Entry information : LeCSD02(Solyc03g062890.2)
Entry ID 15950
Creation 2019-10-30 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2019-10-30 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-10-30 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LeCSD02(Solyc03g062890.2)
Name LeCSD02(Solyc03g062890.2)
Class Cu/Zn SOD    [Orthogroup: CSD002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Fruits
Leaves
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LeCSD02
start..stop
S start..stop
HaCSD03 252 9e-88 1..156 1..157
AtrCSD01 243 2e-84 4..156 6..158
ThasCSD03 242 1e-83 2..156 7..161
AtCSD03 231 3e-79 2..155 6..159
Literature and cross-references LeCSD02(Solyc03g062890.2)
Protein sequence: LeCSD02(Solyc03g062890.2)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   156
PWM (Da):   %s   15861.06  
PI (pH):   %s   7.08
Sequence 0
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGNLKAVAVI SGNDSVQGSL QFIQQSNGVT HVRGRIIGLA PGLHAFHIHA LGDTTNGCNS TGPHFNPLKK DHGAPMDEVR HAGDLGNIVA GPNGVAEISI SDMQIPLSGV HSILGRAVVV 
HADPDDLGRG GHELSKTTGN AGARVGCGVI GLQSSV* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and ESTs.
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TGTTTGTGTT ACTCAGTTAA TCATGTTAAA CTAGCAATAC TCTCAACTTT CCATATATCT CAAAGAGCTG ATTAATAAAA TAGTAGTGAT TTAACACTCA GCTCAAGTGT TTGAACCTTA  GTTACATTTT GCTAGTGAAA ATAATGAGCG TCTCTTTCTC GATTGTGTAG ACAATTTCGA TTACGTTGGG TGTGATGGGA AATCTTTTCT TTTTTGGGAA ATATTCTTTT TATCTATTCT  CAAGTGTAAG GTAAATAAGG TGAAAATGCT AGACTAAGAG CAGGGGCGGA GCTACAACAT CTTTCATCGG AAAATTATAC TAGGTATATA GGTAAAATAT CGTCTGATAT TTGGATTTTT  AATAAATTGA ACTCTTATCT ACAATGCAGG TTGTTGGTCC TCTATGTCTT TGAGGTCCCT GATTTGATCA CCAATAGCAG TGTATATTTT TTAAAACAGA AATAGCTGCC CCCATATCTT  CTTTATATGT TTCTTGCATT AAATTTTGAC CTAATATTTA ACTTTAAATT AACCTAATAA TTAAGATTTT AGTATTTTCT TTATATTTTT GATCTGTACT AAGTCAATTA TTAGGTATAA  CACACTGTCA AGAAATTATT TTTAAAAATT ATTATCCACT ATTATATTTT TTATTATTTA TAAACTATTC TTTAGAAAAT GTAAAATAGT TAAGAATGGT ATTGAATGAA GGATAACTTT  CACATATAGC AAATATAAAA TTCATATTTG TATGCTATAA CAAACTTTGC ATAATTGTGC TCCATAACAA ACTTATATAT GTATAATTCG CTATAAATAT ACAATTAAAG CAAATTGTAT  AAAATGAGAA AGAAAGAAAT TATATACAAT TTGAATGGTA TAAAACGAGA AATCGAGAAA GGCAGAATTG AATTGTATAA AATGAGAAAT AGAGAAAGGC AAAAAGAGAC TTGTGCAGGG  AATATATAAT TGAATCGAAT TGTATAAAAC GAGAAATAGA GAAATTATAT AAAATTTGAA ATTGTATAAA ACGAGAAAGG CAAAAGAGAC TTTGGGCAGG GAAATATTTG TATTGTATAA  TTATAAGTGT ATATGGCAAA AATATATGTA TTTGCATGCG TTTATACAAT TTCTCTCGCT TTATACGATT AGAAACACAA TTTATACAAT TCTATTGTAT AAAGCGAGAG AGGCGAGAGA  GAGAGGGAGA GTGGTGAAGT AAGACTATGA GGGAGAGAGG GACTATCAAA CAGTTTGCTA TGGAACACAA ATAAATCAAA GGGTAGCTAC TATATTTATT TTGTATTATT AGTTTGTCAT  TCTATACGAT TATCCCATAA AAGAAAAGGT AAATATGGAA AAAAAAGTTT CCTTGAACTT TCAAACACTA AGTTATTTTG GATCATGAAA AAAGTCTCAA TAATTCACTT AATATGAATT  AGAAGAAGTA TTTTCCACTA GTAGCTAAAA TTGTTTTTGT TGATCTTTCT CCATTAGTTT ATTTATGCTA TTGATAATTT TATAATTTTA AGTTTGTGTA TAAAAAAAAT TTCGTATGAT  TTAGTAATTT AGTGATATGT ACTTTAAATA TGAAAAAATT ACATAAATTA GTACATTTTA ATAAATAATT ACTGATTTTA GCAATACTTT TTATTTATTA CCATTTATAA CAATACTATG  TTAAATCTGC AATATGCATT AAAAGTAAAT TATGTATGCA ATATATATGA ATTATAATTA TTTTTTGAAA TATATTTATG TTTGTTTGGT AAAAATTTGA CACATTGTAT TATAAGTGTA  TTAAAATGTG TGATAAGTAT TATTCACCAT TAAAACTTGT ATTATATATG AATAATAAAT TGTTCTTTGT AATATGTGTT AAACTTGTAT TATAAATGAA TTAAAAGTGA TAAGTGAAAA 
AGATATATTA TTACTATAAA TGGTAAATAT TTTTTTATTT TAGTATATTT ATGTAAGTTT TCCTTTAAAT ATTCAATTTG 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGGAATT TGAAAGCAGT AGCTGTAATC TCCGGGAACG ATAGTGTGCA AGGATCCTTA CAATTCATCC AGCAATCCAA TGGTACTTCT CTAACTATTT ATTGTGTTTT CTACTCCTCG  ATCGTCTTGT TATTAATTTG GGTAATACAA CTCATACAGG TGTTACCCAT GTGAGAGGAA GAATAATTGG TCTAGCTCCA GGTCTTCACG CTTTCCATAT CCATGCCTTG GGTGATACCA  CTAACGGCTG CAATTCCACT GGTTTCTTCC CTTTTCTTCT AATTCTTTTT TTTTTTGGGG ATTACAGGTG GAGCTAAGTG GGTTTACTGG TTTGTTTGAA TCTAATAATT TTTTCCTAGA  TATTTTATTT GTTAAAAAAT TAAATAAATA TATATGTATA TTAACTTGTC AACTTATTAT TGATATGAAT CTAATAACTT TTCGATAGAT ATTTTATTTG TTAAAAAATT AAATAAATAT  ATATGTATAT TAACTTGTCA ACTTAAGAAA ACTTATTATT GATAACTCAG TGATAAAGGA GGAGCAACGC TTTCTATACT TGAGTTGTGG GTTTGAACCC CCACATGCAT GTGTCGAAGA  GTTTTTGATC AATTTAAAAT ATATTTCACT ATTAGAATAG GTGAGTTGTC TTCATGAGAG CAAAAGGACT GGGAAGGACG CAGGACGCAC CTTGGTGTGC TAGTTATCAT GCCCACGGTA  AACGCTAGGT AGCCAAGTGC AGAGCGGATA ACTGCTATAT ATGGAACCAA GATATTTCCC TTTCAGAAAA AATTCTAACA CTAGTAGAAA TGCCTATCCT TTATTGAAGG TGGGAAAAAA  AAGATAAAAC TAAATAAACG GATTATTAAT CTAAATTTCA GTTTGAAGCT CATGTAATGA ACCTATTTTT TTTTTTGGTT AACCTAAAAC TGAGATAACT CCATGAGAAA TCTAATTGGA  TTTTATTAGA TATGGTATAA ATCAAAATGG GACACCAAAA GAATTGAATC GTTTTATGTT AATTACATTG CAACTTATCC CCTTCTATGT TCTAGTAATT CTGTCATTCA ACTATCAATT  TGATTACTAG CTACTTTAAT TTAGTTAGTT TCAGGCGATA CAACTTGGGA TGAAGGTTTG GTTACTGACA CATTCTTGTT TGTTACAAAC AGCTAATTAA TTACCTTGTA CATGATAAGC  TAAAAGGAGA TTTAATTAGA TTAATTACTA ATCTAGGTAG ATAAGGACCC TTCTATGGTA ATCAAATGCA AGTCCTTGAT TATACTTGCC CCTAACAGTG TAACTGATTG ATTTTTAGGA  CCTCATTTTA ATCCACTTAA GAAAGATCAT GGAGCTCCCA TGGATGAAGT ACGTCATGCG GGTGATTTAG GCAACATTGT TGCTGGTCCT AATGGTTAGT TTTATTACTT TTATACTTCA  TATTTTTCAA ACTTCAGTAG TTGGATTGAT TGTTCCCTTG AATTTATGAT CGTTTCTTCA ATCAAGGGGT GGCAGAGATA TCAATTTCAG ATATGCAGGT ACGGTACAGT ACAGTACAGT  CTACTTCTTC GCTATGCTAT TTGATTGGTG TATGACATCA TTGAATTTTG CTCGTACATA TAGATTCCTC TTAGTGGAGT ACACTCCATC TTGGGGAGAG CAGTAGTTGT GCATGCTGAT  CCTGATGATC TGGGAAGAGG TATGCATGTT TTTGGTCACT CTTAACTTAT TTTGAGCAAT CTTCAATATC ACTTCCCTTT CAACTTGCCC TTTTTTTGTG CTCTGCTTAT GATCAGTATG  TGCTTCTGAG TTGACTTGTG ACCATTAATC CTGACCATGC CTTTAAGATT GTTGACAGAA ATTGTGCATT TCATATCTCT TGAGTGAGCC AAACATTTGA AGAGAAAAAC ATAATGCATG  AGGGTGTCTT GTTTGGCTGA GATAGTCATT CTTTCATACT GTTTTTAAGG ATGTCATTCT TTTTCTTTCT TCTTTACTAG CTTCGAGTTA ATGGGCAATG TATTTGCTTG ATTCTTTTAC  GACTCTCAGT TGTGATGGCA TGCTAACTTA TAACTAATGT TTGTATTAAG CTACACTAAT GGAAACTGTA CAAATTTAAA ATTAGCTTTC AGTATTACTG AGAGATCCAG TTTATAATCA  CCAAAATAAA GGATTTTTTT TTCTTTTTGT AATTATCTCA GATATAGTCA TTTGATGATT CGATCTTAGC TTTCATCTTA TATACCTCTC AAGTGTTTCT TGCTTTTTAC TAAGTAGACA  ACATTGGTCA TAGGATTTTT GAGGCTCAAA TTTGTCATCA ACGCCTATTT ATGAAATGTG AATAAAATTT CAACTTCAAT GTCAAATTAT GATATAAAAT ATCAAACTCT CCAAAAAGTA  GGATTTCAAA TTGTAACTTG ATTTTTTTAT TTAAACTGTA AAACTTAACC AATAAGTTTA TACGTTGCAA AGAAAGATTC ATCATTTATT GCAAATATAA TTATTCAACC TAGCTCGATG  TGAAGAATCT GTACCATGTG AGTGGATTAT AATAAAGGAT AGTTAGTTTC TACTATTGTT GATTTATTGG ACTAGTAAAA ATTATGTGTG TTTGAAAGAT TGTAATTATA TGTATTGCAA  ACATTATTTG TATAAAAAAC TAACAAAGAT ATGCAGGACA TTCTGATACG TTATTTATGA ACTATACTTG TGTTATTTTG TAAGATCAAG AGAAATTTTG ATAGTTTTCA CAAATTATGG  ATACTGAGAT GTATAACTCA TCACTAGAAG TATATATTAG AAAAAAATAA ATCGGGTAAT TGATGAAAAG AGTCAACTTG GGTTGTATCT AATAGTTTCA ATTGGTATGC TCAGCAATCA  GTTCACCCAC TACTGAATCT TGGTCTTTCT CTACCTTGAT TGCAAAGCAT GGTTTGAAAA TGTCAGTTGA AAGACAGTAT ATAGCTAAAA GGATTATCTC AAAATTAAGT GAATCAACAA  AACTTATACT CTTGTTATAT GGTTTTTATA TTTAAGATAC TGGTGTACCC TTAACTTTTA AATCTTAGGT CCGCCTCGGA TTGTAAATGA GATATCTTTA TCTGGTGAAA TCATTCTCGA  GACCTACTCT ACTGTTCATT TACTCTATGT TATTATATGC TATAGCATAA GAAAGTCCAA ATATTTTGAG GAATGTCATT CTTTATGAGT CCTGAGCTGA TCAACTATTG AACAGGTGGA  CATGAACTTA GTAAGACAAC TGGAAACGCA GGTGCAAGAG TTGGCTGTGG TAATTGCATT TCCTTTTCCC CAGAGATTTT TGGAGATATA TGGATATTCC CCAGAATATA TCATGATTTT  AGAAGTATTG GAGATTAACA AATATAAACT CTATACCAAT AGATAGACAT CAATTCTAAC TGAGACTGAA ATTGTTTCCT TTATCTCTAT TTATATGTGT TTCTTGAAAA TGTTAAAAAT  GGGTTATTGG ATGATCTGGA AAACAGAATT TGCAAAACAA ACAAATAGAA ATAGGAAACG ATTTCATTAA CAATTATGAA TTTGTTTTAC TTTCTCTAAG AATGGTATGA TAAAAGAAAT  CAAATTCAAT TGTATCTTTG TATGTTTTGT TACTTATCAT AACTTTAAGT CATCCCAAGT TTAAGTTGAG GCGGGTATTT TAGTTCTGAA AGGAAAGAGT AGAATAAATA TTTAGTTGAA  AAGTTAATGC ACATAATTAG ACTTCATATA AAATGTAATA ATAGCATTAT ATAAAAATTG TCACTGAAAG TCAAATTAAT CTAATGATCT CCAATACAAG TTTCTGCTCA AGTCTTTACA  ATTAAGAGCA CTTGTCCTGA ACTTTAAATG GAGGGAAAAC TTCCTTATGT AGAATAATTC AAGACAAATT TAGACCCATT TTCCTTGTTT TGGACAAATC TTTAGTAAGA AGGATTCTTT  TGACCTATTT TGATAGTCGG AGTCTATTTT TGAGCCAAAA ACATAACCGA GGGTAAAGCT GACTTATTTG AATAGTTCCG AGGTATATTT AGCCCCTGTT CCCTATATAT ATGTGTGTGT  ATGTGTTGTT TTGCTTGGGT TGTTAAGTTT TCTTATCAGA GACTAAATGC ACCAATAGCA CAAGTAAGGT CCAAGGGACA ATGTTTTACT TAGAACAAGC CTACTGCTAA AGTGACTATT  TTGAACCTAA ATTGTATGAA ATCTGAACCT AAATTGCAAT TGCTTTTCAG GTTCAAATTT TATTGTGATT TCTATGTTCA TGTAACTACA ATTGAGACTG TAATTCCTTC TGTGTCTTCC 
TCGTTCTTCT TATCTGTGGC ACTAATATGT TTTTACTAAA CTTGTTTTCG CAGGCGTTAT TGGGCTTCAA TCATCTGTCT AA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGGAATT TGAAAGCAGT AGCTGTAATC TCCGGGAACG ATAGTGTGCA AGGATCCTTA CAATTCATCC AGCAATCCAA TGGTGTTACC CATGTGAGAG GAAGAATAAT TGGTCTAGCT  CCAGGTCTTC ACGCTTTCCA TATCCATGCC TTGGGTGATA CCACTAACGG CTGCAATTCC ACTGGACCTC ATTTTAATCC ACTTAAGAAA GATCATGGAG CTCCCATGGA TGAAGTACGT  CATGCGGGTG ATTTAGGCAA CATTGTTGCT GGTCCTAATG GGGTGGCAGA GATATCAATT TCAGATATGC AGATTCCTCT TAGTGGAGTA CACTCCATCT TGGGGAGAGC AGTAGTTGTG 
CATGCTGATC CTGATGATCT GGGAAGAGGT GGACATGAAC TTAGTAAGAC AACTGGAAAC GCAGGTGCAA GAGTTGGCTG TGGCGTTATT GGGCTTCAAT CATCTGTCTA A 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CAGAATTGTG AGAGAACACA GGTAGGAGGA GGATAGAGAC AAAATGGGTG ACCCTTAAAA ATGGAGAAAG ATGTAGGGGA AAATATTAAT GGGGAATTTG AAAGCAGTAG CTGTAATCTC  CGGGAACGAT AGTGTGCAAG GATCCTTACA ATTCATCCAG CAATCCAATG GTGTTACCCA TGTGAGAGGA AGAATAATTG GTCTAGCTCC AGGTCTTCAC GCTTTCCATA TCCATGCCTT  GGGTGATACC ACTAACGGCT GCAATTCCAC TGGACCTCAT TTTAATCCAC TTAAGAAAGA TCATGGAGCT CCCATGGATG AAGTACGTCA TGCGGGTGAT TTAGGCAACA TTGTTGCTGG  TCCTAATGGG GTGGCAGAGA TATCAATTTC AGATATGCAG ATTCCTCTTA GTGGAGTACA CTCCATCTTG GGGAGAGCAG TAGTTGTGCA TGCTGATCCT GATGATCTGG GAAGAGGTGG  ACATGAACTT AGTAAGACAA CTGGAAACGC AGGTGCAAGA GTTGGCTGTG GCGTTATTGG GCTTCAATCA TCTGTCTAAT GTTTGTGTTA CTCAGTTAAT CATGTTAAAC TAGCAATACT  CTCAACTTTC CATATATCTC AAAGAGCTGA TTAATAAAAT AGTAGTGATT TAACACTCAG CTCAAGTGTT TGAACCTTAG TTACATTTTG CTAGTGAAAA TAATGAGCGT CTCTTTCTCG 
ATTGTGTAGA CAATTTCGAT TACGTTGGGT GTGATGGGAA ATCTTTTCTT TTTTGGG 

Retrieve as FASTA