Entry information : LeGR05(Solyc09g091840.2)
Entry ID 15968
Creation 2019-10-31 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2019-10-31 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-10-31 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LeGR05(Solyc09g091840.2)
Name LeGR05(Solyc09g091840.2)
Class Glutathione Reductase    [Orthogroup: GR001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type All tissues
Inducer Constitutively induced
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LeGR05
start..stop
S start..stop
HaGR01 780 0 7..454 49..497
HaGR03 776 0 7..450 43..487
ThasGR01 754 0 7..454 45..493
AtGR01 749 0 7..455 51..500
Literature and cross-references LeGR05(Solyc09g091840.2)
Protein sequence: LeGR05(Solyc09g091840.2)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   454 (301)
PWM (Da):   %s   49350.39 (31678.8)  
PI (pH):   %s   6.52 (6.50) Peptide Signal:   %s   cut: 31 range:31-331
Sequence
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Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MELRYMVAIC ELPFDPIGSE VSGGVGGTCV LRGCVPKKIL VYGAAYGPEL EDAKNYGWEV NENVNFNWKK LLHKKTEEIV RLNGIYKRLL SNAGVKLFEG EGRVVGPNEV ELIQLDGTKI  SYSAKHILIA TGSRAHRPDI PGQELAITSD EALSLEELPK RAVILGGGYI AVEFASIWRG MGSTVDLCFR KELPLRGFDD EMRAVVARNL EGRGITMHPC TTLTKLEKAE GGIKVHTDHG  EVILADVVLV ATGRLPNTKR LNLDAVGVEL DNMKAVKVDE YSRTNIPSIW AIGDVTNRMN LTPVALMEGT CFAKTVFGGK PTKPDYSHIP CAVFCIPPLS VVGFSEEQAI EQINGEVSVY 
TSSFNPMKNT ISGRTEKSVM KLLVDAQTDK VIGASMCGPD APEIMQGIAV ALKCGATKEQ FDSTVGIHPS AAEEFVTMRS ESRRISSNKP KTNL* 

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Remarks Complete sequence fromgenomic and ESTs. Highly expressed.
Promoter
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTCAAAATAC GAATTACTTG ATATTTTTTC TAAAAAAAAT TATTATAATA AATATAGTTA AAAGTGATCT CAATAAATCT ATAAAATTTG ATATTAATAT AGACTTAGTT AAAAATAAAA  TACGATTAAA AAAAGAAAAG AAAAGATTCA TATAAATAAT TATAACTAAT TGATGTTATG TTTTAGATCT GTATGAATTA GCACTATAAT TTACATATTT TTAATGTATT TTTTCAGTTT  TATTTTATTT ATGAAAATGA TATGATTTAA GTTTTTAAAA AAAGAGAACT CGCAGAGCTG ATGTCAAACA TATTCGGGAA TGAGATCATT ATTACTCCTT TCATTTCATT TTTTTAAATT  TTGAAATAAT CCGCAATTGT TATAACTTCT GTCACAATTC CTGTAAACCA CCGTAAACAA TAAGGCAATG AGAAGAATCG ATCTAAGTCA TCCGTGTGAA TATATTCACC TCTCCAAACC  ACCTTCCAAT TCATTTTACT TGACTTTTAT ATATATAAAA AATCTATTAT ATTTTATTTA TTCATTTTAA TAAATCAACT TTTATGATTA TTTTTTCGAT ATTATTAACT ATATAAAATT  ATAGTCAATT TTCGTATAAT TAAATACATT TTGAATTAAA AATAGTCAAT TCCGGTTCCT CGAAGAAAAA ATAAATAAAT TCCCCAAAAC CTTGAATATC GCTTAGATGA ACCGGTGGGT  GCCGGTTCAT TTTTGGTTTT ATAAAACCGG GTTCTCATTT CTACCCTATA TATAGAGGAG CACTTGCAGT TAATTCTCCG TTGTCTACTC CGGCGATAGT TTACCGGCGG CGAGTGAAAG  TTGTCTCTCT CACTATATCT ACTGGTAATT TCATATTTTC AGCTTACTAT GAAATTTTTT GAAGTTTTAA GTTGACGATC GTCGAACTAT TTATCGAGGT TTACAGCGTT TAGTTGATTT  TAATACTTAA ATTGATACTA GTATTGAGTT TTGAGTTTTT GATTTCGATC CGGCACCGGC GTGCTGTCGG TTGTTTTGCT AGGTCATCGG GAAACCGGAA TTTTATATAT TTTGCGTGAT  TATATTTGAT TCTGCGGCTG CTGCAAGAGA ATTTATTTAT GTTTTATTCA ACAGTATTGT TATTTTGTGT AGAAATAATA CATATTTTGT TTTGAAACTT CTTCCTGTTC ACTGATTAGA  GACCAAAAGA GCTTTTTTTT TTTAATACTT TGACTAATAT TATATTTATT GTTTTAATAT TATTTTTGAG AAAGATAGAT TTTTTTTTTT GTATAGTTCT ACAATTCCTA TACACATTTG  ACTATATTTT TATCATGTGA ACACTATGGT ATACACATCT CTCCATTGAC CCACTCAAAG TTTTTTTTTA GTTTTATAAA CACTTTGTGC TTTTCAGAAG TTTTCCAGAT TAACTATCTC  CTTAAGCTGA AAAGGATTAA CTTTGCTGAT AACTGCTTGC TTCAAGTTTA CTAAGGTATT CTAATATTTG ATTCTTTCTA CAGTTTGTTG CTAAGAATAT TGGTGTGATA TAAGAACTAA  AGGGTGGCAG AAAAGTATAA ACAGATTTAG TATTGTTTTA AGGTGTTATT TTCTTGAGTT ATTTACAAGT TGCTTCCTAG TTCCTTATCA ATTTATAGGC ATCTTTAAGT TAATGGGTCG  TTTCAAATAT TGGGTTTTTT GAGCTCCTTG TTTGGAAATG CTATGTTAAA CTTCTTTTGG TAGTTCCAAT GTACTTATCA CAAGAGTTCT CTTGTTTCCC CTTCCTTCTT TCTGTGCATT  TCTTCCTGGT AAGCAGTATA TGAAAGTAGT GGTGATTTTC CTTTATGGGT GATGTGCATA CAGACTAATC ATGGCTAGGA AGATGCTAAT TGATGGAGAG TTGAGCAAAC CTGGTGAAGA 
AGAAGCGCAC TATGACTTTG ATTTATTCGT AATAGGTGCT GGAAGTGGTG GGGTTCGAGC TAGTCGGTTT TCAGCCCAAT 

Retrieve as FASTA  
DNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGCTAA GGTATATGGT ACTTCTGAAC TTTGTTTATG ATTCAAATTG TTTCAATCTA ATGTGCCCAA CAGTTAGTTC GAAGCAATGG ACTGGAGTTC TTGGGATCTT TCTGTTCAGC  TGTAGCTTTA AGGTCGCTTG AAAGGGATAA ATTTCCATTA GTTTTATTGA TGGATATGAC AAGTTGAGAT ATGCAGCAAA GCTAGTAAAA GTTTGTTCCT GCTTGCATTT GTTGGTCTTA  GCGTCTCTGT GATTACATGA AGGGTGAATT TCCATTCACG TTGTTGAACA ACATTGACAA GCTGGATAAG CACCTGTGTC AAAATGACTT GTTCTCTTAT TTGTTTGTTG AGTGGTCTCT  TCTAGAATGG TTAGACTAGA TAGTTAGTGT CCATTTTGTA AGTCATGATT ATTCTATCCA GGTGGTATTT TGAGTTTTTC TTTGCGGAAC TCAATTTAAG AGAGCTTTAA GACTAGAATG  ATCTAGTCAT GGACAGGTAG ATGGTGAAAC CATATAATCA AATATTGATA AATATAGGAT ATAGCATCTC TAGGATCTTA TTTCATTCTG ATGGCTTTAT GTCTTGAGTA CCATTAACTG  AAGCAACATG CTTGGTTACT ATTTTTTCTC TTCCTCAATG GTTGCATTTC CTGCTGGGAT ATGTCATCAC ATTATGATGA AACATGTTTC TGTTGTTCCG TGAACTTGTT GTTACCACTC  TTATTTACTT GTCTTCTATT GATCCTTGAA TAAAAACCCA TTCAATTTTC CTTTACACAA TTATTTTATA TTGATTTTTG AAGGTTGCAA TCTGTGAGCT TCCGTTTGAT CCCATCGGCT  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CCAAAGACAA ACCTCTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
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GAGTCGAGGC GCATTTCTTC AAACAAACCA AAGACAAACC TCTGA 

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cDNA
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