Entry information : LeCSD03(Solyc11g066390.1)
Entry ID 15956
Creation 2019-10-30 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2019-10-30 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-10-30 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LeCSD03(Solyc11g066390.1)
Name LeCSD03(Solyc11g066390.1)
Class Cu/Zn SOD    [Orthogroup: CSD001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Fruits
Leaves
Shoot meristems
Inducer Constitutively induced
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LeCSD03
start..stop
S start..stop
HaCSD04 303 4e-106 4..217 12..225
AtCSD02 300 4e-105 1..217 1..216
ThasCSD02 283 6e-98 1..217 1..221
PpaCSD04 278 3e-96 8..217 5..204
Literature and cross-references LeCSD03(Solyc11g066390.1)
Protein sequence: LeCSD03(Solyc11g066390.1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   217
PWM (Da):   %s   22268.27  
PI (pH):   %s   6.5
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAAHSIFTTT STTNSFLYPI SSSSSSPNIN SSFHGVSLNV KSKFGQSLTL YAVTTPKPLT VFAATKKAVA VLKGNSNVEG VVTLSQDDDG PTTVNVRITG LAPGLHGFHL HEYGDTTNGC 
MSTGAHFNPN KLTHGAPGDE IRHAGDLGNI VANADGVAEV TLVDNQIPLT GPNSVVGRAL VVHELEDDLG KGGHELSLTT GNAGGRLACG VVGLTPI* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and ESTs. Highly expressed in leaves.
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AGTAAATGCA GCAGCAACAA CAGCTCTTTT GTCGGAATTA TAATGAGTGA ACGTATTTAC CCTCCTCTCC GGGTTGCCAA TAAACCTCTA CATGAATTTG TACTGAGAAA TTCTTTGATG  AACTAAATTT GAACTTGTAT GTACACACTT GCCAACACTT TTTTGCTTCA AAACTGTAAT TGGAGTTGGC TATTTACCTT CCTTTGTGTT TTGGCTATCT AAAGTTACAC TCAGTTAACT  AAGTGTTGTC TTGGATTTTG AACTCCTGTC ATGTATAGTT TCCCTCGAGA CGAGGGTCTA TCAGAAACAA CAATCTGTCA TTGATTAAGA TCAGATTCAG TTTATCACTT CTCTTGAGTG  TTAGAGTTTT TCAAAAATAA TTTTGCTACT CTGTAAAGAT AGGGGTAAGG TCTAGGGGCG TGCATCGGTC GGTTCGGTTT TACATATAAT TGGTTCGGTT TATCGGTTTT CGGTTTTAAA  ATATTCTAAC CCAATAACAA ACCAATAAGA AACTTTTTAT CGGTTTATCG GTTTTTGATA TTATCGGTTC GATTTCGGTT AATCCAATAA GAAAATGTCG ATCAAATAAT ATATAATAGT  ACGTATGTTA TAATTACATG TTACCAACTT ATCGCCAAAA CATAATAGAA AACTTTGAAT GTTGATCAAA TTACTAACAT TCACAAACTT GCAAAAGCTA TCGCCTACAA TTACGAATTA  GAATTAAAAC TAAAATAAAA TATTTCAATG AGACAATCTT GAACAGTTGC TTGATCCACA AGATAATCAA CAAAGTTCTC ACTAATTTCC TAACCAAAAA ATCACATAGC GTGAAAAACT  AATATTGAAT CTATTTATGT ATTAAATTAT GTATATTTAA TATTGAGGAA GGGTAAAGTA GTAAATAACT ATAGTCTTAT TGGGTTATCG GTTTACCCAA TAGCCCAATA GGAAAAACCG  AAACCGACCC AATAACCCAA TAATTATTTT TTCTAAACCC ATTAAAAACC CAATAACCCA ATAACAATAA CCCAATAATA TTTTATCGGT TCGGTTTATT GGTCGGTTCG TTTTTTGCAC  ACCCCTAGTA AGGTCTGTCT ACATTTCATC TTACACGGAT CATTCGAGTT TGGTTGTTGT TCGTTTACGT CTTCAATATA TAGTCATGAG CTAACCAATG TTTTATTTGA TTTTTCACTT  GATGTTTGGT ACACATTTTA GGATATCGAT TAGTATAGAT TCATTAAACA TAAGATTCAT CATGGAGAAG TGCAGTCTAA TTAGATTTTC ATTTTTATTT TTAAGGCTCA AACCTGAAAT  CCCTGATTAG TTTCAGACGA AGTTTTATGT GAAAGCAAGA AGCATTACTT ACTAATTAGG TGGCATTTTA CATCAGAATG ATTGAAGTAA GAGTGGCAGT ATGTTTTTAG CCAATCTTAA  CTATTAAATT ATATAAGCAA TTATGAGTAA TTAAGGGTTT AATAAGGAAA TTAAAATTTC TAAGATATTT GGTTTAGCAA TTCATCAATG ATTGGAGGCA GGAAAAAAAA ATACTGTACT  GCCAAAACAA TATATATATG CAATAGTTTC ACCTTAATTT TGGTTAAAAT TTTCTGAATT AATTACTATG TTTTTAAAAA CAGCAAGTTT GGAATTTAAT ATTTATTGAA ATTTATTAGT  TTTCATATAC ATATCAATTC AAGACACACT CAAAAATATG TGTAAGCAAA AAAAAATATT AAAATTTAAA TCGAAAGTAT CTAATAGAAA TAGATTATCA TGTGTTCAAA TATTCAATTA  AAACAATCTG TAATTTAAGT GTCTAAATAC AATAAACTGA AGAAATTTAT CGATGAATTT AAAAGTCTAT ATTTTATATC ACATGCTTCA ATTTAGTTTT TAAATTTTTT TTGTCTATTT 
AAATTCTGCC ACATAAACTG AAACACGACG AATATAAGGA GGCTCAAATT CCCCCATGGG TTGGATAAAT CACCAATAAT 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCGCCC ACTCAATCTT CACCACAACC AGCACTACCA ATTCTTTCTT ATACCCAATT TCTTCTTCTT CTTCTTCCCC TAACATTAAC TCTTCTTTCC ATGGTGTTTC ACTTAATGTT  AAGTCAAAAT TTGGCCAATC TTTGACCCTT TATGCTGTCA CTACCCCTAA ACCCCTTACT GTTTTTGCTG CTACTAAGAA AGCTGTTGCT GTCCTTAAGG GCAACTCTAA TGTTGAGGGG  GTTGTCACTC TATCTCAAGA TGATGATGGT TGTTTATACT TTCTTTTTAT GCTTTAATTT GCTGCTTTTT GGGTTATGTA TGTGGATTAA AGATGTAATC TTTATTACTA ATGGTTCATA  CCCTTTTATC TGAATCTTTA TCTGTTTCAA TTTCCACCAT TTTGTGATCT AATTTGTTGT TTTTGTCATA TTTGTGGATT GTGACTTAAA GATGTAATCT TTATTACTAA TGGTTCATAC  CCTTTTATCT GAATCTTTTA TCTGTTTGCA TTTCCACCAT TTTGTGATCT AATTTTTTGT TGTTTTTGTC ATATTTGTGG ATTGTGACTT AAAGATGTAA TCTTTATTGC TAATGGCTTC  AGACCCTTTT ATTTGAATCT TTATCTGTTT GCATTTCCAC CCTTTTGTGT TCTGCTTTGC TGTTTTTCTC GTCGTATTTG TGGATTGTGA CTTAAAGATG TAATCTTTAT TGCTAATGGC  TTCATACCCT TTTGTTTGAA TTTCCACCCT ATTGTGCTTT ATTTTTCTTA CTGATTTTTG TTATGCTTTT ACTTGAGATG AGGGTCTATT CAAAACAGCC TCTCTGCCTT AACAAGGTAT  GGGTAAGGTT TGCGTACACA CTATCATCCC TAGACCTCAC TTGTGGGATT ATGCTGGGTT GTTTGTTGTT CGATTGTGAA CTAAAGATGC AATCTTTATT ACTAATGTTT CATACCTTTG  ATCTGAATCT TTATCTGTTT ATTTTTCCAC CCTTTTGTTT TTAGTTATTT TATATTCTTG GATTGTGACC TTAAGAAGTA ATCTTTTGTT ACAAATGTTT CATACCCTTT TATCTGAATC  TTTATCTGTT TAAATGTCCA TCCTTTATGC TCTATTTTTC TCTTCTGTTG TCACATTTGT GATCGTGAAC TAAAGATGTA ACCCTTTCTA AATACAGTTC ACACCCTTTT ATCTGAATCT  CTATCTGTTT GCATTTCCAC CATTTATGCT CTAATTTGCT CTTCAGTATC ACATTTGTGA TTGCTAGCTA AAGATGTAAG TCTTTCTGAG TATATTTTGT AATGTGATTG TCACCTAAGA  TGTAATCTTT ATTAAGAACT TTCGTACCCT TCTATCTGAA TCTTTATCTG TTTGCATTTC CACTCCTTAT GCACTAATTT GCTTTTCTTT TGTCACATTG GTGGATTCTG ACCTAAAGAT  CTGAGCTTCT CTAAGAGTAT TTTCGTAGCC ATTACTCCAA ATCTTTATCT CTTACTTCTG TCAGTACTCA TAATGTCCTT ATTTGGTTTT GTATAACAAT ATTTTTTGTT TGGGACCTAA  AGATGTAAGC TTTTATAGGA ATATTTCAGA CCCTTATGTA TTGAGTATTT TTTTTCTTCT TTGTATAGGT CCAACTACGG TTAATGTTCG TATAACTGGA CTTGCTCCTG GACTTCACGG  GTTTCATTTA GTAAGTTATG GTTGCTACTA TTTGAATTAT ACTGCTTCTT GTATGTACTT GTCCTTGTGG CAATTATTGG TGAATTTTGG TTAATGTTAT GCTTTGGCTT GTGTTGTAGC  ATGAATATGG TGACACTACA AACGGATGTA TGTCTACAGG TTAGCTTCTG ATTTAGTTTG AACTTTGAGT TAATCGAAAT GTTGATGAAT TGGAACTCCT CTTGTAATGT ACTAAAATAA  AATTGGAACT CTTCTAGTAG CTAGTTGGAA ATGATGTGTT TAGTTCTAGT TTCGCTGGTA CTAGTTTGAA ATTTGTTCCC TTTTGATTAC TGCAGGAGCC CATTTTAATC CGAATAAATT  GACACATGGA GCTCCTGGAG ATGAAATCCG TCATGCGGGT GACCTGGGAA ACATAGTGGC CAATGCCGAT GGTAAAGTAC ATCTTTTCTA TTCTTTCATA GCGCTTTGAT TCTGTATTTG  TTTGTTAAGA TGGATGATGA CTTTCTAGAT TCTTAATTGC GCTTACTGTA TGCAGGCGTG GCTGAAGTGA CACTTGTAGA TAATCAGGTT GTTACATTCA CCTTGTCTGG TCATCGTCAT  TCGATGTCAC TTTATGTGCT CTATGTTTGC TATTGTTATA GTTTTAGGAT AATTTACTGA CTCTAAATCT TGTGCACCAA TTAGATACCA TTGACCGGTC CAAACTCAGT TGTTGGACGA  GCACTTGTGG TTCATGAGCT TGAGGATGAC CTCGGAAAGG GTAAGGTTCT ACATTTTGTA TTTGATCCAT CTTAATCTGT AAATTTGAAA AGGTTATTTC TGCGAGTGTA TCAAATTTTA  TTTGGTGCAT GCTATACTAC CTTTACATTT TTTTGGAGGT CTCTATGGTG CCTTCATCTA ACCCTCATTT GGTGGTCTCT CTGTAGGTGG CCATGAACTC AGTCTTACCA CTGGCAATGC  TGGTGGACGA TTGGCATGCG GTAAGAAGAA ACACTCTTTT CTCCCCCTTT CTGTGCTGCG CTCTCTTCCT TCATGTATAA TTACTAGTCT GACATTATTC CTGCTAAATG AAAACAACAA  TAACATACTC GGTGGAGAGT GTAGTCCCAC AAAGTGAGGT TTGGGGAGCG TGTACGGAGA CCTTATCTCT ATCCGTACCT TATAGGTGGA GAAGCTTTCC GGTAGACCCT CGTCTCAAGG  AAAAACAGTC CAAAGCAGTT CAGGAAAAGA AGTAACAGAA TTACAAGAAA CATCAGATAA TAATACAACA GAAACTACAA AGAAACAATT CTGTCATCGA GGTACAAGAA ATCAACAAAT  AGGAACAGAA ATCTAAGGAC AAGAAAATAG GGGAGCAATA CTACAGTTAC TAATATGAAC GGACTGCAAG ACACCACACT GCCATCTACT AACCTATGAA ATAAAAAGGC AAAGCTTAAA  TTAGTAGAAC TTAGCCTCGT ATAGTTTTAA CCCCTAGTTG CATTGTGTTT ATAATGGTTA AAGATAATCT TAAGAGTTCG TTTTGCAAGT CTAGAACTTT ATTGGGCTGG GAAATGAATG  TTCATTTTGC AAAAAGAAAA GGAGATAAGA CAATCAAAAG TAAAATGGTC CTCATTTTCA TTGAATATGT GGTGCATTTT GTTTGGTTAA TGTCCTTCTG TATACAGCTA GTTTGCTTCT  CTCTCCTTTT TTAGTTTAGC AGCAATTATA CAATTATAAC GTTTATATAT ATATTTATAC ACAACAATAA CAAACCTAGT GCAATCCCAC AGGTGGGGTC TGGGGAGGGT AGTATTTACA  CAGACATTAT CCCTTTCTCG GGAGGTAGAG ATATTGTTTC CAATAGACCT TCAGCTCAAG AAAATAACAC GGGTGAAGAA ACCAGGGCAA AATACTAAAT AAGGTATGCC AAGCATTCTG  GAAAAGGACA GTAACTACAC TATGTAATAC TATAATCGAA GTACAAGGGA TAATAATTAA TAACAGAAAT CAAAGAAACA AGAAACTACT AGAGTAATAC TATGACTACT AGTAAGGAAG  GATAAACGAG ACTACACTCA TCTACCTACT AACCTTCTAC CTTAATTTGT GTCCTCCATA ATCTCCTATC TAAGGTCATG TCCTCGACAA GCTGAAGTTG CACATGAATT GTTAAAATAT  TATGAATATT TAATAAATGA ACTCCTACAG TGTTGTAACA TTTGCACTTC CCTGTAGGGG GTCAATGAGC AATCAATAAG GCTCATGGCT TACGCTGGTG ATTTCTAATG CACTTTGGAA  CGGTGCCAAC TTAAGGTCGG CCCAAGTCAG TTTAGAAAAA AACATTTACA CTTCCCTGTG GAACCAATTC AATCCTTGTC CTTATCTCCC CCCCCCCCCC ACCCGATACA CAAACAAAAA  AACATCTCTG TTTTATGTAA TTGTAGTTTT GTGGAGAGTA TTCTTCATTT CTATTTAATG AGGTCAGAAT CAGAATATAC CTGTTTTTAT GAAGAAGCTA CTACTTCTAT GGCCTCTTTA  TCTTGCAACT TGTTTTCAGT ATTTTATTTT TATTTGTATA TATGTGTGTG TGCGCTTGCG CATGTGTCTA TGTGAATGAA CTTCGGGTCT TGGCACCCAA AAAATATCAG CCAATAAAAC  AAAGTTGGGC AGAACGGACG CAACTTGTAA AAGTTATTTC AGGAAACTAA CATAAGGTGG AATAGAACTC TAGAAGGAAA ACGAAACCTC CGAAGAAGGA AACTATGACT AATTAGACCT  TTTGGTAACC AAATGATAAC AACACTGAAT GTGAGATACA GTATAGAAGT ACAATTCTGC AAACTGATCC TCTGCAGTTA TTTTGATTCT TCTAAAGAGC TTCTGCGAAA TGTTGTGCAC  CCTATATTAG ATTGTGCACA TTGTGAGGCT AACTATAGTA AACGGGACTT TACAATTCAT GTTTCAATCT CCAGAGAGTG TGTGTATACA ATTTTGGAAG AGCATCTTCA TTGCCCCATA  TGCGAGGTTT AACAAAATTC ATTGCCCCAT ATTTTCATCT AGCTCTTGTG CTACTAGTGA AGGTTCAAAA TTCGTGTGCC ATTTATGCGA GGTTTAACAA AAGCACGCAT AAGAGAGACC  TTTTCAAGTT TGTTGTAAAA AAGAGTGACG TTTTTGAAGC TAGCTCCAAC TCCAACATCC TACACCATCC ACCAGGTGCC AGCCCTGAAA ACATCCCCGT CTTTTCTCGC TAAGTAGTTC  ATCTCCATGC CCCCTCTCCA TTACCCGAGA CAGATTTATT TTGGGGTTTA CTTGTTATTG ATCTAAGAAA ATACTTTTGA ACGACATTGC TTTCGGTATA TAGTTTGTCT GACTTTGATA  TGTCAAGAGG AAGACTAGAT TACAAGTTCA TTAGTAGAAG TATCATATAT AGCTATGTGA CTACTCCACT TTGACTTGTA ATTTCGTTCA AGTTGAGATC TTTCCTCTAC TTTGGATTTC  TTAAATGCTA GATATGTTTC TCTTTATACT TTCAGATGAG AGGCTTCTCG TGTACCTTCC TTGGTCGGAT TTCTTACATG CTGTTTACAA AACTACCTTT TCACTTATGT TCATCGCGAA 
ATTTTCCTAT GCAGGTGTGG TTGGTTTGAC TCCAATATGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCGCCC ACTCAATCTT CACCACAACC AGCACTACCA ATTCTTTCTT ATACCCAATT TCTTCTTCTT CTTCTTCCCC TAACATTAAC TCTTCTTTCC ATGGTGTTTC ACTTAATGTT  AAGTCAAAAT TTGGCCAATC TTTGACCCTT TATGCTGTCA CTACCCCTAA ACCCCTTACT GTTTTTGCTG CTACTAAGAA AGCTGTTGCT GTCCTTAAGG GCAACTCTAA TGTTGAGGGG  GTTGTCACTC TATCTCAAGA TGATGATGGT CCAACTACGG TTAATGTTCG TATAACTGGA CTTGCTCCTG GACTTCACGG GTTTCATTTA CATGAATATG GTGACACTAC AAACGGATGT  ATGTCTACAG GAGCCCATTT TAATCCGAAT AAATTGACAC ATGGAGCTCC TGGAGATGAA ATCCGTCATG CGGGTGACCT GGGAAACATA GTGGCCAATG CCGATGGCGT GGCTGAAGTG  ACACTTGTAG ATAATCAGAT ACCATTGACC GGTCCAAACT CAGTTGTTGG ACGAGCACTT GTGGTTCATG AGCTTGAGGA TGACCTCGGA AAGGGTGGCC ATGAACTCAG TCTTACCACT 
GGCAATGCTG GTGGACGATT GGCATGCGGT GTGGTTGGTT TGACTCCAAT ATGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCGCCC ACTCAATCTT CACCACAACC AGCACTACCA ATTCTTTCTT ATACCCAATT TCTTCTTCTT CTTCTTCCCC TAACATTAAC TCTTCTTTCC ATGGTGTTTC ACTTAATGTT  AAGTCAAAAT TTGGCCAATC TTTGACCCTT TATGCTGTCA CTACCCCTAA ACCCCTTACT GTTTTTGCTG CTACTAAGAA AGCTGTTGCT GTCCTTAAGG GCAACTCTAA TGTTGAGGGG  GTTGTCACTC TATCTCAAGA TGATGATGGT CCAACTACGG TTAATGTTCG TATAACTGGA CTTGCTCCTG GACTTCACGG GTTTCATTTA CATGAATATG GTGACACTAC AAACGGATGT  ATGTCTACAG GAGCCCATTT TAATCCGAAT AAATTGACAC ATGGAGCTCC TGGAGATGAA ATCCGTCATG CGGGTGACCT GGGAAACATA GTGGCCAATG CCGATGGCGT GGCTGAAGTG  ACACTTGTAG ATAATCAGAT ACCATTGACC GGTCCAAACT CAGTTGTTGG ACGAGCACTT GTGGTTCATG AGCTTGAGGA TGACCTCGGA AAGGGTGGCC ATGAACTCAG TCTTACCACT 
GGCAATGCTG GTGGACGATT GGCATGCGGT GTGGTTGGTT TGACTCCAAT ATGA 

Retrieve as FASTA