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Entry information : LeCSD01(Solyc01g067740.2)
Entry ID 15948
Creation 2019-10-30 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2019-10-30 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-10-30 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LeCSD01(Solyc01g067740.2)
Name LeCSD01(Solyc01g067740.2)
Class Cu/Zn SOD    [Orthogroup: CSD001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type All tissues
Inducer Constitutively induced
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LeCSD01
start..stop		 S start..stop
ThasCSD01-1 272 6.28e-96 1..152 1..152
ThasCSD01 268 2.86e-94 1..152 1..152
HaCSD01 269 4.18e-94 1..152 45..197
AtrCSD02 268 6.92e-94 1..153 25..177
Literature and cross-references LeCSD01(Solyc01g067740.2)
Protein sequence: LeCSD01(Solyc01g067740.2)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   152 (303)
PWM (Da):   %s   15275.58 (32289.0)  
PI (pH):   %s   5.77 (6.65) Peptide Signal:   %s   cut: 24 range:24-326
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MVKAVAVLNS SEGVSGTILF TQDGDAPTTV NGNISGLKPG LHGFHVHALG DTTNGCMSTG PHYNPAGKEH GAPEDEVRHA GDLGNITVGE DGTASFTITD KQIPLTGPQS IIGRAVVVHA 
DPDDLGKGGH ELSKSTGNAG GRIACGIIGL QG* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and ESTs . Highly expressed.
Promoter►
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CTGCTCCGGT GAGGTGAAGA TTCAGCAACT AGCGGTGGTG TCTGTCTTAG AATAAAGTTA TATTGGAGCT GCTGAGCCTT GTTTTCTATG TATTTATCAT TTGACGCCTT TTGAATTGGG  GTTGAACCAT TCATAATACA TGACTGTAGT GCTGCTTTTC AGTGGATGTT GTACTAGTTT TTGCCGATCA TTAACCATAA AAAAACATGG GCTGTGTTAG CTTTGCTGGT TTCTTAAATT  TGAGTGGATG GTTTGAAAAC TAGACAAAAT TTAGATGAAT TTGCAGATTA CAGTGCCTGC AGTTTTTGTT CATAAAATTG TATTTCAACT GACTTCTCAG ATGGCAGAGT ATTTGCAAAA  TGATCCAAGG CTTACATAAA CATTGTGTGT GGAATGATGT TTTGTGAGGT TTACGTCTGA AGATATTGGT GCAGCTACAA TCTCTTCAAG CAACAAACAT TAGTTATAAT GCTAGCAACA  ATTCTAAAAC TATAACTAGA TTTGAAAACT CAAAGCATTA AACCAAATAA ATTTTTTCAA ATGGTTGCTT CTATTACACC TACTTCGTCT GTCTTATTCT ATAGAAAAAT ATAACCAACA  TGTATATATA CCTGCTCCAC ATGCACCAAT ATAGGAAAAA AAAATATTTT TTATATTTTT GTGGATTGTG CAATAATATG GAATAACAAA CAATAACATC CATCAATCTT GTTGTTTTAC  ATCCCTCATC ACTTCAATCT ACAACATATC AAAGAGTTTC TACATTTTTT CTAATTATAA CCTCTTTCAT TCTTTGGAAT ATTTGAAAAA AACAGAAACA GAAAAATCCA AAAATTAAAA  GTACAAATAG AAGTCCGCCG AAGGAAATCA AAGAATTCAA ATATGAATAG AAACCAGCCT TATGATTTTT ATGCATCTAC TTCTTTTGTA ATTAATGCAC TGATAGAGAC GTTAGTGAAA  CTGTGATCAG TTCCTTTTTG TATGTATAAT CCTTTAAAAG ACGAATAAAA TCCCTTCTTT TTAAGCCAAA GAAAATCATT TACTTCAAAA CGTCATTAAA GAAGCTCGAA GCTAAAGTTT  TAAAAATCGA CTTATAGCAA ACTTACTTCA TTTCAAGTGA ATAATATCTC AAAAGAACTA GAAAGTTCGA GTATGAAATT AGGATAAAAT TTGAGCTAGT TATGGATTAA ATTGTATGCT  TAGTTGTATA AAACTTATGT TTGAAGTTCT ATTTGTTGTT GGAGTTGTAT AAATTAGTAT GAATATCGTA TAGAAGTAGT ATATAATAAT ATTAAATTTG TAGAAACCTA ACCTACATTT  TATATAATAT TTATACACTT GACACATATA GCAATACCGT CTATATATTG ATTTTATATA CAAAATTATG AACAAAAATT TCAAGCATTG AGCATATACA CACATTTCAT ACCATTTTCA  TAGAGAAAAA ATTGAAGTGA GAATTTCACA TATATTTTGC AAAAGAATTC CTGATATGTT TTGTCTTATT ATTAGGTATA TATAGACACA TCATTCTCCC AAATTTGAAG GAAAAATTAC  ACATTTTGAT AAATAATTAT TAATTTTAGC GATATTTTTT TTATATTTAT TAATATTTGT AGCAATAAAT AACAATATTA TGATAAATCT GTAATATGTA TTAAAAGTGA ATCATGTATG  CAATATATAT GAATTATAAC TGTTTTAAAA TATATTATGC TTGTATAGTA AGAAATTGAC ACGTTGTATT ATAAGGGTAT TAAAATATGT GATACATGTG TTATTTATCA ATAGAACTTG  TATTATATGT GTTTTATAAA TTGTTCTCTG TAATATGTGT TAAAACTATA TTATAAATAT ATTAAAAATA TTTAAGTGAA AAGAAAATAT CATTGTCATA AAGAATAAAT ATTTTCTTCA 
AATTTGAATG GGTATGAAGT TGACCCATAA ATCCTCTAGT TGCCAATAAT AATGGTCATT CGTCATTTTT TGTCTTAAAT 

Retrieve as FASTA  
DNA ►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTGAAGG CCGTCGCCGT CCTTAACAGC AGTGAAGGTG TTAGTGGCAC CATCCTCTTC ACTCAAGATG GAGATGGTAA TTTACTTTAA TAATTGTAAA ATGGTTTCTT CATGCATCTA  TCATGGGTGA CCGGTCTCTA ACTGATGTGA TGCATACAGC TCCAACCACA GTTAATGGAA ATATTTCTGG CCTAAAACCT GGACTTCATG GCTTCCATGT CCATGCCCTT GGTGATACCA  CAAATGGCTG TATGTCAACA GGTAATTTTA TTTTATCTAT TTGAGACTCT GACAAATAAT GATTTTTAGA TGTTTTGAGT TTTGAATTTT TTCTTGGTTA ACTTGCAGGA CCACATTACA  ATCCTGCTGG TAAGGAGCAT GGTGCTCCTG AAGATGAGGT GCGTCATGCT GGTGATCTTG GTAACATCAC AGTTGGAGAA GATGGTAAGT GTTCCTTGTT TAATAATTTA ACTTAATCTG  GTTGTAGTTA TCCTTATTCA TTTCAAATCA AATGTCTGCA ATTGAAGATT TTTATCATCA TCTATGCCTA GTGTTTTTGG TTTGACATGA TGTATAGTTC ATTTGGAAAA ATTAATTCTC  TTGTAGTAAA GGTTTACCCA TGATTTTATT GTCCCGAAAA CAACAATTAT TTTGCATAGT GAAGCCAAAA TTTATTTCAG AGAGGTCAAT GCTGCTCTCT CCCTCTCTCT CCTTGCGTAA  TTCCAAATTA GTTAGCATCA CTAACGATGT AATCATTGCA AAAAATTTCA GGTACTGCAT CTTTTACTAT TACCGACAAG CAGGTAAATT CTTTGTTGAA CTCTAAGCTT TAGACTTGCT  CTAATATTTG TTCCTGAACT AATTGGCAAG CTGATTTGTT GCAGATTCCT CTCACTGGTC CACAGTCCAT CATTGGAAGA GCTGTTGTTG TTCATGCTGA TCCTGATGAT CTTGGAAAGG  GTTAGTTTCT CTACTTCAGT GACTAAACTT TAATGAGCTG AGTACGACAT GCTTTTATTA TTACAACAGA ATGTGAAAGA TGAAAGAGGA TAAGAAAGTA AGAAATAAAA TACATATAAC  CTTGACACTC AACCTTTTAT TTTAGTTTGA GACCATCAAC ACTCGTCCAT AGTGCTTGAC ATATAAAAAC CCCATTTCCA TTTAATGTGT TTTCTTCAAG AAGTATATCT GGGAGATTGG  TGTATTATAA TGGAAAGTAT TATGGATTGG AGAAGGAAGA AGTCTAGGTG TGATTGTGTC ATATCTTATA ATTTAATTTT GAAGAAAACG ATGAAAGCTC ATTTAAATAA GACTAGGTAA  AGTGAAAGAG AAAGGGGCTC TGAACCATGA CCACACTAGC AAGGATCCAC TAGGTTCATT TAAATAAGAC TAGGCAAAGT GAAAGAGAGA GGGTTTCAAT CTGAACCACG ACCACACTAG  CAAGGATCCA CTAGGTTCAT TTAAATAAGA GCAGGCAAAG TGAAAGAGAA AGGGGTTCAG TCCTACCCAT GACCTCCCTA GCAAGGAGCC ACTTCTATCA TTTTCACATC TCCCAAGCAC  CAATAAGATT TCATTTTTCT TCTTCAAAGA ATTTACCATT CTCCGTATAT TGAGCTGAAA ATTAATGCCT GGTAATTGCT GACTCAAAAA TCAAGCGGGA ACAGGTGTGT GCATTTCTGA  GTGATGTTAA ATCTCCTTGA AGAATCAGGA TGTTCATATA CATTCTCTCA AGGAATGAAT AGGTGCTATC TTTTTTTTCT TTTTTTTTTA TGGCCATGCA ATTCCTGCGG GCTGGTGGTG  CAATTGGTGG ATAATGGCCT GCCCCTCTAC CATTCTCCAC TTATATACTA GTATTTTATC CGTGTATAGT TCGAACCTAT GACGTGCACC TAATCTACAC ATCACATGTT GCGCTCTTTC  CACTAAACAT ACCTCTGGGG GCAAGAACGA GTTCCTGTTA TACAGGTTTT GTAGTTGAAT TCATATCTGG AATAGGACAT TGTATGGACT GTCTGTGAGA TGTGGGTTGT TGGAGGCTTG  GAGCTAACAC TGGTCAGTTT GTAAAATACT AGCTGACAAA TAGTCTGCAA GGTTTTTTTG GACAATTTGT TCTAGAAATT CTTTCACTCC ATGATGCTTG GTTACCTATT ACCATTTAAT  TATGCTTCTC CTCTCACTTA CCTTGTCTGT ATTTGTCAAA AGTCTCGTCT CTTAAATGCA GTCTAATAGA AAAAAACCTT TTTTTAATGT TTCTGTAAGG GGAGGGACAG AGAGAAATGG  ACTAACATTT GCAGATGTTG GATATAAATT GATTTTAGCC TGAAGCTGAG ACTTGTGATT GATTGATTGT AAGAAAGGTG GACTGAAATC TAATAAGAAA ATGCATTACA ATGATAAGCT  ATTGAGTTCT ATTTTTGCTT AGAGTTAAGT CATTGTGAGC CCTTTGCTTT ATCCATCTAA AATTACTTCA AGATCCTTCA GGATTAAGGC TGGATAAGAG CCTGTTTGGA TTGACTTATT  TCAAGTGTCT TTAAGCCAAA ATAACTTTTA AGCAATTTTG GAGTGTTAGG GTATATAGCT CTTAGTTTTA AACAGGCTCT AAGACCCATA GGTTTTACAT ATCCTTTAGT GTGTGTGATT  GGAATGGTTG AACTGCAAGG AATATGTTCC TCATTGTGCA AATTGTGAGA TCTCGAATGC AAATGTTCGA GGATGACCAA GTATCAACTT GTTTCAGAAA ATTGAAATTA GGGAAGTGGA  CTATAGTTGC AAATAATCAA GTGGGCGTAC AGTGATATAT GAGATTAGGA TTATGCACAA AAGAGTTATG CTCTATTTAG CTACGAGGTT TAGTATTCTA TTTGCATCCA AACAAATTTG  GTGTCTGGTG TAGGAGCATT GAAAATCCTT TCATCATGGA ATAAAAATAA GACGGTTAAA ATATAATTTA CTTTAACCAT ATTTGTAACC CACTTTCACT TAATCTGACT TGAAATTTAT  TTTCCTGCTG TTTTAGGAGG ACATGAGCTC AGTAAAAGCA CCGGAAATGC TGGCGGAAGG ATTGCTTGTG GTAAGTACTA ATTGTCTTGC ATCTGGGACT AGATCCATTG ATTTATGTGT  CTCATTTAGT CATTTAACTA TGTGTCGTAA TTACATTGAT CAATTGCTGA TAGGTTAGTT CAATCTCTTT GATTTCTTTT TCAAATGATT CTTCTGGGCT ACTTGTTTTG AGTAAAATAG  AAACATGCAA GATTCTTTTG CTTTCTAATC TAAGTTGTCC ATTTGTCAAT GTGCTTTCAA ACGACAAGTT GAATCATTTG CTTTTTGAGA ATTATATAGG CAAGCCTGGT TTTGTTCTTA 
ATTATGTTTG TAGTAGTAAT AACATGTGGT ATTGTCACTC TTGTCAGGTA TTATTGGCCT CCAGGGTTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTGAAGG CCGTCGCCGT CCTTAACAGC AGTGAAGGTG TTAGTGGCAC CATCCTCTTC ACTCAAGATG GAGATGCTCC AACCACAGTT AATGGAAATA TTTCTGGCCT AAAACCTGGA  CTTCATGGCT TCCATGTCCA TGCCCTTGGT GATACCACAA ATGGCTGTAT GTCAACAGGA CCACATTACA ATCCTGCTGG TAAGGAGCAT GGTGCTCCTG AAGATGAGGT GCGTCATGCT  GGTGATCTTG GTAACATCAC AGTTGGAGAA GATGGTACTG CATCTTTTAC TATTACCGAC AAGCAGATTC CTCTCACTGG TCCACAGTCC ATCATTGGAA GAGCTGTTGT TGTTCATGCT 
GATCCTGATG ATCTTGGAAA GGGAGGACAT GAGCTCAGTA AAAGCACCGG AAATGCTGGC GGAAGGATTG CTTGTGGTAT TATTGGCCTC CAGGGTTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CTCTTTACAA TTATCGAACT CATCATTATC AGCACTCATA TTGGACTTCT CTCTCTCTCT CTCTAAGGGT GACCTGAGAT CACATACAAA AATGGTGAAG GCCGTCGCCG TCCTTAACAG  CAGTGAAGGT GTTAGTGGCA CCATCCTCTT CACTCAAGAT GGAGATGCTC CAACCACAGT TAATGGAAAT ATTTCTGGCC TAAAACCTGG ACTTCATGGC TTCCATGTCC ATGCCCTTGG  TGATACCACA AATGGCTGTA TGTCAACAGG ACCACATTAC AATCCTGCTG GTAAGGAGCA TGGTGCTCCT GAAGATGAGG TGCGTCATGC TGGTGATCTT GGTAACATCA CAGTTGGAGA  AGATGGTACT GCATCTTTTA CTATTACCGA CAAGCAGATT CCTCTCACTG GTCCACAGTC CATCATTGGA AGAGCTGTTG TTGTTCATGC TGATCCTGAT GATCTTGGAA AGGGAGGACA  TGAGCTCAGT AAAAGCACCG GAAATGCTGG CGGAAGGATT GCTTGTGGTA TTATTGGCCT CCAGGGTTAA CTGCTCCGGT GAGGTGAAGA TTCAGCAACT AGCGGTGGTG TCTGTCTTAG  AATAAAGTTA TATTGGAGCT GCTGAGCCTT GTTTTCTATG TATTTATCAT TTGACGCCTT TTGAATTGGG GTTGAACCAT TCATAATACA TGACTGTAGT GCTGCTTTTC AGTGGATGTT  GTACTAGTTT TTGCCGATCA TTAACCATAA AAAAACATGG GCTGTGTTAG CTTTGCTGGT TTCTTAAATT TGAGTGGATG GTTTGAAAAC TAGACAAAAT TTAGATGAAT TTGCAGATTA 
CAGTGCCTGC AGTTTTTGTT CATAAAATTG TATTTCAACT GACTTCTCAG ATGGCAGAGT ATTTGCAAAA TGATCCAAGG CTTACATAA 

Retrieve as FASTA