1. Browse the Database
  2. View Redoxidase
Entry information : LePrx96(Solyc05g013350.2.1 [2.3])
Entry ID 15848
Creation 2019-04-19 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2019-04-19 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-05-10 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LePrx96(Solyc05g013350.2.1 [2.3])
Name LePrx96(Solyc05g013350.2.1 [2.3])
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx272]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LePrx96
start..stop		 S start..stop
LpPrx05 983 0 1..487 1..487
NtPrx26-1B 669 0 1..487 1..499
NtPrx26-1A 644 0 1..487 1..500
NtPrx24-1A 466 1.63e-162 181..487 123..429
NtPrx24-1A 52 0.000000157 1..44 1..45
Literature and cross-references LePrx96(Solyc05g013350.2.1 [2.3])
Protein sequence: LePrx96(Solyc05g013350.2.1 [2.3])
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   487 (463)
PWM (Da):   %s   52586.36 (50000.9) Transmb domain:   %s   i7-26o
PI (pH):   %s   5 (4.85) Peptide Signal:   %s   cut: 25 range:25-487
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MVGKARIFAG LFLICIVLPS LASAFVDHLP EVGQVNDNND VPIHVSTVAH FSEKQVKEAM IRRAKAVHDL WANFGNNDKD DVAKEDAAPV TPTPVDSTPT TTPVDPTPTP VDPTPNPGPV  NPVPADPTPN PVPANNVPAG YPGATQGPPV AMGYGGAPIT QNPSDQQTVP EQAGAAQNHP TPEEIKEQRK HAGLQVGFYD STCPNAEKII KDGMNRAFGN DSSMAAPIGR LLFHDCFVNG  CDASILLDKT PSGARVEKLA PTNGATIRGF ELIDEIKAEL EAECPGIVSC SDLLVYLSRD AFVVSGVPYY DVPGGRRDGM ESLEANVIGN LPLPDNTVDK MIDLFKKKGL TEEDLVVLIG  AHSIGVAHCF SFRYRVDNPV KATMVDPRLA GVMKFTCTTP MSTLAFDTTT QYKMDSVYYK QLSGKRALLE SDALLNEDPR TKDFIQKFGD DENGWFIKFG KAMNKLTSIQ VLTGDQGQIR 
KQCRFVN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Very long signal peptide.
DNA ►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTAGGGA AGGCGAGGAT TTTCGCTGGT CTTTTTCTTA TTTGCATTGT CCTCCCTTCG CTGGCCTCAG CGTTTGTAGA TCATCTACCT GAAGTTGGCC AAGTAAACGA TAACAATGAT  GTACCGATCC ATGTTAGTAC TGTTGCTCAC TTCAGCGAAA AGCAAGTTAA GGAGGCAATG ATAAGAAGGG CAAAGGCAGT GCATGATCTG TGGGCAAATT TTGGTAATAA TGATAAGGAT  GATGTAGCTA AAGAAGATGC TGCACCTGTA ACTCCAACGC CTGTTGATTC AACACCTACA ACTACACCTG TTGATCCAAC TCCAACGCCT GTTGATCCAA CACCTAATCC TGGGCCTGTT  AACCCTGTTC CAGCTGATCC AACACCTAAT CCTGTGCCTG CTAACAATGT ACCTGCAGGA TATCCAGGAG CAACTCAAGG GCCGCCTGTG GCGATGGGAT ATGGGGGTGC ACCTATAACA  CAAAATCCAT CAGACCAACA AACTGTGCCT GAACAGGCAG GTGCTGCTCA GAACCATCCA ACACCGGAAG AAATTAAAGA GCAGCGCAAA CATGCTGGAT TACAAGTGGG ATTTTACGAT  AGCACTTGCC CGAATGCTGA GAAGATCATT AAGGATGGAA TGAACAGAGC TTTTGGGAAT GATTCCAGCA TGGCTGCTCC AATTGGGCGT CTTCTGTTCC ATGATTGCTT TGTCAATGTA  AGTTTTCAGT GTGCAGATTC TACAATGTAC ACCTCTGAAA ATAGGTTTTG CTATGCTTTC TTAACAATGA CAACCAAAAG AAACCCTTAA AAGTTTCATG AAAATTCATT TATCTAATGT  ACAGGGATGT GATGCGTCTA TACTCTTAGA CAAGACACCA AGTGGTGCAA GGGTAGAAAA ACTCGCCCCC ACCAATGGTG CAACAATTAG GGGATTTGAA CTCATTGACG AGATCAAGGC  TGAGCTTGAG GCAGAATGCC CTGGCATAGT CTCATGCTCT GATCTTTTGG TATACTTGTC AAGGGATGCA TTTGTTGTAT CAGGTGTCCC TTACTACGAC GTGCCTGGTG GACGTCGTGA  TGGAATGGAA TCCCTTGAAG CTAATGTTAT TGGAAACCTC CCACTTCCTG ATAATACAGT GGACAAGATG ATTGACCTGT TTAAAAAGAA AGGCCTGACT GAAGAGGATT TGGTTGTCCT  AATTGGTGCC CACTCCATTG GAGTAGCCCA CTGTTTCAGC TTCCGTTACA GAGTGGATAA TCCAGTGAAG GCTACTATGG TAGATCCAAG ACTCGCGGGA GTTATGAAAT TCACATGTAC  CACCCCAATG AGTACTCTGG CTTTTGATAC CACCACACAG TACAAGATGG ACTCCGTTTA TTACAAACAG CTGTCGGGGA AGAGAGCATT GCTTGAATCT GATGCACTTT TGAATGAAGA  TCCCAGAACA AAGGACTTCA TCCAGAAGTT TGGTGACGAT GAAAACGGAT GGTTCATTAA GTTTGGTAAG GCCATGAATA AGTTGACTTC AATACAAGTG CTCACGGGAG ACCAGGGGCA 
GATCAGGAAA CAATGCCGGT TTGTCAACTG A 

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTAGGGA AGGCGAGGAT TTTCGCTGGT CTTTTTCTTA TTTGCATTGT CCTCCCTTCG CTGGCCTCAG CGTTTGTAGA TCATCTACCT GAAGTTGGCC AAGTAAACGA TAACAATGAT  GTACCGATCC ATGTTAGTAC TGTTGCTCAC TTCAGCGAAA AGCAAGTTAA GGAGGCAATG ATAAGAAGGG CAAAGGCAGT GCATGATCTG TGGGCAAATT TTGGTAATAA TGATAAGGAT  GATGTAGCTA AAGAAGATGC TGCACCTGTA ACTCCAACGC CTGTTGATTC AACACCTACA ACTACACCTG TTGATCCAAC TCCAACGCCT GTTGATCCAA CACCTAATCC TGGGCCTGTT  AACCCTGTTC CAGCTGATCC AACACCTAAT CCTGTGCCTG CTAACAATGT ACCTGCAGGA TATCCAGGAG CAACTCAAGG GCCGCCTGTG GCGATGGGAT ATGGGGGTGC ACCTATAACA  CAAAATCCAT CAGACCAACA AACTGTGCCT GAACAGGCAG GTGCTGCTCA GAACCATCCA ACACCGGAAG AAATTAAAGA GCAGCGCAAA CATGCTGGAT TACAAGTGGG ATTTTACGAT  AGCACTTGCC CGAATGCTGA GAAGATCATT AAGGATGGAA TGAACAGAGC TTTTGGGAAT GATTCCAGCA TGGCTGCTCC AATTGGGCGT CTTCTGTTCC ATGATTGCTT TGTCAATGGA  TGTGATGCGT CTATACTCTT AGACAAGACA CCAAGTGGTG CAAGGGTAGA AAAACTCGCC CCCACCAATG GTGCAACAAT TAGGGGATTT GAACTCATTG ACGAGATCAA GGCTGAGCTT  GAGGCAGAAT GCCCTGGCAT AGTCTCATGC TCTGATCTTT TGGTATACTT GTCAAGGGAT GCATTTGTTG TATCAGGTGT CCCTTACTAC GACGTGCCTG GTGGACGTCG TGATGGAATG  GAATCCCTTG AAGCTAATGT TATTGGAAAC CTCCCACTTC CTGATAATAC AGTGGACAAG ATGATTGACC TGTTTAAAAA GAAAGGCCTG ACTGAAGAGG ATTTGGTTGT CCTAATTGGT  GCCCACTCCA TTGGAGTAGC CCACTGTTTC AGCTTCCGTT ACAGAGTGGA TAATCCAGTG AAGGCTACTA TGGTAGATCC AAGACTCGCG GGAGTTATGA AATTCACATG TACCACCCCA  ATGAGTACTC TGGCTTTTGA TACCACCACA CAGTACAAGA TGGACTCCGT TTATTACAAA CAGCTGTCGG GGAAGAGAGC ATTGCTTGAA TCTGATGCAC TTTTGAATGA AGATCCCAGA  ACAAAGGACT TCATCCAGAA GTTTGGTGAC GATGAAAACG GATGGTTCAT TAAGTTTGGT AAGGCCATGA ATAAGTTGAC TTCAATACAA GTGCTCACGG GAGACCAGGG GCAGATCAGG 
AAACAATGCC GGTTTGTCAA CTGA 

Retrieve as FASTA