Entry information : CcampPrx07(Cuscam_OOIL01000019.1_FGenesh214.1/211.1)
Entry ID 16085
Creation 2020-01-11 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2020-01-11 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-01-14 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CcampPrx07(Cuscam_OOIL01000019.1_FGenesh214.1/211.1)
Name CcampPrx07(Cuscam_OOIL01000019.1_FGenesh214.1/211.1)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx011]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Cuscuta campestris    [TaxId: 132261 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CcampPrx07
start..stop
S start..stop
CcampPrx09 631 0 1..329 1..330
LePrx08 508 0 7..329 8..332
StPrx19 506 0 7..329 8..332
NtPrx22-1A 501 0 26..329 29..332
Literature and cross-references CcampPrx07(Cuscam_OOIL01000019.1_FGenesh214.1/211.1)
Protein sequence: CcampPrx07(Cuscam_OOIL01000019.1_FGenesh214.1/211.1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   329
PWM (Da):   %s   35694.08  
PI (pH):   %s   8.47
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAHNNNLSPL ISLLILSLSL CASAQQLSPS YYSAVCPNLE ATVRGVVAQK FRQTFVTVPA TLRLFFHDCF VEGCDASVVV ASAPGNTAEK DHPDNLSLAG DGFDTVIKAK EAVDKIPGCR  NKVSCADILA IAARDVISLA GGPWYRVELG RRDGLTSKAT NVEGRLPQPT FNLKQLNSLF ASHGLTQTDM IALSAAHTVG FAHCDRFANR IYNFSKQSPV DPTLNQQYAA QLQSSCPTNV 
DPLIAIDMDP VTPKNFDNQY YKNLKDGKGL FNSDQVLYMD PRSKPTVESW ANNPKAFQDA FVVAMTKLGR VGVKTGRRGN IRVDCGRFN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Incorrect prediction from FGeneSH (two independant predictions: Cuscam_OOIL01000019.1_FGenesh214.1 (5') and 211.1 (3')).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTCATA ATAATAACCT CTCCCCCCTC ATCTCTCTGC TAATCCTCTC CCTCTCCCTT TGTGCATCCG CACAGCAGCT CAGCCCAAGC TACTACTCCG CCGTGTGCCC CAACCTCGAG  GCCACCGTCC GGGGCGTGGT GGCCCAGAAG TTCCGGCAGA CGTTCGTCAC CGTCCCGGCC ACGCTCCGCC TCTTCTTCCA CGACTGCTTC GTCGAGGGGT GCGACGCCTC GGTGGTGGTG  GCGTCCGCGC CGGGCAACAC CGCCGAGAAG GACCACCCCG ACAACCTCTC GCTGGCGGGG GACGGGTTCG ACACCGTGAT CAAGGCCAAG GAGGCCGTGG ACAAGATCCC GGGGTGCAGG  AACAAGGTGT CGTGCGCTGA CATTCTTGCA ATTGCAGCCC GGGATGTCAT TTCTCTGGTT AGTAGTCCTC TCCCCATACC TCTTCTATTT TCTTCAACAA ATTTAATATT TAGTTGGGTT  AGACACTTGC TAGGGCTTCA TTCCACTAAA GCCTAGTTTT TTGCCTCACT AAGGTTAAAT AAACAAGCAA TTTGATCGTA ATAAAATTTG ATCATAATAA TTAATAAGAT CTCGGGGTAC  AAGAAAAAGG TGTCTTGTGG GGACATTCTT GTAATTGCAC CCTGGATGTT ATTTATCTGG GAGATGCTAG GGGTACACCA AAAGGTGTAT CCCATTTGTA CACCACCCCT CCATAATCAC  TCATTTATTT TTTATTTTTA TTTACTTAAT TTTTTTTAAA TTTCTTGCCT ATTTAAGTGG TAATGGAGGG GTGGGGGACA AATGGGGTAC ACCCCTCACT TAGTCCTATC CCCATATATA  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TGACGAAATT GGGCCGCGTC GGGGTCAAAA CCGGACGGCG TGGGAATATT CGCGTTGACT GCGGAAGGTT TAACTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTCATA ATAATAACCT CTCCCCCCTC ATCTCTCTGC TAATCCTCTC CCTCTCCCTT TGTGCATCCG CACAGCAGCT CAGCCCAAGC TACTACTCCG CCGTGTGCCC CAACCTCGAG  GCCACCGTCC GGGGCGTGGT GGCCCAGAAG TTCCGGCAGA CGTTCGTCAC CGTCCCGGCC ACGCTCCGCC TCTTCTTCCA CGACTGCTTC GTCGAGGGGT GCGACGCCTC GGTGGTGGTG  GCGTCCGCGC CGGGCAACAC CGCCGAGAAG GACCACCCCG ACAACCTCTC GCTGGCGGGG GACGGGTTCG ACACCGTGAT CAAGGCCAAG GAGGCCGTGG ACAAGATCCC GGGGTGCAGG  AACAAGGTGT CGTGCGCTGA CATTCTTGCA ATTGCAGCCC GGGATGTCAT TTCTCTGGCA GGTGGGCCAT GGTACCGAGT AGAGTTGGGG AGACGGGACG GGTTAACGTC AAAGGCGACA  AACGTGGAAG GGAGACTCCC ACAGCCAACT TTCAACTTGA AACAGCTCAA CTCTTTGTTT GCTTCTCATG GTCTTACCCA AACCGACATG ATTGCCCTCT CTGCGGCCCA TACAGTGGGA  TTTGCTCACT GCGACAGGTT CGCCAACCGG ATATACAATT TCAGCAAGCA AAGCCCAGTG GACCCAACTC TGAACCAGCA ATACGCGGCC CAGTTACAGT CCTCGTGCCC GACGAATGTG  GACCCATTGA TAGCGATCGA TATGGACCCA GTCACTCCCA AGAATTTCGA CAACCAATAT TACAAGAATC TAAAGGACGG AAAGGGCCTG TTCAATTCCG ATCAAGTTCT GTACATGGAC  CCTCGGTCCA AGCCCACTGT GGAGTCTTGG GCTAATAACC CAAAAGCCTT CCAAGATGCG TTTGTAGTGG CGATGACGAA ATTGGGCCGC GTCGGGGTCA AAACCGGACG GCGTGGGAAT 
ATTCGCGTTG ACTGCGGAAG GTTTAACTAA 

Retrieve as FASTA