Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein)
|
Length (aa): |
347 |
PWM (Da): |
38295.29 |
|
PI (pH):
| 6.64 |
|
Sequence 443
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
|
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
MAFINFCQSKIVIFEFLVLVFIGICFSKLNGISDSHLSLDYYKKTCPSVEGIVRKEMECACLSDPRNAAFILRLHFHDCFVQGCDGSVLLDDTVTLKGEKNAPNNKNALKGFKIIDRIKNRIESECPGTVSCADILTIAARDAVLLVGGPYWDVPLGRKDSIKAGYELADTNLPTADEGLISIISKFISQGLSVTDMVALSGAHTIGKARCVNFRNRIYGDFKMTSTSYINPISSSYLSKLKSLCPPIEINGSSDNNETSMDNITPNLFDNSYYHVLLKGEGLINSDQELYSSYLGIQTKKIVEKYAANTIAFFEQFAESMVKMGNITNQETYVNGEVRKSCRFVNT |
Retrieve as FASTA
|
|
Remarks |
Complete sequence from genomic. No prediction from Phytozome. No EST found. |
DNA ►
Send to BLAST
|
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGGCTTTTATTAATTTTTGTCAATCAAAAATTGTGATTTTTGAGTTTTTGGTTTTGGTATTTATTGGCATTTGTTTTAGCAAATTGAATGGAATTAGTGATTCACATTTAAGTCTTGAT TATTATAAGAAAACATGCCCTTCTGTAGAAGGAATTGTGAGGAAAGAAATGGAATGTGCTTGTCTTTCTGATCCTCGTAATGCTGCTTTCATTTTGAGATTACATTTTCACGATTGCTTT GTTCAGGTACGTAAATGAAAATATGAAAATATTATCGATTTAGTTTATTGGAATTATTGAACTGTATGAGCATCTCGTCTAGAAGTTTAACGAATGTTAGAGAAAGGTATACGTAATTCT GTTATTATGTCTCATGAACACCCCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCCCTAAATCTCGAATAATTTACACAAATAGCCACTTTTTTGGCG GCGTCTTAAGAAATCGACCACTATTTCAAAATGAGATTACTTGTGTGAAGTTTGAAAGTAGCCAAGGTTCAAAACTAGTAGTAATATTTAGAGCATGGGACTAATTTTGAAATGTGGTCA ACTTTTAAATAAACCACAAAAGTGGTCATCGGATGTAAATTCAACATGAAACACGTGGAATTTTATTTTTTTTGGAAAGATTTGAATATACGATCTTCATTACTTAATTATATTATGTTT AAACAATCGCTCCTTTCATGTAAACTTGATTCTTTTGCATGAGTCAAACGTAGATTTACACAAATAACCACTTAGTGATAGTCACTTCTTCAAAATTAGACAAGTAGTCAGAAGTCAAAA TTCAAAACTATTTATATATTCATAGTACATATCTAATTTTGAAAAAGTGGTCAAATTTTAAATACAAACCAAAAAAGTTGTCAATTGGTTTAAAACTTTAAATTCATTCTCAAACACATG GAAATATTTCGTTTACTTTATAGATGGCAATAAGATTTAAACTTACGACATTTTTATTTGCACTAATATCATGTTGAATTATGTAACAGGGTTGCGATGGCTCGGTATTGTTGGATGATA CAGTGACATTAAAAGGAGAAAAGAATGCTCCAAACAACAAAAATGCATTAAAAGGATTCAAAATTATTGATAGAATTAAAAATAGAATTGAATCTGAGTGTCCGGGAACTGTTTCTTGTG CTGATATTCTAACTATTGCTGCTAGAGATGCTGTTCTTCTGGTAATTATATTCTTGGAATTTTATTTATGATAATATATAATATTATTAAATTATTAGTTTTTAGGTTTCTTTGGTTATT ATTTAAATAAAATAACCATAATATGAATAAGGGTCGTTTGGGTTCGTATACAGTTAAATCTTTCTATAACGACGTTGTTTGTCTAGAAATGTTGTTAGAACATATAATATATATAACATC ACAAAAAATATTAGTTCGGATAAAAACTTGACCGTTATAGTGAATCTTATTATAGAAGATGACTGTTATGTAAAGGTCTGACCGTATGCATAACTATAAAATGCATTTTTTTTGTTACAT TATATTCTTGGAGTGTTGTTTATGGTATTATTAGAATATTAATGTTTAGGTTTTTTAATTATCATCATAGGAATAATTAAAGTTGTATTAATTAATTAATGATTTTTTTAAAATTAATTT GTGTACTAGGTTGGTGGACCTTATTGGGATGTTCCATTAGGTAGAAAAGACTCAATAAAAGCAGGATATGAATTGGCAGATACAAATCTTCCAACAGCTGATGAAGGATTAATTTCTATT ATATCTAAGTTTATATCACAAGGACTTTCTGTTACTGATATGGTTGCTCTGTCTGGTAAGCATTCTTTAATATATATAATCCTCCGTGTCAATTTATATGACACAATTCGTGTTCGATAG TAAAATATGTGATTTATTCATATGCTTTTTAAATTTTTAATTCTTGTGACTTTTTGTATGTATAGTTATTACGTAGTTTCTATATATGAAAATTATTTTTCAAAAATCTTAAAGAATATA TGTTTGAATTTACAATCAAAATAAACAAAACACTTCAACTTATAAAATAATCATTTAGACACCTCTAAAATTTTATCCGTCAGATCAACGTCAGGTGTCTACGAGACACAACAAGGACGA GTTTGAGAGTTTAGTTGTCAATTCTGACCAAGTTAACGTGTACTAGATATACACTTTCAAAGTTGGAGTACTGCTAATTAACGAGGACGAGTTGGACTGTTTAGTTGTTAGTTGAGACTA AGTCAACGTGTCCTAGATATACACTATCAAAGTTGGAGTACTGCTAATTAACGAGGACGAGTTGGACTGTTTAGTTGTTAGTTGAGACTAAGTCAACGTGTCCTAGATATACACTATCAA AGTTGGAGTACCACTAATTAACGAGGACGAGTTGAAGTATTTAGTGGTCAGTTGAAACTTCAATCGACTTGTCCTAGATATAAACTTTCAAAGTTAGAGTATTGTTAATTAATGAGGACG AGTTGGAGTGTTTAATTGTCAGACTAAGTCGACTTGTCCTAGATATACACTTTCAAAGTTGGAGTACTGCTAATTAATGAGGACGAGTTGGGTGTTTAGTTTTCTGTTGAGACCAAGTCG ACGTGTCCTAAATATACACTTTCAAAGTTGAGTACTGCTTAATTAATTACTTGTCAGTTAAGATCAAATTTGAATGTTTATTTATGTCTTATACAAAAGATTAATTACATGACTTTCTAA ATTAAGTATTACACAAAATTTATCTTATTTTTAATTAATTGTTTCAAAATTTGGCAGGTGCACATACAATAGGAAAAGCAAGATGTGTGAATTTCAGAAATAGAATATATGGAGATTTCA AAATGACAAGTACTTCATATATAAATCCAATTTCATCCTCTTATCTTAGTAAATTAAAATCATTATGTCCTCCAATTGAAATTAATGGATCATCAGACAACAATGAAACATCAATGGACA ATATTACTCCAAATTTATTTGATAATTCATATTATCATGTCTTACTTAAAGGTGAAGGACTCATAAATTCAGATCAAGAACTTTATTCAAGTTATCTTGGAATTCAAACAAAAAAAATTG TTGAAAAATATGCTGCAAATACAATTGCATTTTTTGAACAATTTGCTGAATCAATGGTCAAAATGGGAAATATTACAAATCAAGAGACTTATGTGAATGGAGAAGTGAGAAAGAGTTGTA GGTTTGTGAATACATAA |
Retrieve as FASTA
|
|
CDS►
Send to BLAST
|
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGGCTTTTATTAATTTTTGTCAATCAAAAATTGTGATTTTTGAGTTTTTGGTTTTGGTATTTATTGGCATTTGTTTTAGCAAATTGAATGGAATTAGTGATTCACATTTAAGTCTTGAT TATTATAAGAAAACATGCCCTTCTGTAGAAGGAATTGTGAGGAAAGAAATGGAATGTGCTTGTCTTTCTGATCCTCGTAATGCTGCTTTCATTTTGAGATTACATTTTCACGATTGCTTT GTTCAGGGTTGCGATGGCTCGGTATTGTTGGATGATACAGTGACATTAAAAGGAGAAAAGAATGCTCCAAACAACAAAAATGCATTAAAAGGATTCAAAATTATTGATAGAATTAAAAAT AGAATTGAATCTGAGTGTCCGGGAACTGTTTCTTGTGCTGATATTCTAACTATTGCTGCTAGAGATGCTGTTCTTCTGGTTGGTGGACCTTATTGGGATGTTCCATTAGGTAGAAAAGAC TCAATAAAAGCAGGATATGAATTGGCAGATACAAATCTTCCAACAGCTGATGAAGGATTAATTTCTATTATATCTAAGTTTATATCACAAGGACTTTCTGTTACTGATATGGTTGCTCTG TCTGGTGCACATACAATAGGAAAAGCAAGATGTGTGAATTTCAGAAATAGAATATATGGAGATTTCAAAATGACAAGTACTTCATATATAAATCCAATTTCATCCTCTTATCTTAGTAAA TTAAAATCATTATGTCCTCCAATTGAAATTAATGGATCATCAGACAACAATGAAACATCAATGGACAATATTACTCCAAATTTATTTGATAATTCATATTATCATGTCTTACTTAAAGGT GAAGGACTCATAAATTCAGATCAAGAACTTTATTCAAGTTATCTTGGAATTCAAACAAAAAAAATTGTTGAAAAATATGCTGCAAATACAATTGCATTTTTTGAACAATTTGCTGAATCA ATGGTCAAAATGGGAAATATTACAAATCAAGAGACTTATGTGAATGGAGAAGTGAGAAAGAGTTGTAGGTTTGTGAATACATAA |
Retrieve as FASTA
|
|