Entry information : MpalPrx115
Entry ID 15458
Creation 2018-09-03 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-09-03 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: MpalPrx115
Name MpalPrx115
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx188]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Marchantiaceae Marchantia
Organism Marchantia paleacea    [TaxId: 56867 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value MpalPrx115
start..stop
S start..stop
MpPrx115 583 0 1..322 1..322
MpalPrx114 528 0 1..322 1..322
MpalPrx113 519 0 1..322 1..322
MpPrx113 513 0 1..322 1..322
Literature and cross-references MpalPrx115
Protein sequence: MpalPrx115
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   322 (298)
PWM (Da):   %s   34401.9 (31912.6)  
PI (pH):   %s   10 (10.02) Peptide Signal:   %s   cut: 25 range:25-322
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAMTGSKWIL SIFITLAVVA AVDAQLSESF YAAKCPRAPA KVAEVIRSWI ARDRTLAPAL LRLHFHDCFV RGCDASVLLD GAKSEKNAGG NKGSLRGFNV IDDVKAKVES LCPGVVSCSD  ILALAARDAI VAMGGTNWTV PLGRRDGVLS IQSEADANLP SPFASFDTLS SNFAKKGLTT KDLVVLSGSH TVGLAQCAVM QTRLYNFSAT AKTDPALEPT FAAALKRQCK QGDLTTKIKM 
DQTKAVDSWD PNYYSNVLKG KSLFRSDDQL KKNSVGLKIV QTMNRIPSPF NAEFGAAMVK MGRIGVLTGT SGQIRKKCNV KN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete seequence from genomic (3 introns, contig_7496:37404-39084) and RNA seq (part, isotig37880 )
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGATGA CAGGCTCCAA ATGGATTTTG AGCATATTCA TAACATTAGC TGTGGTGGCA GCAGTTGACG CTCAACTGTC TGAATCTTTC TACGCAGCTA AGTGCCCAAG AGCTCCTGCC  AAGGTTGCCG AAGTTATCAG GAGTTGGATA GCCAGGGACA GGACTTTGGC ACCAGCCCTC CTCCGACTGC ACTTCCATGA CTGCTTCGTT CGGGTAATTT GATAATTGAT AATTGGTTAT  TTATATAGAT TATCGATCCG CGGGATCTTC ATTGCCAATA CTATTTTTTA TTCCCTCAGC AATAGGCGAA GGAATCATTT CAATTGGTAG TTCTTTATCA TATCCTTGGA TATGTAGAAT  TCCCTTATCT TCAATCTCAG ATACTCAACC CGAGCCATAA AGTGCGAGCG AGACAAAAGT CCACTTTATT AAACGTCACA AAAAAGATTA CGCAAGCAGT CAAGTCCAGT CAAGCAGTTT  GAATTCTCGA ATCTGGAACG CCTAGCAGGC CATGATTTCG CTGGACTATT TTGGACTGCT GAAGTATTGA CGCATCGTGT CCACAGGGAT GTGATGCTTC TGTGCTCCTC GATGGTGCTA  AGAGCGAGAA GAATGCAGGA GGAAATAAGG GTTCTCTTCG TGGATTTAAT GTAATCGACG ATGTGAAGGC TAAAGTGGAA TCTTTGTGCC CTGGCGTGGT GTCTTGCTCT GATATCCTTG  CCCTTGCTGC CCGTGATGCT ATCGTTGCGG TAAGCACTCA GAGTCAAACC AGTGTTAAGT TCCTGTACGC TGCTGGTGGC AGTTCTACGT CTCGTCTGCC ACTGCCTCGA ACTGAGTTTG  AAAAGTGATA TGACAATGTG TAAATGCATG CGCATGTGTG TTCAGATGGG AGGAACCAAC TGGACCGTTC CTCTTGGTCG ACGAGATGGA GTCCTCTCCA TCCAGTCTGA AGCTGACGCA  AACTTGCCAT CTCCATTCGC ATCCTTCGAT ACCTTGTCCA GCAACTTTGC CAAAAAAGGT CTCACCACTA AGGACCTAGT GGTGCTTTCA GGTAAGAAGA TCCTCAACAA CTAGTAGGAA  AACGAAATTA TACTCCACGG ATGTCATATT TACACGCTCA GACTCAGCAA ATGAACAGCA AGAAGACAAT GCATAGCAGG AAATCTCAGA TCTGAATCAT GTTAGCAAGC AGGGCACGTC  AAGAGGTGGA TCTGAGTGTC TCAAGCGATT CTTTGTAATT GAAATCTGAT ATACTTGCGT TTGTTTGGTA TCAGGTTCAC ACACTGTTGG ACTTGCACAG TGCGCAGTCA TGCAGACTCG  TCTGTACAAC TTTTCAGCCA CAGCGAAAAC AGACCCAGCT TTGGAACCTA CCTTTGCAGC TGCATTGAAG AGGCAGTGCA AGCAAGGCGA TCTAACCACA AAGATCAAGA TGGACCAGAC  CAAGGCAGTT GACTCCTGGG ATCCTAACTA CTACTCGAAT GTCCTTAAAG GAAAATCTTT GTTCAGATCC GACGATCAGC TGAAGAAGAA CTCCGTAGGT CTGAAAATCG TGCAGACGAT  GAACAGGATA CCATCTCCTT TCAATGCTGA ATTTGGAGCT GCTATGGTTA AGATGGGAAG GATTGGCGTG CTTACCGGCA CCAGTGGTCA GATTCGTAAG AAGTGTAACG TCAAGAATTA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGATGA CAGGCTCCAA ATGGATTTTG AGCATATTCA TAACATTAGC TGTGGTGGCA GCAGTTGACG CTCAACTGTC TGAATCTTTC TACGCAGCTA AGTGCCCAAG AGCTCCTGCC  AAGGTTGCCG AAGTTATCAG GAGTTGGATA GCCAGGGACA GGACTTTGGC ACCAGCCCTC CTCCGACTGC ACTTCCATGA CTGCTTCGTT CGGGGATGTG ATGCTTCTGT GCTCCTCGAT  GGTGCTAAGA GCGAGAAGAA TGCAGGAGGA AATAAGGGTT CTCTTCGTGG ATTTAATGTA ATCGACGATG TGAAGGCTAA AGTGGAATCT TTGTGCCCTG GCGTGGTGTC TTGCTCTGAT  ATCCTTGCCC TTGCTGCCCG TGATGCTATC GTTGCGATGG GAGGAACCAA CTGGACCGTT CCTCTTGGTC GACGAGATGG AGTCCTCTCC ATCCAGTCTG AAGCTGACGC AAACTTGCCA  TCTCCATTCG CATCCTTCGA TACCTTGTCC AGCAACTTTG CCAAAAAAGG TCTCACCACT AAGGACCTAG TGGTGCTTTC AGGTTCACAC ACTGTTGGAC TTGCACAGTG CGCAGTCATG  CAGACTCGTC TGTACAACTT TTCAGCCACA GCGAAAACAG ACCCAGCTTT GGAACCTACC TTTGCAGCTG CATTGAAGAG GCAGTGCAAG CAAGGCGATC TAACCACAAA GATCAAGATG  GACCAGACCA AGGCAGTTGA CTCCTGGGAT CCTAACTACT ACTCGAATGT CCTTAAAGGA AAATCTTTGT TCAGATCCGA CGATCAGCTG AAGAAGAACT CCGTAGGTCT GAAAATCGTG  CAGACGATGA ACAGGATACC ATCTCCTTTC AATGCTGAAT TTGGAGCTGC TATGGTTAAG ATGGGAAGGA TTGGCGTGCT TACCGGCACC AGTGGTCAGA TTCGTAAGAA GTGTAACGTC 
AAGAATTAG 

Retrieve as FASTA