAAGATGG CACTGCTCCG TATAGTTTAC AAAGCGATAA GCTCATGTCC AACGATACTC AAACTGCCAA AACTTGGGCA GCTTTTGGAG ACGACGCAAA CTCATGGGCT  TCAAAATTTA CTGATGCCTG GAATCGTTTC GCTGTTATTG GAAACGATGT TGGTAGTCTA ACGGACTGCT CGAGCTTGAT ACCGAGTGGG TCTGCAAGAA AGAGACGGGG AATGAGCATG 
CCGATGGGTG CGCGAGGTTA TGCTAGGTAT CATTCTTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CAAACTCTTT GTCCTATATC TTGGATCTTG TGCAGTTTGG TCTAAGCACT CGTTGTGTAT ACCATACCCA AAATGCCTTC CTATACCTTC ACGCTTCTAG CTCTGGTAGC ATCCACCTCA  GCCTTCAACA TCTGGCCTCG GCAAACAAGC AGTTGCCCAT CAGTCTGGTC AGACGTGGTC AAAGAGCTGC AGACTTCCTT CTCAGGATGC GGAAGAGATG CTCATGGAGC CATCCGAGCC  CCTTTTCATG ATTGCATCAA CAATGGCTGT GATGGATCTC TCATCTTAAC CGATGAGTGC AGTCGCGCAG AAAATGCCGG ACTCTCCGAT ATATGCGCCA AGCTCAAGAA TTGGTCAACC  AAGTACAGTG TCAGCGCCGC AGACATGATT CAATTCGCCG CTGCCACTGC CATCGCTGTA TGTCCCCTTG GACCAACAGT CAAGGCACTT GTTGGCCGGA AAGACAGCTC CAATGCCGCA  CCCGTAGGCT CAGTACCAAG CAGTCGAGAC TCAGTCGACA AGATTCTTGC TGCCTTCAGT GCCAAAGGCT TTTCCGCCGA CGACCTTGTT GCTCTTCTCG GCACTCATTC TGTCGCCGTT  CAAGTCAACG ATGACCCATC ACAAGCAGGA AAGTCGCTCG ACTCAACGCC ATCAGTGTAT GACACAAAGT TCTACAAGGA GACAAAAGAT GGCACTGCTC CGTATAGTTT ACAAAGCGAT  AAGCTCATGT CCAACGATAC TCAAACTGCC AAAACTTGGG CAGCTTTTGG AGACGACGCA AACTCATGGG CTTCAAAATT TACTGATGCC TGGAATCGTT TCGCTGTTAT TGGAAACGAT 
GTTGGTAGTC TAACGGACTG CTCGAGCTTG ATACCGAGTG GGTCTGCAAG AAAGAGACGG GGAATGAGCA TGCCGATGGG TGCGCGAGGT TATGCTAGGT ATCATTCTTA A 

Retrieve as FASTA