Entry information : LeFSD01(Solyc02g021140.2)
Entry ID 15949
Creation 2019-10-30 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2019-10-30 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-10-30 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LeFSD01(Solyc02g021140.2)
Name LeFSD01(Solyc02g021140.2)
Class FeSOD    [Orthogroup: FSD001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Flower buds
Fruits
Leaves
Roots
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LeFSD01
start..stop
S start..stop
ThasFSD03 381 1e-135 19..252 23..264
HaFSD04 377 2e-133 6..252 36..292
AtFSD03 371 9e-132 35..252 46..263
LeFSD03 240 4e-80 12..240 23..249
Literature and cross-references LeFSD01(Solyc02g021140.2)
Protein sequence: LeFSD01(Solyc02g021140.2)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   252
PWM (Da):   %s   29107.48  
PI (pH):   %s   7.18
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MSWCCCNRLS TSTSSDLWRQ FNIPNVGLRQ KKRSVSAYYG LKTPPYKLDA LEPYMSQRMV EIHWGEHHRG YVESLNKQIE NNDIFYGCTM EQLIKLTYNN GNPLPEFSDA AQVWNHDFFW  ESMQPGGGDM PKLGFLHQID KDFGSFTNFK DKFIEAALTL FGSGWIWLVL SREEKRLAII KTSNAVNPLV WNDIPLIGLD LWEHAYYLDY KNDKAKYVNV FMNHLVSWDA ALGRMARAQA 
FVNLGEPKIP VA* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and ESTs.
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TCATCAAATC CCTGTGCAAG AAGAGCAGCT AGTTTAGTTT AGTAGAAAGA AAAGCTTGTG TTCCACTGCA GAATATAATA GGTAGGTAGG CTTGTATGTT AGTACTAAAC CTTATCATCT  TGTGCGTTCA TTCCATGCAC ATGTACTTAC AATGATCAAT GGTACATTTC TTTTGTGGAT CACAACAAAT ACATTAATTT CATTGATATA TAAAGGCTTA AGTCATCTGG GGCCCCTTAA  AGTTGTTCAC ATAATTTACT TAGACACCTG AACTAGGACT TATACCTATT GAACACCTAA ATTATCAAGA AATGTGCCTA TTAAACACAA AACGTTGATG TGGCAAAATA AGTGTATCTC  ACTGCTGCTG AGCGTGTGAA AACACTCTTT TAATTTTTTT AAAAATATTT ATACCTACTT TGTTTACACT TGGCATGCAT TGACTAAATA TAAAAAAAAT TTAATTAAAC ATAAATCTTT  TAAATCATTA AAAAAAAACA CCTCCACACT CATCTTCCTT CAATCCACCA TTTTAAAAAC TTCAAATTTC TCTTCCTTTT ATTATGATTC ATTTTTTTTC ATTTTCTGTA AACAAAGTAC  CTGTTAAATT TTCAAGAAGA AGAAAAAATG GATCATTTGG AGTTAAAAAA TTGACCAATA TCTGTAAATT TTTATTTTCA AAAACTCCAA TTGAGCAACT ATTACCATTC ATAAACTTAT  TAGAAATGCT ATCAAATATT TGATATAATT TAATTTCTCT TTGTTGTCGA TTTCAAAATA ATTTATCAAG GTCGATTATA TTTACAAAAT CGGAATAGTC GTCGGAGGAA TAGCATATAA  CGAAGAAAAT GAAAGAGGAA AACATTTGGT GGATGAATCT TTTTTTGTTA TGCAGAGGAA TGGTGATTGT GGAACAACAT AGAAGAAGAT GAAGAAAAAA AGGCAATAAG TTAGATGGGG  TGGGTGGGGT GGGGGAAAAG ATTTTTTTTT TATCAATTTA ATTTTTTATA TATTATTAAA GGTAGGAAAA TATTTTTTAT TTTTCAAAAT TAAAATTATG GGCCCATATG CCACGTGTCG  TAGTTCTATT CGTAATTTTG TCAACATAAT GAGTGTGCAT TACACGCACA ATATTTATAA AAGTAGTTGC TATTTTATGT TCAATAGATA AATATTTATT AATATTAAGT GTCTAATATG  TAAGAGTCTC AGTTGATGTG TCTAAATGAA TTATGCGGAC AACTTTAAGG GGCTATCGAT GACTTAAGCC ATATATAAAT GATCTACAAT CGAACTCCAT ATAAATGAGG CTTGAAAAAA  CTAATATAAA TGGAAAAAAT GTACAGGAGA AAAAAATAAA TAAAACGGAA AAGGACCTAA AATACCCTTG AAGTATTGAA AATGGTGTAC AATTATCCTT CATCCATCTA TTGGCTCTAA  AATGTCATTT TCACCCACCT ATTGGCTTCA AAATACTCTT GACATCCACC TATGTGTTCA AAATTGACCA CTTATTTAAC GGTTTCATAT TTAAACCATT TAACTCTTTT TTTAAATAGT  TGGCGTTCGA CTATTAGATA TAATTTAATT TATTAATATC ATTTATAAAT CAATCCACTA CCGATCAATT ACTAATTAAA CCCTATCCAA TTAATAAACA AATTGTAATA TCAAAATCGC  CCTAAACACT ACTAGAACAC GACGAAATTA CAGATTCCTA AAACTGACAT CCAAAATTAT TTAGTCCGAA TTAAAGCCCC AATTGAATTT AGGTTAAGCC GATTATTTAG GACACTTTCA  ATAGAATTCT CTTTCAAGCT TGAATTCGAA TTTTATGATT AAATGTAAAG AAATAGTACA TCCCGAATTA ATTTATGCAC TTTTTAAATA TAATTTTATA TAAATTTATT ATTTGTTTTA 
AATACTTTAA TATATTCTTT TTAAAAAAAG TAAGTTATCC ATTAAATAAC ATCACATAGT 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGTTGGT GCTGTTGTAA TCGTCTTTCC ACTTCAACTT CAAGTGATTT GTGGAGGCAA TTCAATATAC CAAATGTTGT AGGTGTTTTG ACTCTACGGC GTGGCTCTTA CTCTTGTGTT  TATGTATGTA TTAATTGTGG TTTGTGTTGT TTACATTGCA GGGTTTGAGG CAGAAGAAGA GAAGCGTTTC TGCTTATTAT GGCCTTAAAA CCCCACCTTA TAAGCTTGTA AGTCGTAACT  GTTTTTTTTT GTTTTGGGTC AAACTCAAAG TGACCCCTGT TGTTGTTGGT GTTGTTGTAG GACGCACTAG AACCATATAT GAGCCAAAGG ATGGTTGAGA TACATTGGGG AGAGCATCAT  CGTGGTTATG TTGAATCTCT TAATAAACAA ATTGAAAACA ATGACATATT TTATGGATGC ACCATGGAAC AACTTATCAA ACTAACATAC AACAATGGAA ATCCATTACC TGAATTCTCT  GATGCTGCCC AGGTAATTTT TTGTGTATTT AAAGTTCAAA GCTTTTCCAT TTCTACTAAA TTCAACTTTA TCCCAAGTAA GTGGAGGGGA TTGATTACCC ATAGGAATAA TTTGTATTTA  CTACATGTGT AAACTTCATT AGATTTTGAT AAAGAACCAT TCAAATTCAT ATCTACAACT ATTAGTATGT TTTGTATTTT TCCAATAAAA GCACAAGTTA CAATACTTAT GGATCTTCTT  ATCCCAGGTA TGGAATCATG ATTTCTTCTG GGAATCCATG CAACCGGGAG GTGGTGACAT GCCTAAATTG GGATTCCTCC ACCAGATTGA CAAGGATTTT GGTTCATTTA CCAACTTTAA  GGACAAGTTT ATTGAAGCAG CTCTCACATT ATTTGGCTCT GGGTGGATTT GGCTTGTCTG TAAGTTGCTA AATGTTTTAT GCTTCTTGTG TATGAAATAA AAGCTCTACT AGTCTAGCAT  TGTTGTTTCA CTTCTCCTTG CATATGTTTT TTCTCCAAAC CAACTCATTG ACGGACAGCT TGTGCTCAGT TGTATAACTA AAACATTTTA TAAGAATAAC ATGTGCTTTT TGTTTCTCAA  ACTCGTTCAT TAAATTTCCT GTTCCTGTCA TTAATTTTAA TTTAGTATGT TTGACAGTTA AAAAATGTGA AATATCAACC TTAGATTTTG GCCTCAGTCT CTTGTACAGA GTGTGTAAAC  ACCAAGTTCA GAATGAAGTT CTGGACTTCA TCTTGTGTGT CAACTCAATT CTCGTACAAT TTGGTAGATG CAAAAAGGTT TGGCAAAATT ATTATTTCTA GTGATCAAAA CATCTATACA  TGCTCATTTT TCGCAACCTT TAAATATTGA ATATTCCTCT AGATCCCTAA AGTTTTCATC GCATGAACCT CCAGATTCAT CTTTTGGAAA GTTTTATAGC AGTCCATACA TACATCCATC  TCCTTGAAGG TAACACCTTC AATTTGATTA TTTCAGTGAG CAGAGAGGAG AAGCGTCTTG CAATTATTAA AACATCAAAT GCTGTCAATC CTCTTGTGTG GAATGATATC GTGAGGATTC  TTTAACACTT TGTTAGAAAT TTCATTTTCT TGGTTACCCA ATACTTGCAT TTTCATTTTG TATCTTTTTG ATTTTGCAGC CCCTGATCGG TTTGGATTTG TGGGAGGTAA GTTTGTAGGC  GCCCATGTAC CCTTCTCTCA TTCTCTGAAA GAAATCACAA TTTTATATTG AGAAAAGATT TTCATTAATA CTTGGTCTTT CTATTTTGCA GCATGCTTAT TATCTGGATT ACAAGGTAAC  CAACCAACCC ACAGTTCTTC CCTTGTGCTT TATTTCTGCA CAAGATTTTT CTAATGCGTG TCCTCTCTTT TGACAGAATG ATAAAGCAAA GTATGTTAAT GTGTTTATGA ATCATCTTGT 
TTCTTGGGAT GCGGCATTGG GACGCATGGC TCGAGCACAG GCCTTTGTAA ATTTAGGGGA ACCGAAAATT CCTGTTGCAT GA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGTTGGT GCTGTTGTAA TCGTCTTTCC ACTTCAACTT CAAGTGATTT GTGGAGGCAA TTCAATATAC CAAATGTTGG TTTGAGGCAG AAGAAGAGAA GCGTTTCTGC TTATTATGGC  CTTAAAACCC CACCTTATAA GCTTGACGCA CTAGAACCAT ATATGAGCCA AAGGATGGTT GAGATACATT GGGGAGAGCA TCATCGTGGT TATGTTGAAT CTCTTAATAA ACAAATTGAA  AACAATGACA TATTTTATGG ATGCACCATG GAACAACTTA TCAAACTAAC ATACAACAAT GGAAATCCAT TACCTGAATT CTCTGATGCT GCCCAGGTAT GGAATCATGA TTTCTTCTGG  GAATCCATGC AACCGGGAGG TGGTGACATG CCTAAATTGG GATTCCTCCA CCAGATTGAC AAGGATTTTG GTTCATTTAC CAACTTTAAG GACAAGTTTA TTGAAGCAGC TCTCACATTA  TTTGGCTCTG GGTGGATTTG GCTTGTCTTG AGCAGAGAGG AGAAGCGTCT TGCAATTATT AAAACATCAA ATGCTGTCAA TCCTCTTGTG TGGAATGATA TCCCCCTGAT CGGTTTGGAT  TTGTGGGAGC ATGCTTATTA TCTGGATTAC AAGAATGATA AAGCAAAGTA TGTTAATGTG TTTATGAATC ATCTTGTTTC TTGGGATGCG GCATTGGGAC GCATGGCTCG AGCACAGGCC 
TTTGTAAATT TAGGGGAACC GAAAATTCCT GTTGCATGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GTGAGTAAAG AGAAACTTAA TATTTGGGGG CGTAACCTAA CCTAACCTAA AAAGGGGTTG GATAAGGGGA AATTGTAAAG CAATGAGTTG GTGCTGTTGT AATCGTCTTT CCACTTCAAC  TTCAAGTGAT TTGTGGAGGC AATTCAATAT ACCAAATGTT GGTTTGAGGC AGAAGAAGAG AAGCGTTTCT GCTTATTATG GCCTTAAAAC CCCACCTTAT AAGCTTGACG CACTAGAACC  ATATATGAGC CAAAGGATGG TTGAGATACA TTGGGGAGAG CATCATCGTG GTTATGTTGA ATCTCTTAAT AAACAAATTG AAAACAATGA CATATTTTAT GGATGCACCA TGGAACAACT  TATCAAACTA ACATACAACA ATGGAAATCC ATTACCTGAA TTCTCTGATG CTGCCCAGGT ATGGAATCAT GATTTCTTCT GGGAATCCAT GCAACCGGGA GGTGGTGACA TGCCTAAATT  GGGATTCCTC CACCAGATTG ACAAGGATTT TGGTTCATTT ACCAACTTTA AGGACAAGTT TATTGAAGCA GCTCTCACAT TATTTGGCTC TGGGTGGATT TGGCTTGTCT TGAGCAGAGA  GGAGAAGCGT CTTGCAATTA TTAAAACATC AAATGCTGTC AATCCTCTTG TGTGGAATGA TATCCCCCTG ATCGGTTTGG ATTTGTGGGA GCATGCTTAT TATCTGGATT ACAAGAATGA  TAAAGCAAAG TATGTTAATG TGTTTATGAA TCATCTTGTT TCTTGGGATG CGGCATTGGG ACGCATGGCT CGAGCACAGG CCTTTGTAAA TTTAGGGGAA CCGAAAATTC CTGTTGCATG  ATCATCAAAT CCCTGTGCAA GAAGAGCAGC TAGTTTAGTT TAGTAGAAAG AAAAGCTTGT GTTCCACTGC AGAATATAAT AGGTAGGTAG GCTTGTATGT TAGTACTAAA CCTTATCATC 
TTGTGCGTTC ATTCCATGCA CATGTACTTA CAATGATCAA TGGTACATTT CTTTTGTGGA TCACAACAAA TACATTAATT TCATTGATAT ATAAAGGCTT AAGTCATCT 

Retrieve as FASTA