1. Browse the Database
  2. View Redoxidase
Entry information : StPrx74 (PGSC0003DMT400062326 [4.03])
Entry ID 15335
Creation 2018-06-19 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-06-19 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: StPrx74 (PGSC0003DMT400062326 [4.03])
Name (synonym) StPrx74 (PGSC0003DMT400062326 [4.03])
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx036]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Solanum tuberosum (Potato)    [TaxId: 4113 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Mixed tissues
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value StPrx74
start..stop		 S start..stop
LePrx34 625 0 1..318 1..318
NtPrx45-1A 555 0 1..317 1..323
NtPrx45-1B 552 0 1..317 1..323
CroPrx34 504 0 1..318 1..318
Literature and cross-references StPrx74 (PGSC0003DMT400062326 [4.03])
Protein sequence: StPrx74 (PGSC0003DMT400062326 [4.03])
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   317 (297)
PWM (Da):   %s   34426.37 (32183.1) Transmb domain:   %s   i5-27o
PI (pH):   %s   7.38 (7.40) Peptide Signal:   %s   cut: 21 range:21-317
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAPFSTIVFL ILLIVPLCSA TLGVQYYDQT CPHAEDIIYQ TIRNASFFDP KVPARILRMF FHDCFIRGCD ASVLLDSTPE NKAEKDGPPN LSLGAFYVID AVKTNLEKAC PATVSCADIV  AIAARDVVAM SGGPYWNVLK GRKDGRVSRA NETVNLPAPS FNTSQLIQSF ANRGLGVKDL VALSGGHTLG FSHCSSFEGR LHNFSSVHDT DPSLNAVFAQ SLKQKCLKPN SDSNAGQLLD 
PTSSVFDNNY YKQIISGKGV FASDQSLSND YRTGLIVKAF ANDQTVFFRE FAASMIKLGN VGVLENAEVR LNCRAVN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (introns 1 and 2) and 1 EST
DNA ►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTCCTT TTTCTACAAT CGTATTTCTT ATTTTGTTAA TAGTCCCTCT ATGCAGTGCA ACTCTTGGAG TTCAATACTA TGATCAAACA TGTCCTCATG CTGAAGATAT TATTTATCAA  ACAATTCGCA ATGCTTCGTT TTTTGATCCT AAAGTCCCAG CACGTATTCT CAGGATGTTC TTCCATGATT GTTTCATTAG AGTATGTATT TAATTGTGTG CATAATGCAA GTCATTATAT  TATAGATGCA TACAAGAGAT GGAAATTGAA ACTGTTTTGT TAATGATTAT TCACAGGGAT GTGATGCATC AGTTCTACTG GATTCAACAC CAGAAAACAA AGCAGAGAAA GATGGTCCGC  CTAACCTCTC TCTTGGAGCT TTCTATGTGA TTGATGCTGT CAAAACAAAC CTCGAAAAGG CTTGCCCAGC AACTGTTTCT TGTGCTGACA TAGTTGCCAT CGCAGCTAGA GATGTTGTGG  CCATGGTACT ACTTCATCAT CCTCCCTACT AAATTGTTAA TTCACGAGCA GTAAATAACA CTATATGACC AGTTAAAATA TACTACTAGC TAGCAAGGCG TTGTCAGTGT ATATAAGTTA  AATTCACTGA TTAAACTGTA ATCATAAGCT CATAAATACT TCATGTCTGA TCAATTTTGT AGTCTGGAGG TCCATACTGG AATGTACTAA AAGGAAGAAA AGATGGAAGG GTGTCAAGGG  CCAATGAGAC AGTAAACTTA CCTGCTCCAT CCTTCAACAC AAGCCAACTC ATTCAGAGCT TTGCCAACAG GGGATTGGGA GTGAAAGATT TGGTTGCTCT TTCTGGTGGA CACACACTTG  GATTCTCACA CTGCTCTTCA TTTGAAGGCA GACTTCATAA CTTCAGCTCA GTGCACGACA CTGACCCGAG CTTGAACGCA GTATTTGCAC AGAGCTTAAA GCAGAAATGC CTGAAACCCA  ACAGTGATAG CAATGCAGGA CAATTATTGG ACCCAACTTC ATCAGTATTT GACAACAACT ATTACAAGCA AATTATTTCA GGCAAAGGTG TTTTTGCATC AGACCAGAGT TTGTCGAATG  ACTACAGGAC TGGATTGATT GTTAAGGCAT TTGCCAATGA CCAAACTGTG TTCTTCAGGG AATTTGCTGC TTCAATGATC AAGCTTGGAA ATGTTGGTGT CCTTGAAAAT GCAGAAGTTA 
GACTCAACTG CAGAGCTGTG AACTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTCCTT TTTCTACAAT CGTATTTCTT ATTTTGTTAA TAGTCCCTCT ATGCAGTGCA ACTCTTGGAG TTCAATACTA TGATCAAACA TGTCCTCATG CTGAAGATAT TATTTATCAA  ACAATTCGCA ATGCTTCGTT TTTTGATCCT AAAGTCCCAG CACGTATTCT CAGGATGTTC TTCCATGATT GTTTCATTAG AGGATGTGAT GCATCAGTTC TACTGGATTC AACACCAGAA  AACAAAGCAG AGAAAGATGG TCCGCCTAAC CTCTCTCTTG GAGCTTTCTA TGTGATTGAT GCTGTCAAAA CAAACCTCGA AAAGGCTTGC CCAGCAACTG TTTCTTGTGC TGACATAGTT  GCCATCGCAG CTAGAGATGT TGTGGCCATG TCTGGAGGTC CATACTGGAA TGTACTAAAA GGAAGAAAAG ATGGAAGGGT GTCAAGGGCC AATGAGACAG TAAACTTACC TGCTCCATCC  TTCAACACAA GCCAACTCAT TCAGAGCTTT GCCAACAGGG GATTGGGAGT GAAAGATTTG GTTGCTCTTT CTGGTGGACA CACACTTGGA TTCTCACACT GCTCTTCATT TGAAGGCAGA  CTTCATAACT TCAGCTCAGT GCACGACACT GACCCGAGCT TGAACGCAGT ATTTGCACAG AGCTTAAAGC AGAAATGCCT GAAACCCAAC AGTGATAGCA ATGCAGGACA ATTATTGGAC  CCAACTTCAT CAGTATTTGA CAACAACTAT TACAAGCAAA TTATTTCAGG CAAAGGTGTT TTTGCATCAG ACCAGAGTTT GTCGAATGAC TACAGGACTG GATTGATTGT TAAGGCATTT 
GCCAATGACC AAACTGTGTT CTTCAGGGAA TTTGCTGCTT CAATGATCAA GCTTGGAAAT GTTGGTGTCC TTGAAAATGC AGAAGTTAGA CTCAACTGCA GAGCTGTGAA CTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTCCTT TTTCTACAAT CGTATTTCTT ATTTTGTTAA TAGTCCCTCT ATGCAGTGCA ACTCTTGGAG TTCAATACTA TGATCAAACA TGTCCTCATG CTGAAGATAT TATTTATCAA  ACAATTCGCA ATGCTTCGTT TTTTGATCCT AAAGTCCCAG CACGTATTCT CAGGATGTTC TTCCATGATT GTTTCATTAG AGGATGTGAT GCATCAGTTC TACTGGATTC AACACCAGAA  AACAAAGCAG AGAAAGATGG TCCGCCTAAC CTCTCTCTTG GAGCTTTCTA TGTGATTGAT GCTGTCAAAA CAAACCTCGA AAAGGCTTGC CCAGCAACTG TTTCTTGTGC TGACATAGTT  GCCATCGCAG CTAGAGATGT TGTGGCCATG TCTGGAGGTC CATACTGGAA TGTACTAAAA GGAAGAAAAG ATGGAAGGGT GTCAAGGGCC AATGAGACAG TAAACTTACC TGCTCCATCC  TTCAACACAA GCCAACTCAT TCAGAGCTTT GCCAACAGGG GATTGGGAGT GAAAGATTTG GTTGCTCTTT CTGGTGGACA CACACTTGGA TTCTCACACT GCTCTTCATT TGAAGGCAGA  CTTCATAACT TCAGCTCAGT GCACGACACT GACCCGAGCT TGAACGCAGT ATTTGCACAG AGCTTAAAGC AGAAATGCCT GAAACCCAAC AGTGATAGCA ATGCAGGACA ATTATTGGAC  CCAACTTCAT CAGTATTTGA CAACAACTAT TACAAGCAAA TTATTTCAGG CAAAGGTGTT TTTGCATCAG ACCAGAGTTT GTCGAATGAC TACAGGACTG GATTGATTGT TAAGGCATTT 
GCCAATGACC AAACTGTGTT CTTCAGGGAA TTTGCTGCTT CAATGATCAA GCTTGGAAAT GTTGGTGTCC TTGAAAATGC AGAAGTTAGA CTCAACTGCA GAGCTGTGAA CTGA 

Retrieve as FASTA