Entry information : LeFRO02(Solyc01g094890.2)
Entry ID 15958
Creation 2019-10-30 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2019-10-30 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-10-30 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LeFRO02(Solyc01g094890.2)
Name LeFRO02(Solyc01g094890.2)
Class Ferric reduction oxidase    [Orthogroup: FRO002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Leaves
Roots
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LeFRO02
start..stop
S start..stop
LeFRO03 846 0 19..713 21..719
AgluFRO01 826 0 19..713 19..711
LeFRO01 480 1e-164 266..713 1..444
AgluFRO02 460 1e-156 243..667 6..438
Literature and cross-references LeFRO02(Solyc01g094890.2)
Protein sequence: LeFRO02(Solyc01g094890.2)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   713
PWM (Da):   %s   80867.46  
PI (pH):   %s   9.09
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MEVMNRRSSS FSDGKIRMIQ GAILALALTI FLGNLMMWII MPTFTYYQKW VPVLVAATNS TFFDIQGPIM MNFTFPILFI AVLGCLYVHL EKKKSDIVTS SYCNKDWLKI LKKPKIIKSL  GIVTWIELFF LAMFIILCVW YFSAFVYFHY STITTYAATK GVEVWQARID RLALVIGLTG NICLTFLFYP VSRGSSILPL LGLTSEGSIK YHIWLGHMAM TLFTIHGLLF ILFWAVSGRL  HEMLTWNPHY ISNVPGELGL LVGLILWATT FPAIRRRMFE VFFYTHYLYI LFMVFYLLHT GMFYACIMLP GFFLFLIDRY LRFLQSKQQV RLISARVLTC ETVELNFSKI SGLEYSPTSI  MFLNVPSISK LQWHPFTVTS NSNLESDTIS VVIKCEGSWT KKLYSVMSLP KPVDRLDVSV EGPYGPASTH FLRHDTLVLI SGGSGITPFI SIVRELIHMS STLKCKTPKI LLVSVFRNTS  QLSMLDLLYP IAGTPSGCSS NLDLQVEAYI TREIEPAQEK SEPLRTILFK PDHSDAPITP ILGQNNWLWL AAIISSSFAL YLLFVGLLYQ YYVYPMDHGT NQVFPYHTRA LFNMLFIAAA 
IVITASAAFL WNKKKSARET KQIQDMADSA KSLNSLIAYA DQELESLPQQ SLDKSIKTHY GHRPDLKRIL LEVKGSSVGV LASGPKTLRH DVAAICSSEL VENLHFESIS FTW* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and ESTs.
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GAGATGTTTA GTCATAATTT GCATCGACCT TTTGATAGAA TGGTCCATAG ATGTGAAAAT ATTATCGTAA GTGAAGATGT ACTAAAAGGA AATAGAATAA AGTAATAAAC TTAAAACTCA  CATAAAAGAA AATTGTCTTG AATGACATTT ATTGTTTCAT ATAAATTTAG CAAAATAATT GATTTTTTTT TAAAAGATAA CACTAATTAG TTGATAATCT ATTTCAATGA CATTTATTGT  CTCATATAAA TTTAGCAAAA TAATTGATTT TTTTTAAAGA TAACACTAAT TAGTTGATAA TCTATTTCAG TCATATTTAT TTTAGGTATA TACTATACTT TATAAAAGTT ATTAACCTTA  CTTGAGCAAT GATATACCCA TCGTAATTCT ACATAATATA AAGTCAGAAA TAAATAAATA TTTTTAAGAC AAAGTTACAA TCTATCCTTT AAAAGTTTAT AATTACAGAA ATTCCTTAAA  TAGATACAAC AATATAAGCG TTGATAAACT AAAAAGAGGG CCGAATACAT ACATGGCCGA AAAATCAAGC GCGGATACAT TAAAATGAAG ATCGATACAT GCGATAATAC ATTAAAAAAG  AGTCGAATAC ATTAATGGCC AAAAAATCAA AACATTGATA CATTAGGAAG AGGGTCAGAT ACATGCTCTG ATACATTTAA TGGAGAATCG GATACATTAA TGACATCTAT TACCTATGAG  AATAATGAAC AGTTTTAAAA ATTCATAAAA CTTATTAGGA ATAATGATAA TATATAAACT AAAAGTGAGA TTTATATTAT TATTCCGTAT AAATAAAATA TATACAAAAC CTACCACTAA  TTTACTTTAC ATGCACTTCT TTTTGTATTC TGTTCTTTTT TTCTTAAAGC AGGATAAGGC CACAAGTTCA CTTTTTTAAT TATATATATA TATATATATA TATATATATA TATAAAATAT  TTTTTATTTT TACATATTTC AATGATACTG TTATACCTAC TCTCCCATAG CCAAGCTACA ACAATATCAC AAAATTAAAA AATAACCAAA AGAGAGAAAA AAATCTAAGG CAACAACCAC  AAGATTCCTG GTACAAATCT AAAGCCAAAA GATCTAAAAG AAAATATATA GCTTACTTTT AAATGTATTT TAATATTTTC ACCAATTTGT CATTAAGAAA CCCAACAAAA CAATAATCTT  TAATTACTAA TTGCCAAAAG AACATATATA TATTTACAGA AGTAGTAGTA ATTAAAATAA ATTGCATTTG GTTAGGGAGT TGGATACAAA ATCAAACTAA TTAAAATGAT ATATATGCCA  TGTATACATT CACCATAGCT ATTTTACTAG TAAAAACATT TTAAGTGATT TGATAACACT GTCGATTTAT ATTACTTAAA CTCAAGCTAA ATACTCATGC ATCAATTTAA ATGACACATT  TTATATCTTG AGAATCAACC AATTTAAGTT TTATCGAAAA TTTGCGCATG AAATTTTTAA TTTTTTTGAA ATGAAATTTA TAGATTTGTA AACTACGTAA AAAGTACTAC GAGTCACAAT  AATCGATAAT ACAAAATATT TTTAAAAATC TATAAAAATT TTACGATCAC AGATAGATTT ATTTGACTCT TGAAATCTAA AATGTGGCAT ATAAAATAGA ACGGAGGGAG TATACAACTC  AAACAATTAG TGAAGAACTT AGTTTAGAGG AAAAGTTTCA ACAAAAACTT GAAGAAGAGT TTAGAGGTGA AGAAAAATAA TTAAAAGTTA GGTGAAAAAA AAATGAAAAA ATGAAAAATA  TATTTACAAT GGGGCCCTAG GAAGACAAGA TCACTAGACC ATTGAGAGGT GGAATAATCT TGTCAAGTCA GCATCCTATA CAAATTTTGC TTATTTATAG CATACAACTT GTGAACACTT 
ATTTGATGTA TATAACAAGT TCACTACTAC TATATATTTC CAATTTATAT TCAACAAAAG CTAATTTTGT TACAAGAAAA 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGGTGA TGAATAGGAG ATCATCATCA TTTTCTGATG GAAAAATTAG AATGATACAA GGAGCAATAT TAGCTTTAGC ACTTACAATA TTTCTTGGGA ATTTAATGAT GTGGATTATT  ATGCCAACTT TTACATATTA TCAAAAATGG GTCCCTGTTC TTGTTGCTGC CACCAATTCC ACATTCTTTG ATATTCAAGG TATTTTAATT TTAATTATGT ATTCCATTTT CCCATCCTCG  AGGCGTGAAT TTAGGATTTG AATATTATAA AATTGAGTTT GGAAGTATAC TAGTACTAAA AACACGCGAA TTTCTGATGG AAATTTTCGT CCTTGGAGAA AAATTGTTTG GCAATTTGCG  TGTTTTTAAT AGTGTATGTG TATAAGGTTC GTCAGTGGAT CTTTTAATAT ATCTGTGTAT AAGATTTAAA TCAAAATTAC ATACTGAGTT TGAATGAGCT CGTCAGTACT TAATAACTAC  ATTCACTCTT GCCTTTTTGG AAATTTTCTA ATAAAATTAG AACGACACAG AAAATAAACC TAGCAAGAAA ATTGGACTTC CTTTATTTTC TTTTGCATGT TTCTATTTTT TTTTCATGTC  GAGATGAGGG TAAATAAAAG AAATTATAAT TTTGATTTTT GGTGTTATTT TTACAGGTCC CATTATGATG AACTTCACAT TCCCAATCTT ATTCATAGCT GTTTTGGGTT GTCTTTATGT  TCATCTAGAG AAGAAAAAAA GTGATATTGT CACTTCATCA TATTGGTATA TGATATATAT ATTTTTTTAT TTTGGTTTGT GATTATGATA TATTTAATTG TTTTTATTGT TGTTTAATTT  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AGACATGACG TAGCAGCCAT TTGCTCGTCT GAGTTGGTTG AAAATCTGCA CTTTGAGTCC ATCAGCTTCA CCTGGTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGGTGA TGAATAGGAG ATCATCATCA TTTTCTGATG GAAAAATTAG AATGATACAA GGAGCAATAT TAGCTTTAGC ACTTACAATA TTTCTTGGGA ATTTAATGAT GTGGATTATT  ATGCCAACTT TTACATATTA TCAAAAATGG GTCCCTGTTC TTGTTGCTGC CACCAATTCC ACATTCTTTG ATATTCAAGG TCCCATTATG ATGAACTTCA CATTCCCAAT CTTATTCATA  GCTGTTTTGG GTTGTCTTTA TGTTCATCTA GAGAAGAAAA AAAGTGATAT TGTCACTTCA TCATATTGCA ATAAGGATTG GTTGAAGATA TTGAAAAAGC CAAAAATCAT CAAATCATTA  GGAATAGTGA CATGGATAGA ACTATTTTTT CTAGCCATGT TTATTATTCT ATGTGTTTGG TATTTCTCAG CATTTGTCTA TTTTCACTAT AGTACCATTA CTACTTATGC AGCAACTAAA  GGAGTTGAAG TGTGGCAAGC AAGAATCGAT AGGTTGGCTT TAGTAATAGG GTTAACAGGG AATATATGTT TAACATTTCT ATTTTATCCA GTAAGTAGAG GCTCTTCAAT TTTGCCTCTT  TTGGGATTAA CTTCAGAAGG CAGCATCAAA TATCATATAT GGTTGGGACA TATGGCTATG ACACTTTTCA CTATTCATGG TCTTCTTTTT ATTCTATTTT GGGCTGTCTC TGGGAGATTA  CATGAGATGT TGACATGGAA TCCACATTAC ATATCAAATG TACCTGGAGA ACTTGGTTTA CTAGTTGGAT TGATATTGTG GGCAACAACA TTTCCAGCAA TTAGAAGAAG AATGTTTGAA  GTCTTCTTCT ACACTCACTA TCTCTACATT CTATTCATGG TTTTCTACCT ACTCCACACT GGAATGTTCT ATGCCTGCAT TATGCTTCCT GGTTTCTTCC TCTTCTTGAT CGATCGATAC  TTGAGATTCT TGCAATCCAA GCAACAAGTT CGTTTGATTT CAGCCCGAGT TTTGACTTGT GAAACTGTTG AACTCAACTT CTCCAAAATA TCAGGTTTGG AGTACTCTCC TACGAGCATT  ATGTTCCTAA ACGTGCCAAG CATATCCAAA TTGCAGTGGC ATCCATTCAC TGTAACTTCA AACAGTAACC TAGAATCAGA TACAATTAGT GTTGTCATCA AATGTGAAGG AAGCTGGACT  AAGAAGCTTT ACAGTGTCAT GTCATTGCCT AAACCAGTCG ATCGTCTTGA TGTTTCTGTT GAAGGACCCT ATGGACCTGC TTCCACTCAT TTCCTAAGGC ATGATACATT GGTGTTGATC  AGTGGAGGGA GTGGAATAAC TCCATTCATT TCCATCGTCA GAGAGCTGAT TCATATGAGC TCAACACTGA AATGCAAAAC TCCAAAGATC TTATTAGTTA GTGTGTTCAG GAATACTTCA  CAACTCTCTA TGTTAGACCT TCTTTATCCT ATAGCAGGCA CTCCTTCAGG ATGTTCTTCT AATCTTGACC TACAAGTTGA GGCTTATATA ACCAGAGAGA TTGAACCAGC ACAAGAAAAA  TCCGAACCCC TACGGACCAT TTTGTTCAAA CCTGACCACT CTGATGCACC CATAACCCCC ATTTTAGGCC AGAACAATTG GCTCTGGCTT GCAGCTATAA TATCGTCTTC ATTTGCTTTG  TACCTTCTAT TTGTGGGACT TCTTTACCAA TACTATGTTT ACCCTATGGA CCATGGTACT AACCAGGTAT TCCCATACCA CACAAGGGCT TTATTCAACA TGTTGTTTAT AGCAGCTGCT  ATAGTAATTA CAGCAAGTGC AGCCTTCCTA TGGAACAAGA AGAAAAGTGC TAGGGAAACT AAGCAGATTC AGGACATGGC AGATTCAGCA AAATCTTTGA ACTCATTAAT AGCTTATGCT  GATCAAGAGC TAGAAAGTCT TCCTCAACAG TCGCTCGACA AATCTATCAA GACACATTAT GGCCACAGAC CTGATCTCAA GCGAATATTG CTAGAAGTTA AAGGATCAAG TGTTGGAGTA 
CTTGCCTCTG GACCGAAGAC CTTGAGACAT GACGTAGCAG CCATTTGCTC GTCTGAGTTG GTTGAAAATC TGCACTTTGA GTCCATCAGC TTCACCTGGT GA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
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