Entry information : MpalPrx113
Entry ID 15462
Creation 2018-09-06 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-09-06 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: MpalPrx113
Name MpalPrx113
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx421]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Marchantiaceae Marchantia
Organism Marchantia paleacea    [TaxId: 56867 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value MpalPrx113
start..stop
S start..stop
MpPrx113 577 0 1..322 1..322
MpalPrx115 541 0 1..322 1..322
MpalPrx114 523 0 1..322 1..322
MpPrx115 523 0 1..322 1..322
Literature and cross-references MpalPrx113
Protein sequence: MpalPrx113
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   322 (298)
PWM (Da):   %s   34770.8 (32283.5) Transmb domain:   %s   i5-27o
PI (pH):   %s   9.85 (10.00) Peptide Signal:   %s   cut: 25 range:25-322
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MTSTGSKWLL VMCLVLVVVA VADAQLTESF YASKCPKGPA KVREVIKTWI TRDRTLAPAL LRLHFHDCFV RGCDASVLLD GANSEKQSLG NRDSLRGFNV IDDVKAKVEA LCPGVVSCSD  ILALAARDAI LEMGGTNWSV PLGRRDGLVS FASEANANLP SPFSTFSSLV TSFARKGLTT QDMVVLSGSH TVGLTSCALV QSRLYSFSSS AKTDPALDPT FAASLKRQCK QGDFTTKIKM 
DQTKSVDTWD PNYYSNVARG RSVFTSDDEL RRNSAGLKIV QQMNRSPSPF NRNFGASMVK MGRIGVLTGT QGQIRKKCSV KN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (3 introns, contig_7496:47004-48721) and RNA seq (isotig33010).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACATCAA CCGGTTCTAA ATGGCTGCTC GTCATGTGCT TAGTTCTGGT CGTTGTTGCA GTGGCTGATG CTCAGTTGAC AGAATCTTTT TACGCGTCCA AGTGTCCGAA AGGTCCTGCC  AAAGTTCGCG AAGTGATCAA GACATGGATT ACTAGAGACA GGACTTTGGC ACCGGCTCTT CTTCGATTGC ACTTCCATGA TTGCTTCGTT CGGGTAATTG GCACTTACAA TAGGCATCAT  CTTTAGTCCT ATCGGCTGTG TGCTTTCTTC CACCCGTTAG TCGACCGTAA AGAGCAAAAA GCGATCTGAT TCCCTTAGTG AATCTCCACG ACTATCATGC TACCTGAATC CCAAGCTTTC  TGATTGCTAT GTGTTTATAT GAAAATTTCA TATAAAGCTT CTGAAAACTT TCGAGAGTAG AAGTGTCCCA GCCATGATTG GATATATATC AATATCAAAT TGCTATTGAA CGGCTTCATA  AAAATCTGAT AGCTTTCTCC TTTCTTGCGA ATCATGCATG CTCTTGATTT GTCTCTTTCA GGGCTGTGAT GCTTCCGTGC TTCTGGATGG TGCCAACAGC GAGAAGCAAT CACTCGGAAA  CCGAGATTCC CTCAGGGGTT TTAATGTCAT CGATGATGTT AAGGCCAAAG TCGAGGCTTT GTGCCCAGGC GTTGTGTCTT GCTCCGACAT CCTTGCTCTG GCCGCTCGAG ATGCCATCCT  TGAGGTAAGA ACATACTCCA GTATAAACCT TACCCTGTTG AACGATAAAA TTACACCTCA TTCCATAATT TATCAAGTTA TGTACTCAAA TAGTAAAGTT CGAAATCAAC TAAAAAAAAC  TGACCACTCG AATTCATGCA CATGGGAAAA CAGATGGGAG GAACAAACTG GAGCGTTCCC CTAGGCCGAC GAGATGGCCT TGTGTCATTT GCTTCGGAGG CCAACGCAAA CTTGCCTTCT  CCATTTTCTA CCTTCTCCTC CCTGGTCACC AGCTTCGCTA GGAAGGGTCT GACAACTCAA GACATGGTGG TTCTTTCAGG TATAAAGATG GAGATAAGAT TCTCTATCAT TCATTCAATC  CAAATTCCAG TTATCAACAG CCAGAATGTT GACTCGTATG AAACGTTGAA ATTGCAAGTA GAAGTATGCG CGAGTACAGC CTGGAGTTTG ACTGACTGAG AATATTCAAT GCATTAGATG  TGAATTTCCA ATCTTTAGAT CTGGAACTGT GTACCCAGTT ATTTAGCAGT TGAGGTGATT CATGAATTTC TGACGAAGTC TACATTGCCA TCTTTAATGG AACTGTCTCA GGATCACACA  CAGTTGGTCT CACGAGCTGC GCGCTTGTCC AATCACGTCT CTATAGTTTC TCCTCGTCAG CGAAGACTGA CCCAGCATTG GACCCAACTT TCGCAGCCTC TCTGAAGAGG CAGTGCAAGC  AGGGGGATTT CACCACCAAG ATTAAGATGG ATCAGACCAA GTCCGTCGAC ACATGGGACC CCAACTACTA CTCCAATGTC GCTCGCGGAC GGTCCGTCTT CACTTCTGAC GATGAGTTGA  GGAGGAACTC CGCAGGTCTG AAGATCGTGC AGCAGATGAA CAGATCGCCT TCTCCTTTCA ACAGGAACTT CGGAGCCTCT ATGGTCAAGA TGGGCAGGAT CGGTGTGCTT ACTGGCACTC 
AAGGTCAGAT TCGTAAGAAG TGTTCAGTCA AGAACTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACATCAA CCGGTTCTAA ATGGCTGCTC GTCATGTGCT TAGTTCTGGT CGTTGTTGCA GTGGCTGATG CTCAGTTGAC AGAATCTTTT TACGCGTCCA AGTGTCCGAA AGGTCCTGCC  AAAGTTCGCG AAGTGATCAA GACATGGATT ACTAGAGACA GGACTTTGGC ACCGGCTCTT CTTCGATTGC ACTTCCATGA TTGCTTCGTT CGGGGCTGTG ATGCTTCCGT GCTTCTGGAT  GGTGCCAACA GCGAGAAGCA ATCACTCGGA AACCGAGATT CCCTCAGGGG TTTTAATGTC ATCGATGATG TTAAGGCCAA AGTCGAGGCT TTGTGCCCAG GCGTTGTGTC TTGCTCCGAC  ATCCTTGCTC TGGCCGCTCG AGATGCCATC CTTGAGATGG GAGGAACAAA CTGGAGCGTT CCCCTAGGCC GACGAGATGG CCTTGTGTCA TTTGCTTCGG AGGCCAACGC AAACTTGCCT  TCTCCATTTT CTACCTTCTC CTCCCTGGTC ACCAGCTTCG CTAGGAAGGG TCTGACAACT CAAGACATGG TGGTTCTTTC AGGATCACAC ACAGTTGGTC TCACGAGCTG CGCGCTTGTC  CAATCACGTC TCTATAGTTT CTCCTCGTCA GCGAAGACTG ACCCAGCATT GGACCCAACT TTCGCAGCCT CTCTGAAGAG GCAGTGCAAG CAGGGGGATT TCACCACCAA GATTAAGATG  GATCAGACCA AGTCCGTCGA CACATGGGAC CCCAACTACT ACTCCAATGT CGCTCGCGGA CGGTCCGTCT TCACTTCTGA CGATGAGTTG AGGAGGAACT CCGCAGGTCT GAAGATCGTG  CAGCAGATGA ACAGATCGCC TTCTCCTTTC AACAGGAACT TCGGAGCCTC TATGGTCAAG ATGGGCAGGA TCGGTGTGCT TACTGGCACT CAAGGTCAGA TTCGTAAGAA GTGTTCAGTC 
AAGAACTAG 

Retrieve as FASTA