Entry information : SaPrx40
Entry ID 16007
Creation 2019-11-27 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2019-11-27 (Christophe Dunand)
Sequence status partial
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-12-04 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: SaPrx40
Name SaPrx40
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx026]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Orobanchaceae Striga
Organism Striga asiatica (witchweed)    [TaxId: 4170 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value SaPrx40
start..stop
S start..stop
MguPrx89 276 2e-92 72..279 133..338
MguPrx89 128 4e-35 1..86 1..87
MguPrx300 276 2e-92 72..279 133..338
MguPrx300 128 4e-35 1..86 1..87
CroPrx20 254 9e-84 86..286 146..347
CroPrx20 96 5e-23 14..86 14..87
JcPrx01 253 1e-83 12..280 7..333
Literature and cross-references SaPrx40
Protein ref. GenBank:   GER34144.1
Protein sequence: SaPrx40
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   286
PWM (Da):   %s   31864.28  
PI (pH):   %s   9.98
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKGCEGFNLP AAWIVVVLSL YVGRMQAAVS LPPEARQLRR QFYKKLNTCA PVEPFVRHQV ELWWGRDKTI TAKLLKLLYA DCMVNAxxxG APSYPVLLGR RDGMDSKASW VDLPLPSISV  TQGLAYFQSK GLDSQDYATL LGSHTLGKTH CRYVNDRLYN FNKTGKPDPS MSRATLDNLR QQCPQTLRNK DPTVFLTSQS GAQYRFTNKY YSNVLSFDSV LGVDQGLLYN YNTSQLALEY 
AGSMEQFKRA FALSVTRMSS LKVLTGKQGE IRRNCRYTNK NNPYIN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Partial sequence from genomic. Exon 2 is missing due to N in the sequence.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGGGCT GTGAAGGTTT CAACTTACCG GCGGCCTGGA TTGTGGTGGT GCTCAGCCTG TACGTGGGGC GGATGCAGGC GGCGGTGAGC CTGCCGCCGG AAGCCCGGCA GTTGAGGCGG  CAGTTTTACA AGAAGCTCAA CACGTGTGCG CCCGTGGAGC CGTTTGTTAG GCATCAAGTG GAGCTTTGGT GGGGCCGAGA TAAGACCATC ACGGCCAAGC TGCTTAAGCT GCTCTATGCT  GATTGCATGG TTAATGTGAG TATATATGAA ATTTTAAAAT TTTTTTAAAA TATGCATGGT ATTTCGGCAG TACGTATGTA AACCTATTGA AAAAGTATGA TTATCTAACG ATTATGCAGC  CTGAAAATGT ATAGTTATCT AACGATTATA CAGCCTGACT GTAGCATTAC TGCAAACTAA ATCGATTAGT TTGAGTTATT ATAATTATGA TTTCTTTTTT GGTACTGTTT AGATCTCTTC  TTATTTAATA GCAGTTTACG TTTTTGTTAT TATCTCTTCT TGGGGAGATC ATATTTTTGT GTAGTTCATA AATGAATAGA TTTTTTTTTA TTTAGCGTTT AATGCCGAAA ATAAAAAGAA  AAAACGAAAA AAGAGAAAGT GAAATAATCT TTGACACATA TTGATTAATT TGTTGTTTTT TAACTTTTAA TCTTCATTTC TTCCATGCAA AGGCATCTTT CTTAATGCAA TAGGATATAC  AAAGCGCAGA TTTATGTGCA TGAGCAGTGT CTCAATATGT GAAATCACAT GTTTGCATTA AATGCGGTAA ATCCTATGCA CGCACACAnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnAA AAAAAAAAAA AAAAAGAAAA  AAAAAAAAGA AAGAGAAATG TTTCATTTTC ATTTCAGTGA CATAAATATT AACTAACGAG ACAAGAAAAT CTTAATTTTT TTTTCTTTTT AATTAATTAC AAGCAAATCG TAGCTACTTC  ATCGTTTTAT TTCACCCCAA ACCTAGTAGA ACAATTATTT TAAAAGATTT AACATTGTAT GTAAATGATT ATGAAGTACT ATTTAATATT TATATCACAT CTTTTCAAAA TTCTTAAAAT  AGATATTGGT GTTTGAGCAG GCAGGTGCAC CATCTTACCC AGTGCTGTTG GGAAGAAGAG ATGGAATGGA CTCAAAAGCA TCCTGGGTTG ATCTCCCATT GCCTTCAATT TCTGTGACAC  AAGGCTTGGC TTACTTCCAA TCTAAGGGCT TGGATTCACA AGATTATGCT ACACTTCTAG GTCAATCTCT TAATTAGAAA TCCTGATATA TTTAATTTAT TAGACTTTTT TAAGACTTTT  AAAAGTTTTC GGGTACTCAT TTGAGATTTT AAAGAGTCAT ACAAAATCCT AGGATATTTA ACTTATTTGA GACTATGATT TGTTAAGATT TTTAAGGTTT GTTGGATTTC AAAAGAAAAA  ACCTTATACG AAATCCAACT TCAAATCTCA CCTCCAGACT TAAGGGGGGT GTATTCAATT CGGAATTTAA TTGACATTTT AAAACTTTTT GAGATTTGAG ACTTTCTAGG ATTTTCAGAT  TTTGGAAGAA TTCTATGAAA TCTCAAGTCC GGAGGTAGGA TTTGAAGTGG GATTTCATAT AAGGTTTTTT GTTTAGAAAT CCCACAAAAT CTTAAAAAGG CTTAATAAAT CCTAGTGTCA  AAAAAATTAA ATACCTCAGG ATTTTGTAAG ACTTTTGAAA ATCCCAATTG AATACCCCAG GATTTTTAAA AGTTTTAAAA AGTCTTAACA AATCTAAATT GAATACACCA GGATTTCTAA  AGTCTTAAAA AAATCCTTAA AAATGCTAAT TAAATACACC GCCATAAATT TCTATGTCAC TCAAAATCCC AAACGAATAC ACCGCCATAA ATTTCTATGT CAAAACAAAC AGCTTGTTTT  ACTGCTCGAA CCTAAAAGAG CTCTCCTCAT AATTATCAGG TTCACATACC TTAGGGAAAA CACACTGCAG GTACGTAAAC GACCGGCTTT ACAACTTCAA CAAGACCGGA AAACCCGATC  CAAGCATGAG CCGAGCCACG CTCGACAACC TGAGGCAACA ATGCCCACAA ACACTAAGGA ACAAAGATCC AACCGTGTTC TTGACCAGTC AAAGCGGAGC TCAGTACAGA TTCACAAACA  AATACTACTC TAATGTTCTA TCATTTGATT CGGTACTAGG GGTGGACCAA GGGCTACTGT ACAACTACAA CACGTCTCAA TTGGCGCTCG AGTATGCCGG GAGCATGGAG CAGTTTAAAA 
GGGCATTTGC ATTGTCAGTC ACTAGAATGA GCAGTCTCAA GGTGTTGACA GGGAAGCAAG GGGAGATTCG GCGCAACTGC CGTTATACTA ACAAGAATAA TCCGTACATC AACTAG 

Retrieve as FASTA